1r Tema Flashcards

1
Q

Que es la diversidat microbiana?

A

Es pot entendre com a deferents microorganismes que ocupen diversos ambients

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Que és la diversitat morfolòfica?

A

Podem trocar morfologia espirala, bacilar, espiral… Também hi ha cèl·lules pleomòrfiques, filamentosas, ramificadas o no, amo prosteques o prolongations, formes peduncles ama apèndixs i formes quadrades.
Les cèl·lules poden agrupar-se formant agregats irregulars, cadences per parelles o tètra des,etc.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Com es el rang de mida de les cèl·lules procariotes?

A

Extrem mes petit 0,2-2μm i la longitud entre 1-10μm.
Extrem més gran, un gram-positiu: Eculopiscium fishelsoni amb una longitud de 600μm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Quin tipus de bacteri es Thiomargarita namibiensis?

A

Oxidador del sofre i obteve energia de l’oxidació del sulfur i acumula sofre en granules. Mesura 700μm i es pot arribar a veure sense microscopi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Com diferenciem els gram positius dels gram negatius?

A

Gram postius te acids micòlics, i tenen capa gruixuda de peptoglica
Gram negatius te lipolisacàrids a la membrana externa i tenen una bicapa lipidica.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Com es la paret cel·lular arqueus?

A

Poden tenir pseudopeptidoglicà, també poden tenir capes S i poden ser tenyits per la tinció de gram però no tenen peptidoglicà

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Quin tipus de varietat poden tenir a nivelles estructures externes i internes?

A

E. externes: flagels, pilis, fímbries, càpsules, beines, etc.
E. internes: esporulats o no, organismes fotosintètics amb sistema membranós intracitoplasmàtic, vacuoles de gas, etc.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Si la font energia es font química s’anomena

A

Quimiotrofic

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Si la es font energia és font quimica i la font de carboni és de compostos orgànics s’anomena

A

Quimioheterotròfics

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Si la acceptor terminal d’electrons és O2 són

A

Respiradors aerobis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Si acceptor terminal d’electrons no és O2 s’anomena:

A

Si es un compost orgànic: fermentaciones
Si es un compost inorgànic: respiración anaeròbica

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Si la font energia es font química i la font de carboni es CO2 s’anomena

A

Quimioautotròfics, aquests obtenen l’energia d’oxidació de compostos inòrganics reduïts serien quimiolitoautotròfics

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Si la font energia es la llum s’anomenen

A

Fototròfics

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Si la font energia es la llum i la font de carboni es compostos orgànics s’anomena

A

Fotoheterotròfics, trobem bacteris verds no del sofre i bactérias vermells no del sofre

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Si la font energia es la llum i la font de carboni es CO2 s’anomena

A

Fotoautotròfics, si no utlitzen H2O per reduir-lo es fotosíntesis anoxigènica ( bact verdes i vermells del sofre) i si utilizen H20 es fotosintesis oxigènica (vegetals i cianobacteris)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Per mirar la diversitat ecològica tenim en compte…

A

La temperatura i el PH

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Pel que fa la diversitat de comportament es poden classificar segons…

A

-Motilitat i tàxies
-Cicles de desenvolupament
-Resposta metabòlica
-Comportament comunitari

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Que es un microorganisme magnetotàctic?

A

Intetitzar una mena de brúixola
magnètica que ajuden a orientar-se respecte els pols de la Terra i s’ha vist que ho fan per
orientar-se en les zones on les condicions d’oxigen són més favorables.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Que vol dir VBNC (cicles de desenvolupament)

A

Significa Viable però no cultivable, en condicions amo estrès mantenen la seva viabilitat però perden la capacitat de reproduir-se perquè han de minimitzar el cost energètic degut a les condicions desfavorables. Quan la situació millora es pot recuperar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

A que fa referencia el terme Swarming o motilitat en eixam?

