הרצאה 3 Flashcards

1
Q

מהם שלושת השלבים שבהם התאים (גזע) נהיים מחוייבים סופית?

A

1. commitment

מחויבות של תאי הגזע שעוברים התמיינות לשושלת מסויימת.

2. תאים פרוגניטוריים, מחויבים לשושלת מסוימת

מבחינה פנוטיפית דומים לתאי גזע, אך לא יכולים להתמיין לכל סוג תא (אם נשתיל אותם במקומות שונים יש ייעודים שלא יוכלו להגיע אליהם).

3. מחויבות סופית של התאים

כל תא מתמיין לתפקידו הסופי, הם יוצאים ממחזור התא ומפסיקים להתחלק. מתחילים לבטא את הגנים שמעניקים להם את תכונותיהם הייחודיות. לא יכולים לעבור לגורל אחר.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Instructive signals מהם ה?

A

סיגנלים חוץ תאיים המגיעים מתאים שכנים על ידי פקטורי גידול, מרחוק על ידי הורמונים, או בהשפעת המטריקס החוץ תאי. משפיעים על תאים פרוגניטוריים.

Ent, GFG, Notch, TGF beta.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

מתי התאים הם טוניפוטנטיים?

מתי הם הופכים להיות פלוריפוטנטיים?

A

בזיגוטה ובשלבים הראשונים.

הם הופכים להיות פלוריפוטנטיים blastocyte בשלב ה

כי הם יכולים להתמיין לכל תא חוץ מלטרופובלסט.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

באיזה שלב יש את החלוקה ל-3 שכבות הנבט?

מהן שלושת השכבות?

מהי הפוטנטיות של התאים בשלב זה?

אילו תאים נוצרים מכל שכבה?

A

גסטרולה

השכבות הן אקטודרם, מזודרם, אנדודרם

התאים מולטיפוטנטיים.

אקטודרם- אפידרמיס, נוירונים

מזודרם- שריר, לב, עצמות, סחוס, דם

אנדודרם- איברים פנימיים כמו כבד ומעיים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

אילו תאי גזע יש באדם בוגר?

A

יוניפוטנטיים או מולטיפוטנטיים.

תאי גזע השוכנים באיברים ספציפיים כמו עור, מערכת העיכול, מערכת הדם, שריר שלד ועוד.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מהם תאי גזע מזנכימליים?

באיזה שלב יש אותם?

מה המקור שלהם?

A

נמצאים בגוף האדם הבוגר, יכולים לחדש רקמות בהתאם למקום בו הם נמצאים בגוף.

תאים ממקור מזודרמלי ויכולים להתמיין רק לרקמות שמקורן במזודרם (שריר, לב, עצמות, סחוס, דם).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מה אופי הפקטורים החיצוניים שמשפיעים על זהות התאים לעומת אופי הפקטורים הפנימיים?

A

פקטורים חיצוניים- מולקולות מופרשות מרחוק (הורמונים), תאים בסביבה, אינטראקציות בין תאים, אינטראקציות עם המצע החוץ תאי.

סיגנל-> נקשר לרצפטור/ נכנס לתא-> סיגנל בתא-> הפעלת תכנית השעתוק של התא בגרעין.

פקטורים פנימיים- מצב אפיגנטי (הסטוריית התא) המאפשר שעתוק תוכניות מסוימות, בקרה לאחר שעתוק.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה הקשר בין סיגנלים חיצוניים למבנה הכרומטין בדטרמינציה?

A

סיגנלים משפיעים על מבנה הכרומטין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מהי הבקרה על ביטוי גנטי?

A
  1. שעתוק

המנגנון העיקרי לבקרת ביטוי גנטי

  1. Cis אזורי
  2. Trans פקטורי
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

איך מתבטא ברמה המולקולרית תהליך השעתוק?

A
  1. Genetal transcription factors הפולימראז וה

מביאים את הפולימראז לאזור תחילת השעתוק- לפרומוטור/

TATA box

  1. שנקשרים אליהם אקטיבטורים או רפרסורים enhancers יש אזורי

בעזרת חלבונים אחרים הנקשרים אליהם ויוצרים קומפלקסים חלבוניים משפיעים על מידת שעתוק הגן.

  1. האקטיבטורים מייצבים את הקישור של הפולימראז למקום הנכון.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מה הראו בניסוי על אלסטז ושינוי אזורי הבקרה?

A

ניסוי להדגמת חשיבות אזורי הבקרה: אלסטאז הוא גן בעל אזור בקרה לפני האזור המקודד, המשפיע על ביטוי החלבון בלבלב. בגן אחר, הורמון גדילה, יש אזור בקרה אחר, והוא מתבטא ברקמות שונות. איחוי של הגנים: אזור בקרה של אלסטאז הקשור לגן המקודד להורמון הגדילה: נקבל עכברים טראנסגנים בהם הורמון הגדילה יתבטא רק בלבלב עקב שינוי אזור הבקרה

הבקרה משפיעה על רמת ביטוי הגן הסמוך אליו.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מהם פקטורי שעתוק פליאוטרופיים?

