1.INFECTIONS viro Flashcards

Question

Donner pathogenèse du HCV :

Answer 1

Transfusion mal contrôlée, seringue infectée...--> HCV dans le sang --> Infecte un hépatocyte via E2 et LDL --> Manifestations inflamm mineures (HCV inhibe les APC) (donc on est loin de l'hépatite fulminante) --> Augmentation des ALAT --> Infection devient chronique dans 80% des cas--> Dysfonction hépatique au bout de 20 ans d'infection ! --> Destruction hépatique progressive --> Séquelles à long terme avec 20% de cirrhose et 10% de carcinome Hép.

Answer 2

La combinaison du HBV avec le HDV.

Answer 3

Via la prot H (Hemaglutinine) sur l'a.sialique pour les Respirovirus (sauf hRSV (g)) la nectine 4, SLAM, CD46 pour les Mobilivirus (Rougeole). Liaison à la cible --> Chgt de conformation et activation du pouvoir fusogénique --> Dislocation du réseau prot M et libération de la nucléocapside (ARNsb-, N, L, et P). Organisation génomique : Dans l'ordre du premier gène transcrit (3') au dernier (5') : N, P/C/V, M, F, HN, L. Sont séparés par des séquences End/Initiation/Start. Transcription : Le transcrit N est 20x plus transcrit que les autres car l'ARNpol se détache entre chaque gène et a tendance à revenir au point de départ. Un transcrit contient une coiffe méthylée en 5' et une queue poly(A) en 3' donc peut sortir du noyau. Le gène P contient un site d'édition à la moitié du gène où il peut ajouter 1 ou 2 bases G au transcrit ce qui change le cadre de lecture et permet d'avoir les prot C, V et W. Traduction : ARNm viral traduit par un ribo cellulaire. Chaque ARNm code pour une seule prot sauf le gène P qui donne les prot P, C, V et W. P permet la liaison de L avec la nucléocapside et facilite ainsi l'encapsidation des ARN naissants et la réplication. C, V et W inhibent la réplication du génome et les réponses anti-virales (pr pas se faire remarquer) (ce sont donc des fac de virulence). Réplication du génome : Accumulation de la prot N qui devient élevé--> Switch l'activité de l'ARNpol qui passe de transcriptase à réplicase --> Ne tient plus compte des séquences Start/stop entre les gènes et passe à la synthèse d'un antigénome complet d'ARNsb+ --> Sert de matrice pour faire un ARNsb-. Sans prot N, la prot L ne peut pas fonctionner. Assemblage : A lieu des cholesterol rafts (microdomaines riches en chilesterol) --> Grâce à la prot M qui est liée aux prot F et H ainsi qu'à la nucléocapside c'est ainsi la prot organisatrice de la structure du virion --> Une fois tous les composants du virion assemblés --> Polymérisation de l'actine qui pousse le virion vers la sortie --> Pour les respirovirus (sauf hRSV) clivage de l'a.sialique par la Neuraminidase --> Dissémination des virions. Pour la rougeole on ne connait pas bien le mécanisme.

Answer 4

Prot G lie les rc des cell ciliées de l'ép respiratoire (héparan sulfate, chondroïtine sulfate B, GAG, ICAM1, CXCR3). --> Une fois attaché --> Prot F déclenche la fusion des membranes--> Libération de la nucléocapside composée du brin d'ARNsb-, N, P, L et M2.1. Transcription : Comme pour la rougeole avec des séquences Start/Stop entre les gènes et 20x plus de prot N que les autres. Traduction par les ribosomes cell. Réplication : Accumulation de la prot M2.2 --> L'ARNpol switch en réplicase ---> Synthèse d'un antigénome + Assemblage et bourgeonnement : La prot M fait l'assemblage en liant la nucléocapside et les prot de surface --> Bourgeonnement du virus à la surface apicale et utilisant le cytosquelette --> La protéine M permet l'evagination membranaire (s'enveloppe dans avec la membrane plasmique).

