חלק ראשון Flashcards

1
Q

מיהם הבסיסים הפורינים?

A

שתי טבעות

AG

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מיהם הבסיסים הפירמידינים?

A

טבעת אחת

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

A מיהו הנוקלאוטיד

A

אדנין

ההבדל מגואנין-

NH2 יש לו סיום

(קשור לפחמן 6)

(חלק מהפורינים)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

G מיהו הנוקלאוטיד

A

גואנין

חלק מהפורינים (שתי טבעות),

מאפיין ייחודי מאדנין-

O קשר כפול ל

בפחמן 6.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

U מיהו הנוקלאוטיד?

A

אורציל

פירמידין (טבעת אחת)

מאפיין ייחודי- שני קשרים כפולים עם O

מחוץ לטבעת

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

T מיהו הנוקלאוטיד?

A

טימין

פירמידין (טבעת אחת)

מאפיין ייחודי- שני קשרים כפולים עם O

מחוץ לטבעת כמו אורציל- בנוסף לזה מה שמבדיל אותו זה קשר למתיל חיצוני

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

C מיהו הנוקלאוטיד?

A

ציטוזין

פירמידין (טבעת אחת)

O מאפיין ייחודי- קשר חיצוני כפול אחד עם

NH2 קשר חיצוני ל

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה מצא צרגף?

A

כמויות נוקלאוטידים בדנא

גילה שבכל היצורים החיים היחס בין פורין לפירמידין הוא מאוד דומה ל-1

באמצעות הידע הזה ווטסון וקריק הבינו את ההתאמה בין הנוקלאוטידים

AT

GC

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

באיזה כיוון קוראים גדיל דנא?

A

קצה 5 לקצה 3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

איזה נוקלאוטיד יש ברנא ואין בדנא

A

U

(במקום T)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

למה הרנא פחות יציב מהדנא?

A

כי הוא חד גדילי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

ממה נבדל הרנא מהדנא?

A

ברנא יש הידרוקסיל על פחמן 2 בסוכר

ולכן הוא נקרא ריבוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מה יקרה לרנא בסביבה בסיסית?

A

יתפרק (הדנא לא יתפרק)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

איפה נמצא הרנא ואיפה נמצא הדנא בתא?

A

דנא יהיה ממוקם בגרעין

רנא מיוצר בגרעין ועובר להתמקם בציטופלזמה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מהם תפקידי הרנא?

A

נשא ומעביר של הקוד הגנטי של הדנא

תפקיד בייצור חלבונים (בניית ריבוזום, נשא של חומצאות אמינו, תרגום)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

mRNA מהו ה

A

Messenger RNA

מולקולה מתווכת

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

טבלה מסכמת הבדלים RNA DNA

גדילים, בסיסים, התחברות בסיסים, סוג סוכר, מיקום במולקולה, תפקיד

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

מה ההבדל בדנא בין שמרים לבני אדם?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

כמה נוקלאוטידים יש בדנא באנושי וכמה מתוכם מקודד לחלבונים?

A

כ-3 מיליארד

1.5% מקודד

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

מהם גנים פסאודוגנים..?

A

מקטע דנא שאינו פעיל ואינו מתורגם לחלבון של ממש. אזורים ששוכפלו במהלך האבולוציה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

מהו הטלומר?

A

נמצא בקצה הכרומוזום, צריך להיות מוגן כדי שלא יהיו קצוות חשופים של הדנא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מהו הכרומטין?

A

הדרך לסדר דנא

1/3 ממנו הוא דנא

1/3 ממנו הוא חלבונים הסטונים

1/3 ממנו הוא חלבונים אחרים שחשובים לאריזה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

מהם ההיסטונים?

A

חלבון שמורכב מארבעה סוגי חלבונים

H2A, H2B, H3, H4

כל חלבון מופיע פעמיים כך שיש אוקטמר בסוף

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

מהם ההיסטונים של הדנא?

A

H2A

H2B

H3

H4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

ממה ההיסטונים מורכבים בעיקר?

A

חומצות האמינו ליזין וארגנין

לכן יש להם מטען חיובי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

למה חשוב שההיסטונים יהיו חיוביים?

