2.2 Les protéines - les machines qui font tout Flashcards
De quels sous unités sont composées les protéines ?
D’acides aminés
Combien d’acides aminés différents composent les protéines ?
20
Quel est l’acide aminé le plus simple ? (Le groupe latéral est seulement composé d’un hydrogène)
La glycine
Est-ce que les acides aminés sont des acides ou des bases ?
Les deux, ils sont amphiphiles
Quelle molécules est libérée lors de la polymérisation des acides aminés ?
H2O
Est-ce que les acides aminés sont polaires ? Expliquer
Certains sont polaires d’autres ne le sont pas.
Combien y’a-t-il d’acides aminés dont la chaîne latérale est non polaires ?
10
Combien y’a-t-il d’acides aminés dont la chaîne latérale est polaires neutres ?
5
Combien y’a-t-il d’acides aminés dont la chaîne latérale est polaires positifs ?
3
Combien y’a-t-il d’acides aminés dont la chaîne latérale est polaires négative ?
2
Comment appel-t-on un enchaînement d’acides aminés ?
Un peptide
Comment appel-t-on un peptide composé de 2 à 20 acides aminés ?
Oligopeptide
Comment appel-t-on un peptide composé de 10 à 100 acides aminés ?
Un polypeptide
En 3 dimensions, est-ce qu’une protéine est linéaire ? Expliquer…
Non, elle s’enroule pour prendre une conformation stable.
Est-ce que les protéines ont plusieurs conformations stables à la température cellulaire ?
Non, il n’y a qu’une seule conformation stable
Lorsqu’une protéine s’enroule, qu’est-ce qui fait que certains parties iront plutôt au centre et d’autres à l’extérieur ?
Les acides aminés, dont la chaîne latérale est hydrophobe, se réunissent au centre tandis que les hydrophiles restent en périphérie.
De manière générale, quels sont les acides aminés dont les chaînes latérales sont hydrophobes ?
Les chaînes latérales non polaires sont hydrophobes. Les chaînes polaires sont hydrophiles, car elles peuvent former des liaisons hydrogènes
Quels sont les liaisons non covalentes qui interviennent dans le reploiement des protéines ?
Liaisons ioniques
Liaisons hydrogènes
Attraction de van der Waals
Est-ce que les connaissances actuelles permettent de déterminer la structure 3D des protéines à partir de leurs séquences ? Comment sont-elles découvertes ?
Non, les structures tridimensionnelles sont déterminées expérimentalement
Est-il possible de visualiser une protéines au microscope ?
Oui, ce sont de grosses molécules
Quelle est la séquence d’atome le long d’une protéine ? (sans prendre en compte les chaînes latérales)
…NCCNCCNCCNCC…
Quels sont les deux principaux types de structures secondaires des protéines ?
Feuillet bêta
Hélice alpha
Est-ce qu’une protéine se déforme dans son état stable ? Expliquer…
La structure tertiaire (3D) ne change pas, mais les chaînes latérales peuvent tourner autour de leurs liaisons simples.
Que se passe-t-il avec la structure tertiaire d’une protéine lorsque la température monte ?
La protéine se déforme (et elle précipite)
Qu’est-ce qui permet aux protéines d’interagir de façon spécifique avec d’autres molécules ?
L’arrangement particulier des chaînes latérales.
Est-ce que des réactions chimiques peuvent avoir lieu entre les différentes chaînes latérales d’une protéine ?
Oui, des hydrogènes ou des électrons peuvent passer d’une chaîne à l’autre par exemple.
Est-ce que différentes protéines peuvent interagirent ensemble ?
Oui, elles peuvent même s’assembler en structures quaternaires comme l’hémoglobine.
Comment appel-t-on les protéines qui catalysent des réactions chimiques ?
Une enzyme
Qu’est-ce qu’une coenzyme ?
Une molécule organique non protéique qui permet à une enzyme de catalyser une réaction.
Qu’est-ce qu’une vitamine ?
Une coenzyme qui ne peut pas être synthétisée par l’organisme.
Est-ce que les molécules FADH et NADH sont des vitamines, des enzymes ou des coenzymes ?
Des coenzymes
Est-ce que les protéines ont des formes et des tailles similaires ?
Non, elles peuvent être très diverses.
Est-ce que toutes les protéines sont des polypeptides, et inversement ?
Les protéines sont des polypeptide (chaînes d’acides aminés), mais tous les polypeptides ne sont pas des protéines. Le terme protéine s’applique à une chaîne d’acides aminés après son repliement et ses modifications.
De quels sous unités (protéines) est constituée l’hémoglobine ?
2 bêta hémoglobines
2 alpha hémoglobines
Est-ce que l’hémoglobine est une protéine ?
Oui, c’est un assemblage de protéine ou complexe protéique. Les assemblages de protéines sont aussi considérées comme des protéines.
Dans le cadres des protéines, qu’est-ce qu’un dimère ? Quelle est la différence entre un homodimère et un hétérodimère ?
Un dimère est un complexe de protéine composé de deux sous unités.
Un homodimère est constituée de 2 sous unités semblables. Un hétérodymère est composé de deux sous unités différentes.
Est-ce que les ribosomes et l’hémoglobine sont des dimères ? Homodimère ou hétérodimère ? Expliquer
L’hémoglobine n’est pas un dimère car elle est composée de 4 sous unités et non 2.
Les ribosomes sont des hétérodimères car ils sont composés de 2 sous unités différentes.
Quel est le nom de la grande sous unité ribosomique ?
60S
Quel est le nom de la petite sous unité ribosomique ?
40S
Quelle est la structure des microtubules ?
Les microtubules sont formés de dimères de tubulines constitués chacun de deux sous-unités, la tubuline α et la tubuline β. Un grand nombre de dimères sont assemblés entre eux en une sorte de tube.
Quel est le diamètre des microtubules ?
25nm
Qu’arrive-t-il si une protéine attache un groupe phosphate à une autre protéine ?
La protéine peut changer de conformation et donc être désactivée ou activée
Comment appel-t-on les protéines qui attachent des groupes phosphates à d’autres protéines pour réguler leur actvitié ?
Des kinases
