מולקולרית Flashcards
1
Q
MutH
A
1.אינו קיים באוקרטים בכלל!
2.חתוך את הדנא בתהליך של MMR
3.נמצא בפרוקריוטחם
4.MMR בשכפול יש את
2
Q
טלומרים
A
נבנים רק באאוקריוטים על הגדיל ההורי בלבד.
3
Q
פרומוטור
A
מהווה אתר תחילת שעתוק
ולא שכפול !!!!!
4
Q
מה התפקיד של
Histone fold domaim
A
5
Q
Abortive initation
A
בשעתוק חיידקי ואוקריוטי לפי שהפולימרז עוזב את הפרומוטור, הוא משעתק מקטעי RNA קצרים שנקראים כך.
6
Q
באיזה שלב ההסטונים עוברים סינתזה?
A
בשלב S
7
Q
מתי וריאנטים של הסטונים מיוצרים?
A
שלב האינרפאזה
8
Q
למי אין וריאנטים?
A
להסטון H4
9
Q
וריאנט H3 אחראי על ?
A
CENP-A
10
Q
למנות את כל סוגי הוריאנטים ועל מה הם אחראים?
A
11
Q
רצפי אלפא סטיילאז
A
בדרך כלל מופיעים בצנטרומר אך גם באיזורים שאינם הצנטרומר.
מכך מסיקים שרצפים אילו אינם מספיקים על מנת ליצור צנטרומר.
12
Q
מה התפקיד של האנזים פוספ-הידרולאז?
A
הוא מסיר את פוספט גמא מהנוקלאוטיד הראשון
של mRNA
כאשר רוצים להוסיף cap
13
Q
מה התפקיד של האנזים גואניליל טראנספראז?
A
הוא מעביר GMP מתוך GTP החופשי לפוספט בטא של ה-mRNA.
בתהליך הcapping של mRNA
14
Q
בתהליך איניציאציית התרגום באיזה רצף הריבוזום יתחיל תרגול ראשוני?
באואוקריוטים
A
ברצף קוזאק
ACcAUGG
15
Q
כיצד עובדת האנטיביוטיקה כלורמפניקול?
A
כלור זה גלון גדול ולכן אנטיביוטיקה זו פוגעת בתת היחידה הגדולה.
מעכבת את הפפטידיל טרנספראז
משפיע על האלונגציה.
כלור הורגת את החיידקים ומפסיקה להם את האלונגציה
16
Q
אוליגונדטרוציט מי הוא? ומה תפקידו?
A
אוליגודנטרוציט מספק את מעטפת המיאלין לאקסונים.
אוליגו=אולירך=עשיר מלא כסף=עשיר במיאלין.
17
Q
מה הדנטריטים הפרוקסימליים (ליד גוף התא) מכילים?
A
גופי ניסל- שהם חלקים מrET, ומכילים ריבוזומים ומשמשים לסינתזה של חלבונים. וחלקים ממערכת הגולגי.
18
Q
גוף תא הדנדריט-מכונה סומא או perikaryon
A
המרכז הגנטי והמטבולי העיקרי של נוירון. מכיל את הגרעין ואברונים רבים הדרושים לביוסנתזה של מרכיבי ממברנה ואנזימים. בין היתר גם גופי ניסל,גולג׳י,מיטוכונדריה ואלמנטים של שלד התא.
19
Q
מה התפקיד של snoRNA?
A
הם מכווינים את המודיפיקציות שמוסיפים על גבי הריבוזום.
snoRNA
מכילים RNA מכווין guideRNA אליו מחוברים האנזימים החלבוניים שאחראים לביצוע מודיפיקציות לרצפים ספציפיים. חלקיקי snoRNA אחרים מתיישבים על גבי RNA הריבוזומאלי ומאפשרים שינויים במבנה שלו וחופשים אתרים יעודיים לחתוך על ידי נוקלאזות.
20
Q
snoRNA
A
חלק ממולקות snoRNA הפעילים בגרעינון, מקורם באינטרונים המקודדים על גבי pre-mRNA של חלבונים ריבוזומאלים.
21
Q
snoRNP
A
דוגמה למודיפיקציה שהוא מבצע היא הפיכת אורידין לפסאו אורידין על ידי סיבוב הבסיס החנקני. כך שהריבוז קשור לפחמן של הבסיס החנקני במקום לחנקן בבסיס החנקני.
כלומר, הוא משנה את הקשר בין הבסיס החנקני ובין הריבוז.
22
Q
snoRNP
A
מבצע מתיליה על הריבוז על פחמן 2 .
23
Q
עם מי הסטונים עושים אינטרקציה?
A
התעלה הקטנה רצפי AT
24
Q
NtrC
A
משמש כאקטיבטור בעזרת DNA looping בחיידקים.
ביוקריוטים יש גן שימוש בלולאות דנא כאמצעי בקרה.
לשים לב שהוא נקשר לרנא פולימרז. ניתן לראות אותו במקרוסקופ אלקטרונים את האינטרקציה.
25
איזה יכולת הגהה יש לtRNA?
יכולת הגהה הידרוליטית.
יש טעות אחת ל40,000 ריאקציות.
26
CStF
קומפלקס רב יחי הרוכב על זנב CDT ומזהה רצף עשיר ב - G וב- U
27
CPSF
קומפלקס הרוכב על זנב ה-CDT ומזהה רצף AAUAAA.