A

פקטור שעתוק מסוים יכול להיקשר להרבה גנים. בחלקם הוא משמש כאקטיבטור ובחלקם הוא יכול לשמש כרפרסור.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

TCF מה הקשר בין

Graucho / בטא קטנין ל

לפקטורים בכללי enhancer מה אפשר ללמוד מזה על הקשר בין?

A

Graucho יכול לקשור קו רפרסוק TCF

כשהם נקשרים לא יקרה שעתוק. במקרים אחרים הוא יקשור קו-אקטיבטור בשם בטא-קטנין, ואז הוא יפעיל ביטוי גנים.

קושר סט של פקטורים enhacner כל

-וכדי שיקרה שעתוק כל הפקטורים צריכים להיקשר לאזור ה

enhacner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Feed forward מהו המנגנון?

A

המנגנון שקובע את סדר ביטוי הגנים בזמן ההתמיינות של תאי שריר.

באמצעות הסדר נוצר דירוג בביטוי הגנים.

התרשים מדגים זאת (מקווה שהבנתי נכון)

A סגול וירוק יוצרים פקטור שעתוק אדום-

C אדום וסגול יוצרים פקטור שעתוק צהוב

וכך הלאה.

כל פעם יצטרף עוד פקטור שעתוק שמבוטא ודרוש לביטוי הגן הבא בתור. כך נוצר דירוג בביטוי הגנים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מה הסדר בפקטורי השעתוק המיוגניים במיוגנזה?

התמיינות שריר

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

בזבוב Eve מה נלמד על הגן

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

אילו בקרות אפיגנטיות יש?

A

1. DNA בקרה עי מתילציה של ציטוזין ב

ידוע כי בעובר נוצרת תבנית מתילציה לפני ההשרשה של העובר, שעושה רפרסיה לרוב הגנון. התאים מתחלקים ודפוס המתילציה נשאר. התבנית נשמרת בזכות אנזימים שעושים מתילציה לאחר הכפלת הדנא בחלוקת התא.

כדי שתא ירכוש תכונות חדשות צריך להסיר את המתילציה וכך יהיה שפעול של גנים משותקים.

2. בקרה עי מודיפיקציות של הכרומטין וההיסטונים

ההיסטונים עוטפים את הדנא במבנה של נוקלאוזומים- מבנה מגן על הדנא שמפריע לשעתוק. כדי לאפשר שעתוק צריך לרווח את ההיסטונים.

יש מנגנונים שעושים סידור מחדש להיסטונים- אצטילציה, מתילציה, פוספורילציה, יוביקוויטינציה.

חלר מהמודיפיקציות הופכות את ההיסטונים לפתוחים (ופעילים יותר) וחלק סוגרות את הכרומטין (ומעכבות את השעתוק)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

איך נקרא כרומטין סגור?

ואילו אנזימים סוגרים את הכרומטין?

איך נקרא כרומטין פתוח?

ואילו אנזימים פותחים את הכרומטין?

מהו המצב של ברירית המחדל של הדנא?

A

הטרוכרומטין

היסטון דה אצילז (מוריד אצטיל), היסטון מתיל טרנספראז (מוסיף מתיל)

אאוכרומטין

היסטון אצטיל טרנספראז (מוסיף אצטיל לזנבות)

המצב של ברירת המחדל הוא הטרוכרומטין- כרומטין סגור.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

מה הקשר בין מבנה הכרומטין לרמת ביטוי חלבון?

A

מבנה כרומטין פתוח- ביטוי פעיל של גן.

בתמונה- הניסוי שסופר בהרצאה על הממצא.

20
Q

Positive Autoregulation מהו התהליך?

A

פקטורי שעתוק מבקרים את הביטוי של עצמם. פקטור שעתוק יכול להיקשר לפרומוטור של הגן שמייצר את עצמו, כל הזמן מפעיל את הביטוי שלו. מנגנון זה הוא חלק מתהליך ההתמיינות ובעזרתו תבנית הגנים נשמרת לאחר חלוקת התאים.

דוגמה בתאי מיובלסט (פרהקורסר של תא שריר).: איי הוא פקטור שעתוק, מפעיל את עצמו (אוטורגולטורי) וגורם לביטוי של הגן סי ודיכוי של הגן בי. בציטופלזמה של שני תאי הבת עדיין קיים הגן איי שיוכל להיכנס לגרעין של התאים ולשמור על דגם הביטוי של הגנים.

