חלק ראשון Flashcards
מיהם הבסיסים הפורינים?
שתי טבעות
AG
מיהם הבסיסים הפירמידינים?
טבעת אחת
A מיהו הנוקלאוטיד
אדנין
ההבדל מגואנין-
NH2 יש לו סיום
(קשור לפחמן 6)
(חלק מהפורינים)
G מיהו הנוקלאוטיד
גואנין
חלק מהפורינים (שתי טבעות),
מאפיין ייחודי מאדנין-
O קשר כפול ל
בפחמן 6.
U מיהו הנוקלאוטיד?
אורציל
פירמידין (טבעת אחת)
מאפיין ייחודי- שני קשרים כפולים עם O
מחוץ לטבעת
T מיהו הנוקלאוטיד?
טימין
פירמידין (טבעת אחת)
מאפיין ייחודי- שני קשרים כפולים עם O
מחוץ לטבעת כמו אורציל- בנוסף לזה מה שמבדיל אותו זה קשר למתיל חיצוני
C מיהו הנוקלאוטיד?
ציטוזין
פירמידין (טבעת אחת)
O מאפיין ייחודי- קשר חיצוני כפול אחד עם
NH2 קשר חיצוני ל
מה מצא צרגף?
כמויות נוקלאוטידים בדנא
גילה שבכל היצורים החיים היחס בין פורין לפירמידין הוא מאוד דומה ל-1
באמצעות הידע הזה ווטסון וקריק הבינו את ההתאמה בין הנוקלאוטידים
AT
GC
באיזה כיוון קוראים גדיל דנא?
קצה 5 לקצה 3
איזה נוקלאוטיד יש ברנא ואין בדנא
U
(במקום T)
למה הרנא פחות יציב מהדנא?
כי הוא חד גדילי
ממה נבדל הרנא מהדנא?
ברנא יש הידרוקסיל על פחמן 2 בסוכר
ולכן הוא נקרא ריבוז
מה יקרה לרנא בסביבה בסיסית?
יתפרק (הדנא לא יתפרק)
איפה נמצא הרנא ואיפה נמצא הדנא בתא?
דנא יהיה ממוקם בגרעין
רנא מיוצר בגרעין ועובר להתמקם בציטופלזמה
מהם תפקידי הרנא?
נשא ומעביר של הקוד הגנטי של הדנא
תפקיד בייצור חלבונים (בניית ריבוזום, נשא של חומצאות אמינו, תרגום)
mRNA מהו ה
Messenger RNA
מולקולה מתווכת
טבלה מסכמת הבדלים RNA DNA
גדילים, בסיסים, התחברות בסיסים, סוג סוכר, מיקום במולקולה, תפקיד
מה ההבדל בדנא בין שמרים לבני אדם?
כמה נוקלאוטידים יש בדנא באנושי וכמה מתוכם מקודד לחלבונים?
כ-3 מיליארד
1.5% מקודד
מהם גנים פסאודוגנים..?
מקטע דנא שאינו פעיל ואינו מתורגם לחלבון של ממש. אזורים ששוכפלו במהלך האבולוציה
מהו הטלומר?
נמצא בקצה הכרומוזום, צריך להיות מוגן כדי שלא יהיו קצוות חשופים של הדנא
מהו הכרומטין?
הדרך לסדר דנא
1/3 ממנו הוא דנא
1/3 ממנו הוא חלבונים הסטונים
1/3 ממנו הוא חלבונים אחרים שחשובים לאריזה
מהם ההיסטונים?
חלבון שמורכב מארבעה סוגי חלבונים
H2A, H2B, H3, H4
כל חלבון מופיע פעמיים כך שיש אוקטמר בסוף
מהם ההיסטונים של הדנא?
H2A
H2B
H3
H4
ממה ההיסטונים מורכבים בעיקר?
חומצות האמינו ליזין וארגנין
לכן יש להם מטען חיובי
למה חשוב שההיסטונים יהיו חיוביים?
כי המטען של הדנא הוא שלילי (בגלל הפוספאט) ולכן חשוב שההיסטונים יהיו חיוביים
Linker DNA מהו ה
למה הוא חשוב ומה הוא מאפשר
מקטע דנא חשוף בין שני נוקליאוזום
באמצעותו יש דינאמיות לגנום כך שיוכל לעבור שעתוק או לשמש כאיזור בקרה
א
מה מבדיל בין ההסטונים?
