עיכובים ונהנים-אנזימים

Question 1

מהו עיכוב הפיך?

מהו עיכוב בלתי הפיך

התייחס ל:

סוג הקשרים הנוצרים בכל מצב

מהם תת הסוגים השונים של כל סוג עיכוב? בלי פירוט

אתר הקשירה

Answer 1

עיכוב הפיך- מעכב נקשר לאנזים בקשרים לא קוולנטים חלשים ואין עיכוב קבוע של האנזים. מידת העיכוב תלוי בכמות האנזים הקשור למעכב בשיווי משקל. יכול להיקשר לאתר הפעיל או לאתר שאיננו האתר הפעיל.

יש 3 סוגים של עיכוב הפיך:

1. MIXED
2. uncompetitve
3. competitve

עיכוב בלתי הפיך- כרוך ביצירה של קשר קוולנטי בלתי הפיך של מעכב לאנזים באתר שאיננו האתר הפעיל. גורם לביטול מוחלט של פעילות האנזימית ומידת העיכוב מתקדמת עם הזמן (גז כעצבים לדוגמא מעכב באופן בלתי הפיך את אצטיל כולין אסטרז) במצב הזה

vmax יורד כי כמות הפועלים יורדת

Question 2

מהו

k_i

k_ampp

_{a (alpha)}

Answer 2

k_i

קבוע הדיסאסוציאציה של המעכב מהוו מדד לאפיניות האנזים למעכב. כל שערכו קטן יותר ככה הוא יותר אפיני אליו (כמו באפיניות רגילה).

k_ampp

_{ערכו של בנוחכות מעכב KM}

_{. הוא תמיד יהיה יותר גבוה מקיי אמ כי הוא מוכפל בפאקטור אלפא . בנוסף ק’יי אמ הוא ערך קבוע והוא נמדד עבור אנזים מסויים ביחס לסובסטרט נתון לעומת זאת ערך <em>קיי אמפ </em>תלוי <strong>גם בריכוז המעכב. </strong>}

_{a (alpha)}

_{הזווית שבה גדל או קטן השפיע בנוחכות מעכב}

1+ concentration of inhibitor/ the affintiy of the inhibitor to its substrate

Question 3

כלל שפאקטור a

גדול יותר- האנזים פחות או יותר אפיני למעכב שלו?

Answer 3

אלפא גדולה פירושה מונה גדול ומכנה קטן.

המכנה מייצג את האפיניות של האנזים למעכב, והמונה את ריכוז המעכב

לכן, אם יש ריכוז אנזים גבוה, ואפיניות נמוכה- האנזים פחות אפיני למעכב שלו.

Question 4

מה ההבדל בין

a ל a’

(אלפא לאלפא טאג)

Answer 4

ההבדל הוא ביחידות הריכוז של K_I

שימו לב שאלפא- תקף על מעכב competitve and non competitve

אלפא טאג- mixed and uncompetitve

בשני המקרים זה פאקטור ההכפלה של

km and vmax

Question 5

הגדר

עיכוב תחרותי

(competitve)

האם המעכב דומה לסובסטרט?

לאיזה אתר המעכב נקשר?

מה קורה ל

vmax

km

Answer 5

עיכוב תחרותי-המעכב מתחרה עם הסובסרט על האתר הפעיל של האנזים לרב, יהיה דומה לו מרחבית. מוריד את כמות האנזים החופשי שיכול לקשור סובסטרט

• האם המעכב דומה לסובסטרט?* כן
• לאיזה אתר המעכב נקשר*? האתר הפעיל

vmax

לא משתנה, הוא לא פוגע במהירות שבה פועלים אנזימים לא מעוכבים

km יקרא K_ampp

,עולה פי פאקטור אלפא, כי צריך ריכוז גבוה יותר של סובסטרט כדי להגיע למחצית מהמהירות המקסימלית

או במילים אחרות - ככל שאלפא גדול יותר ככה צריך יותר סובסטרט

Question 6

הגדר

עיכוב בלתי הפיך

האם המעכב דומה לסובסטרט?

לאיזה אתר המעכב נקשר?

