4.1 Transcription

Question 1

Qu’est-ce que l’ARN polymerase?

Answer 1

Enzyme clé de la transcription

Question 2

Les rôles/fonctions de L’ARN polymérase

Answer 2

•Catalyser (logique c’est une enzyme)
>Synthèse des différents ARN
•utilise ATP, autres (ribonucléotides)
•Reconnaît sites spécifiques(promoteur/terminateur)
> Amorcer/finir la transcription

Question 3

Synthèse d’ARN ou réplication de l’ADN qui est le plus fidèle?

Answer 3

Synthèse (1nucléotide/10 000)
>moins de conséquences
Réplication (1nucléotide/10 000 000)

Question 4

Comme la réplication de l’ADN, la transcription s’exécute que dans un seul sens, quel est-il?

Answer 4

5’ to 3’ : pour n’importe qu’elle brin
>sliding along DNA : 3’ to 5’

Question 5

Deux homologies/ similitudes STRUCTURALES entre ARN pol bactérienne et ARN II de levure(eucaryote)

Answer 5

1. Pince de crabes (formé par les deux plus grosse sous unité)
   •sous unité B et B’ (bactérie)
   •sous unité Rpb1 et Rpb2 (levure)
   >pourquoi cette structure?
2. Site actif : ion Mg++ situé au centre et essentiel pour la catalyse
   >Extrêmement conservé durant l’évolution!!

Question 6

Qu’est ce que le brin codant et matrice?

Answer 6

Matrice/ Template : celui utilisé comme modèle par l’ARN pol.
Codant : l’autre ( identique au transcrit à l’exception de T vs U)

Question 7

Que veut-on dire par en aval en amont?

Answer 7

Positon prenant comme référence le site de début de transcription ( TOUJOURS +1) :
Amont : désigne donc les valeurs négatifs avant le start
Aval : Désigne valeurs positif après le start

Question 8

3 étapes de la transcription?

Answer 8

1. Initiation
2. Élongation
3. Terminaison

Question 9

Explique en détail la première étape de la transcription : l’initiation.

Answer 9

Step 1: Binding to the promoter and formation of the closed complex
During this step, the RNA polymerase binds to the promoter sequence on the DNA, which is typically located upstream of the gene being transcribed. The binding of RNA polymerase to the promoter forms a closed complex, which is characterized by the polymerase being tightly bound to the DNA and not yet being able to start transcription.

Step 2: Melting of the promoter and formation of the open complex
In the next sub-step, the promoter DNA begins to denature, or melt, creating a small bubble in the DNA that allows the RNA polymerase to access the template strand. This forms the open complex, which is characterized by the separation of the DNA strands in the region of the promoter.

Step 3: Formation of the initial transcription complex
Once the open complex has formed, the RNA polymerase can begin to synthesize RNA using the template DNA strand. The first few nucleotides are added to the growing RNA chain to form the initial transcription complex.

Step 4: Many aborted transcripts
During initiation, the RNA polymerase often produces many short RNA transcripts that are quickly released from the polymerase. This is because the polymerase may not properly engage with the DNA template during the initial stages of transcription.

Overall, initiation is a complex process that involves multiple sub-steps and is tightly regulated to ensure accurate transcription of genes.

Question 10

Explique la 2ᵉ étape, l’élongation.

Answer 10

a) additionne nucléotide par nucléotide (nécessite deux ions Mg++)
b) Déroule vers l’avant (devant bulle de transcription) et enroule vers l’arrière.
>permet d’avancer dans la transcription jusqu’à sa disociation.[Terminaison]
c) En cas d’erreur, c’est aussi l’ARN pol qui corrige.

Question 11

Explique la 3e étape, la terminaison.

Answer 11

• Arrêt de synthèse
• Décrochage de l’ARN, de l’ARN polymérase et de l’ADN
• Fermeture de la bulle de transcription
• Séquences de terminaison très spécifiques : site terminateur (terminator)