3.Pred Flashcards
Zašto genotipizacija?
Dijagnoza,liječenje bakterijskih infekcija
Utvrđivanje bakterijske raznolikosti
Metode genotipizacije?
- Dna fragmentiranje
- PCR amplifikacije
- Hibrudizacija
- Prisustvo i izostanak gena
Metode bazirane na dna fragmentima
Pfge
Reap
Pfge
Dna fragmenti se razdvajaju po veličini tijekom elektroforeze
Pulsefield - djelovanje struje pod različitim kutovima,putuje dna u cik cak formi, manji fragmenti su brzi
Sporo i skupo
Reap
Analiza plazmida res.enzimim
Izolirani plazmida i režemo ga endonuklama
Elektroforeza
PCR rflp
Analiza polimorfizam na temelju duljine res.fragmenata
1. PCR umnažanje
2. Restrikcija
3. Elektroforeza
4. Bojanje i i interpretacija
Rapd
Kratke početnice
PCR
Početnice trebaju biti blizu i 3 krajevi trebaju gledati jedan u druge
Rep pcr
PCR amplifikacija ponavljajućih dna elemenata
Hibridizacija
Southern blotting
Korištenje probe
Karakteristično vezanje probe na dna
Sekvencioniranje
Sangerova metoda
Pirosekvencionirnje