A

כי המטען של הדנא הוא שלילי (בגלל הפוספאט) ולכן חשוב שההיסטונים יהיו חיוביים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Linker DNA מהו ה

למה הוא חשוב ומה הוא מאפשר

A

מקטע דנא חשוף בין שני נוקליאוזום

באמצעותו יש דינאמיות לגנום כך שיוכל לעבור שעתוק או לשמש כאיזור בקרה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q
A

א

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

מה מבדיל בין ההסטונים?

A

N הקצה ה

טרמינלי

השערות הצהובות באיור

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

מהם שלבי הסידור של האוקטומר שמחזיק את הדנא?

A

H3 ל H4 נוצר דימר בין

שני דימרים כאלו מתחברים ויוצרים טטראמר

H2A ל H2B נוצר דימר בין

שני דימרים כאלו מתחברים לטטראמר הקיים כדי ליצור אוקטומר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

מהו ההיסטון H1?

A

פחות שמור מיתר הסוגים

פחות קושר דנא

יותר קושר חלבונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

מהו תפקיד ההיסטונים?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Heterochromatin מהו ה

A

האזור הדחוס בכרומוזום

לא עובר שעתוק

הצנטרומר והטלומר הם הטרוכרומטין

רק 10% מהדנא הוא במצב הטרוכרומטרין

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Euchromatin מהו ה

A

האיזור הפחות דחוס שעובר שעתוק בכרומוזום

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Chromatin Remodeling Proteins מהם ה

A

חלבונים שמעורבים בהחלפת היחידות הפנימיות של הנוקליאוזום בהתאם לצרכי התא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Histone Chaperones מהם

A

משתמשים בהם כשרוצים לשחלף תת יחידות של הסטונים בהתאם לתפקוד הנדרש באותו רגע, נעשה ע”י שימוש ב

ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

H1 מהן התכונות של ההיסטון ?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

מהן התכונות של ההיסטונים של הנוקלאזום?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

מה עושה מתילציה לשעתוק ומה עושה אצטילציה לשעתוק?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

על מה המודיפיקציות שההיסטונים עוברים יכולות להשפיע בתא?

ולמה יש מודיפיקציות בעיקר על ליזינים?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q
A

6

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q
A

4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q
A

ה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q
A

ג

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q
A

ב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

Exonuclease מהם ה

אקסונוקלאזות

A

יודעים לחתוך בסיסים בודדים בדנא, לא ספציפיים לרצפי בסיסים מסויימים, מעכלים מהקצה כלפי פנים

(לא יודעים לחתוך באמצע

מכאן נובא שלא יחתכו פלסמיד)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

מתי האקסונוקלאזות יהיו פעילים?

A

סינתזת דנא, שבר דנא, הגנה לחיידק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

איזה סוגי חיתוך נוקלאז עושה?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

Readers & writers מהם ה

A

בגדול- עובדים יחד כדי להפיץ מודיפיקציות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

reader & writer מתי התהליך של ה

נפסק

A

כאשר יש רצף בסיסים בדנא שמונע דחיסה באיזור מסויים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

מה זה הטרוכרומטין ויו-כרומטין?

A

דחוס- עם הסטונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
52
Q
A

ג

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
53
Q
A

א

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
54
Q

איך אפשר להשפיע על ביטוי של גן

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
55
Q

מהם האנדוקלונאזות?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
56
Q

אילו אנדוקלונאזות (אנזימי קיטוע) משאירים קצוות דביקים בדנא?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
57
Q
A

ג

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
58
Q

blunt ends מה ההבדל בין חיתוך בשיטת

sticky ends ל

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
59
Q
A

ב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
60
Q

מה עושה דנא ליגאז?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
61
Q
A

א

מה הקשר קשר מימני

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
62
Q
A

ב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
63
Q

מהם התאים- סומטי, נבט, זוויג (גמטה)

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
64
Q

האם שכפול דנא מתרחש רק לצד אחד מהמקור?

A

לא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
65
Q

Leading איפה יהיה ה

Lagging ואיפה יהיה ה

במזלג ההכפלה הבא?

