ציטוסקלטון ואקטין Flashcards
מהו ציטוסקלטון וממה הוא מורכב?
ציטוסקלטון = שלד התא
אקטין, סיבי ביניים, מיקרוטובולי
מה התפקיד של כל אחד משלושת הסוגים העיקריים שמרכיבים את הציטוסקלטון?
- Actin filaments
סיבי אקטין. מעצבים את קורטקס התא, משמשים בעקר לתנועה ולחלוקת תא לשניים. - Intermadiate filaments
סיבי ביניים. משמשים בעיקר לתמיכה מכאנית. - Microtubuls
מיקרוטובולי. קובעים את המיקום של אברוני התא, משמשים לתובלה תוך תאית, ויוצרים את הכישור המיטוטי בהפרדת כרומוזומים.
מה משותף לשלושת סוגי הציטוסקלטון?
- תתי היחידות יוצרות פולימר על ידי קשרים לא קוולנטים. כך הבנייה והפירוק של הפולימרים נעשים מהר.
- מערכת השלד התאית היא דינאמית ומסתגלת לתנאים המשתנים, ודומה יותר לסידור של שיבלי נמלים יותר מאשר כבישים.
פילמנט האקטין נקרא _____ וכל תת יחידה
____ בו נקראת
פילמנט האקטין נקרא
F-אקטין,
וכל תת יחידה בו נקראת
G-אקטין.
G-אקטין
הוא חלבון גלובולרי שבנוי מ___ חומצות אמינו.
357
אקטין שמור היטב באאוקריוטים- זהות של
____ בערך
יש 3 איזופורמים של אקטין בבעלי חוליות:
_____
מבוטא רק בתאי שריר, בעוד ש
______
מצויים בתאים שאינם תאי שריר.
אקטין שמור היטב באאוקריוטים- זהות של בערך 90%.
יש 3 איזופורמים של אקטין בבעלי חוליות:
α‐Actin
מבוטא רק בתאי שריר, בעוד ש
β , γ‐actins
מצויים בתאים שאינם תאי שריר.
כל
אקטין G
נושא
_________
שנמצא עמוק במרכז החלבון.
תתי היחידות של ה
אקטין G
יוצרות פילמנט סלילי מסוג הליקס ____. הסיב מכיל ___ פרוטופילמנטים, שמוחזקים יחד בקשרים ____, ומתפתלים ליצירה של טוויסט כל
nm ____.
לכל תתי היחידות בפילמנט יש את אותה אוריינטציה/אוריינטציה שונה.
כל
אקטין G
נושא
ADP/ATP
שנמצא עמוק במרכז החלבון.
תתי היחידות של ה
אקטין G
יוצרות פילמנט סלילי מסוג הליקס ימני. הסיב מכיל 2 פרוטופילמנטים, שמוחזקים יחד בקשרים לטרלים, ומתפתלים ליצירה של טוויסט כל
nm 37.
לכל תתי היחידות בפילמנט יש את אותה אוריינטציה.
תתי היחידות של
אקטין G
הן א-סימטריות ומתחברות זו לזו בצורת ראש-זנב לאותו הכיוון: כך נוצר פילמנט שהוא ____ ובעל שתי קצוות - קצה ____ וקצה ____.
קצה הפלוס יהיה
“______”.
שמתארך מהר/לאט,
קצה המינוס יהיה
“_____”
שמתארך מהר/לאט.
תתי היחידות של
אקטין G
הן א-סימטריות ומתחברות זו לזו בצורת ראש-זנב לאותו הכיוון: כך נוצר פילמנט שהוא פולרי ובעל שתי קצוות - קצה פלוס וקצה מינוס.
קצה הפלוס יהיה
“barbrd end”.
שמתארך מהר,
קצה המינוס יהיה
“pounted end”
שמתארך לאט.
תתי היחידות של
אקטין G
ממוקמות כך שה
ATP
פונה לקצה ה.
