עיכובים ונהנים-אנזימים Flashcards
מהו עיכוב הפיך?
מהו עיכוב בלתי הפיך
התייחס ל:
סוג הקשרים הנוצרים בכל מצב
מהם תת הסוגים השונים של כל סוג עיכוב? בלי פירוט
אתר הקשירה
עיכוב הפיך- מעכב נקשר לאנזים בקשרים לא קוולנטים חלשים ואין עיכוב קבוע של האנזים. מידת העיכוב תלוי בכמות האנזים הקשור למעכב בשיווי משקל. יכול להיקשר לאתר הפעיל או לאתר שאיננו האתר הפעיל.
יש 3 סוגים של עיכוב הפיך:
- MIXED
- uncompetitve
- competitve
עיכוב בלתי הפיך- כרוך ביצירה של קשר קוולנטי בלתי הפיך של מעכב לאנזים באתר שאיננו האתר הפעיל. גורם לביטול מוחלט של פעילות האנזימית ומידת העיכוב מתקדמת עם הזמן (גז כעצבים לדוגמא מעכב באופן בלתי הפיך את אצטיל כולין אסטרז) במצב הזה
vmax יורד כי כמות הפועלים יורדת
מהו
ki
kampp
a (alpha)
ki

קבוע הדיסאסוציאציה של המעכב מהוו מדד לאפיניות האנזים למעכב. כל שערכו קטן יותר ככה הוא יותר אפיני אליו (כמו באפיניות רגילה).
kampp
ערכו של בנוחכות מעכב KM
. הוא תמיד יהיה יותר גבוה מקיי אמ כי הוא מוכפל בפאקטור אלפא . בנוסף ק’יי אמ הוא ערך קבוע והוא נמדד עבור אנזים מסויים ביחס לסובסטרט נתון לעומת זאת ערך <em>קיי אמפ </em>תלוי <strong>גם בריכוז המעכב. </strong>
a (alpha)
הזווית שבה גדל או קטן השפיע בנוחכות מעכב
1+ concentration of inhibitor/ the affintiy of the inhibitor to its substrate
כלל שפאקטור a
גדול יותר- האנזים פחות או יותר אפיני למעכב שלו?
אלפא גדולה פירושה מונה גדול ומכנה קטן.
המכנה מייצג את האפיניות של האנזים למעכב, והמונה את ריכוז המעכב
לכן, אם יש ריכוז אנזים גבוה, ואפיניות נמוכה- האנזים פחות אפיני למעכב שלו.

מה ההבדל בין
a ל a’
(אלפא לאלפא טאג)
ההבדל הוא ביחידות הריכוז של KI
שימו לב שאלפא- תקף על מעכב competitve and non competitve
אלפא טאג- mixed and uncompetitve
בשני המקרים זה פאקטור ההכפלה של
km and vmax

הגדר
עיכוב תחרותי
(competitve)
האם המעכב דומה לסובסטרט?
לאיזה אתר המעכב נקשר?
מה קורה ל
vmax
km
עיכוב תחרותי-המעכב מתחרה עם הסובסרט על האתר הפעיל של האנזים לרב, יהיה דומה לו מרחבית. מוריד את כמות האנזים החופשי שיכול לקשור סובסטרט
- האם המעכב דומה לסובסטרט?* כן
- לאיזה אתר המעכב נקשר*? האתר הפעיל
vmax
לא משתנה, הוא לא פוגע במהירות שבה פועלים אנזימים לא מעוכבים
km יקרא Kampp
,עולה פי פאקטור אלפא, כי צריך ריכוז גבוה יותר של סובסטרט כדי להגיע למחצית מהמהירות המקסימלית
או במילים אחרות - ככל שאלפא גדול יותר ככה צריך יותר סובסטרט