(ארבעה מקטעים)

A

הבנייה עצמה היא מ-5 ל-3

אבל!! בונים הפוך הרי, קצה 5 של גדיל הבניה הוא קצה 3 של הגדיל שבונים עליו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
66
Q
A

ד

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
67
Q

מה עושה האנזים דנא פולימראז?

A

שכפול דנא

אבל הוא לא יודע להתחיל ביצירת גדיל חדש ולכן הוא צריך מקטע התחלתי- פריימר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
68
Q

מהו פריימר?

A

RNA רצף של 20 בסיסים

מספק לאנזים פולמיראז נקודת התחלה בשכפול ליצירת הגדיל החדש

יש הרבה פריימרים בכל נק שכפול כפי שניתן לראות בתמונה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
69
Q

איך האנזים פולימראז מתקן את עצמו?

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
70
Q

האם האנזים פולימראז עושה מעט או הרבה שגיאות?

מה קצב הפעילות שלו.?

A

מעט (1 ל100)

איטי (80 נוקלאוטידים בשניה)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
71
Q
A

ג

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
72
Q

מה עושה האנזים הליקאז?

A

פורם את המבנה הדו גדילי של הדנא ע”י הידרוליזה של

ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
73
Q
A

ג

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
74
Q
A

ג

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
75
Q
A

ג

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
76
Q
A

ד

77
Q

איזה היסטונים משתחררים כשמזלג ההכפלה מתקדם?

A

H2B, H2A

78
Q

Topoisomerase 1 מהו

טופואיזומראז 1

A

משחרר את המתח בדנא בשכפול (במזלג ההכפלה), הוא מפרק את הקשר הפוספודיאסטרי בין שני בסיסים (יוצר ניק) , הסלילים מסתובבים סביב עצמם קשי לשחרר את המתח. הריאקציה הפיכה והקשר הופופדיאסטרי בין שני הנוקלאוטידים יכול להיווצר מחדש באופן ספונטני

79
Q
A

ב

80
Q
A

ד

81
Q

Topoisomerase 2 מה עושה ?

טופואיזומרז 2

A

פותח פלונטרים בעייתים (שלא בשגרה) שנוצרים בדנא

82
Q

SSB מהם?

Single strand binding proteins

A

שההליקאז פותח את הדנא כלולים להיווצר קשרי מימן בין בסיסים שלא חייבים להיות סמוכים זה לזה , זה מאט את פעילות האנזים פולימראז והשכפול.

SSB ה

פורסים את הדנא החד גדילי .

lagging strand יותר נפוץ ב

leading strand מאשר ב.

83
Q
A

א

84
Q

DNA Ligase מה עושה?

דנא ליגאז

A

NICK אנזים שמחבר

85
Q

Processivity מהי?

פרוססיביות

A

מתאר כמה נוקלואטידים מוסיף הפולימראז עד שנמאס לו וישתחרר מהדנא

86
Q

מהו דנא פולימראז 2?

פרוקריוטים

A

עושה תיקוני חירום בהגהה של הדנא

87
Q
A

ד

88
Q
A

א

89
Q

מה עושה דנא פולימראז 1?

פרוקריוטים

A

יכול להחזיק 200 בסיסים בשכפול עד שהוא נופל

Lagging strand זה טוב ל

Leading strand אבל לא ל

90
Q

מה עושה דנא פולימראז 3?

פרוקריוטים

A

הפולימראז האמיתי שמבצע את עבודת השכפול בתא, המהירות שלו היא בערך 2000 נוקלאוטידים לשניה.

יש לו פרוססיביות טובה- הוא עובר 500,000 בסיסים לפני שהוא חושב להתנתק.

Leading strand עובד בעיקר ב

הבעיה בו שהוא לא יודע להאריך את שרשראות הפריימר ולכן פולימראז 1 מתחיל את ההארכה אחרי הפריימר ואז פולימראז 3 מחליף אותו

91
Q
A

ג

92
Q
A

ד

93
Q
A
94
Q

איך נקראים הדנא פולימרזים של האאוקריוטים?

A

במקום מספרים- אלפא, דלתא, אפסילון

95
Q

מהו דנא פולימרז אלפא?

A

באאוקריוטים-

היחיד שיודע לבצע הארכה אחרי הפריימר

96
Q

מה עושה דנא פולימרז דלתא?

