בקרת ביטוי גנים בחיידקים-הרצאה 10 ד"ר יונתן פרידמן Flashcards

1
Q

באילו רמות יכולה להתבצע בקרת גנים?

A

שעתוק, תרגום , פעילות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מהו יחס הזמנים בין שיעתוק ותרגום בחיידקים?

A

קורה בו זמנית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

באיזה צורה מאורגנים רוב הגנים בפרוקריוטים?

A

באופרונים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מהו אופרון?

A

רצף של גנים שמשועתקים יחד ביצורים פרוקריוטים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

ממה מורכב האופרון?

A

איזור בקרה אחד או שניים - פרומוטור ואופרטור, וגנים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מהו הפרומוטור?

A

האיזור אליו נקשר הרנ”א פולימראז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מה עלול להיקשר לאופרטור ולהפריע לשיעתוק?

A

רפרסור

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מהי בקרת עידוד (אינדקשן)

A

הגברת שיעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

כיצד עובד אופרון הארגינין?

A

באיתות סיגנל, נקשר רפרסור
לאופרטור, שיכול למנוע מהפולימרז לשעתק. הארגינין משמש ככקו רפרסור שעוזר לרפרסור להיקשר לפרומוטור
ולהפסיק לייצר ארגינין
(עיכוב על ידי תוצר)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מהו הקו-רפרסור

A

מולקולה קטנה שנקשרת לרפרסור, משנה את הקונפורמציה ועוזרת לקישור
הרפרסור לאופרטור ומונעת שיעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

אופרון המלטוז הוא דוגמה לאיזה סוג של בקרה?

A

בקרה חיובית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

מדוע הפולימראז צריך סיוע בקישור לפרומוטור שלו באופרון המלטוז?

A

בשל זיקה נמוכה בין הפולימראז לאופרון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מי עוזר לפולימרז להיקשר לפרומוטור?

A

האינדיוסר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מתי האקטיבטור יכול לצאת לעזרת הרנ”א פולימראז להתחבר לאקטיבטור?

A

בנוכחות אינדיוסר, המלטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

למה מקודד אופרון הלקטוז?

A

לגנים שאמורים לפרק את הלקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מהם הגנים שנמצאים על אופרון הלקטוז?

A

lacZ, lacY, lacA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

מה תפקיד האינדיוסר באופרון הלקטוז?

A

משחרר את הרפרסור מהאופרון ולאפשר שיעתוק תקין של הגנים לפירוק הלקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

איך נקרא האינדיוסר באופרון הלקטוז?

A

אלו-לקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

כשחיידק חי בסביבה שיש בה מקורות פחמן שונים, האם תיווצר רמה של אנזימי פירוק לכל מקורות הפחמן?

A

לא, ייוצרו אנזימי פירוק בהתאם למקור המועדף

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

מהי הבקרה הגלובלית על אופרון הלקטוז?

A

כשכמות הגלוקוז בתא נמוכה, ציקליק AMP
נקשר לפקטור שיעתוק CRP
CRP נקשר לרנ”א פולימראז ומתבצע שיעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

כשהגלוקוז נמוך, רמת הציקליק AMP

A

עולה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מהו האיזון בין גלוקוז ללקטוז אשר מבטיח שיעתוק של הגנים באופרון הלקטוז?

A

מעט גלוקוז, הרבה לקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

מהי רמת השיעתוק כשיש מעט גלוקוז והרבה לקטוז?

A

יש שיעתוק משמעותי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

מהי רמת השיעתוק כשיש

הרבה גלוקוז ולקטוז נמוך?

A

אין שיעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

מהי רמת השיעתוק כשיש

מעט לקטוז ומעט גלוקוז?

A

אין שיעתוק

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

מהי רמת השיעתוק כשיש

הרבה לקטוז והרבה גלוקוז?

A

אין שיעתוק, כי התא מעדיף להשתמש בגלוקוז לפני לקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

אילו רמות של גלוקוז ולקטוז יתנו ביטוי משמעותי של שעתוק אופרון הלקטוז?

A

מעט גלוקוז והרבה לקטוז

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

כיצד פועלת בקרת תרגום sRNA?

A

יכול להיקשר לאתר קשירת הריבוזום או בכך לעכב תרגום/לעודד תרגול על ידי פתיחת ההתעקלות של ה–מרנ”א
יכול לעודד קישור של ריבונוקלאז או להגן מפניו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

האם sRNA

יכול גם לעודד תרגום?

A

כן, כאשר הוא נקשר לרנ”א במקום להיקשר אל איזור קישור הריבוזום

30
Q

על פי ההערכה, מתי הופיעו חיידקים לראשונה?

A

לפני כ-3.5-4 מיליארד שנים

31
Q

באיזו סביבת אוויר הופיעו החיידקים הראשונים?

A

סביבה ללא אוויר

32
Q

על כמה מהביומסה אחראים הפרוקריוטים בכדור הארץ?

A

כ-14%

33
Q

על פי אילו קריטריונים מסווגים מינים של חיידקים?

A

לפי דימיון בגנים

34
Q

כמה מיני חיידקים יש בכדור הארץ?

A

בודדו וזוהו רק 10,000 מינים

אך ההשערה היא שיש מעל מיליוני מינים

35
Q

ככל שאנחנו נמצאים גבוה יותר בים, מה יש יותר : חיידקים או ארכאות

A

יש יותר חיידקים,

פחות ארכאות

36
Q

ככל שאנחנו נמצאים עמוק יותר בים, מה יש יותר : חיידקים או ארכאות

A

יותר ארכאות פחות חיידקים

37
Q

מהם פיטופלנקטונים?

A

אורגניזמים אשר חיים באוקיינוס

38
Q

מה עושים הפיטופלנקטונים?

