4-Taxinomie

Question 1

Définition d’espèce

Answer 1

C’est l’unité de base de la taxinomie. Elle correspond à un regroupement d’individus (ex: souches bactériennes) qui partagent un haut niveau de similarité phénotypique et génotypique

Question 2

Qu’est-ce que la taxinomie numérique ?

Answer 2

Consiste à assigner une valeur à chacun des caractères phénotypiques et à calculer mathématiquement le coefficient de similarité entre différentes souches bactériennes.

Question 3

Le rapport G+C : A+T est-il constant ou variable d’une espèce à l’autre ?

Answer 3

VARIABLE

Question 4

Les souches d’une même espèce ont-elles un contenu en G+C similaires ou variable ?

Answer 4

SIMILAIRE

Question 5

Expliquer la technique d’hybridation de l’ADN de 2 microorganismes différents pour l’identification.

Answer 5

• On peut réassocier de l’ADN d’une bactérie avec l’ADN d’une autre marqué avec un radioisotope
• On obtient une molécule hybride qui nous permet de déterminer le degré d’homologie entre les 2 bactéries
• 2 souches bactériennes doivent obligatoirement avoir plus de 70% d’homologie pour appartenir à la même espèce.

Question 6

Quels ADN utilisent-on souvent en taxinomie pour identifier par séquençage ?

Answer 6

L’ ARNr 16S ou l’ADNr 16S et de plus en plus les séquences du génome complet

Question 7

Quels sont les avantages d’utiliser l’ARNr 16S pour séquencer et identifier ?

Answer 7

• Petite molécule abondante

- Fonction conservée

Question 8

Quelle classification est utilisée par les laboratoires pour les bactéries ?

Answer 8

La classification proposée dans le “Bergey’s Manual of Systemic Bacteriology”

Question 9

Nommer 4 caractéristiques utilisé par les classifications qui se basent grandement sur les caractéristiques phénotypiques.

Answer 9

1-Gram
2-Coque/batonnet
3-Spore
4-O2

Question 10

Quelle est la différence des mycoplasmes avec les bactéries ?

Answer 10

Pas de paroi cellulaire

Question 11

Quelle est la différence des Rickettsies avec les bactéries ?

Answer 11

Parasitisme intra-cellulaire obligatoire (transmises par arthropodes (puces, tiques)

Question 12

Quelle est la différence des chamydies avec les bactéries ?

Answer 12

• Parasistime intra-cellulaire obligatoire

- Absence d’un système générateur d’ATP

Question 13

Que devons-nous obtenir afin de faire une identification rapide d’un microorganisme ?

Answer 13

L’isolé en culture pure

Question 14

Quelles sont les 4 méthodes de typage ?

Answer 14

• Biotypage (selon les besoins nutritifs)
• Sérotypage (avec des anticorps)
• Lysotypie (avec des bactériophages)
• Typage moléculaire (plusieurs méthodes)