N הקצה ה
טרמינלי
השערות הצהובות באיור
מהם שלבי הסידור של האוקטומר שמחזיק את הדנא?
H3 ל H4 נוצר דימר בין
שני דימרים כאלו מתחברים ויוצרים טטראמר
H2A ל H2B נוצר דימר בין
שני דימרים כאלו מתחברים לטטראמר הקיים כדי ליצור אוקטומר
מהו ההיסטון H1?
פחות שמור מיתר הסוגים
פחות קושר דנא
יותר קושר חלבונים
מהו תפקיד ההיסטונים?
Heterochromatin מהו ה
האזור הדחוס בכרומוזום
לא עובר שעתוק
הצנטרומר והטלומר הם הטרוכרומטין
רק 10% מהדנא הוא במצב הטרוכרומטרין
Euchromatin מהו ה
האיזור הפחות דחוס שעובר שעתוק בכרומוזום
Chromatin Remodeling Proteins מהם ה
חלבונים שמעורבים בהחלפת היחידות הפנימיות של הנוקליאוזום בהתאם לצרכי התא
Histone Chaperones מהם
משתמשים בהם כשרוצים לשחלף תת יחידות של הסטונים בהתאם לתפקוד הנדרש באותו רגע, נעשה ע”י שימוש ב
ATP
H1 מהן התכונות של ההיסטון ?
מהן התכונות של ההיסטונים של הנוקלאזום?
מה עושה מתילציה לשעתוק ומה עושה אצטילציה לשעתוק?
על מה המודיפיקציות שההיסטונים עוברים יכולות להשפיע בתא?
ולמה יש מודיפיקציות בעיקר על ליזינים?
6
4
ה
ג
ב
Exonuclease מהם ה
אקסונוקלאזות
יודעים לחתוך בסיסים בודדים בדנא, לא ספציפיים לרצפי בסיסים מסויימים, מעכלים מהקצה כלפי פנים
(לא יודעים לחתוך באמצע
מכאן נובא שלא יחתכו פלסמיד)
מתי האקסונוקלאזות יהיו פעילים?
סינתזת דנא, שבר דנא, הגנה לחיידק
איזה סוגי חיתוך נוקלאז עושה?
Readers & writers מהם ה
בגדול- עובדים יחד כדי להפיץ מודיפיקציות
reader & writer מתי התהליך של ה
נפסק
כאשר יש רצף בסיסים בדנא שמונע דחיסה באיזור מסויים
מה זה הטרוכרומטין ויו-כרומטין?
דחוס- עם הסטונים
ג
א
איך אפשר להשפיע על ביטוי של גן
מהם האנדוקלונאזות?
אילו אנדוקלונאזות (אנזימי קיטוע) משאירים קצוות דביקים בדנא?
ג
blunt ends מה ההבדל בין חיתוך בשיטת
sticky ends ל
ב
מה עושה דנא ליגאז?
א
מה הקשר קשר מימני
ב
מהם התאים- סומטי, נבט, זוויג (גמטה)
האם שכפול דנא מתרחש רק לצד אחד מהמקור?
לא
Leading איפה יהיה ה
Lagging ואיפה יהיה ה
במזלג ההכפלה הבא?
(ארבעה מקטעים)
הבנייה עצמה היא מ-5 ל-3
אבל!! בונים הפוך הרי, קצה 5 של גדיל הבניה הוא קצה 3 של הגדיל שבונים עליו
ד
מה עושה האנזים דנא פולימראז?
שכפול דנא
אבל הוא לא יודע להתחיל ביצירת גדיל חדש ולכן הוא צריך מקטע התחלתי- פריימר
מהו פריימר?
RNA רצף של 20 בסיסים
מספק לאנזים פולמיראז נקודת התחלה בשכפול ליצירת הגדיל החדש
יש הרבה פריימרים בכל נק שכפול כפי שניתן לראות בתמונה
איך האנזים פולימראז מתקן את עצמו?
האם האנזים פולימראז עושה מעט או הרבה שגיאות?
מה קצב הפעילות שלו.?
מעט (1 ל100)
איטי (80 נוקלאוטידים בשניה)
ג
מה עושה האנזים הליקאז?
פורם את המבנה הדו גדילי של הדנא ע”י הידרוליזה של
ATP
ג
ג
ג