Answer 5

GP virales de surface gC et gB lient les GAG des héparans sulfate de la surface cell --> gD lie la nectine et le rc au TNF --> Chgt de confo --> Expose gB, gH et gL qui déclenchent la fusion--> Relâchement du tégument et la capside dans le cytoplasme --> Capside transportée jusqu'au noyau via les microtubules --> Décapsidation au niveau du pore nucléaire --> L'ADN entre et la capside reste ds le cyto --> UL41 (tégument) reste dans le cytoplasme et empêche la traduction de prot anti-virales--> VP16 (tégument) entre dans le noyau et active l'expression des gènes très précoces du virus en se liant à leur promoteur --> Transcription : L'ADNviral dans le noyau est sous forme d'épisome --> Ne peut pas s'intégrer --> La transcription se fait par l'ARNpol II cellulaire relgulée par des prot virales qui installent 3 phases d'expression intra et inter-relgulées --> Très précoce alpha (activée par VP16), précoce bêta (donne les prot de la réplication) et tardive gamma (donne les prot de structure et d'assemblage)--> Réplication : Grâce aux prot virales issues de la phase précoce bêta --> Un complexe de 7 protéines dont l'ADNpol virale et son facteur de processivité --> Il se forme un ADN concaténaire (une saucisse de génomes) qui sera coupé en ADN monocaténaire par les prot de l'échafaudage lors de son entrée dans la capside. Assemblage et relâchement : Synthèse des protéines structurelles de la phase tardive gamma --> Elles sont transportées vers le noyau --> Forment des coquilles vides munies d'un échaffaudage qui permet à la capside de garder sa forme et sa stabilité et de faire entrer l'ADNdb viral --> L'échaffaudage est ensuite dégradé --> La capside comprenant l'ADN s'entoure de protéines du tégument --> Tout ça bourgeonne de la membrane nucléaire interne vers la lux du RE --> Puis l'ensemble est exocyté dans le cyto (perte de l'enveloppe) --> Puis l'ensemble capside tégument bourgeonne dans le Golgi --> Prend quelques prot de l'hôte au passage --> Re-bourgeonne du Golgi pour aller dans le cytoplasme --> Exocyté au niveau de la membrane plasmique et perd ainsi sa deuxième enveloppe, mais garde la première du Golgi.

Answer 6

``` Alpha : Spectre d'hôte large Cycle reproductif court Propagation cellule-cellule rapide Effet cytopathique fort Infection latente dans les neurones des gg sensitifs. --> HSV1 et 2, VZV ``` Bêta : Spectre d'hôte restreint Cycle reproductif long Propagation cell-cell lente Effet cytopathique de type cytomégalique Latence dans les cellules lymphoréticulaires et glandes sécrétoires. --> CMV Gamma : Spectre d'hôte très étroit --> Restreint aux cell épithéliales, endoth et lymphocytes qui sont les sièges de latence --> EBV (et KSAH, Kasposis Sarcoma Associated Virus)

Answer 7