בציטופלזמה של 2 תאי הבת עדיין קיים הגן איי שיוכל להיכנס
לגרעין של התאים ולשמור על דגם הביטוי של הגנים.

21
Q

מהם השלבים בהתמיינות תאי שריר מהתטים הפרוגניטוריים לסיבי השריר?

A

1. Myoblast

התאים הפרוגניטוריים של שריר השלד, תאים שמחויבים להתמיין רק לשריר. הם יוניפוטנטיים. לא נראים כמו תא שריר, הם ממשיכים להתחלק. הרחקת פקטורי הגידול גורמת למעבר לשלב הדיפרנציאציה, התאים מפסיקים להתחלק ועוברים לסיבי שריר במספר שלבים:

2. מיוציטים

התאים מסתדרים זה לצד זה ומתארכים, בנוסף, מתחילים לבטא גנים שריריים. תאים חד גרעיניים עוברים איחוי

3. Myotube

סיבים מאוחדים רב גרעיניים המבטאים גנים שריריים.

4. סיבי שריר

תאי שריר מסודרים, כוללים סרקומרים המאפשרים את הכיווץ.

22
Q

מה גילו בניסוי בו איחדו בין תא כבד ממקור הומאני לתא שריר ממקור עכברי?

A

פקטורים שקיימים בציטופלזמה של תאי השריר הצליחו להגיע לגרעין של התאים ההומאניים והשפיע על ביטוי גנים באופן שיבוטאו גנים שריריים.

23
Q

לפי ניסוי בתואר, למה דה מתילציה גורמת מבחינת התמיינות?

A

ע”י הסרת המתילציה, הופעלו תוכניות שונות של השושלות השונות אליהם התמיינו הפיברובלסטים.

24
Q

MyoD ניסויים בהקשר של

A
25
Q

MyoD איזו משפחת חלבונים מכילה את?

מה המאפיינים של משפחה זו?

A

BHLH

מיוגניים- פקטורי שעתוק.

MyoD ,Myf5, Myogenic, MRF4

יש להם מוטיב הקושר את החלבון לאלמנט דומה בדנא, יודעים לשפעל שעתוק של גנים שרירים

החלבונים עובד רק כאשר הם דימרים

26
Q

צריך להיקשר MyoD עם אילו חלבונים?

אני מניחה שכדי להיות פעיל

ובאיזה הרכב?

A

E12, E47 נוספים bHLH עם חלבוני

נקשר כהטרודימר

27
Q

MyoD מהו המבנה של הגן?

A
  1. Basic-

אזור המקודד לדומיין עשיר בחומצות אמינו שיכול להקשר לדנא כשהמטען שלילי.

  1. Helix loop Helix-

אלמנט הדמריזציה, מקודד לדומיין בחלבון שנקשר לחלבון אחר מאותה משפחה.

רצף פילנדרומי E box הרצף אליו נקשר ההטרודימר הוא

28
Q

E47/ E12 גורם כאשר הוא מחובר כהטרודימר ל MyoD למה ?

A

מיובלסט מתמיין למיוטוב.

29
Q

MyoD איך משפיע החלבון שנקשר ל?

לתת פירוט על החלבונים השונים.

A

יכול לשמש כאקטיבטור או כרפרסור.

E12 ,E47- אקטיבטורים

Id, Mist1, MyoR- רפרסורים

לחלקם אין אזור בסיסי ולכן הקשירה שלהם למיודי לא מאפשרת לו להיקשר לדנא ובכך הם מעכבים את פעילותו. חלקם פשוט מדכאים אותו למרות שיש להם איזור בסיסי באופן שלא הוסבר בהרצאה.

30
Q

Somites מהם ה?

A

מבנים אפיתליאליים מהם נוצרים השרירים, נמצאים משני צידי ציר העצבים.

סומיט מתחיל ככדור של תאים אפיתליאליים, ככל שהוא מתבגר, הסומיטים מנצים. מהם מתפתחים גם סלקרוטום*, שעוברים מתאי אפיתל לתאים מזנכימליים שפחות צמודים לעומת תאי אפיתלץ. מהסלקטורוטום נקבל סחוס, עצמות, ליגמנטים.

מהסומיטים נוצרים גם דרמומיוטום**- אשר בסוף מתפתח לשכבת הדרמים וגם למיוטום (שריר השלד).

* Sclerotome

** dermomyotome

31
Q

myotome בהקשר של תאי ה MyoD על מה אחראי

A

מבוטא בתאים שנודדים לכיוון הגפה והבטן- באזור הלטרלי (נקרא גם היפקסיאלי). תאים אלו יבטאו את הגן מיודי את שרירי הבטן והגפיים.

מסומן באדום

32
Q

myotome בהקשר של תאי ה Myf-5 על מה אחראי

A

שנודדים לכיון הגב יבטאו גן זה ויהפכו לתאים myotome התאים ב

של שרירי גב

נמצאים באזור אפקסיאלי (מדיאלי/ מרכזי).