A

Es usual en mixobacteris i consisteix en el contacte entre cèl·lules de manera que es mouen formant unes onades de forma coordinada, tot gràcies a senyals químiques que permeten que les diferents cèl·lules es moguin alhora.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Per entendre la diversitat evolutiva ho fem…

A

Seqüencian gens

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

En el mon microbial es dificil tronar els indicis de la vida i registres fòssils degut a…

A

A les estructures delicadas i que no acostumen a presentar estructures exoesquelètiques o endoesquelètiques.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Segons les primeres proves l’apareció de vida procaryotes és fa…

A

3.500-3.800 milions d’anys

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

A quina data va ser apareció de la primera cèl·lula eucariota?

A

2.000-2.500 milions d’anys

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

El registre fòssil es escaso pero tenim diverses proves que són:

A

-Sílex d’àpex de l’arqueà inferior
-Gloeodiniopsis, aproximadament 1.500 milions d’anys, del sílex carbonaci
-Palaeolungbya aproximadament 950 milions d’anys de l’esquist carbonaci

26
Q

Que son els estromatòlits?

A

Són unes formacions sedimentarias que es van formar gracias a l’activitat dels cianobacteris que els compossaven. Aquests
cianobacteris són capaços d’atrapar carbonat calci i formar aquestes
formacions laminares i ens recorden als tapissos microbians actuals.

27
Q

Com seria la primera cèl·lula?

A

Cèl·lula procariota sense uncle definit, seria un microorganisme procariòtic anaerobic autotròfic i termòfil (quimiolitotròfia)

28
Q

Quan va apareixer l’oxigen?

A

Fa 2.500 milions anis en forma de l’apareció fotosíntesi oxigènica ambos cianobateris

29
Q

Per que serveix la capa d’ozo?

A

Protegeix de la radiació UV, i es va formar gracias a un esdeveniment de gran oxidació.

30
Q

Metabolisme primigeni

A

Seria anaerobic, quimiolititròfic

31
Q

Com poden obtenir energia les cèl·lules amb métabolisme primigeni?

A

Les cèl·lules amb metabolisme primigeni obtenien energia a partir formació de pirita (FeS2), es produeix hidrogen, que activa ATPasa i genera ATP i els electrons s’utilitzarien per reduir el sofre, que seria l’acceptor terminal d’electrons, cap a sulfur. El sulfur actuaria com a catalitzador de la reacció.

32
Q

Quines proteines primitives poden generar ATP?

A

Hidrogenasa i ATPasa

33
Q

Quantes manera hi ha per a les cèl·lules primitives l’obtenció de energia ?

A

2, per la formació de pirita i l’oxidació de ferro

34
Q

Quines erien les primeres molècules autoreplicatives que trobaríem?

A

DNA, RNA i proteïnes

35
Q

Qui va trocar existència d’un RNA autocatalític?

A

Thomas Cech (1981)

36
Q

On es va trocar l’existencia d’un RNA autocatalític?

A

En el protist Tetrahymena, en el seu rRNA, una seqüència intrònica RNA, era capaç d’autoescindir-se sense la intervenció d’una altra proteïna.

37
Q

Sidney Altman

A

Va caratceritzar la RNAsa P d’E. coli, és a dir, una ribonucleasa (RNA) amb activitat catalítica.

38
Q

Ribozims

A

RNAs amb activitat catalítica

39
Q

Gilbert (1986) quina hipótesis va emetre?

A

D’un món de RNA, el qual la molecular de RNA, va ser capaç d’emmagatzemar, copiar i expressar la informais genètica i presentar una act catalítica

40
Q

Que van descubrir mitjançant proves indirectes en laboratori sobre embolcall de l’RNA?

A

Que els lipids de l’embolcall de manera espontánea poden formar liposomes

41
Q

En la sopa primitiva es formen?

A

Mòlecules orgàniques sensibles

42
Q

El pas de RNA a DNA es degut…

A

Perquè el DNA es estable, es va donar el flux informatiu DNA-RNA-prot

43
Q

LUCA

A

L’ultim ancestre como entre totes les formes de vida

44
Q

Anàlisi evolutiu

A

Objectiu és obtenir la història evolutiva

45
Q

Filogènia

A

Història evolutiva d’un grup d’organismes, identificació d’un microorganisme a nivell genètic i hi haurà un seguit de tècniques per fer-ho, però no és filogènia. La filogènia es dedueix de manera indirecta de la seqüència nucleotídica.