במנגנון פוליאדנילציה קומפלס זה מבצע חיתוך במרחק של 10-30 נוקלאוטידים מרצף AAUAAA ומשאיר את OH קצה 3׳ של נוקלאוטיד A מרצף CA.
לאחר חיתוך זה יגיע אנזים PAP המפלמר פולי A **ללא תבנית**
28
אנזים PAP
מפלמר פולי A במנגנון פוליאדנילציה. כאשר את 10-12 נוקלאוטידים ראשונים באופן איטי ועוד 200 באופן מהיר.
29
PAB
**חלבון אחד** על כל 10-12 נוקלאוטידים של פולי A.
30
מי מבין חלבוני ההסטונים הבאים מעורב במעבר ממבנה סיב כרומטין בעובי 11 ננומטר למבנה סיב כרומטין בעובי של 30 ננומטר?
H4 andH1
31
פקטורי שעתוק
1.אינטרקציה בינהם היא קואופרטיבית
2.פועלים בגרף סיגמואידלי-all or non
3.
32
Homodomain
נקשרים לסרין וארגנין
33
יחידה סיגמא
נמצאת בתהליך שעתוק.
מתחברת עם אנזים ליבה-> תפקידה של תת יחידה סיגמה להגביר את האפיניות של הפולימראז לרצפי הבקרה =פרומוטורים.
כאשר כל זה מתחבר לדנא תיהיה פתיחה של הדנא (בועה בת 10 בסיסים) שהיא בועת שעתוק=הקומפלקס הפתוח.
**הבסיסים הלא מזווגים בבועת השכפול מיוצבים על ידי תת יחידה סיגמא **
**נקשר בין מינוס 10 למינוס 35**
34
Promoter clearace
כאשר הפולמראז עוזב את תת יחידה סיגמא ומתקדם על גבי התבנית
35
קונפורמציה B
שמור לDNA בלבד
נמצא בסביבה הידרופילית
מצב טבעי של ה DNA
36
קונפורמציה A
סביבה שבה הDNA נמצא בצורה הידרופובית
יכול להיות גם מעורבב עם RNA
תמיד תמיד RNA יהיה רק בקונפורמצית A
37
מתי מתחברים חלבוני SR על גבי האקסונים?
**בזמן** השעתוק
38
כמה מולקולות tRNA יש ?
48
39
קומפלקס Exosome
קומפלקס חלבוני גדול המצוי בגרעין.
קומפלקס זה עשיר ב3 ל-5 אקסונוקלאזות המצויות בחלקו הפנימי ומפרקות את כל השאריות והפסולת של RNA המצוי בגרעין.
40
מקרומולקולות מעל 60 קילודלתון
לא יכולות לצאת מהגרעין דרך ה NPC .
ולכן מוסיפים להם nuclear export receptor
על קצה 3׳
עוד לפני תהליך הביקוע של פוליאדנילציה.
מולקולת ה- nuclear export receptor מלווה את מולקולות הmRNA החוצה וחוזרת אחר כך שוב לגרעין על ידי מערכת ran על מנת להוציא שוב מולקולות חדשות.
41
Enhancers
אקטיבטורים של השעתוק נקשרים לרצפי דנא אילו.
42
מאיפה שרשרת החלבונים שכעת תרגמנו יוצאת?
מאיזור P בריבוזום
43
להיכן מתחברים חלבוני פקטורי השחרור?
לאתר A בריבוזום.
הם יסגנלו לפפטיד טרנספראז להוסיף מולקולה מים במקום חומצה אמינית. וכך יהיה זירוז של הידרוליזה של הקשר האסטרי האחרון.
44
Chromosome Banding Pattern
דפוס מתייחס לאזורים כהים ובהירים לאורך הכרומוזום, אשר בדרך כלל נצבע בצביעת גימזה בשלב המוקם של המיטוזה וניתן לזהותם בעזרת מיקרוסקופ אור.
45
L1
לאיזה קבוצה שייך ?
Nonretroviral retrotransposon
איך זוכרים?
L=leshaker-לשקר
שם נוסף שיש להם LINE הם אחראים למחלות אנושיות כמו המופיליה.
46
RNAseP
אחראי לבקע ולעבד את קצה 5׳ של tRNA באופן מדוייק לחלוטין.
הוא סוג של ריבוזים.
47
דרך איפה החומצה האמינית מחוברת לAMP?
החומצה האמינית מחוברת דרך הקצה הקרבוקסלי שלה.
**הפירופוספט המשתחרר יעבור הידרוליזה בזירוז האנזים פירופוספטאז.**
48
איזה סוג קשר יש בין הtRNA לבין החומצה האמינית המתחברת אליה?
**קשר אסטרי היות והוא עתיר אנרגיה כך שהוא ישמש בהמשך ליצירת הקשר הפפטידי בחלבון שיסונתז.**
אסתר הייתה המלכה היא זו שהחליטה מי ומה יהיה. היה לה הרבה כוח- קשר אסתרי.
49
הוצאת האינטרונים בגנים, האם יש לו סדר קבוע?
לא,
זה לא חייב להיות בסדר קבוע…
לא חייב להיות מקצה 5׳ ל-3׳.
כלומר הוצאת האינטרונים משתנה מגן לגן.
50
quantum dots or fluorescent nanoparticles
ננו חלקיקים אינאורגנים.
המוליכים למחצה,
עוברים אקסיטציה על ידי אור כחול.
האמיסיה שלהם תלויה בגודל המדוייק של הננוקריסטל.