מינוס
ביצירת אקטין, אוליגומרים קטנים של יחידות אקטין יכולים להתחבר זה לזה באופן ספונטני אך הם ___ ועוברים ___ במהרה. כדי שפילמנט חדש של אקטין יווצר, יחידות אקטין רבות צריכות ___ וליצור ___ או ___ שבו תתי היחידות מיוצבות ע”י ___. שלב זה נקרא שלב ה____- השלב ה___ בבניה של סיבי האקטין.
בתאים יש שימוש בחלבונים מיוחדים שמזרזים את ה___ של הסיב באתרים ספציפים בתא.
ביצירת אקטין, אוליגומרים קטנים של יחידות אקטין יכולים להתחבר זה לזה באופן ספונטני אך הם אינם יציבים ועוברים פירוק במהרה. כדי שפילמנט חדש של אקטין יווצר, יחידות אקטין רבות צריכות להיקשר וליצור אגרגט התחלתי או גרעין שבו תתי היחידות מיוצבות ע”י קשרים רבים בין תתי יחידות שכנות. שלב זה נקרא שלב הנוקלאציה- השלב המגביל בבניה של סיבי האקטין.
בתאים יש שימוש בחלבונים מיוחדים שמזרזים את הנוקלאציה של הסיב באתרים ספציפים בתא.
מהו השלב המגביל בבניה של סיבי האקטין?
שלב הנוקלאציה
(nucleation)
הוא השלב המגביל בבניה של סיבי האקטין.
בתאים יש שימוש בחלבונים מיוחדים שמזרזים את הנוקלאציה של הסיב באתרים ספציפים בתא.
חוסר היציבות של אגרגט של אקטין יוצר ___ לנוקלאציה. המחסום הזה מתייצג כשלב ____ בו ____. במהלך שלב זה מספר קטן לא יציב של אגרגנטים מתחיל ליצור תבנית יציבה יותר- שזה בעצם יצירת הנוקלאציה.
לאחר יצירת הגרעין, סיב זה יכול ___ במהירות ע”י הוספה של תתי יחידות נוספות. שלב זה נקרא שלב ה.
חוסר היציבות של אגרגט של אקטין יוצר מחסום קינטי לנוקלאציה. המחסום הזה מתייצג כשלב
LAG (עיכוב)
בו טרם רואים סיבים. במהלך שלב זה מספר קטן לא יציב של אגרגנטים מתחיל ליצור תבנית יציבה יותר- שזה בעצם יצירת הנוקלאציה.
לאחר יצירת הגרעין, סיב זה יכול להתארך במהירות ע”י הוספה של תתי יחידות נוספות. שלב זה נקרא שלב האלונגציה (elingation).
שלב האלונגציה
(elingation)
מתאר
מצב בו לאחר יצירת הגרעין של סיב האקטין, הסיב יכול להתארך במהירות ע”י הוספה של תתי יחידות נוספות.
הריכוז של תת יח’ האקטין החופשיות הנותרו בתמיסה בשלב ה_____ נקרא
אם ריכוז תתי היחידות החופשיות גדול מ
Cc
תתרחש…..
אם ריכוז תתי היחידות החופשית קטן מ
Cc
תתרחש ….
הריכוז של תת יח’ האקטין החופשיות הנותרו בתמיסה בשלב ה
steady state / equilibrium phase
נקרא הריכוז הקריטי
.Cc - critical concentration.
אם ריכוז תתי היחידות החופשיות גדול מ
Cc
תתרחש פולימריזציה.
אם ריכוז תתי היחידות החופשית קטן מ
Cc
תתרחש דה-פולימריזציה.
כאשר ריכוז יחידות האקטין החופשיים יורד, המערכת מגיעה ל____ שבו יש איזון בין קצב ההוספה לקצב ההסרה של תת היחידות.
שלב זה נקרא גם שלב….
כאשר ריכוז יחידות האקטין החופשיים יורד, המערכת מגיעה ל
steady state
שבו יש איזון בין קצב ההוספה לקצב ההסרה של תת היחידות.