A

הפולימרז שמסנתז (יוצר) את ה

lagging strand

97
Q

מה עושה דנא פולימרז אפסילון?

A

בעל פרוססיביות גבוהה (יכול לסנתז הרבה בסיסים ברצף) ולכן מסנתז את ה

Leading strand

98
Q

מה הקשר בין דנא פולימרז אלפא לדלתא לאפסילון?

A
99
Q

PCNA sliding clamp מהו ה?

A

טבעת שדוחפת את הפולימראז לאורך הדנא ומגדילה את הפרוססיביות שלו.

גם לפולימראז אפסילון וגם לפולימראז דלתא

100
Q

סיכום דנא פולימראז

A
101
Q

מה תפקיד הטלומרים?

מה הרצפים החוזרים מכילים בעיקר?

A

להגן על קצוות הכרומזום

C ו G עשיר ב

102
Q

מה עושה האנזים טלומראז?

Telomerase

A

מתקן בעיה שנוצרת באופן טבעי בהכפלה- קיצור הטלומר.

הוא מאריך את הטלומר מחדש ושומר על הכרומוזום שלא יתקצר עם החלוקות.

עושה זאת באמצעות מקטע של רנא שמשלים לרצפים שנמצאים בטלומר.

עושה הארכה מכיוון 5 לכיוון 3!

103
Q
A

ג

104
Q
A

ה

105
Q
A

א

106
Q
A

ב

107
Q

מה הקשר בין סרטן לאנזים טלומראז?

A
108
Q

PCR מה זה?

A

שיטה המשמשת לשכפול מזורז (אמפליקציה ) של מעט מקטעי דנא.

מרתיחים את הדנא כדי שייפרד לשני גדילים בודדים

מקררים ל56 מעלות

מערבבים עם סוג של אנזים פולימראז ב72 מעלות כדי שיסנתז את המקטע.

כל סבב כזה מכפיל את כמות הגדילים שהייתה בהתחלה, חוזרים על התהליך כמה שצריכים.

109
Q

לשים לב שסעיפים ג,ד התערבבו

A

ג

110
Q

מה ההבדל בין מוטציות בתאים מתחלקים למוטציות בתאים לא מתחלקים?

A
111
Q

מתי יווצרו יותר טעויות בשכפול אצל אאוקריוטים?

A

מצבי עקה, הפעילות של הפולימראז היא פחות טובה ויש יותר סיכוי למוטציות.

112
Q

מהם המנגנונים לתיקון DNA?

A
113
Q

MMR- Mismatch repair- מהו המנגנון?

A

מנגנון תיקום לפגם בגדיל בודד

מטרתו לתקן אי התאמת בסיסים שנוצרו במהלך שכפול דנא

הוא פועל על הגדיל המסונתז החדש ולא משפיע על הדנא המקורי

בפרוקריוטים:

MutS MutL MutH החלבונים

עובדים יחד כדי לתקן את הגדיל. מזהים את הטעות לפי מתילציה.

114
Q
A

ג

115
Q

Base excision repair מהו מנגנון?

A

תיקון מוטציות ספונטניות בהן הוסר בסיס אחד.

  1. C A U דה אמינציה, נעשה על בסיסים

( T לא נעשה על

NH3 אין בו אמין - )

  1. דה פורינציה- הסרה של פורין, A G
  2. דה- פירמידיניזציה- הסרה של פירמידין T C
  3. הוספה של קבוצות מתיל לבסיסים

בכולן מדובר על פגיעה בבסיס חנקני אחד של הדנא, ואז המים משלימים את הפעולה ומסירים את הבסיס.

116
Q
A

א

117
Q
A

ב

118
Q

סיכום

MMR vs Base excision repair

A
119
Q

Nucleotide excision repair מהו המנגנון?

A

תיקון מוטציות שנוצרות בדנא עקב חשיפה לאור השמש.

חשיפה לקרינה גורמת לשני הנוקולאוטידים הסמוכים להיקשר זה לזה בקשר קוולנטי וליצור דימר (בתמונה). גורם בסופו של דבר אם אין תיקון למלנומה.

ATP מנגנון התיקון עושה שימוש ב

ומתקן ע”י החלפת הבסיסים.