וזמן מחצית החיים שלהם ארוך יותר.
ולכן מצמידים אותם לתרכובות ביולוגיות בעזרת סטרפטואבידין הנקשר לביוטין או על עדי קשרתם לנוגדנים.
משתמשים בנם בין היתר בתאים חיים.
51
אצל מי רמה הכולסטרול הכי נמוכה?
חיידק אי קולי
וגם צמח
אין בהם כולסטרול.
52
אצל מי רמה הגבוהה ביותר של כולסטרול?
כדורית דם אדומה
53
אצל מי רמה הגבוהה ביותר של גליקוליפיד
מיאלין
54
אצל מי הרמה הגבוהה ביותר של ספינגומילין?
תאי כבד ובממברנה של הפלזמה
55
כמות הגבוהה ביותר של פוספוטידילכולין
מיטוכנדיון
56
Barr body
כאשר כרומוזום איקס דחוס ואינאקטיבי, הוא נראה כגופיף דחוס ולא מסיס בגרעין של התאים ולכן הוא מכונה barr body
57
PDI בer?
PDI-
חלבון שתפקידו לחמצן שירי תיול SH של ציסטאינים ליצירת קשרים די סולפידים בתוך חלל ה-ER.
58
אנא אמירי את התהליך של אוטופג׳יה
ולא מעניין אותי שאין לך כוח קדימה, עצלנות לא פה, שומעת🫵🏽
59
מערכת סטוכסטית
מערכת תאים חיים. ולכן אם נספקת לה תנאי התחלה זהים היא תתנהג עדיין באופן שונה בגל פעם.
דרך לזכור- היא אומנם סט של תאים אז מנהגת לא כסט
60
מערכת רובסטית
מערכת הפועלת באופן דומה גם בריכוזים גבוהים ונמוכים מאוד, מה שמבקר אותה זהו משוב שלילי.
61
CBC- cap binding complex
הכובע של המתיל והגואנין יקשר אל חלבון זה. CBC יסייע לmRNA לעבור החוצה מהגרעין.
62
מיקרוסקופית רב פוטונית
מאפשרת לנו לחדור לריקמה עמוק ממש .
ולקבל רזולוציה סבירה.
יעילה עד 250 מיקרון.
63
בהתפתחות של החולייתנים מה הסדר של הישמרות אבולוציונית?
הכי נשמר:
1.בקרת שעתוק
2.תגובה לסיגנלים חוץ תאים
3.מודיפיקציות לאחר תרגום
הכי פחות נשמר
64
Ku
5 דברים קדימה💪🏼
1. הטרודימרי
2.נקשר לקצוות של הכרומוזומים ומחזיק את שתי הקצוות בזמן שהם עוברים עיבוד.
3.יש לו תפקיד חשוב ברקומבינציה של נוגדנים
4.לוקח חלק בתיקון של NHEJ
5. לכל גדיל יש ku משלו.
65
אלפא אנמטין
מעכב את הפולימראז 2
66
CASP
תוכנת מיחשוב שחוזה קיפולים של חלובונים
67
מחקרי GWAS
מחקרי GWAS הם מחקרים המנסים למצוא אסוציאציה בין לוקוסים/SNP שונים למחלות/תכונות מסוימות רזולוציה של כל הגנום
כולו בטח לא של חלבונים ספציפים
GWAS- מה היה =was בין סניפים למחלות שונים
68
מאיפה אנזימי ה-5 cap מגיעים?
הם נמצאים על גבי הזנב של CDT של הפולימרז.
69
איפה מעשה שעתוק של rRNA 5s
בגרעין
70
צרמיד וספינגוזין איפה מיוצרים?
ER
71
בטא מקרפטואתנול
פירוק מבנה השלישוני והרבעוני של חלבונים
72
Fluorescence anisotropy
1.שיטה הבודקת אינטרקציות עם חלבון
2.נמדד השינוי באור מקוטב העובר אמיסיה ממולקולה מסומנת פלורוסנטית באתר הקישור בין שני חלבונים.
73
Tandem MS
שיטה של ספקטרוסקופיית מסה בה אפשר להריץ פפטיד פעם אחר פעם ולקבל מידע על המסה ועל רצף חומצות האמינו.
ניתן לזהות גם אצטילציות ופוספורילציות
74
מי אחראי ליציר סיב הסטון פלוס DNA באורך 30 ננומטר?
היסטוני H4 and H1
75
חלבוני Tethering
חלבונים הנמצאים בגרעין ולוקחים חלק בלדוג חלבונים ספציפיים לתוך האזור הממודר בגרעין.
76
RPA
SSB באאוקריוטים
כל RPA מכסה 8 נוקלאוטידים
חלבונים SSB היוקריוטים מכילים 3 יחידות.
חלבוני SSB הפרוקריוטים הם מונומרים.
77
מערכת רוביסטית
עובדת
תמיד תמיד באופן זהה גם בזמן מצבי קיצון.
ומבוקרת על ידי משוב שלילי.
78
רקומבינציה הומולוגית כמה בסיסים על מנת להגביר יציבות עם גדיל האחות בעת תיקון?
יש צורך בזיווג של 15 בסיסים שיגביר את היציבות ומאפשר שיחלוף גדילים.
**rad52 בגוף שלנו
הוא זה שמטעין את rad51 על גבי הגדיל**
rad52 - הוא בנוי מ11 תת יחי דמוי טבעת.
79
כאשר מבצעים מודיפקציה על הסטונים.