שלב זה נקרא גם שלב שיווי המשקל (equilibrium phase).
הריכוז הקריטי
Cc
הינו שווה ערך ל ______ חלקי _____. וזה שווה ל…..
.הופכי לקבוע שיווי המשקל _____
הריכוז הקריטי
Cc
הינו שווה ערך ל
Koff -קבוע הקצב לאיבוד יחידות
חלקי
Kon -קבוע הקצב להוספת יחידות
-וזה שווה לקבוע הדיסטוציאציה
Kd.
Kd
הופכי לקבוע שיווי המשקל
Kd=1/K .
במבחנה נראה שה
Cc
הוא כ
_____.
בתא הריכוז הקריטי הוא הרבה יותר גבוה/נמוך, והתא פיתח מנגנונים שימנעו/יעזרו לכל תתי היחידות של האקטין להתפלמר.
במבחנה נראה שה
Cc
הוא כ
μM 0.1.
בתא הריכוז הקריטי הוא הרבה יותר גבוה, והתא פיתח מנגנונים שימנעו מכל תתי היחידות של האקטין להתפלמר.
כאשר מוסיפים לתמיסה פילמנטים קצרים, שלב ה
lag
____
והסיב מתחיל מיד
____.
בתא ישנם חלבונים מיוחדים שתפקידם לייצב יחידות בודדות בגרעין ראשוני לשם
______.
כאשר מוסיפים לתמיסה פילמנטים קצרים, שלב ה
lag
נחסך, והסיב מתחיל מיד להבנות במהירות. בתא ישנם חלבונים מיוחדים שתפקידם לייצב יחידות בודדות בגרעין ראשוני לשם בנייה מהירה של הסיב.
מה נכון לגבי “ההתגרענות” הראשונית של האקטין?
א. זהו השלב המהיר ביותר בפילמור סיב האקטין.
ב. גורמת לפירוק
ATP
של מונומרים של אקטין.
ג. זהו השלב קובע המהירות בפילמור סיב האקטין.
ד. אחרי ההתגרענות כל אקטין נוסף שיוסף לתמיסה יעלה את האוסמולריות של התמיסה.
ג. זהו השלב קובע המהירות בפילמור סיב האקטין.
לכל קצה של אקטין יש קצב גדילה שונה.
קצב ההוספה - kon
וקצב ההסרה - koff
הם גדולים יותר בקצה ה
____
אם כמות המונומרים החופשיים קטנה מהריכוז הקריטי -> קצה ה___ עובר דה-פולימריזציה מהר יותר.
לכל קצה של אקטין יש קצב גדילה שונה.
קצב ההוספה - kon
וקצב ההסרה - koff
הם גדולים יותר בקצה הפלוס.
אם כמות המונומרים החופשיים קטנה מהריכוז הקריטי -> קצה הפלוס עובר דה-פולימריזציה מהר יותר.
קצה הפלוס מתארך עד פי ___ מהר יותר מקצה המינוס.
אם כמות המונומרים החופשיים קטנה מהריכוז הקריטי -> קצה ה___ עובר דה-פולימריזציה מהר יותר.
קצה הפלוס מתארך עד פי 10 מהר יותר מקצה המינוס.
אם כמות המונומרים החופשיים קטנה מהריכוז הקריטי -> קצה הפלוס עובר דה-פולימריזציה מהר יותר.
לשני קצוות הסיב יש את אותה אפיניות/אפיניות שונה לתתי יחידות של אקטין.
אם כך, היחס בין הקבועים
koff/kon
הוא זהה/שונה עבור שני הקצוות.
מה לגבי הערכים המוחלטים?
לשני קצוות הסיב יש את אותה אפיניות לתתי יחידות של אקטין.
אם כך, היחס בין הקבועים
koff/kon
הוא זהה עבור שני הקצוות, למרות שהערכים המוחלטים הם שונים בכל קצה.
