רעות שלגי 2021

Question 1

מהו קודון הפתיחה בתרגום?

Answer 1

AUG

Question 2

tRNA במולקולת ה

איזה קצה נקשר לחומצה האמינית

מה קורה לקצה השני

Anticodon loop מהו ה

Answer 2

קצה 3 נקשר לחומצה האמינית.

CCA מורכב מרצף

קצה 5 סוגר את הלופ

האנטיקודון הוא האיזור שבעזרתו מוודאים שהטי.רנא מתאים לקוד על האם.רנא

Question 3

Wobble position מהי ה

מה היא מאפשרת?

Answer 3

העמדה השלישית של החיבור בין האנטי קודון לקודון בתרגום.

בגלל שיש יותר קודונים מחומצות אמינו בפועל היא מאפשרת קשר חלק בנוקלאוטיד השלישי בקודון, כך שזיווג יכול להתקיים גם אם אין 100% התאמה בקודון בתנאים מסויימים. לשים לב ששני הנוקלאוטידים הראשונים כן חייבים להיות מתאימים באופן מדוייק.

Question 4

RNA pollymerase 3 מה התפקיד של?

Answer 4

tRNA אחראי לשיעתוק של מולקולת ה

Question 5

מהו התהליך אמינואצטילציה?

איפה הוא מתרחש?

מה הוא דורש?

Answer 5

ספציפי tRNA צימוד חומצה אמינית מתאימה ל

יכול להתרחש במיטוכונדריה, בציטופלזמה ובגרעין.

והיא משמשת ליצירת הקשר ATP צורך אנרגיה ע”י שימוש ב

לחומצה האמינית tRNA בין ה

פירוק הקשר הוא זה שייתן את האנרגיה לאחר מכן ביצירת הקשר בין החומצות האמיניות בריבוזום.

tRNA synthetase הצימוד נעשה עי האנזים

Question 6

tRNA synthetase מה התפקיד של האנזים?

אילו אתרים חשובים יש בו?

תחת אילו בקרות הוא פועל?

למה חשוב שתהיה בקרה אדוקה על פעילותו?

Answer 6

אנזים שאחראי על האמינואצטילציה, הצימוד בין חומצה אמינית

שמתאימה לו tRNA ל

יש סהכ 20 כאלו, אחד לכל חומצה אמינית

יש בו שני אתרים פעילים

1. Activation site- האתר בו מתבצע הצימוד
2. Editing site- האתר שאחראי על בקרה

הבקרה נעשית עי התאמה מרחבית למולקולת

Editing site וגם ל tRNA ה

הבקרה חשובה כי הריבוזום לא בודק את התאמת החומצה האמינית לאם.רנא שהוא מתרגם אלא רק את ההתאמה של הקודון. לכן הקודון צריך להיות מתאים לחומצה האמינית.

Question 7

מה החשיבות של הריבוזום בתהליך התרגום?

Answer 7

1. אמינות

מוודא מסגרת קריאה- שאין הסטה

מוודא קודון התחלה/ סיום

היא מקצה 5 לקצה 3 mRNA מוודא שהקריאה של ה

2. דיוק

עושה טעויות 1 ל 10,000 (מעט מאוד)

Question 8

באיזה כיוון של החומצה האמינית מתבצעת הארכת השרשרת הפפטידית בריבוזום?

Answer 8

טרימנלי Cהקצה החשוף הוא הקצה ה

החומצה האמינית החדשה שמתווספת עושה זאת דרך הקצה

טרימנלי שלה N ה

_{* האנרגיה ליצירת הקשר מגיעה משחרור הקשר מולקולת}

_{לחומצה האמינית tRNA ה}

Question 9

מהם שלבי התרגום?

Answer 9

1. start codon איניציאציה- תחילת התרגום, זיהוי ה
2. אלונגציה- הארכת החלבון
3. טרמינציה

Question 10

מה ההבדל בין הרכב הריבוזום של פרוקריוטים, אאוקריוטים נמוכים ואאוקריוטים?

מסומן במרקר

Answer 10

Question 11

בריבוזום decoding center מהו ה?

Answer 11

נמצא בתת היחידה הקטנה,

mRNA שם מתרחש הצימוד בין הקודון של ה

tRNA לאנטי קודון של ה

Question 12

peptidyl transfer center -PTC מהו ה

בריבוזום?

Answer 12

האתר בו מסונתזת השרשרת הפוליפפטידית,

Question 13

A,P,E sites מהם ה?

Answer 13

tRNA האתרים לקשירת

A- האתר של הקודון הבא שיהיה מתורגם, בו מתבצעת הבדיקה של הקודון- אנטי קודון ויצירת הקשר הפפטידי

P- האתר שמחזיק את השרשרת הפוליפפטידית

E- לאחר שהעביר את השרשרת tRNA האתר שבו

נמצאים בחיבור בין תת היחידה הקטנה לגדולה בריבוזום

Question 14

מהו מהלך האלונגציה?

Answer 14

1. A חדש לעמדה tRNA מגיע
2. P חיבור בין השרשרת הפוליפפטידית שקשורה לעמדה

A בעמדה tRNA לבין הפפטיד שקשור ל

3. תזוזה של תת היחידה הגדולה
4. תזוזה של תת היחידה הקטנה
5. החדשה E מעמדה tRNA שחרור של
6. חזרה לשלב 1

Question 15

EF-Tu, eEF1 מה התפקיד של הפקטורים?