הגדר
עיכוב בלתי הפיך
האם המעכב דומה לסובסטרט?
לאיזה אתר המעכב נקשר?
מה קורה ל
vmax
km
עיכוב בלתי הפיך- נוצרים קשרים קוולנטים בלתי הפיכים המוציא את האנזים בכלל שימוש- מוריד את כמות האנזים האפקטיבי בתמיסה
vmax
קטן -כי פוחת הסיכוי למפגש פורה בין אנזים לסובסטרט כאשר ריכוז האנזים האפקטיבי יורד
KM
לא משתנה- זוהי תכונה אינטרינזית לכל אנזים

הגדר
un-competitve עיכוב
מה
האם המעכב דומה לסובסטרט?
לאיזה אתר המעכב נקשר?
מה קורה ל
vmax
km
un-competitve
עיכוב בו המעכב אינו נקשר לאתר הפעיל** של אנזים אלא לאתר אחר באנזים **לאחר** **היווצרות הקומפלקס ES.
המעכב מונע את הפיכת התצמיד לתוצר באחת משתי דרכים: 1.קשר ישיר עם הסובסטרט 2. שינוי קונפורמציה של האתר הפעיל לאחר קשירת המעכב
האם המעכב דומה לסובסטרט?
- לא דומה*
- לאיזה אתר המעכב נקשר?*
לא לאתר הפעיל
vmax
קטן פי פאקטור אלפא טאג- יש פחות אנזים אפקטיבי בתמיסה
km
קטן פי פאקטור אלפא- בגלל שתהיה ירידה ב K-1
כלומר כל מה שעוכב נתקע בשלב הקומפלקס אנזים סובסטרט
K1, לא מתרחשת התגובה לכיוון השני.
המונה קטן, זה מקטין את כל KM

הגדר
MIXED
האם המעכב דומה לסובסטרט?
לאיזה אתר המעכב נקשר?
מה קורה ל
vmax
km
mixed
נקשר גם לאנזים חופשי וגם לקומפלקס אנזים סובסטרט באתר שאיננו האתר הפעיל
both E and ES
האם המעכב דומה לסובסטרט?
לא
לאיזה אתר המעכב נקשר?
אתר שאיננו האתר הפעיל
vmax
יורד פי פאקטור אלפא טאג!
km
יורד פי פאקטור אלפא טאג או עולה פי פאקטור אלפא- לרב יורד אך תלוי לאן נקשר
מה ההבדל בין עיכוב
mixed
ל nonecompetitve
?
כאשר המעכב אפיני באותה מידה לאנזים חופשי ולקמפלקס זה נקרא
none competitve
זה למעשה מקרה פרטי של mixed
שבדרך כלל מעדיף להיקשר לאחד מהם יותר.
מה המגרפים הבאים מייצג עיכוב מסוג
mixed ומה
מייצג none competitve?

הקו הירוק-MIXED
אם יורד VMAX
וזה לא קווים מקבילים זה בטוח
MIXED!
קו אדום-none competitve
vmax יורד
km לא משתנה
בשורה התחתונה- כדי להבדיל בינהם צריך להסתכל שקיי אם לא מתשנה זה בטוח נונקומפטיטיבי אם לא נתנו פרטים נוספים על אפיניות המעכב
- יכול להיות שבמיקס זה ירד גם אבל אז יתנו פרטים על אפיניות המעכב- אם הוא מעדיף להיקשר לקומפלקס אנזים סובסטרט אז הוא ירד, אם לאנזים חופשי אז נצפה לעלייה בKM!!
אם
vmax לא משתנה
KM עולה
זה?
תחרותי
אם
VMAX יורד
KM יורד
וזה קווים מקבילים
זה?
uncompetitve
אם
VMAX יורד
KM יורד או עולה
וזה לא קווים מקבילים
זה?
mixed
אם
VMAX יורד
KM לא משתנה
זה?
none competitve
or
בלתי הפיך!
נראה גרפית אותו דבר
בבלתי הפיך לא נראה תלות בזמן
זהה את סוג המעכב