אלונגציה של סיב האקטין תקרה באופן ספונטני כאשר האנרגיה החופשית
(ΔG)
______
זה קורה כאשר ריכוז המונומרים החופשיים בתמיסה הוא ____ מהריכוז הקריטי.
אלונגציה של סיב האקטין תקרה באופן ספונטני כאשר האנרגיה החופשית
(ΔG)
היא קטנה מאפס.
זה קורה כאשר ריכוז המונומרים החופשיים בתמיסה הוא גדול מהריכוז הקריטי.
ההידרוליזה של
ATP
בתתי יחידות חופשיות היא ____, ו___ כאשר תתי היחידות משתלבות בסיב.
ההידרוליזה של
ATP
בתתי יחידות חופשיות היא איטית מאוד, ומואצת כאשר תתי היחידות משתלבות בסיב.
לאחר ההידרוליזה של סיבי האקטין, ה___ משתחרר מכל תת יחידה, אך ה
___
עדיין לכוד בתוך מבנה הסיב.
לאחר ההידרוליזה של סיבי האקטין, הפוספט משתחרר מכל תת יחידה, אך ה
ADP
עדיין לכוד בתוך מבנה הסיב.
נהוג לסמן את תתי היחידות בסיב האקטין לפי תצורת ה
ATP או ADP:
אקטין עם
ATP
נקרא תצורת
…….
אקטין עם
ADP
נקרא תצורת
…….
נהוג לסמן את תתי היחידות בסיב האקטין לפי תצורת ה
ATP או ADP:
אקטין עם
ATP
נקרא תצורת
T form.
אקטין עם
ADP
נקרא תצורת
D form.
יחס
koff/kon
עבור
_____
גדול יותר מהיחס
koff/kon
עבור
_____
כתוצאה מכך
Cc() < Cc().
בריכוזים מסוימים של תתי יחידות חופשיות, פולימרים בצורת
_
יתכווצו, בעוד שפולימרים בצורת
_
.יתארכו
זה נקרא
______
בסה”כ אורך הסיב
_____.
יחס
koff/kon
עבור
D form
גדול יותר מהיחס
koff/kon
עבור
T form.
כתוצאה מכך
Cc(T) < Cc(D).
בריכוזים מסוימים של תתי יחידות חופשיות, פולימרים בצורת
D
יתכווצו, בעוד שפולימרים בצורת
T
.יתארכו
זה נקרא
treadmilling (הליכון)
בסה”כ אורך הסיב לא משתנה.
תארי את תנועת ה
treadmilling
יחס
koff/kon
עבור
D form
גדול יותר מהיחס
koff/kon
עבור
T form.
כתוצאה מכך
Cc(T) < Cc(D).
בריכוזים מסוימים של תתי יחידות חופשיות, פולימרים בצורת
D
יתכווצו, בעוד שפולימרים בצורת
T
.יתארכו
זה נקרא
treadmilling (הליכון)
בסה”כ אורך הסיב לא משתנה.
קיימים ריכוזים קריטים שונים בקצוות פלוס והמינוס. תתי יחידות קשורות ל
ATP
(T צורת)
מתפלמרות בשני הקצוות של הסיב הגדל ואז עוברות הידרוליזה בתוך הסיב.
כשהסיב גדל, אלונגציה מהירה יותר מהידרוליזה בקצה ____, ולכן תתי היחידות בקצה הם תמיד בתצורת
____.
הידרוליזה מהירה יותר מאלונגציה בקצה ___, ולכן תתי היחדות בקצה זה הן בתצורת
____
קיימים ריכוזים קריטים שונים בקצוות פלוס והמינוס. תתי יחידות קשורות ל
ATP
(T צורת)
מתפלמרות בשני הקצוות של הסיב הגדל ואז עוברות הידרוליזה בתוך הסיב.
כשהסיב גדל, אלונגציה מהירה יותר מהידרוליזה בקצה פלוס, ולכן תתי היחידות בקצה הם תמיד בתצורת
T.