Answer 15

EF-Tu בפרוקריוטים, eEF1 באיוקריוטים

בעלי תפקיד כפול (היא פירטה על פרוקריוטים אבל נראה לי שזה גם באיוקריוטים)

1. tRNA+ הפקטור מביא את הקומפלקס של החומצה האמינית

לריבוזום

2. tRNA הפקטור מכסה את החומצה האמינית על ה

רק כאשר ההיכרון בין הקודון לאנטי קודון הוא עושה הידרוליזה

והוא משתחרר, בכך מונע חיבור לא נכון GDP ל GTP מ

כאשר אין התאמה אין הידרוליזה והמולקולה תצא

Question 16

איך הריבוזום יודע שהקשר של הקודון והאנטי קודון נכונים?

Answer 16

16S תת היחידה הקטנה של הריבוזום ובפרט החלק

יכולה לעשות קשרי מימן עם האנטי קודון, ורק כאשר האנטי קודון מתאים ויש התאמה מרחבית יווצרו קשרי מימן גם בין

mRNA ל tRNA ה

Question 17

EF-G, eEF2 מה עושים הפקטורים?

Answer 17

EF-G בפרוקריוטים, eEF2 באיוקריוטים

פירטה רק על פרויקריוטים אני מניחה שזה אותו דבר לשניהם

וההידרוליזה GTP נכנס לריבוזום קשור ב EF-G

היא זו שמספקת את האנרגיה לטרנסלוקציה GDP שלו ל:

1. תזוזה של תת היחידה הגדולה
2. E-site עובר ל P-site שהיה ב tRNA ה
3. P-site עובר ל A-site שהיה ב tRNA ה

Question 18

מהי סך האנרגיה שמושקעת באלונגציה ולפי איזה סדר?

Answer 18

1 ATP, 2 GTP

ATP- tRNA נדרש בצימוד חומצה אמינית ל

GTP- tRNA שמביא את ה EF-Tu/eEF1 דרוש ל

ומוודא שהוא מתאים

GTP- שמזיז את הריבוזום ואת EF-G/eEF2 דרוש ל

שלב אחד קדימה tRNA מולקולות ה

Question 19

בריבוזום Exit tunnel מהי ה?

Nascent chain מהי ה?

Answer 19

מנהרה הידרופובית שבה השרשרת הפפטידית שנוצרת בריבוזום נדחפת החוצה.

23S מחלק הנקרא rRNA המנהרה עשויה מ

L4, L22 החלבונים המשתתפים בתעלה הם

התעלה צרה וככה החלבונים נשארים לינאריים, זה מונע יצירת קשרים לא נכונים לפני היכולת של החלבון להתקפל מחוץ לריבוזום.

Nascent chain- החלבונים שיוצאים מהתעלה

Question 20

RBS- shine delgarno מהו הרצף?

Answer 20

רצף שנמצא בפרוקריוטים.

start codon ל upstream רצף שנמצא

מתריע על כך שקודון ההתחלה עומד להגיע.

Question 21

של פרוקריוטים לעומת איוקריוטים mRMA מה מאפיין ?

Answer 21

פרוקריוטים- פוליציסטרוני, כמה מסגרות קריאה שעולות אחת על השניה, מקודדים לכמה חלבונים.

איוקריוטים- מונו ציסטרוני.

Question 22

מה ייחודי באיניציאציה של פרוקריוטים שלא יכול לקרות באיוקריוטים בגלל הסידור התאי השונה?

Answer 22

בגלל שבפרוקריוטים אין הפרדה של איזורים בתוך התא, שעתוק ותרגום יכולים להתרחש בו זמנית.

Question 23

מהו מהלך האיניציאציה בפרוקריוטים ומהם פקטורי האיניציאציה שמשתתפים בתהליך?

Answer 23

ובשיתוף תת היחידה IF3 פקטור איניציאציה בשם

mRNA הקטנה של הריבוזום קושרים את ה

RBS- shine delgarno באיזור של ה.

IF1/IF2* לאחר הקשירה מגיעים הפקטורים

שמביאים איתם פורמיל מתיונין (החומצה האמינית

(של הפרוקריוטים start codon שמתאימה ל

,GTP יש זיווג בסיסים, הידרוליזה של

פקטורי האיניציאציה מתנתקים, מצטרפת תת היחידה הגדולה ויש מעבר לאלונגציה.

_{* אם הבנתי נכון כל פקטור לקודון שונה, והתפקיד שלהם זהה}

Question 24

eIF4F מהו הקומפלקס?

Answer 24

באיוקריוטים mRNAשל הCAP מה

eIF4F- cap binding complex נוצר

eIF4E-CAP קושר את ה

eIF4G- מחבר את החלבונים של הקומפלקס

eIF4A- הליקאז, פותח קשרים שלא אמורים להיווצר

ATP בשרשרת תוך השקעת

_{מבפנים החוצה AGE לזכור שהפקטורים הם}

Question 25

ternary complex מהו ה?

מהו הפקטור החשוב בו שנלמד בהרצאה??

Answer 25

באיניציאציה באיוקריוטים, בתמונה הכתום.

קומפלקס שנוצר בתחילת האיניציאציה, מכיל את תת היחידה של הריבוזום, מתיונין שמתאים לקודום ההתחלה ועוד.

eIF2a* פקטור חשוב שמסייע לבניית הקומפלקס הוא

start codon שמתאים ל iMET-tRNA רנא עם מתיונין

GTP שקשור ל eIF2a ה start codon לאחר זיהוי של

עובר הידרוליזה ומשתחרר, לאחר מכן תת היחידה הגדולה מצטרפת.

_*a=alpha

Question 26

סיכום איניציאציה באיוקריוטים

Answer 26

Question 27

באיוקריוטים shine delgarno מהו המקביל ל?

Answer 27

kosak רצף מועדף של בסיסים הנקרא

start codon- AUG ונמצא לפני ואחרי ה