שיעור 2

Question 1

החוק השני של התרמודינמיקה

Answer 1

האנטרופיה (אי סדר) במערכת תמיד נוטה לגדול ושואפת להגיע לערכה המקסימלי

Question 2

האפקט ההידרופובי

Answer 2

תכונה של מולקולות לא פולריות להתארגן יחד כצבר, במקום שכלוב מים יקיף כל מולקולה בנפרד.

Question 3

האפקט ההידרופובי בממברנות

Answer 3

• ראש פולרי וזנב הידרופובי
• מסביב לאיזור ההידרופובי ייווצר כלוב מסודר. בגלל האפקט ההידרופובי כל המולקולות האלו יסתדרו יחד וייצרו את הממברנה.

Question 4

האפקט ההידרופובי בחלבונים

Answer 4

החלבונים מורכבים משרשראות של חומצות אמינו שמתקפלות למבנה תלת מימדי מוגדר. אחד הכוחות שדוחפים ומקפלים את חומצות האמינו קשור בדחיפת האיזורים ההידרופוביים של חומצות האמינו.

Question 5

מהן הסביבות בהן מתרחשות תגובות ביוכימיות?

Answer 5

1. בעיקר מים
2. ממברנות

Question 6

חומצות ובסיסים כתורמים ומקבלים

Answer 6

חומצות תורמות פרוטונים ובסיסים מקבלים פרוטונים

Question 7

טיטור

Answer 7

שיטה לקביעת הריכוז של חומרים שונים בתמיסה

Question 8

עקומת טיטרציה

Answer 8

• גרף המציג את ריכוז אחד החומרים (או מצד אחר בתמיסת הנעלם) כנגד כמות הטיטרנט המוסף.
• נקודת הפיתול בגרף היא ה-pKa

Question 9

מה חשיבות נקודות הפיתול בעקומת טיטרציה?

Answer 9

בסביבתן השינוי ב-pH לא משתנה יותר מדי (בניגוד לקצוות שעולים מאוד מהר)

Question 10

דרגות המבנים של החלבונים

Answer 10

1. מבנה ראשוני - שרשרת חומצות האמינו. לכל סוג חלבון יש שרשרת האופיינית לו. הרצף הזה קובע את כל המבנים שייתקבלו בדרגות הבאות.
2. מבנה שניוני - איזושהי תבנית שחוזרת על עצמה, אך לא המבנה המלא של החלבון.
3. מבנה שלישוני - צירוף של המבנים השניוניים ליצירת מבנה מוגדר, שבדרך כלל עובד בפני עצמו.
4. מבנה רביעוני - מספר שרשראות שיוצרות מבנה אחד תלת מימדי.

• מבנה החלבון קובע את הפונקציה שלו.

Question 11

מבנה ראשוני של חלבון

Answer 11

שרשרת חומצות האמינו. לכל סוג חלבון יש שרשרת האופיינית לו. הרצף הזה קובע את כל המבנים שייתקבלו בדרגות הבאות.

Question 12

מבנה שניוני של חלבון

Answer 12

איזושהי תבנית שחוזרת על עצמה, אך לא המבנה המלא של החלבון.

Question 13

מבנה שלישוני של חלבון

Answer 13

צירוף של המבנים השניוניים ליצירת מבנה מוגדר, שבדרך כלל עובד בפני עצמו.

Question 14

מבנה רביעוני של חלבון

Answer 14

מספר שרשראות שיוצרות מבנה אחד תלת מימדי.

Question 15

מבנה חומצות אמינו אלפא

Answer 15

• הפחמן באמצע נקרא סי אלפא
• ב-3 הצדדים האחרים יש צד קרבוקסילי, מימן ושרשרת צד R
• שרשרת הצד היא זו שמשתנה ומגדירה את סוג החומצה האמינית

Question 16

אננטיומרים של חומצות אמינו

Answer 16

• חומצות אמינו הן כירליות (בגלל שיש פחמן שקשור ל-4 קבוצות שונות).
• כל חומצות האמינו הביולוגיות הן L.
• ריבוזום יכול ליצור שרשראות חלבונים רק עם חומצות אמינו L.

Question 17

איזה אננטיומר של חומצה אמינית יכול לשמש כתפקיד בתפקודים ביולוגיים?

Answer 17

רק חומצות אמינו L.

Question 18

צוויצריון

Answer 18

• מצב בו יש ליון גם + וגם -
• כל חומצות האמינו הן צוויצריון

Question 19

איך תיראה עקומת טיטרציה של חומצת אמינו?

Answer 19

• יהיו 2 נקודות פיתול - אחת ב-pKa של הצד הקרבוקסילי (+) ואחת ב-pKa של הצד האמיני (-)
• המטען של חומצת האמינו יהיה 0 בדיוק באמצע בין נקודות הפיתול. נקרא גם pI

Question 20

מתי מטען של חומצת אמינו יהיה ניטרלי?

Answer 20

• בדיוק בין 2 נקודות הפיתול
• נקרא pI