120
Q

Translation repair מהו המנגנון?

A

תיקון מוטציות בדנא עקב חשיפה לגורמים סביבתיים בעייתיים שיצרו בו מודיפיקציה (כימיקלים/ קרציונוגנים).

מתקן גדיל אחד.

121
Q

Cdks מהם ?

cyclin dependent kinases

A

חלבונים, נהיים פעילים אחרי שנקשרים אליהם חלבונים בשם

cyclin

משפעלים תהליכים בתא, נמצאים בעודף בכל התאים האאוקריוטים, מעורבים בוויסות שלבי מחזור התא.

122
Q

P53, P21 מה עושים?

A

P53- מפעיל את

P21.

עוצר את מחזור התא- P21

123
Q

מי הם האנזימים שמשתתפים בתיקון ניק?

nick

A
124
Q

מהם המנגנונים שיודעים לתקן נזקים דו גדיליים?

A
125
Q

nonhumologous end joining (NHEJ) מהו המנגנון?

A

מתקן שבר דו גדילי בעיקר תאים סומטיים,

מהיר אך גורם למוטציות,מדביק את שני חלקי הכרומוזום השבורים.

תוצרי לוואי: איבוד מידע גנטי, איבוד הרצף התקין, לעיתים אף איחוי בין שני גדילים מכרומוזומים שונים.

126
Q
A

ב

127
Q

Homologus recombination מהו המנגנון?

A

המנגנון נכנס לפעולה לאחר השכפול כאשר הכרומטידות האחיות נמצאות מספיק קרוב אחת לשניה, עושה שחלוף בין כרומוזומים הומולוגיים/ כרומטידות אחיות לצורך השלמת המקטע החסר.

משתמש בכרומוזומים התקינים לשחזור החלקים החסרים.

128
Q

Tumor suppressor gene מהו .?

A

גן שמונע חלוקה תאית סרטנית.

אם אין אותו יש סרטן.

129
Q

מהן שתי השיטות העיקריות לשינוי הגנום האנושי כך שתפקוד התא ישתנה?

A
130
Q

מה זה נוק אאוט ונוק אין של גנים.?

A

נוק אאוט- להנדס יצור שבו גן מסויים לא פעיל

NHEJ mediated repair נעשה באמצעות

נוק אין- תהליך של החדרת גן חליפי במקום זה שהשותק.

HDR mediated repair נעשה באמצעות

131
Q

באילו שתי מערכות משתמשים היום בשביל לערוך גנום ולהוציא מקטעים ממנו?

A

Tale nuclease

CRISPER nuclease

132
Q

TALEN מה עושה האנזים?

A

אנדוקלאז שחותך רצפים ספציפיים בדנא.

משמש לעריכת גנום.

133
Q

CRISPER מהי ה?

A

בקצרה- מערכת שבאמצעותה אפשר להנדס תאי גזע, עובדת על שני גדילים במקביל.

cas עושה זאת באמצעות שימוש בחלבוני.

134
Q
A

א

135
Q

מהן שתי האפשרויות של רנא שיוצא מהציטופלזמה?

A
  1. להישאר במקום שאליו הוא יצא ולהתחיל לעבור דיפוזיה ולהגיע לכל מיני מקומות בציטופלזמה
  2. להתפס ע”י מנגנון שמסיע אותו בצורה אקטיבית למקום שבו הוא נדרש.
136
Q

מושגים בסיסיים בשעתוק

A
137
Q

מה היתרון בכך שהפקטורים (של הרנא?) משתתפים בכל השלבים

A

תקשורת בין השלבים שונים, הביטוי הגנטי לא יעשה ע”י שלב מסויים אלא ע”י אינטראקציה של כל השלבים בינם לבין עצמם

138
Q

למה רק 50% ממולקולות רנא פולימרז מעורבות בשעתוק פעיל ולא 100%?

A

כי אם יהיה מיצוי מקסימלי לא תהיה אפרות להגביר שעתוק בהתאם לצורך מסויים. גם כדי שהרנא פולימראז שלא מחוברות יוכלו להחליף פולימראז שמתנתק

139
Q

במה רנא פולימרז של פרוקריוטים ואאוקריוטים דומה? במה הוא שונה?