על איזה חומצה אמינית מבצעים פוספורילציה?
על איזה חומצה אמינית מבצעים אצטילצעה?
אצטילציה על שיירי ליזן
פוספורילציה על שיירי סרין
בלבד!!!
80
אצטילציה על ליזין?
מנטלת את המטען החיובי של ליזין ומאפשר התרופפת של הדנא וההיסטון.
81
DNA-A
חלבון פרוקריוטי איניציאטורי של פעולת השכפול.
היא גורמת להפרדת גדילים במוצא השכפול.
פעולה שדורשת ATP
כי שוברים קישרי מימין.
82
DNA-G
משמש כפרימז פרוקריוטי
83
DNA-B
משמש כהליקז פרוקריוטי
גם משתמש בATP
84
פרימאז
DNA dependent RNA polymerase
כלומר הוא מסנתז RNA
שזה החלק השני של המשפט.
והוא סוג של DNA פולימארז.
כלומר הוא מסנתז RNA על גבי תבנית של DNA בתחילת השכפול של מקטעים מסוימים.
85
לזכור בעלפה
86
לזכור
87
DNAse footprinting
🦶
88
מנגנון ריבוסווצ נמצא?
גם בשעתוק וגם במנגנון התרגום
89
פקטורי אינישאציה בתרגום
elF2
הקשור ל-GTP
ונקשר לtRNA imat
כלומר מתיונין התחלתי.
90
פקטורי אלונגציה בתרגום
EF-G and Eftu
הם נמצאים בחיידקים. הם סוג של חלבוני G המבצעים הידרוליזה של GTP toGDP
ההידרוליזה משמשת להאצת התהליך האלונגציה,
Eftu-
מוביל את ה tRNA
הקשור לח״א לאתר A
בזכות הידרוליזה לוקח מהר יותר, ומאפשר דייוק.
U אתה יוגר לדיוק טוב יותר
EF-G
המחובר גם ל-GTP
ההדרוליזה שלו מזרזרת את תנועת הריבוזום בדיוק 3 נוקלאוטידים במורד הזרם.
91
כמה אטומי חמצן מצויים על סוכר המרכיב מולק׳ דה אוקסי נוקלאוזיד
3
92
מי מעבד את miRNA?
ולא מעבד את siRNA
DORSHA
מולקולות miRNA מיוצרות בגרעין ומוסיפים להן cap ופולי A
בחלבון DORSHA הוא מבחן את cap ואת הפולי A בגרעין.
לאחר מכן miRNA יוצא מהגרעין.
93
מה עוד תפקיד של siRNA
מולקולות siRNA עוברת אינטרקציה עם הקומפלקס ארגונט = נוצר קומפלקס הנקרא RITS
קומפלקס זה ילך לתוצר השעתוק mRNA וזה יגרום לעוד חלבונים להגיע בין היתר חלבונים הגורם ליצירת הטרוכרומטין. וכך נמנע שעתוק.
בקיצור , siRNA הוא גורם בין היתר להטרוכרומטין.
**ודיכויי שיתוק וגם הגנה מפני טרנספוזומים**
**וגם שומר על הצנטרומר במצב הטרוכמטין**
94
TF2D
נקשר לזנבות של ההיסטונים
95
מי מהבאים מאפשר לבדוק ביטויי של mRNA
Northern blotting
96
שיטת EMSA
שיטה זו בודקת אינטרקציה בין DNA לחומצות גרעין.
בדיקה בין קישור מקוע דנא לחלבון\פרומוטור
97
אנהנסור
רצפים המשפיעים על השעתוק של הגן. נמצאים בכל מקום/אורנטציה/מרחק.
בדרך כלל רחוק מאוד מתחילת הגן. מהווים אתר קישור לפקטורי שעצוק רגולטורים.
לדוגמה
אם יקשרו אקטיבטורים-יפעילו שעתוק
אם יקשרו אינהיבטורים-ישתיקו אותו
ההבדל בין פרומוטור לאנהסור. **אנהנסור משפיע על רצף שמאוד רחוק ממנו**
98
SNP
כאשר יש פולימרפיזם המתבטא רק בשינוי נוקלאוטיד אחד!
הם אינם נפוצים באופן רנדומאלי, הם מצטופפים בקבוצה שנקראת
Haplotypes blocks
אילו הם קומבינציות של פולימרפיזם מורשות כיחידה מקבצת.
99
איזה מחלה נובעת מ פאק ב-
MMR
HNPCC
100
מוטיב ההיסטון
לכולם יש מוטיב היסטון מסוג הליקס לופ הליקס .
לופ כמו הלאפ עוזר לו.
101
החלפת הסטונים
מחליפים רק את H2b or H2a
102
IncRNA
1.מוחק RNA ארוכות
2.משועתקות על ידי פולי 2
3.כוללת פולי A and cap
4.רבים עוברים שיבור
5.נמצא בגגיד בטלומראז, Xist x, מעורב בהחתמה גנטית
6.משפיעות על אנזימים ופקטורי שעתוק ,משפיעים על שחבור,דיכויי תרגום,פיגום.
6.ציס: באתר בו הן משועתקות משמשות כפיגום. עבור חלבונים שמבצעים מודיפקציות על בכרומטין.
או משפיעים על בקרות בגנים.
טראנס:הן נעות בדיפוזיה מחוץ לאיזור בו הם שועתקו.
103
ברקומבינציה הומולוגית
נוקלאזות המעבדות את השברים נעשה על ידי RecBCD.