KM גדל
VMAX לא משתנה
מעכב תחרותי
זהה את המעכב

קווי מקבלים,
vmax קטן
uncomeptitve
זהה את המעכב

Km לא משתנה
vmax יורד
none competitve
זהה את המעכב

vmax אותו דבר
km גדל
competitve
מהי בקרה אלוסטרית?
בין אילו שני מצבים היא נעה?
מהו מנגנון הפידבק ?
איזה עקומה מייצגת את פעילותם? ומה משמעותה?
מהי בקרה אלוסטרית?
: בקרה שכיחה במערכות ביולוגיות המבוססת על שינוי קונפורמציה של החלבון בעקבות קישור למולקולת אפקטור. האפקטור יכול להיות אקטיבטור או רפרסור. חומרים אלו הם בעלי מבנה כימי שונה לחלוטין מסובסטרט של אותו אנזים, לכן הסברה היא שהם נקשרים לאזורים שאינם האתר הפעיל, אלא לאתר אלוסטרי המתאים להם. יש שני מודלים שהוצעו בכדי להסביר את התנהגותם: הדגם המתואם (הסימטרי) ודגם הרצף. שינהם מסבירים את השינויים המתרחשים בעקבות הקשירה ושינהם מושתתים על אופי שיתופי בין הליגנד לתת היחידות המריכבות את החלבון
- בין אילו שני מצבים היא נעה?*
- מצב פעיל- מסיט את העקומה שמאלה (כמו בהמוגלובין) מושרה עי אקטיבטור מגביר אפיניות*
- מצב בלתי פעיל- מסיט את העקומה ימינה- מוריד אפיניות מושרה עי רפרסור*
R= פעיל T=לא פעיל
מהו מנגנון הפידבק ?
פידבק חיובי- תוצרים שנוצרו בשלבים יותר מאוחרים של הריאקציה מעודד את היווצרות התוצרים שקדמו להם.
פידבק שלילי:ו התוצר מעכב את הריאקציה שגרמה להיווצרותו
לדגומא בגליקוליזה
ATP
הוא מעכב אלוסטרי שלילי של פוספופרוקטוקינאז- שיש הרבה ממנו הוא יעכב את האנזים ויאט את הייצור שלו עצמו
- איזה עקומה מייצגת את פעילותם? ומה משמעותה?*
- עקומה סיגמואידית, הסטה שמאלה זה הגברת אפיניות השטה ימינה זה הורדת אפיניות. הבטן של העקומה מייצגת את מנגנון הקואפרטיביות. זה לא עולה לינארית אלא מתחיל רגיל ואז בבאת אחד כל הקומפלקס יותר אפיני. קואפרטיביות יכולה להיות חיובית או שלילית- כלומר להוריד או לעלות אפיניות של כל הקומפלקס*
מהו מעכב הומוטרופי?
מהו מעכב הטרוטרופי?
מעכב המוטרופי- התוצר הוא גם הסובסטרט
מעכב הטרוטרופי- המעכב והסובסטרט זה לא אותו חומר
מיהו
k0.5
מה קורה לערך הזה אם מוסיפים רפרסור או אקטיבטור
באנזימים אלוסטרים, מכיוון שאינן מצייתים למיכאליס מנטן נעשה שימוש במושג מקביל לKM, שנקרא
K0.5- ריכוז הסובסטרט שנותן לי חצי מהמהירות המקסימלית
הוספת אקטיבטור – מורידה את K0.5
הוספת מעכב- מוריד את K0.5
מה זה
suicide inactivator?
עיכוב התאבדותי, או רפרסור התאבדותי זה סוג של עיכוב בלתי הפיך בו המעכב משתמש במכנזים של האנזים כדי להשבית אותו.
הרפרסור הזה רותם את מנגנון הקטליזה של האנזים באתר הפעיל כדי להשבית אותו עי מודיפקציה כימית על הקו פקטור של האנזים
באיזה קשרים נקשרים אפקטורים אלוסטרים לאנזים?
by definition
קשר אלוסטרי הוא קשר לא קוולנטי