מה קורה ל

vmax

km

Answer 6

עיכוב בלתי הפיך- נוצרים קשרים קוולנטים בלתי הפיכים המוציא את האנזים בכלל שימוש- מוריד את כמות האנזים האפקטיבי בתמיסה

vmax

קטן -כי פוחת הסיכוי למפגש פורה בין אנזים לסובסטרט כאשר ריכוז האנזים האפקטיבי יורד

KM

לא משתנה- זוהי תכונה אינטרינזית לכל אנזים

Question 7

הגדר

un-competitve עיכוב

מה

האם המעכב דומה לסובסטרט?

לאיזה אתר המעכב נקשר?

מה קורה ל

vmax

km

Answer 7

un-competitve

עיכוב בו המעכב אינו נקשר לאתר הפעיל** של אנזים אלא לאתר אחר באנזים **לאחר** **היווצרות הקומפלקס ES.

המעכב מונע את הפיכת התצמיד לתוצר באחת משתי דרכים: 1.קשר ישיר עם הסובסטרט 2. שינוי קונפורמציה של האתר הפעיל לאחר קשירת המעכב

האם המעכב דומה לסובסטרט?

• לא דומה*
• לאיזה אתר המעכב נקשר?*

לא לאתר הפעיל

vmax

קטן פי פאקטור אלפא טאג- יש פחות אנזים אפקטיבי בתמיסה

km

קטן פי פאקטור אלפא- בגלל שתהיה ירידה ב K_-1

כלומר כל מה שעוכב נתקע בשלב הקומפלקס אנזים סובסטרט

K1, לא מתרחשת התגובה לכיוון השני.

המונה קטן, זה מקטין את כל KM

Question 8

הגדר

MIXED

האם המעכב דומה לסובסטרט?

לאיזה אתר המעכב נקשר?

מה קורה ל

vmax

km

Answer 8

mixed

נקשר גם לאנזים חופשי וגם לקומפלקס אנזים סובסטרט באתר שאיננו האתר הפעיל

both E and ES

האם המעכב דומה לסובסטרט?

לא

לאיזה אתר המעכב נקשר?

אתר שאיננו האתר הפעיל

vmax

יורד פי פאקטור אלפא טאג!

km

יורד פי פאקטור אלפא טאג או עולה פי פאקטור אלפא- לרב יורד אך תלוי לאן נקשר

Question 9

מה ההבדל בין עיכוב

mixed

ל nonecompetitve

?

Answer 9

כאשר המעכב אפיני באותה מידה לאנזים חופשי ולקמפלקס זה נקרא

none competitve

זה למעשה מקרה פרטי של mixed

שבדרך כלל מעדיף להיקשר לאחד מהם יותר.

Question 10

מה המגרפים הבאים מייצג עיכוב מסוג

mixed ומה

מייצג none competitve?

Answer 10

הקו הירוק-MIXED

אם יורד VMAX

וזה לא קווים מקבילים זה בטוח

MIXED!

קו אדום-none competitve

vmax יורד

km לא משתנה

בשורה התחתונה- כדי להבדיל בינהם צריך להסתכל שקיי אם לא מתשנה זה בטוח נונקומפטיטיבי אם לא נתנו פרטים נוספים על אפיניות המעכב

• יכול להיות שבמיקס זה ירד גם אבל אז יתנו פרטים על אפיניות המעכב- אם הוא מעדיף להיקשר לקומפלקס אנזים סובסטרט אז הוא ירד, אם לאנזים חופשי אז נצפה לעלייה בKM!!

Question 11

אם

vmax לא משתנה

KM עולה

זה?

Answer 11

תחרותי

Question 12

אם

VMAX יורד

KM יורד

וזה קווים מקבילים

זה?

Answer 12

uncompetitve

Question 13

אם

VMAX יורד

KM יורד או עולה

וזה לא קווים מקבילים

זה?

Answer 13

mixed

Question 14

אם

VMAX יורד

KM לא משתנה

זה?

Answer 14

none competitve

or

בלתי הפיך!