104
RuvB
RuvB -בעל פעילות של הליקס והוא הקסמר.
RuvA- אחראי על הקואורדינציה של תנועות
הגדילים אחד על השני.
105
הרצה בג׳ל
הכי לאט :
Relaxed
Linear
Supercoiled
הכי מהר:
106
אתדיום ברומיד
מוסיף פיתול על חיוביים ויוצר אינטרקלציה עם הדנא ולכן הוא גורם להגדל הרוחב של הקוטר של הדו גדיל. הוא חומר פלורוסנטי שעושה אקסיטציה בתחום UV
107
מוטציה מסוג frame sglhift mutation
מוטציה שמתרחשת כאשר יש הוספה רו מחיקה של אחד או שני נוק׳.
ולכן כל מסגרת הקריאה משתנה.
108
מוטציה מסוג
Missense mutation
המצב זה ישנה מוטציה הגורמת לשינוי בקודון.
Miss - עשה טעות שינה את הקודון.
109
רקומבינציה
תתרכש כאשר יש איזור פיסי של גן קטן יותר.
וגודל בסנטי מורגן יהיה גדול יותר.
לשים לב שהצנטרומר לא עובר רקומבינציה.
110
פקטור אוניברסלי
TBP
נמצא בכל רצף באאוקריוטים
111
מי הדומה אצלנו ביותר לפולימאז החיידקי?
Poly RNA 2
112
Shuffling Domain
תופעה בה יש ערבוב של אקסונים בה שני גנים **שונים** יוצרים גן חדש על ידי שימוש באקסונים **שונים** .
**לשים לב שהתהליך יוצר גן חדש לעומת שיחבור שיוצר mRNA ויצירת חלבון אחר.**
113
מה נכון לגבי כרומוזומים?
1.כרומוזום של אורגניזם רב תאי הינו מולקולה ליניארית ארוזה היטב באופן קומפקטי
2.החלבונים המעורבים באריזת הכרומטין שמורים
3.בבני אדם יש אותו מס כרומוזומים הומולוגים לזכר ונקבה
תשובה:
כרומוזום של אורגניזם רב תאי הינו מולקלינארת ארוזה היטב באופן קומפקטי
114
TLS
טרזלישן סינתסיס
פולימרזות מעקף
הם אחראיות על מחיק נוקלאוטיד בודד!!
הוא אחראי על רוב המוטציות החלפת בסיסים
הם גם אצל אואוקריוטים וגם פרוקריוטים
1.אין הם אקונוקלאז
2.יש פעמיים שהם מנחשות איזה נוקלאוטיד להכניס.
אם יש שאלה בריצוף גנום שיש לו מחיקה של נוקלאוטידים בודדים
נבין שהיה מחיקות בגלל תיקון דנא מעקף
115
רווס טרנסקריפטאז
הוא סוג של DNA פולימרז
116
למי יש פוליזומים?
גם לאואקריוטים וגם לפרוקריוטים
ורק באאקריוטים יכול להיות בקרה על קצב התרגום. היות ובהם יש גם תהליך של יציאה מהגרעין.
117
מה האורכים של מקטעי אוקוזקי באואוקריוטים ומה הם בפרוקריוטים?
באואוקריוטים מקטעים בני 200-100
פרוקריוטים-2000-1000
הסיבה למקטעים הקצרים יותר באאוקריוטים כי צריך להצמיד את רצף הנדר להיסטונים.
במידה והמקטעים ארוכים, לא נוכל לחבר ליבה חלבונית בכל נקודה שאמורה להיות כזו ולכן תהליך בניית הנוקלאוזומים יהרס
118
לאיזה שיטה תיקון שיחבור יש תפקיד משמעותי ביותר במחלות גנטיות/תורשתיות?
מוטציה הנגרמות בעקבות מוטציות nonsense .
פאק במנגנון NMD
**הפועל בציטוזול**
119
120
על איפה מטעינים את המטען והמחליק?
על הפיימר של התבנית
121
מתי ואיך מתאפשר פעילות של פולימאז אקסונוקלאז?
יש לנו אפשרות לבצע לבצע את הפעילות של האקסונקךאוז כאשר הוא יציב.
היציבות מאפשרת כאשר יש לי דו גדיל, ולכן DNA פולימאז חייב פריימר על מנת להרגיש יציבות כך שמערכת האנדונוקלאז יכול לעבוד.
122
שיטת NMD
סוג בקרה?
**בקרת תרגום**
123
124
מי אחראי להרגיש את השינוי המהיר שיש בשריר?
אוסף סיבי כישור השריר הנמצא בשריר.
הם חשים->עובר לחוט השדרה->רצון לתקן->שינוי מהיר מדי במתח השריר.
125
מה גורם לתא שריר להשאר תא שריר?
1.סיגנלים תוך תאים
2.מבנה סיבי
3.סיגנלים חוץ תאי
4.פטורי שעתוק
תשובה:פקטורי שעתוק כמו פקטור השעתוק MyoD שגרם לתא להפוך לתא שריר.
במידה והייתה אפשרות לבחור מבנה הכרומטין. זו הייתה צשובה מדוייקת יותר.
126
רצפי
GpC Island
הם יהיו באיזור פרומוטור
כל הפרומוטורים שמקודדים לhousekeeping genes.
יהיו באיזור זה.
