1.4 Flashcards
4 kinases qui phosphoryle eFI2 .
- HRI ou HCR.
- PKR
- GCN2
- PEK
HRI OU HCR ACTIVÉE QUAND ?
QUANTITÉ DHEME DIMINUE.
STRESS OXYDATIF
AUGMENTTION DE TEMPÉRATURE
pkr active quad?
arn double brin plus grand que 30 pb.
NORMALEMENT CEST LA QUAND INFECTION VIRALE
GCN2 ACTIVÉE QUAND
en présence de artnt non chargée. CARENCE D’A.A.
PEK ACTIVÉE QUAND
reticulum endoplasmique a beaucoup de protéine repliées , a cause du stress
quelle protéine cible la proteine eIF4E liant la coiffe 5 prime?
protéine 4E-BP , quand elle est pas phosphorylée elle est en competition avec eIF4G pour se lier à eIF4E donc ELLE INHIBE LINITIATION
4E-BP PHOSPHORYLER NE FAIT PAS DINHIBITION . ET ELLE EST PHOSPHORYLÉE PAR ?
proteine kinase mTor
UN arntm qui sauve les ribosomes bloqués quand mutation poncuellee SANS STOP.
SsrA
2 mecanismes pour les eucaryotes si stop trop tot ou trop tard.
tot : les complexe ne sont pas déplacés ça entraine le recrutement de Upf1 Upf2 Upf3 sur le ribosome et elles activent les enz hydrolysant la coiffe et apres les exonucléases 5 prime 3 prime viennent dégrader .
tard : queue poly A est traduite. instable . blok. exosome arrive .
exosome :
Ski7 et exonuclease 3 prime 5 prime dedans .
ski7 ?
apparenté à eRF3 qui stimule la dissociation du ribosome.
ADN CIRCULAIRE DEVIEN VITE TORDU DONC IL FAUT ______ POUR ELIMINER LES TENSION DE TORSION EN PRODUISANT DES _____
ADN GYRASE
SUPERTOURS NÉGATIFS
BRIN DISCONTINUE SYNTHÉTISER DANS LE BONS SENS : MAIS APRES IL SONT RELIÉS PAR :
ADN LIGASE
QUEST-CE QUI PRODUIT LES AMORCES CHEZ E.COLI ? POUR SYNTHESE DOKASAKI?
PRIMASE : DnaG
enz sépare les 2 brins
hélicases : DnaB
prot empechant les 2 brins de se réassocier
SSB
enz synthétise les amorces darn
DnaG
adn replicase :
HOLOENZ : POL 3
enz qui enleve les amorces :
pol1
enz qui ligature de maniere covalente les okazaki
ADN ligase
pol1 est processive :
copie 20 nt et plus sans la quitter
grace a quoi que pol 1 peut se corriger
possede exonucléase 3 prime 5 prime et 5 prime 3 prime
comment se nomme le site actif de pol 1 pour exonucléase 3 prim 5 prim ?
fragment de Klenow
pol 1 fait quoi quand lesion chimique :
acttive act exonuclease 5 prim 3 prim . en meme temps elle comble le trou avec son act polymerase
pol 43 a combien dunité
10 sous unités
holoenz.
centre catalytique de pol 3 ….. quelles s-u
alpha
E
teta le genre de O.
quoi qui lie les 2 centre catalytique ? .
composante de dimérisation ( t )
quest-ce qui retien la pol III SUR LADN ET AUGMENTE LA PROCESSIVITÉ DE LENZYME?
attache dimérique B (BETA )
permet de placer les sous unités BETA sur ladn .
chargeur dattache ( GAMA )
3 etapes de lasssemblage de holoenz POL 3.
- gama transfere beta a la matrice portant lamorce
- centr catalytique sassocie avec BETA sur adn
- dimere T se lie au centre catalytique permettant a un autre centre cata de sassocier
pk holoenz asymétrique ?
un seul complece gama.
chargement de beta est coupler a
ATP.
pol 1 ou 3 qui déroule ADN
1
quest-ce qui déroule aDN.