נראה גרפית אותו דבר

בבלתי הפיך לא נראה תלות בזמן

Question 15

זהה את סוג המעכב

Answer 15

KM גדל

VMAX לא משתנה

מעכב תחרותי

Question 16

זהה את המעכב

Answer 16

קווי מקבלים,

vmax קטן

uncomeptitve

Question 17

זהה את המעכב

Answer 17

Km לא משתנה

vmax יורד

none competitve

Question 18

זהה את המעכב

Answer 18

vmax אותו דבר

km גדל

competitve

Question 19

מהי בקרה אלוסטרית?

בין אילו שני מצבים היא נעה?

מהו מנגנון הפידבק ?

איזה עקומה מייצגת את פעילותם? ומה משמעותה?

Answer 19

מהי בקרה אלוסטרית?

: בקרה שכיחה במערכות ביולוגיות המבוססת על שינוי קונפורמציה של החלבון בעקבות קישור למולקולת אפקטור. האפקטור יכול להיות אקטיבטור או רפרסור. חומרים אלו הם בעלי מבנה כימי שונה לחלוטין מסובסטרט של אותו אנזים, לכן הסברה היא שהם נקשרים לאזורים שאינם האתר הפעיל, אלא לאתר אלוסטרי המתאים להם. יש שני מודלים שהוצעו בכדי להסביר את התנהגותם: הדגם המתואם (הסימטרי) ודגם הרצף. שינהם מסבירים את השינויים המתרחשים בעקבות הקשירה ושינהם מושתתים על אופי שיתופי בין הליגנד לתת היחידות המריכבות את החלבון

• בין אילו שני מצבים היא נעה?*
• מצב פעיל- מסיט את העקומה שמאלה (כמו בהמוגלובין) מושרה עי אקטיבטור מגביר אפיניות*
• מצב בלתי פעיל- מסיט את העקומה ימינה- מוריד אפיניות מושרה עי רפרסור*

R= פעיל T=לא פעיל

מהו מנגנון הפידבק ?

פידבק חיובי- תוצרים שנוצרו בשלבים יותר מאוחרים של הריאקציה מעודד את היווצרות התוצרים שקדמו להם.

פידבק שלילי:ו התוצר מעכב את הריאקציה שגרמה להיווצרותו

לדגומא בגליקוליזה

ATP

הוא מעכב אלוסטרי שלילי של פוספופרוקטוקינאז- שיש הרבה ממנו הוא יעכב את האנזים ויאט את הייצור שלו עצמו

• איזה עקומה מייצגת את פעילותם? ומה משמעותה?*
• עקומה סיגמואידית, הסטה שמאלה זה הגברת אפיניות השטה ימינה זה הורדת אפיניות. הבטן של העקומה מייצגת את מנגנון הקואפרטיביות. זה לא עולה לינארית אלא מתחיל רגיל ואז בבאת אחד כל הקומפלקס יותר אפיני. קואפרטיביות יכולה להיות חיובית או שלילית- כלומר להוריד או לעלות אפיניות של כל הקומפלקס*

Question 20

מהו מעכב הומוטרופי?

מהו מעכב הטרוטרופי?

Answer 20

מעכב המוטרופי- התוצר הוא גם הסובסטרט

מעכב הטרוטרופי- המעכב והסובסטרט זה לא אותו חומר

Question 21

מיהו

k_0.5

_{מה קורה לערך הזה אם מוסיפים רפרסור או אקטיבטור}

Answer 21

באנזימים אלוסטרים, מכיוון שאינן מצייתים למיכאליס מנטן נעשה שימוש במושג מקביל לKM, שנקרא

K0.5- ריכוז הסובסטרט שנותן לי חצי מהמהירות המקסימלית

הוספת אקטיבטור – מורידה את K0.5

הוספת מעכב- מוריד את K0.5

Question 22

מה זה

suicide inactivator?

Answer 22

עיכוב התאבדותי, או רפרסור התאבדותי זה סוג של עיכוב בלתי הפיך בו המעכב משתמש במכנזים של האנזים כדי להשבית אותו.

הרפרסור הזה רותם את מנגנון הקטליזה של האנזים באתר הפעיל כדי להשבית אותו עי מודיפקציה כימית על הקו פקטור של האנזים

Question 23

באיזה קשרים נקשרים אפקטורים אלוסטרים לאנזים?

Answer 23

by definition

קשר אלוסטרי הוא קשר לא קוולנטי