A

פוטוסינתזה

39
Q

מהו שם החיידק הפוטוסינתתי הכי קטן ונפוץ בכדור הארץ?

A

פרוקלורוקוקוס

40
Q

מהו החיידק הנפוץ ביותר באוקיינוס?

A

SAR 11

41
Q

מהו היחס בין וירוסים לחיידקים בים?

A

פי עשרה יותר וירוסים מאשר חיידקים

42
Q

באיזו צורה נפוצים הוירוסים בתוך הים?

A

בקטריופאג’ים

43
Q

כמה חיידקים נמצא בגרם אדמה?

A

כ-10 מיליארד מיקרואורגניזמים

44
Q

אילו חידקים נותנים לאדמה את הריח שלה?

A

אקטינומיצטים

45
Q

מה מייצרים האקטינומיצטים?

A

אנטיביוטיקה

46
Q

מה מאפשר לקרקע להיות קרקע פורייה להרבה מיני חיידקים?

A

העובדה שהיא הטרוגנית ומשתנה מאיזור לאיזור

מבחינת לחות/חמצן/מינרלים/טמפרטורה וכו’

47
Q

מה צריכים חיידקים כדי לשרוד בתנאים קיצוניים?

A

אנזימים יציבים ופעילים,

ממברנה תקינה ופעילות של ריבוזומים ומקארו מולקולות אחרות

48
Q

מהו תנאי שהכי משפיע על גידול חיידקים?

A

טמפרטורה

49
Q

מה קורה לקצב גידול החיידק כשהוא נמצא אחרי טמפ’ האופטימום?

A

יורד בצורה חדה במיוחד

50
Q

מה קורה לממברנה בטמפ’ נמוכות מאוד?

A

הופכת לג’ל, לא חדירה ויש עצירה של הגידול

51
Q

מה קורה לחיידק פוטוסינתי כתוצאה מעלייה קלה בטמפ’ המים?

A

מת ומפסיק לתפקד

52
Q

לאילו קבוצות מחלקים את החיידקים בהתאם לטמפ’ המתאימה להם?

A

פסיכרופילים
מזופילים
תרמופילים
היפרתרמופילים

53
Q

אילו חיידקים חיד בטמפ’ הנמוכות?

A

פסיכרופילים

54
Q

אילו חיידקים מתקיימים בתנאים החמים ביותר?

A

היפרתרמופילים

55
Q

מהם חיידקים מזופילים?

A

חיידקים שחיים בטמפ’ דומה לזו שמתאימה לבע”ח,צמחים והאדם

56
Q

עם מה צריכים להתמודד חיידקים שחיים בחום?

A

דנטורציה של חלבונים

57
Q

מהן הבעיות שנוצרות אצל חיידקים שחיים בטמפ’ גבוהות?

A

דנטורציה של חלבונים, חדירות יתר של הממברנה, חוסר יציבות של מולקולות מסוימות

58
Q

איזה סוג חומצות שומן יעדיפו חיידקים שנאלצים להתמודד עם חום רב?

A

חומצות שומן רוויות

כדי שישאירו את הממברנה מוצקה גם בהעלאת טמפ’

59
Q

באיזו סביבה בדרך כלל חיים חיידקים פסיכורופילים?

A

באוקיינוסים

60
Q

מעל איזו טמפ’ סביבה לרוב חיידקים פסיכורופילים מתים?

A

מעל כ-5 מעלות צלסיוס

61
Q

מהן הבעיות שנוצרות אצל חיידקים החיים בסביבה קרה?

A

ממברנה נוקשה, קפיאה של הממברנה

62
Q

איזה סוג חומצות שומן יעדיפו חיידקים שנאלצים להתמודד עם קור רב?

A

חומצות שומן לא רוויות

כי טמפ’ הקפיאה שלהם נמוכה יותר והם ישמרו על גמישות הממברנה גם בתנאי קור קיצוני

63
Q

מהם סוגי החיידקים המחולקים לפי סביבת החומציות שבהם הם חיים?

A

אסידופיליים
נויטרופילים
אלקליפילים

64
Q

באיזו רמת חומציות גדלים חיידקים נויטרוילים?

A

בין 5.4 ל8.5

65
Q

איזה מנגנון פיתחו חיידקים אלקיליפילים ואסידופילים?

A

שמירה על חומציות ניטרלית תוך תאית באמצעות משאבות פרוטונים

66
Q

מהם סוגי החיידקים המחולקים לפי סביבת המליחות

בה הם חיים

A

הלוטולרנטים
הלופילים
אקסטרים הלופילים

67
Q

מהי סביבה היפוטונית?

A

סביבה שבה ריכוז המלחים בתוך בתא יותר גבוה והמים זורמים פנימה כדי לאזן את המליחות

68
Q

מהי סביבה היפר טונית?

A

סביבה שהיא מלוחה יותר מפנים התא ובה המים זורמים החוצה

לשם האיזון

69
Q

מה הסכנה בסביבה היפוטונית עבור התא?

A

זרימה של מים אליו שתגרום לפיצוץ התא

70
Q

איך שורד תא בסביבת מלחים גבוה?

A

מגדיל את כמות המומסים מסיסי מים בתוכו,

שואב יונים מן הסביבה אל התא

71
Q

איך מתמודד חיידק ההלופארקס הוולקניאיי שנמצא בים המלח עם רמת מליחות גבוהה במיוחד?

A

שומר על ריכוז תוך תאי גבוה של אשלגן

72
Q

כיצד חיידק מתמודד עם שינוי בתנאי לחות/יובש?

A
  1. ייצור ביוסורפקטנטים שמשאיר את המים על המשטח

2. יצירת ביופילם המגנים מפני היובש על ידי שימור הלחות בפנים