מסומן בכתום

bHLH אחד מארבעת הגנים של משפחת Myf-5 תזכורת-

33
Q

מתבטא Myogenin: מתי?

חלק מאיזו משפחת חלבונים הוא?

A

גן שמתבטא בשלבים יותר מוקדמים של דיפרנציאציה של מיובלסטים

מתבטא במיובלסטים עצמם לפני שמתמיינים. נמצא באזור המדיאלי.

bHLH חלק ממשפחת חלבוני ה

34
Q

מתבטא MRF4 מתי?

חלק מאיזו משפחת חלבונים הוא?

A

גן שמתבטא בשלבים יותר מאוחרים של דיפרנציאציה של מיובלסטים

-myotubes ו-myofibers בשלבין ה

bHLH חלק ממשפחת חלבוני ה

35
Q

מהם הסיגנלים האקסטרינזיים שמשפיעים על המיוטום?

A
36
Q

MyoD מהם האנהנסורים* של?

*אנהנסור- מקטע דנא קצר, המשמש להגברת תיעתוק של גנים באופן ספציפי לסוג התא ולזמן ההתפתחותי.

A
  1. אזור היושב 24 אלף בסיסים לפני התחלת השעתוק

hypaxial באזור ה MyoD מבקר את ביטוי

*היפקסיאלי- לתרלי

  1. אזור היושב 6 אלף בסיסים לפני התחלת השעתוק

Satellite בתאי MyoD מבקר את

תאים סטלטיים- תאי גזע של שריר בוגר**

37
Q

מהם שלבי ההתפתחות של תא השריר?
כולל פקטורי השעתוק

A

גורמים לתאים להתחייב להפוך להיות מיובלסטים Myf5 ו MyoD

ולהתמיינות השרירית, אך לא גורמים לתאים להיות תאי שריר.

הוא גן של דיפרנציאציה Myogenin

גורם לתכנית יצירת סיבי השריר הבוגרים.

38
Q

מה גילו בניסוי העכברים בו עשו נוקאאוט לגנים ממשפחת

bHLH

A
39
Q

בהתמיינות התאים MyoD ו Myf5 מה היחסים בין

בהתמיינות לתאי שריר?

איך קוראים לתופעה?

A

הם גנים שמכסים זה על התפקוד של השני. רק כאשר שניהם חסרים לא נקבל שריר

Redundancy לתופעה קוראים

.

40
Q

מספיק בשביל להפוך תאים מזודרמליים Myogenin האם

למיובלסטים?

A

לא, הוא חייב גם את הגנים

Myf5 או MyoD

41
Q

MyoD משהו שצריך להשלים על הביטוי של

A
42
Q

Myogenin ל MyoD מה ההבדל בין?

A
  1. MyoD- ספסיפיקציה

תאי גזע בהם יבוטא הגן יהפכו למיובלסטים, מחויבים להפוך לתאי שריר.

  1. Myogenin- דיפרנציאציה

חשוב לשלב בין מיובלסט לבין מיוטובס. הוא לא יצליח להפוך תאי גזע

למיובלסטים. הביטוי של מיוגנין עולה רק לאחר הסרת פקטורי הגדילה.

43
Q

Myogenin שלא קיימים ב MyoD אילו איזורים יש ב?

למה ההבדלים גורמים?

A
  1. אזור עשיר בציסטאין והיסטדין
  2. C terminal איזור הליקס 3 ב

אזורים אלו חשובים בגיוס חלבונים המשפיעים על מבנה הכרומטין. על ידי אזורים אלו, מיודי נקשר לאנזים היסטון אצטיל טרנספראז שגורם ל_פתיחת מבנה הכרומטין_.

בנוסף, מיודי גם מסוגל להיקשר לקומפלקס נוסף הקשור לפתיחת הכרומטין

הפועל באיזורי פרומוטורים Swi/ Snf

44
Q

להשלים את החרא הזה

A
45
Q

Stellite מהם תאי?

איפה הם יושבים?

מה המצב הטבעי שלהם ומה גורם להם לצאת ממצב זה?

A

תאים יוניפוטנטיים- תאי גזע בוגר של שריר.

יכולים להתמיין רק לשושלת השרירית.

הם יושבים מעל הממברנה של השריר ומתחת לממברנה הבזאלית.

Quiescent תא זה יכול להיות במצב רדום,

כלומר לא מתחלק.

בהינתן סיגנל כתוצאה מפציעה של השריר התא יעבור אקטיבציה ויתחיל להתחלק, יהפוך למיובלט.

46
Q

איך נראה התהליך שבו תאים סטלטיים הופעים למיובלסטים בעקבות פציעה?

מבחינת הפקטורים המשפיעים עליהם

A