הרצאה 2 מבנה הנוקלאוזום Flashcards
מה כולל הנוקלאוזום קור כמה בסיסי דנא יוצרים כמה ליפופים ואיזה צורה יוצרים היסטוני הליבה
145-147 בסיסי דנא שעטופים 1.65 פעמים סביב אוקטמר ההיסטונים
מה כולל הנוקלאוזום 2 מרכיבים
- לינקר דנא 2. נוקלאוזום קור (147 בסיסים מלופפים 1.65 פעם על אוקטמר היסטונים)
מה כולל כרומטוזום כמה בסיסי דנא סהכ כלולים בו
היסטון H1 + נוקלאוזום 167 בסיסי דנא סהכ כלולים בו
האם היסטון H1 נחשב לחלק מהנוקלאוזום
לא!!!!! הוא חלק מהכרומטוזום
האם לינקר דנא הוא חלק מהנוקלאוזום
כן!! אבל לא חלק מחלקיקי הליבה שלו שכוללים רק את הדנא המלופף על אוקטמר ההיסטונים
היסטונים הם חלבונים קטנים וחומציים/בסיסיים
בסיסיים מכילים הרבה חא בסיסיות !
מהם ארבעת היסטוני הליבה
H3 H4 H2A H2B
מהו הלינקר היסטון
H1 ולפעמים H5 שהוא אנלוג לH1 בחיות אחרות
מהו H5
לינקר היסטון אנלוג לH1 בחיות מסוימות
אלו היסטונים מבוטאים רק בזמן חלוקה? מהם שלושת השמות שלהם? מתי הם מסונתזים?
Replication dependent histone Major histon Canonical histone מסונתזים רק בזמן חלוקת התא
מתי מסונתזים הוריאנטים של ההיסטונים והאם הם תלויים בחלוקה
לא תלויים בחלוקה. מבוטאים במצבים ספצפים ברקמות ספציפיות או בשלבים מסוימים בחיים
מהו מוטיב ה Histone fold ובאיזה היסטונים נמצא אותו? מה תפקידו, מקשר בין מי למי כמה חא הוא מכיל מה מיוחד בקצוות שלו
בהיסטונים קנוניקלים/רפליקטיבים/עיקריים אלפא-טרן-אלפא-טרן-אלפא a1-L1-a2-L2-a3 מוטיב חוזר שאחרי על הקישור בתוך האוקטמר בין ההטרודימרים שמרכיבים אותו והוא מכיל 70 חא בקצוות יש זנבות שמאפשרים יציבות ואינטראקציה עם כרומוזומים שכנים וגם נתונים להמון מודיפיקציות
כמה חא יש בהיסטונים הרפליקטיבים
102-135
איפה הקצה הקרבוקסילי והאמיני
מבין ארבעת היסטוני הליבה. למי השייר האן טרמינלי והסי טרמינלי הארוך ביותר
במוטיב ההיסטון, הסלילים הקצרחם
a1a3
נמצאים בציס/טרנס להליקס המרכזי?
ציס
בהיווצרות הטרודימר
א. אלו מרכיבים במוטיב ההיסטון מתחברים זה לזה?
ב.האם נוצר מבנה סימטרי
ג. היכן יהיה הצד הN טרמינלי
ד. היכן יהיה הצד שיגיב עם הדנא
ה. היכן יהיה הצד שיהווה חלק מליבת האוקטמר המתהווה
א.לופ1 מהיסטון מסוים יתחבר עם לופ2 בהיסטון השני
היווצרות האוקטמר של היסטונ הליבה
א. אלו 2 סוגי הטרודימרים יוצרים אותו
ב. מי נוצר קודם
ג. דרך מי נעשים החיבורים
שני תפקידים עיקריים של זנבות ההיסטונים
למה משמש קצה aN
של היסטון H3
“סדרן” לדנא
עוזר להחזיק את הדנא באתר היציאה והכניסה מהנוקלאוזום שנקרא dyad
למה משמש הקצה הסי טרמינלי של היסטון
H2B
בעיקר עוזר לעיצוב מבנה האוקטמר
מהו אזור הדיאדה
אזור היציאה והכניסה של הדנא מנוקלאוזום שמוחזק על ידי הקמה הN טרמינלי של
H3
א. אינטראקציות בין ההיסטונים לדנא הן ספציפיות/ לא ספציפיות
ב. האינטראקציות הללו כוללות בעיקר קשרים מסוג ….. והן מתקיימות בין ההיסטונים לביו….. בגרוב ה….,
ג. האם יש הכרח לרצף מסוים על מנת שיווצר קישור או העדפה לבסיסים מסוימים
א. לא ספציפיות
ב. קשרי מימן ואינטראקציות יוניות בין ההיסטונים ועמוד השדרה הפוספודיאסטרי של הדנא במיינור גרוב
היסטונים קטנים וחמודים במיינור
ג. אין הכרח לרצף ספציפי יש העדפה ל
Ta כמו טייני למיינור גרוב.
GC
כמו גדול למייגור גרוב
א. הדנא שמקיף את ליבת הנוקלאוזום טעון במטען….
ב. איזה אזור בליבת הנוקלאוזום חשוב להארגנות הכרומטין ולדחיסה שלו וכיצד הוא תורם לזה
א. טעון שלילית
ב.
ACIDIC PATCH
נמצא על כל דימר של H2AH2B
תורם לדחיסת כרומטין על ידי היקשרות לזנבות האין טרמינלים של היסטון H4
בא לדייט עם פאוץ זה מאד שלילי,חשב שנגיע לשלב שתיים, מייד אני אומרת אין מצב תחזור לאמא על ארבע
מהו האסידיק פאטץ והיכן הוא נמצא
מוטיב שנמצא על כל דימר של
H2AH2B
טעון שלילי ומשמש כאתר היקשרות לחלבונים ואנזימים שמשפיעים על התארגנות הכרומטין.
יש אנטיביוטיקות שפועלות באתר הזה כיוון שיש לו השפעה על פעילות כימית וביוכימית
א.מבנה הנוקלאוזום שמור או לא שמור באבולוציה
ב. מהן 3 הרמות בהן מבנה הדיסק שזה הליבה של הנוקלאוזום הזה יכול להשתנות
שמור -לברר שבאמת !!
סטויכומטריה של חלקיקי הנוקלאוזום
א. היכן נמצא את הנוקלאוזום במצב של הקסזום
ב. טטראזום
ג. עם וריאנטים של היסטונים
מהי תופעת הנשימה של קשרי הדנא-היסטונים
כיצד היא יכולה להשפיע על ביטוי גנים
הכין בעיקר היא מתרחשת
מהם שני מנגוניני הבקרה המרכזיים על ההרכב הכימי של ההיסטונים
האם הרצפים של ההיסטונים שמורים באבולוציה?
כן למשל יש 90 אחוז זהות ברצף בין H4 בשמרים ובאדם
האם יש הבדל בכמות העותקים של הגנים להיסטונים בין גנומים של יצורים שונים
כן! למשל להיסטון H4 עותק יחיד בשמרים וכעשרים עותקים באדם
באילו היסטונים נראה וריאציות בין האללים המקודדים לאותו סוג היסטון ובאילו לא? (מאילו הקנוניים)
באץארבע אין וריאציות ב- H2a H2B יש וריאציות בין האללים