46
Q

Rellotge molecular

A

Les molecules canvien al llarg del temps, descobert per Zuckerkandl i Pauling l’any 1965

47
Q

Cronòmetre molecular parteix d’unes assumpcions per implementar el concepte:

A
  • Els canvis nucleòtids s’acumulen en la seqüència proporcionalment al temps transcorregut.
    -Els canvis són selectivament neutrals i no interfereixen a la funció gènica i són a l’atzar.
    Un cronòmetre molecular segueix un model estocàstic: el que s’ha de mantenir constant sempre és la probabilitat de canvi i això es manté constant.
48
Q

Per un analisi filogenètic s’utilitza..

A

rRNA 16S en procariotes i 18S en eucariotes

49
Q

Per poder ser un bon cronòmetre molecular, una molècula ha de complir les següents característiques:

A

-Universalment distribuïts → tots els organismes presenten 16S/18S.
-Estables en la seva funció
- Suficientment conservats → canvien lentament en el temps. Si canviessin de pressa, no podríem fer
una història evolutiva.
-Tenen la longitud adequada → si és petita, hi ha més errors.

50
Q

Quin percentatge representen els microorganismes aïllats?

A

menys de 1% de la diversitat que hi ha

51
Q

Per obtenció de sequÜències de DNA utilitzem…

A

Primers universals, amplificant a partir de l’extracció de la mostra de l’ambient natural el metagenoma de la comunitat.

52
Q

Com s’obte seq de DNA?

A

Amb els primers universals, s’amplificant i s’obté fragments de 1600 pb. Es fa electroforesis horizontal, s’observa una banda pq la mobilitat es per la mida. Es soluciona fent FINGER-PRINTING

53
Q

Que es la técnica de DGGE?

A

Electroforesi en gradient desnaturalitzant. Limitació: no podem resoldre fragments tant llargs, no serveix per més de 800 parells de bases. Hauríem d’utilitzar uns primers de només una part del gen.

54
Q

Una opció per poder treballar amb tot el 16S seria..

A

Seria fer una genoteca, una biblioteca de gens, utilizar un vector de clonació i es poden clonar tots els productes de PCR amplificats. Quan ja tenim les seq finalment podem seq.

55
Q

Metodologies bàsiques de seqüenciació

A

Com el mètode Sanger o portar una seq automática basats en el metode de Sanger. Cada dideoxinucleòtid i marco el nucleotid amb fluorescència o radioactivitat, i s’atura la reacció quan s’afegeix un dideoxinucleòtid, podem córrer un gel d’acrilamida o fer una electroforesi capil·lar i en funció de la mida dels fragments es pot deduir i interpretar la seqüència.

56
Q

En la traducció es produeixen…

A

inserciones o delecions que s’acumulant en la cadena i provoquen canvis en la seq i provocant desarellament en certs punts.

57
Q

Per detectar els gaps i poder identificar els identitat es fa…

A

Alineament de les seqÜències

58
Q

Quan una base ha sigut reemplaçada per una altra, veiem una diferència en la seqüència:

A

-Poden haver-se donat passos intermitjos.
-Poden haver-se donat mutacions en paral·lel en ambdues seqüències → no perquè procedeixin d’un
avantpassat en comú. Homoplàsia.

59
Q

De models estadístics trobem:

A

-Jukes-Cantor: és un algoritme basat en logaritmes. El que fa és corregir aquesta deriva evolutiva que no coneixem, de manera que si en una seqüència hi ha 6 diferències, apliquem l’algoritme i calculem la distància evolutiva. Atribueix la mateixa probabilitat en les bases, tot i que sabem que no és la mateixa.
-Kimura: algoritmes més complicats que atribueixen probabilitats diferents en funció de com es dona la mutació.

60
Q

Dificultats de construcció d’arbres filogenètics:

A

-Selecció de gens a comparar pot afectar a l’arbre resultant
-Duplicacions gèniques
-Velocitat d’evolució desiguals.
-Transferència horitzontal o lateral de gens

61
Q
A