1er niveau d'organisation des protéines : les AA

Question 1

protéine

Answer 1

grande diversité de fonction au sein de notre organisme

Question 2

liason entre deux AA

Answer 2

liaison peptidique

si AA<50=peptide
si AA>50 protéine

Question 3

1er niveau d’organisation protéique= structure primaire

Answer 3

l’aichaineent des AA dans un ordre précis

Question 4

parmis les 20 AA (naturel) il y a

Answer 4

les AA essentiel: par l’alimentation
les AA non-essentiel (corps)

tous serie L

Question 5

masse moyenne d’un AA

Answer 5

Masse moyenne d’un AA : 110 dalton

Question 6

structure d’un AA

comment on nomme une structure

Answer 6

• Un C (carbone alpha) sur lequel est fixé un groupement amine -NH2 et un groupement carboxylique -COOH et un radical qui va déterminer la nature de l’AA
• l’AA a une fonction acide et basique : il est amphotère ( a pH physiologique(7) les deux groupement sont ionisé)

-Pour nommer une structure primaire d’une protéine on écrit de l’extrémité N-Terminal à l’extrémité C-terminal

Question 7

pour classifier les AA on prend en compte

Answer 7

• l’encombrement stérique , qui dépend de la taille de R (place que prend l’AA)
• le caractaire polaire ou apolaire de R

Question 8

AA apolaire

Answer 8

-LES AA APOLAIRE: non ionisable :
n’interagissent pas avec molecule d’eau :
+ implique dans les interaction hydrophobe :

les + hydrophobe : Val, Leu , Ileu, Phe (quand le R est grand)

Soit chaine aliphatique (longue chaine carbonne) ou chaine aromatique (noyau cycle de carbone)

Question 9

les AA polaire

Answer 9

-LES AA POLAIRE : ionisable –> un caractère hydrophile
Ils peuvent être non charges = neutre

chargé + : AA basique.
chargé - : AA acide
–> peut former liaison hydrogène

alcool (Ser, Thr, Tyr), soufré (Cys), amide (Asn, Gln) ),
charges - (acide) : Asp Glu
ou charges + (basique) : His Lys Arg

Question 10

pi / point isométrique / pHi

Answer 10

pH de AA auquel sa charge est neutre

Question 11

pi

et zwitterions

Answer 11

pkA= 2      50%A+    50%Z
pHi= 6      100%Z
pkA= 9      50%A-    50%Z

pHi= (Pka+pKb)/2

Question 12

isomère avec les série

Answer 12

enantiomère: mirroir 
serie D ( déviation vers la droite)
serie L ( déviation vers la gauche)

Question 13

prop spectrales

Answer 13

• incolore
• les acides aminés aromatique absorbent les UV entre 260 et 280 nm

Ordre d’absorption : Trp (280 nm)> Tyr> Phe (260nm)
on detecte prot dans un milieu bio par mesure à 280nm
AA aromatique ont propriete de fluorescence

Question 14

reactivite du groupement amine

Answer 14

-Protonation de -NH2 en placant l’AA en milieu acide
-Alkylation, acétylations, arylations : addition groupement supplémentaire
ex arylation de FDNB (réactif de Sanger)

-Glycosylation : associe a asparagine
- phosphorylation : associe a sérine, tyrosine, thréonine (ser, tire, trinque) se fait grace a une enzyme et nécessite ATP
-Iodation : tyrosine : AA capable de porter des atomes d’iode
-Pont disulfure : cystéine → liaison covalente entre deux atomes de soufre de 2 cysteine
pont entre meme chaine : intracatenaire
pont entre deux chaine diff : extra cat

Question 15

exemple de glycosylation

+ role

Answer 15

N-glyco
O-glyco

• reconnaisance et adhesion cellulaire
• controle du repliment des protéinees
• modulation métabolique d’enzymes
• transport et adressage de protéines
• role structurales

Question 16

formation d’une fonction amide

Answer 16

condensation la fonction acide carboxilique (COOH) avec la fonction amide (NH2) = dipeptide

Question 17

le plus grand vaste groupe des composés biologique

Answer 17

les protides

avec dedans biomolécule (AA) + peptides+ protéines

Question 18

les acides aminés aux extrémité ont :

Answer 18

une seule de leur deux fonction engagées dans une liaison peptidique

Question 19

la liaison peptidique

Answer 19

elle est la clée de la structure spatiales d’une protéine

• plane
• rigide
• polaire
• induit des restiction conformationnelles de la chaine polypeptidique
• resitante à l’hydrolyse

Question 20

liason entre un carbonne asymétrique et un carbonne

Answer 20

epsilon

1,52 A°

Question 21

liaison entre un C et N

Answer 21

omega

1,33A°

Question 22

liaison entre Casymétrique et N

Answer 22

phi

1,45A°

Question 23

l’angle épsilon/omega

Answer 23

autour de CN
ne peu que etre
0° cis –> 2 R en haut
180° trans (plus stable) –>alterné

Question 24

tout les types de liason C-N

Answer 24

C-N normal (1,27A°) < C-N peptidique (1,32A°) < C=N (1,49A°)

double liason: planéité des carbonne
UV absrbé à 215nm