A

דומה במבנה המרחבי

שונה בתתי היחידות (מבחינת הרצף)

140
Q

מהו השלב הראשון לשעתוק בפרוקריוטים?

A

אינטראקציה של הרנא פולימרז בעל יחידה הסיגמא עם הדנא.

הדנא נקשר לסיגמא 3- סיגמא 3 נקשרת לרנא פולימראז- אינטראקציה בין הרנא פולימראז לדנא.

מי שמנחה את הרנא פולימראז לאן להיקשר היא σ 3

141
Q

מה השלב השני לשעתוק בפרוקריוטים?

A

A-T בגלל שהקשרים

G-C חלשים יותר מ

הם נפתחים ספונטנית ונסגרים.

TATA BOX ישנם אזורי

A-T שמלאים בקשרי

ככה הרנא פולימראז יכול עם הסיגמא לתפוס באיזורים האלו.

נמצאים באיזור 10 ו 35 בסיסים לפני נקודת השעתוק.

142
Q

מהו השלב השלישי לשעתוק בפרוקריוטים?

A

הנוקלאוטידים נכנסים לאיזור השעתוק באופן אקראי- אך השהייה שלהם מושפעת מההתאמה לבסיס שנמצא באתר הפעיל של הדנא.

הבסיס הנכון נשאר מספיק זמן כדי לאפשר לקטליזטור (מגנזיום) לעשות את העבודה שלו וליצור קשר פוספודיאסטרי

143
Q

מהו השלב הרביעי בשעתוק בפרוקריוטים?

A

הסיגמא מלווה את הרנא עד הבסיס התשיעי, שם יש לשונית של הסיגמא. במידה והרנא שיכפל את הדנא כמו שצריך הוא יהיה מספיק חזק בשביל להוצי את הלשונית של סיגמא ולהמשיך את השעתוק. אם הייתה בו טעות אז הלשונית תעיף את הרנא. השעתוק יפסיק. כנראה שמשם יתחיל מחדש.

144
Q
A

ג

145
Q
A

ו

146
Q
A

ג

147
Q
A

ד

148
Q
A

א

149
Q
A

ו

150
Q
A

ה

151
Q

מה זה סיגמא 70?

A
152
Q

מה קוה בסיגמות של אי קולי?

A
153
Q
A

ד

154
Q

מה עושים פקטורי שעתוק.?

A

קובעים לאיזה פרומוטרים יגיע הרנא פולימראז, מתי ובאיזה עוצמבה הוא ישעתק.

155
Q

מה זה אופרון?

A
156
Q

מה היתרון בשימוש באופרון?

A
157
Q

repressor מה עושה?

A

חלבון דכאן, קשירה שלו אל הדנא מעכבת את השעתוק.

הרפרסור נקשר לאופרטור וחוסם לרנא פולימראז חלק מאתר הקשירה שלו כך שהוא לא יוכל לשעתק.

158
Q

למה אחיזה של שני פקטורים של דימר עדיפה מ-2 פקטורים שנקשרים כמונומק?

A
159
Q

cis element מה זה?

A

קטעים בדנא שאליהם נקשרים דברים

160
Q

RNA polymerase 2 מה עושה?

A

mRNA אחראי על שעתוק של

שמקודדים לחלבונים.

161
Q

מה ההבדל בין הפולימרז הפרוקריוטי לאאוקריוטי?

A
162
Q

Enhacher מה זה?

A

אלמנטים שעושים הגברה לשעתוק.

האלמנטים יכולים להיות מאוד רחוקים משני צידי הפרומוטור, ואפילו בתוך הגן עצמו, ועדיין להשפיע על תחילת השעתוק.

דבר זה מתאפשר בזכות קיפול הדנא (?)

(במבחן- גמישות הכרומטין בתנאי שאין חסמים מבניים)

163
Q
A

ב

164
Q

Cis regulatory element מהו ה?

A

גנים לא מקודדים שמבקרים שעתוק של גנים, אליהם נקשרים פקטורי השעתוק.

165
Q

Trans Regulatory elements מהם?

A

הגנים שמקודדים לפקטורי השעתוק עצמם?

166
Q

CTD מהו?