הידרוליזה מהירה יותר מאלונגציה בקצה מינוס, ולכן תתי היחדות בקצה זה הן בתצורת
D
תנועת ההליכון מתרחשת בריכוזי ___ של תתי היחידות החופשיים. הריכוז הקריטי של הפלמור בקצה הסיב בתצורת
T
____
יותר מאשר תצורת
D.
אם הריכוז של תתי היחידות נמצא בין שני הריכוזים הקריטיים של קצה פלוס ושל קצה מינוס, נקבל תנועה של התארכות בקצה ___ והתקצרות בקצה ____, וכתוצאה מכך נקבל תנועה של הליכון.
תנועת ההליכון מתרחשת בריכוזי ביניים של תתי היחידות החופשיים. הריכוז הקריטי של הפלמור בקצה הסיב בתצורת
T
נמוך יותר מאשר תצורת
D.
אם הריכוז של תתי היחידות נמצא בין שני הריכוזים הקריטיים של קצה פלוס ושל קצה מינוס, נקבל תנועה של התארכות בקצה פלוס והתקצרות בקצה מינוס, וכתוצאה מכך נקבל תנועה של הליכון.
Arp2/3
עוזר להתגרענות מקצה ה___ ונשאר ___. ולכן מוביל להתארכות מהירה של הסיב בקצה ה
____
Arp2/3
הוא חלבון שכולל ____ חלבונים מסוג
____ (_____).
כל חלבון זהה ה-___% ל
____.
Arp2/3
עוזר להתגרענות מקצה המינוס ונשאר קשור אליו. ולכן מוביל להתארכות מהירה של הסיב בקצה הפלוס.
Arp2/3
הוא חלבון שכולל שני חלבונים מסוג
ARPs (actin related proteins).
כל חלבון זהה ב-45% לאקטין.
נוקלאציה בעזרת
Arp2/3
תלויה ב
______ (_____).
נוקלאציה בעזרת
Arp2/3
תלויה בפקטורים מקדמי נוקליאציה (nuclear promoting factors - NPFs).
ישנם
_____
רבים שכל סוג משמש לאיניציאציה של תהליכים תלויי אקטין שונים.
ישנם
NPFs
רבים שכל סוג משמש לאיניציאציה של תהליכים תלויי אקטין שונים.
לדוגמה - העברת וזיקולות למרחקים קצרים, יצירת צמתי אדהזיה, פאגוציטוזה ויצירת protrusions
במהלך מיגרציה של תאים.
Arp2/3
יכול להיקשר לצידי הסיב ב-___ מעלות וכך ליצור מבנים מסועפים של אקטין (נקרא ___).
Arp2/3
יכול להיקשר לצידי הסיב ב-70 מעלות וכך ליצור מבנים מסועפים של אקטין (נקרא רשת דנדריטית).
Arp2/3
הוא גם
_____
וגם
_____
Arp2/3
הוא גם
גורם התגרענות
וגם
יכול ליצור רשת מסועפת
תארי את
Formin
טבעת שבנויה כדימר.
קושרת שני מונומרים של אקטין ונשארת בקצה הפלוס.
מעודדת נוקלאציה והתארכות של קצה הסיב.
מסייעת ביצירת מבנים ישרים ולא מסועפים של אקטין מסוג צרורות
(bundles).
בנוסף לתפקידה בנוקלאציה, פורמין מאיצה בצורה דרמטית את התארכות הסיב. הפורמינים מתווכים מספר רב של מבנים תאיים שמכילים סיבי אקטין פולריים כולל פילופודיה, סיבי סטרס ואת ה
contractile ring.
טבעת ה
_____
יושבת על קצה הפלוס וכשסיב האקטין עובר פולמריזציה הטבעת ____ יחד איתו (____ על קצה הפלוס).
טבעת ה
Formin
יושבת על קצה הפלוס וכשסיב האקטין עובר פולמריזציה הטבעת זזה יחד איתו (נשארת על קצה הפלוס).