DnaB et SSB ( prot affine )
chez les procaryotes , la réplication est prise en charge par quoi ?
le réplisome
réplisome :
gros complexe protéique associé à fourche de réplication
quest-ce que le primosome
sous-complexe protéique du réplisome impliquéé dans la synthese de chaque frag dokazaki pour le brin retardé
dequoi est composé le primosome
helicase ( DnaB )
primase DnaG
dautres prot
la PRIMASE DnaG est-elle une composante permanante du primosome ?
non sassamble a lhelicase a chaque événement damorcage
voir modele trombone
ok
la liaison de quoi à lholoenzyme pol 3 augmente de 10 fois la vitesse de séparation des brins parentaux ?
liaison de lhelicase , si pas liée elle se ferait rattraper par pol 3 et formerait un replisome complet
replication dadn eécoli est initiée au locus :
grace a quoi
OriC
protéine DnaA
IMAGE POUR MODELE DE LINITIATION AU ORI C
OK
EXPLIQUE COMMENT LA PREMIERE AMORCE DARN EST ELLE SYNTHETISÉE.
- dNAB agrandit region désaparriée
- primase reconnait dnab et se lie à elle et a ladn
- DnaB-Primase déplace sur matrice et primase fabrique les amorces pour le premier fragm
- holoenz 3 sassemble sur DnaB-PRimase et utilise amorce pour commencer.
- autres composantes entre en action
VOIR IMAGE GENRE
2 maniere de voir le mouvement de adn par rapport a machinerie de réplic maintenant on favorise quelle idée
MACHINERIE RÉPLIC EST STATIQUE DANS LA CELLULE
les roles des deux promoteurs pres de lorigine de réplication qui points les deux vers lorigine sont des amorces pour la synthse
nope. ils amene la formation boucle R et stimulent formation de complex ouvert a lorigine
prot HU setrt a quoi
lie à boucle R pour faciliter la fusion de l’adn et promouvoir formation dadn superenroulé negativement REQUIS pour la liaison de DnaA a lorigine
si la divison cellulaire se fait en 60 minutes mettons. le temps de chaque etape cset quoi
40 minutes pour réplication
20 minutes pour ségrégation des composantes cellulaire plus formation du septum
quest-ce qui empeche oriC destre actif tjrs ?
pas connu , mais methylation de ladn a un role important.
DAM cest quoi
méthylase qui reconnait séquence palindromique GATC répétée 11 x dans OriC . Ajoute methyl à N6 de adénine qui se trouve dans brins opposés de chaque répétition. VOIR IMAGE GENRE.
le degré de méthylation du palindrome GATC permet :
de distinguer origine répluqué dune pas répliquée .
meth —- repliqué —- semi-met —dam— méth
ORIC C ACTIVÉE QUAND COMPLETEMENT METHYLÉE.
hémi-méthylée associée à quelle proteine pour que la réinitiation soit réprimée?
SeqA
SeqA relaché ?
Dam peut méthyler
Site Ter.
site de terminaison . : contenant région longue de 350 kb contenant 6 sites de 23 pb presque identiques
Site ter. fourche 1.
traverse terF, , terB et terC , mais sarretequand rencontre terA, terD ou terE.
larret de progression dune fourche a besoin de prot:
Tus
Tus :
lie chaque site Ter
inhibe DnaB
asymétrique , donc arrete mouvement de fourche dans une seule direction .
comment a letape finale de la réplic du genome de eécoli les 2 mol adn fille sont séparer ?
avec la topoisomerase de type 2
comment fonctionnne entrée du bacteripohage M13 dans e.coli :
entre dans E. coli et a adn circulaire simple-brin converti en duplex circulaire appelé RF
diff entre RF1 ET RFII
RF1 EST SUPERENROULÉE
RFII EST PORTE CASSURE SIMPLE BRIN
REPLICATION DUN ADN DUPLEX CIRCULAIRE PAR LE MODE EN CERCLE TOURNANT VOIR IMAGE. plus voir pk mode in vivo buts.
..
VOIR MODE EN CERCLE TOURNANT AVEC BOUCLE….
OK….
FIDELITÉ DE REPLICATION ERREUR ?
1 ERREUR SUR 1000 BACTÉRIES / GÉNÉRATIONS
FAIBLE TAUX DERREUR SEXPLIQUE PAR 4 PROPRIÉÉTÉÉS:
- cellule maintien niveaux équilibrés en dNTP
- changement de conformation induit par la complémentarité de la base ajoutée est nécessaire pour que cette réaction se produise : SON MECANISME EN 2 ÉTAPES
- fonctions exonucléases de pol1 et 3 détecte et elimine erreurs apres la fonction polymérase
- autres syst enzymatiques réparent et peuvent réparer lésions par agents chimiques ou physiques
2 autres fonctions de pol a augmenter la fidel de répli
- incapacité dinitier lélongation sans amorce
2. incapacité de synthetiser 3prim vers 5 prim