**בחלקים אילו הנוקלאוטיד C לא יהיה ממותל!!!!!**
וזאת בעקבות חלבונים מזהי רצף הנקשרים לאיזור CIS
ואחראים לעכב פעילות של מתיל טרנספראז
והם מגייסות את DNA demthylase שמוריד את המתיל מהציטוזין.
127
לשים לב שהם הרצפים שעוברים מתילציה בזמן השכפול… והחלוקה.
ולא עוברים מתילציה ככה סתם באמצע החיים בעולם.
128
129
באאוקריוטים
**יש קו אקטיבטורים וקו רפרסורים**
(בפרוקריוטים י אקטיבטור ורפרסורים)
130
איך יודעים שמדובר באאוקריוטים ולא בפרוקריוטים?
כי בבאוקריוטים יש לך חלבונים שנקשרים לרצף בציס. ועל גבי חלבונים אילו יש לנו קו אקטיבטורים שנקשרים או קו רפרסורים.
לעומת זאת, בפרוקריוטים הרפרסורים/אקטיבטורים נקשרים ישירות.
פה בשאלה מצויין שיש קשירה קודם לחלבונים.
131
132
טופואיזומראז 1 מאופיין ביצירת שבר חד איפה הוא חותך?
נוצר לאחר שחומצה אמינית טירוזין מבצעת התקפה נוקלאופילית על פוספט 5 המצוי בקשר פוספודיאסתרי ובסופו נוצר קשר פוספואסתרי עם האנזים
133
Bromidomain
נמצא ב-CRC
ובפקטור השעתוק Th2D הם נקשר לפרומוטור. אודות לברומודומיין שמאפשר להם לזהות מודיפיקציות על היסטונים.
134
מדוע בני אדם יכולים לקחת אנטיביוטיקה מסויימת במינון נמוך ולא להפגע מכך אך חיידקים כן יפגעו?
כי יש הבדל במבנה הריבוזומים בין האואקריוטים לפרוקריוטים
135
ההגדרה של זה הוא חלבון בקר שעתוק.
136
137
האנזים
deadenylase
מה תפקידו?
זהו אנזים המפרק את קצה 3׳ של מולקולה mRNA יוקריוטיות
138
האם המשפט הבא נכון או לא נכון?
באואוקריוטים בתהליך האינישיאציה ישנה הידרוליזה של ATP בטרם מתחברת תת היחידה הגדולה.
נכון, תהליך הסריקה לחיפוש ה-AUG מלווה בהידרוליזה של ATP
139
מי מבצע עיבוד של RNA
גם פרוקריוטים וגם אורוקריוטים.
כאשר בפרוקריוטים עושים עיבוד על tRNA and rRNA
כחלק מתהליך ההבשלה
אואוקריוטים עושים לכולם עיבוד.
מה שכן, פרוקריוטים לא עושים עיבוד לmRNA בניגוד אילנו.
140
TAF1
פקטור שעתוק כללי שעובד עםמTF2D
גם לו יש את
Bromodomain
141
איזה סוג דומיין יש ברפרסור של טריפטופאן?
Helix turn helix
T=טריפטופאן
142
איפה פולי 1 עובד?
איפה פולי 3 עובד?
פולי 1 בגרעינון
פולי 3 בגרעין
143
144
145
146
147
148
כמו אחיות שהם דומות
149
150
151
152
לשים לב שArf רק גורם לעיכוב שלו.
ואילו התפקיד של Mad2 הוא לפרק את p.53.
153
מצב זה כאשר A מיוצר ומעכב את B וגם B מעכב את A.
154
155
צביעת גימזה
צביעה של הכרומוזומים הדחוסים חלקית
התבנית של הצבעים לא מעידה על כלום
שיטה מסורתית
הצבע נקשר לקבוצת פוספט בעיקר הנוקלאוטיד מסוג A and T
צובעים בשלבי המוקדמים של המיטוזה
ניתן לראות במיקרוסקופ אור
לכל כרומוזום יש דפוס משלו אותו נראה
שחור ולבן **לא אומר** כלום על הדחיסות של הכרומוזומים.
156
Replicative cell sensccence
תהליך שנוצר בעקבות פגיעה של הטלומרים.
אנחנו נעצור את חלוקת התא.
בשלב זה יהיה מופעל ATM and ATR
Dyskeratisis congenita-בעיה בטלומראז כאשר עותק אחד לא תקין של הטלומראז ולכן יש טלומרים קצרים יותר.
157
תשובה ב
לשים לב ♥️ שאלו על מי הוא יעבוד
158
תשובה נכונה ב
לשים לב שסעיף א לא קשור בככל
סעיף ב נכון
סעיף ג המתילציות לא בזמן השעתוק אלא השכפול!!!!
סעיף ד לא נכון בעליל
159
תשובה ד
160
תשובה ד
161
Alpha DNA polymerase
הוא אחראי לשים את הפריימרים.
יש לו תת יחידה pri שהוא זה ששם את הפיריימר.
162
תשובה ב
רוכסן נראה כמו coil coil
163
תשובה ד
לשים לב שיש את inc שהוא גורם לסגירה של הכרומטין
Mi rna -mena
Sirna-mena
164
תשובה א
Dna only
משאירים צלקות של directly repeated
לשים ♥️ שdna only הוא מסוג short invrted rpeats
165
תשובה ג
166
תשובה ב
167
תשובה א
אופרון הלקטוז
עובד שיש לקטוז
יש לו בקרה שלילית וחיובית
168
תשובה ג
169
רזולבאז
בחיידקים נקרר RuvC
אנזים אחראי על הביקוע והשחלוף ברקומבינציה מיוטית
כאשר הוא מצבע צומת הוליידיי.