A

חלק ברנא פולימראז שאליו נקשרים חלבונים שקשורים בבקרת ביטוי גנטי ובקרת שעתוק.

מכיל רצף חוזר של 7 חומצות אמינו.

למשל:

  1. תהליך הקאפינג. (הוספת בסיסים של G)
  2. קישור של הספלייסוזום
167
Q
A

ג

168
Q
A

א+ב

169
Q

Transcription Activators מהם?

פקטורי שעתוק

A

חלבונים שמעודדים התחלה של שעתוק, מורכבים משני חלקים

  1. DNA Blinding Domation

אחראי לקישור של פקטור השעתוק אל הדנא.

  1. Activating Domain

איזור בחלבון שאחראי לאקטיבציית הגן.

שני הדומיינים האלו הכרחיים לביצוע שעתוק יעיל.

(- דומיין חלבוני- יחידת קיפול עצמאי- קיפולו מתרחש באופן עצמאי)

170
Q
A

ב+ג

171
Q
A

ג

172
Q
A

ב

173
Q

מה היתרון במצב בו יש מעכבים לאקטיבטורים לעומת מצב שבו פשוט לא נוצרים אקטיבטורים אם אין בהם צורך?

A

במצב בו יש מעכב לא צריך לייצר מחדש את האקטיבטור אלא פשוט לשחרר את המעכב.

174
Q

הטרוכרומטין יוכרומטין

A
175
Q

אילו מודיפיקציות יכולים לעבור זנבות של היסטונים?

A
176
Q

מה הקשר בין זנבות שעברו מודיפיקציה/ לא עברו מודיפירציה ליכולת ליצור אינטראקציה עם הדנא?

A
177
Q

מהי מטרת המודיפיקציות על ההסטונים?

A

לסמן לתא מה לעשות עם הדנא-

לדחוס/ לשחרר/ לתקן ועוד.

178
Q

מה היתרון במודיפיקציות על היסטונים (לעומת דנא נניח)?

A

מודיפיקציות על היסטונים הן הפיכות.

(לעומת הדנא שכל שינוי בו הוא קבוע)

179
Q

כמה מודיפיקציות בהיסטונים צריך כדי לגרום לשינוי בתא?

A

לא מספרי אבל- יותר מאחת, שינוי בתא נגרם ע”י מס רב של מודיפיקציות.

180
Q

מה קורה למודיפיקציות של ההיסטונים מדור לדור?

A
181
Q
A

ד

182
Q

FACT לאיזו משפחת חלבונים שייך?

מה תפקיד המשפחה?

A

Histone chaperone חלבונים שיודעים לעבור אינטראקציה עם נוקלאוזומים.

השפרונים עובדים לפני הרנא פולימראז, מסירים עבורו את המכשולים כדי שהוא יוכל להתקדם. לאחר שהוא מסיים את עבודתו השפרונים מחזירים את ההיסטונים חזרה לנוקלאוזום וכך לא לפגוע במבנה הנוקלאוזומלי המקורי של הגן.

חשוב מאוד לשמור את האינפורמציה שאיתו הכרומטין הגיע מלכתחילה

183
Q

Splicing מהו שחבור?

A

תהליך שקורה אחרי שנוצר הרנא הראשוני, הוא עובר עריכה והסרה של איזורים לא רלוונטיים שנוצרו בו ולאחר מכן חיבור מחדש של כל המקטעים שכן רלוונטיים.

mRNA בסוף תהליך השחור הוא ייקרא.

184
Q

מהם האקסונים?

A

החלקים מהדנא שנשארים ל

mRNA

185
Q

מהם אינטרונים?

A

מקטעים שלא צריכים להיות ב

mRNA

186
Q

Promotor- מהו?

A

רצף בקרה שמכתיב את נקודת תחילת השעתוק.

187
Q
A

ב

188
Q
A

ב

189
Q

Capping מהו תהליך ה

ברנא?

A

הוספת בסיסים לקצוות במטרה לייצב את הרנא כך שישרוד עד לסיום התרגום שלו.

בקצה 5 מוסיפים לו 7 נוקלואוטידים של G.

בקצה 3 מוסיפים לו 200-250 נוקלאוטידי של A

(Poly A נקרא גם)