``` Dans une gg lymphatique--> Attachement par SU (Gp120) qui s'attache au CD4 des lymphocytes--> Chgt de confo de SU --> Liaison de SU au co-récepteur --> Changement de confo de TM --> Fusion à la membrane --> Entrée de la capside avec les deux brins d'ARN +, la RT et les protéases. ``` Réverse transcription (cytoplasme) : Séquence d'amorce PBS (Primer binding site) de l'ARN+ où un ARNt vient se fixer --> Ceci créé l'amorce pr que la RT se fixe --> Commence à synthétiser le brin d'ADN - --> Au fur et à mesure qu'elle synthétise l'ADN, elle dégrade l'ARN+ via son activité RNAse sauf au niveau de la séquence PP (Polypurine) qui servira d'amorce pour la synth du brin + --> Une fois l'ADN - synthétisé, il vient apparier sa séquence PP avec celle de l'ARN - génomique--> Synthèse du brin + --> Formation d'un ADNdb avec aux extrémités les LTR (Long Terminal Repeat : U3,R,U5) qui lient l'intégrase --> ... Passage de l'ADNdb sans la capside dans le noyau grâce aux signaux d'adressage nucléaire (IN, MA et Vpr) --> Intégration du génome viral au génome hôte de manière aléatoire mais généralement au niveau de gènes actifs (vers les centromères) => C'est la phase précoce (d'intégration) ... Le provirus (génome intégré) se comporte comme un gène humain --> LTcd4 activé --> Synthèse NF-KB et NFAT --> LTR recrute le complexe transcriptionnel avec l'ARNpol hôte --> Donne donc un transcrit avec tt les gènes dessus (polycistronique) avec coiffe et queue poly(A) --> Mais quand même épissage donnant des petits ARNm codant pour les prot régulatrices Tat, Rev, Nef et Env--> Formation de deux polyprotéines Gag et Gag/Pol --> La prot Env (gp160) est clivée en SU (gp120) et TM (gp41) par une furine dans le Golgi --> S'insert dans la membrane plasmique --> Les polyprotéines Gag et Gag/Pol rejoignent la membrane plasmique avec SU et TM --> Pendant/Juste après le bourgeonnement --> La protéase virale PR est activée et clive Gag et Gag/Pol en protéines individuelles --> Elles s'arrangent et forment entre autre la nucléocapside(NC), la capside (CA)...--> L'enveloppe virale provenant de la membrane plasmique de l'hôte prend également avec elle prot membranaires de l'hôte dont des CMH I.

Answer 8

Dans le cytoplasme

Answer 9

Car la RT n'a pas de proof reading et fait 1 erreur sur 10000bases ! Donc 1 erreur par virion produit

Answer 10

Attachement, entrée : Particule de Dane (grosse sphérique) avec son ADNdb partiel à l'intérieur --> Lie les GAG des prot glycosylées des hépatocytes avec son HBsAg L --> Fusion des membranes selon un mécanisme inconnu --> Capside contenant l'ADN viral et la protéine P dans le cytoplasme --> La prot C (de la capside) contient un signal d'adressage nucléaire --> Passage de l'ADN dans le noyau --> ... Expression génétique : Enzymes cellulaires enlèvent l'ARNpol virale sur le brin(+) et la coiffe sur le brin(-) --> Complète le brin + à partir du brin (-) --> L'ADN viral devient DB circulaire (cccDNA = covalently closed circular DNA) --> 4 segments géniques qui se chevauchent : ORF X, S, P et C chacun donnant plusieurs transcrits --> Chaque segments est précédé d'un promoteur sous le contrôle de deux cis-acting enhancers qu'on ne trouve que dans les hépatocytes (c'est de là que vient le tropisme de HBV ! -> un tropisme pour la capacité réplicative de la cellule !) --> Transcription par l'ARNpol II cellulaire --> Tous les ARNm viraux sont coiffés en 5' et polyadénylés en 3', mais pas d'épissage--> Traduction des ARNm dans le cytoplasme par les ribosomes cellulaires des 5 transcrits --> Pré-C ---> HBeAg (soluble) (fct inconnue) C ---> prot C (capside)/ P/ ARNpré-génomique utilisé pour la RT Pré-S1 ---> HBsAg L, M et S Pré-S2/S ---> M/S X ---> prot X (fct inconnue, mais carcinogène) ... Réplication : Migration de l'ARNpg et prot P (RT) dans la capside --> RT du brin d'ADN (-) --> L'ARNpg est dégradé par l'activité RNAse de la RT en même temps qu'il est rétro-transcrit --> Puis la prot P switch en une activité ADNpol ADNdép --> Synthétise le brin d'ADN (+) à partir du brin (-) --> Virion prêt ! --> Certains reviennent au noyau pour refaire un tour de multiplication --> D'autres sortent par la voie de sécrétion --> Avec une enveloppe provenant du RE.

Answer 11

Oui, elle très peu d'erreur (1/10^9). | Du coup elle fait très peu de mutations mais suffisamment pour donner des variants adaptés.

Answer 12

Du RE hôte

Answer 13

Risque de surdité, microcéphalie, pétéchie, purpura, retard mental.

Brainscape's Knowledge GenomeTM

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Brainscape's Knowledge Genome^TM