170
תושבה ג
Sr נקשרים על האקסונים
כל חלבוני השיחבור נמצאים על הזנב.
סעיף ד זה סידור הסלייסוזום
171
תשובה ג
172
תשובה דהפקטוקי שעתוק מצליחים לקרוא את הרצף על התעלה הגדולה.
ועם השלד הפוספוסוכרי של הdna
173
תשובה ג
174
תשובה ד
הכוונה שלהם יצור חומצה אמינית של סלונוציסטאין.
בשיטה זו ניתן להכניס לתוך רצף הפפטיד חומצה אמינית מיוחדת בשם סלנוציסטאין. לחומצה אמינית זו יש tRNA משלה. המזהה את קודון UGA.
175
שיטה א גורם למציאת מודיפקציות
ג קשורה למצאת mena אין קשר לפה
תשובה דזה על מנת למצוא rna. אין מה שימוש לdna
176
2.5 מיליון
כמות SNPים
סניפים זה שינויי הנוקלאוטיד אחד ברצף בודד.
יש 2.5 מיליון סניפים שונים בבני אדם.
זה מה שמבדיל בין מינים וגורם לשונות גדולה מאוד.
בעזרת הסניפים ניתן להשוות מפות גנטיות.
177
10.4
ממצוע של סיבוב של סליל הDNA בתוכו יש 10.4 בסיסים.
178
תשובה ד
תשובה א זה חלבונים
תשובה ג לא קשור
תשובה ב זה מריקמה ספציפית ולא תמהיל של רקמות.
תשובה ד אפשר לבדוק כמות של rna and dna
וגם אפשר להשתמש בו כדן מדווח והמראה את המיקום של mRNA המטבא.
179
תשובה ב
180
בשיטה של IRES יש קצה אמיני שונה כל פעם.
בשיטה זו יש תרגום ללא cap
תשובה ג נכונה.
התרגום כן יעיל.
181
תשובה מספר 4
דרגת החיבור וההדיקות נעשה על ידי h3 and H3
דרכם מגייסים חלבונים לדחיסה.
לינקר זה dna זה לא ישיר.
מוטיב של ההסיטון לא קשור וצפרונים לא באופן ישיר.
182
תשובה 1
יש סוגים שונים של ספלייסינג ונקבל צורות שונות.
אבל אם נוריד את האפשרות לספלייסינג כל החלבונים יעבור להיות באותו גודל. כי אין ספיילסינג.
בקרה שלילית-רפרסור נקשר לרצף ספציפי בתעתיק הpremena וכך חוסם את מערכת השחבור שתגיע לצומת.
זה גורם לשימוש באתר שיחבור משני=גודל שונה של חלבון.
בקרה חיובית- על ידי חלבון שמגביר את יכולת הזיהוי של רצף שחבור מסוים.
183
תשובה ב
184
איך משפיע אקוניטאז דרך?
דרך עיכוב/עידוד
**תרגום**
185
תשובה ב
186
תשובה א
לשים ♥️ שהוא עוזר לנו למצוא גודל של חלבון.
על ידי הקשרות לשתי חומצות אמינו.
כך שכל החבלונים עם אותו מטען וירצו רק לפי גודל.
187
ג
188
קריוטיפ זה מתאר של הכרומוזומים בתא שהם מיושרים אחד על השני.
189
תשובה ג.
ד-יש שימוש בarp
סעיף ב - להפך הסופקוייל גורם להסרת הנוקלאוזומים.
א-כמובן לא זהה אצל פרו ואוק.
190
תשובה ד
191
תשובה א
בלולאות הפתוחות יש שעצוק של גנים. כאשר תמיד מדובר באותם גנים ואילו במקובצים הגנים שם לא באים לידי שעתוק.
192
תשובה א
תוצר בניים שמקבלים בזמן מיוזה.
הוא נקרא צומת הוליידי. סט מיוחד של חלבוני רקומבינציה נקשר ומייצב האיזומר הפתוח הסימטרי. חלבונים יעודיים נקשרים לצמצי הוליידי יכולים לזרז תגובה השם נדידת ענף. Branch migration.
בתגובה זו הDNA מושחל דרך צמצי הוליידי על ידי יצירה ושבירה רציפות של קשרים בין זוגות בסיסים. כאשר חלבונים אילו משתמשים באנרגיה ATP על מנת להרחיב את האיזור של הDNA הטרודופלקס הנוצר על ידי תגובה החלפה הגדילים.
193
תשובה ב
פקטור השעתוק הוא בעצם רצפטור ועליו לעבור אינטגרציה עם ההורמון הגלוקורטיקואיד.לפי שהוא התישב על הDNA.
כתוצאה משחרור ההורמון קורטיזול, גלוקורטיקואיד המופרש בעת רעב ועוד מצבים.
194
תשובה ב
195
תשובה ב
196
תשובה ד
197
תשובה ד
198
תשובה ג
199
תשובה א
200
תשובה ג
201
תשובה ג
202
תשובה ג
תפקיד האינהסור לקשור פקטורי שעתוק, הם יוצריםDNA loop .
ותפקיד הפקטורי השעתוק הוא להגביר את קצב האינישיאציה השעתוק. ומשפיע על גיוס הפולימראז לפרומוטור או שחרור הפולימראז כדי להתחיל לשעתק.
203
קבוע היל
מספר המולקולות המינימאלי שדרוש כדי להניע את התגובה.
בפרמטר לא קופרטיבי אזי קבוע היל הוא אחד.
כאשר קבוע היל קטן מאחד מתקבלת קופרטיביות שלילית-כלומר, אם קישור של מולקולה אחת לחלבון, תקטן האפיניות שלו למולקולות אחרות.
קבוע היל הוא גרף סיגמואידלי.
204
אחוז הנדא שחוזר כל עצמו ?
50%
205
כמה עותקים של רנא ריבוזומלי בגנום הפלואידי יש?
200 עותקים
206
מה הוא נחשב רצף בקרה המשפיע על זמן מחצית החיים של המולקולה והן על המיקום של המולקולה בתא.
רצפי UTR המצויים במרנא הבוגר.
אינם מתורגם אבל כן עוברים שעתוק.
207
גופי כחל
מידור בתוך הגרעין בו יש הבשלה של SNRNA and snoRNA
208
ויש 4 פחמנים
ויש 5 חנקנים
209
לים לשים לב שיש אנטרקציה עם הDNA ולסיטון באופן כללי.
לא מחייב דרך הזנבות .
210
מי מאפשר בדיקה של mRNA
Northern blotting
בצפון יש mrna מולקולת ישנה שלא התקדמה
211
מה התקלה בדנא שיש צורך להפעיל את מנגון Ner?
דימריזציה של פירמידינים הסמוכים בדנא.
בשל קרינת uv
212
מה חובה שיש בכרומוזום
צנטרומר
מוצא שכפול
2 טלומרים
213
האם האנזים דנ״א פולימרז משתמש בatp על מנת לפעול?
לא!! ושוב לא!
214
תת יחידה סיגמה
תת יחידה סיגמה תלויה לחלוטין באנזים ליבה.
היא לא יכולה להקשר לבד לדנא.
יש מלא סוגים של תת יחידה סיגמה והן מתחלפות בסוג הגן.
לאחר שעתוק מספר נוקלאוטידים תת היחידה עוזבת את הדנא.
215
מנגון IRES
מנצל מבנים שניוניים בתוך ה-mRNA כך שאיזורים אלו יודעים לאייס את פקטורי האיניאציה.
כמובן חוץ מפקטור האינישאישן elFe4
ובכך מנגנון IRES מאפשר תרגום ללא שימוש ב CAP5.
216
מתי איניאציה התרגום מסתיימת?
עם הגעת תת היחי הגדולה.
לשים ♥️ שיש סוגים שונים של תת יחי׳ של ריבוזומים היות ויש ריבוזים גם במיטוכנדריה.
כלומר, אין רק גדול של 40 או 60.
217
איפה ועל מי יש מודיפקציה כל היסטונים?
יש מודיפיקציות מסוג:
אצטילציה
מתילציה
פוספורילציה
יש פוספורלציה על סרין
מתלציה על ליזין
זרחון של תראונין
מתלציה על ארגנין
218
DNAa
הוא חלבון האחראי לאינטרקציה עם מוצא שכפול בחיידקים המוכנה ori C.
האינטרקציה בין DNAaלמוצא השכפול דורש ATP המאפשר שינוי במבנה המרחבי שלו לאחר הקישור.
הוא נקשר לאיזורים בעלי A/T הוא יוצר לולאה של דנא סביבו לולאה זו גורמת לאי יציבות של הדנא שמקלה על הפרדת שני הגדילים.
219
DNAb
הוא ההליקאז בפרוקריוטים
DNAg-פרימאז בפרוקריוטים
220
SnoRNP
רובם מקודדים באינטרונים של גנים המשועתקים על ידי פולי 2
SnoRNP מקודד לחלבונים פעילים של הריבוזום
221
במנגון IRES
האם יש cap?
אין cap
אין פקטור אישיינין elF4E
יש רק את elF4G
ניתן לקבל קצת N שונה בכל פעם.
222
Connecting stalk
כאשר מולקולות המים יוצאים מאיזור האיחויי בין ממברנות. זה קורה לאחר שt snare and v snare הסתובבו ביחד.
1.כאשר מולקולות הליפידים בעלילים הציטוזולים של הממברנות זורמים ליצירת איזור הנקרא
Connecting stalk
2.ליפידים של שני העלעלים הלא ציטוזולים מתקשרים זה לזה ויוצרים דו שכבה חדשה המרחיבה את אזור האיחויי ,חתך בדו שכבה החדשה משלים את תגובת האיחויי.
223
היסטונים
היסטוני הליבה קטנים יותר מהסטון H1.
ישנם חלבונים רבים שאינם היסטונים אשר מרביתם קושרים את היסטוני הליבה דרך זנבות האמינים.
224
איפה יש מצמד ומחליק?
גם על הגיל המוביל וגם על הגדיל המתעכב.
הוא יהיה על איזור חד גדילי (גדיל התבנית) בלבד.
Clamp lorder-משתמש בatp
על מנת להצמיד את המצמד לפולימרז.
ביצוע ה-atp מאפשר סגירה של הטבעת ועזיבה של הloader.
225
איזה אנזים נמצאים על זנב של פולי 2
1. גואנליל טרנספראז
2.פוספטאז
3.מתיל טרנספראז
שלולשת אנזימים אילו נמצאים על זנב ה-CDT.
והם מתחילים להיות פעילים אותם לזרחון על סרין 5 שמבצע TFllH.
