ביותא ב Flashcards
1
Q
במה דומה ובמה שונה הפרוקסיזום מהמיטוכונדריה והכלורופלסט?
A
דמיון- עושה תהליכי חמצון רבים, יודע לשכפל את עצמו
שוני- ממברנה אחת ולא 2, חסם גנום עצמאי וריבוזומים
2
Q
מהיכן נובע שמו של הפרוקסיזום?
A
מהתהליכים אותם הוא מקיים- שימוש בחמצן אטמוספרי כדי לחמצן תרכובות אורגניות, כשהתוצר הוא בין היתר מי חמצן (פרוקסיד)- מייצר מי חמצן באופן אינטנסיב
3
Q
מהו האנזים אוראט אוקסידאז?
A
נמצא בפרוקסיזום, עושה שימוש בחומצה אורית שממנה נקבל פרוטון ואוראט. הפרוקסיזום יחמצן אותה שוב על יגי אורט אוקסידאז וכך נפטר מעודפי חמצן.
4
Q
מה תפקידו של האנזים קטלאז ?
A
מנצל את מי החמצן בטכניקה שנקראית פראוקסידציה כדי לחמצן סובסטרטים כמו חומצה פומרית, פורמאלדהיד ואלכוהול.
חשוב בכליה שם מחמצנים ולקולות רעיליות כך שלא יגיעו לדם- כמו חמצון אלכוהול לפורמאלדהיד.
בנוסף- כשיש הרבה מי חמצן האנזים הופך מי חמצן למים- לוקח עוד שני פרוטונים ממולקולה אורגנית והופך את המי חמצן למים
5
Q
אילו תהליכים מתקיימים בפרוקסיזום?
A
א.פרוקסידציה- שימוש במולקולה אורגנית וחמצן ליצירת מי חמצן.
ב. חמצון בטא- ביונקים גם במיטו’ וגם בפרוקסיזום- בפרוקסיזום חש מסועפות וארוכות, בשמרים וצמחים חמצון הבטא קורה רק בפרוקסיזום.
ג. הריאקציה הראשונה של יצירת פלזמלוגן שהוא פוספוליפיד בנפוץ במיאלין. לכן נזקים בפרוקסיזום יובילו לנזקים נוירולוגיים חמורים.
ד. סילוק מי חמצן כשהם מצטברים בפרוקסיזום- הפיכתם לחמצן אטמוספרי ומים.
ה. חמצון אלפא
6
Q
מהו מבנה הפלזמלוגן? מהו ריכוזו במיאלין?
A
מהווה 90 אחוזים מהפוספוליפידים במיאלין
מבנהו: ראש פולרי אתנול אמין, פוספט (כי הוא פוספוליפיד) וקשר אתרי דרכו מחובר שומן כוהלי (ולא חש!)
חסר מטען
7
Q
מה מקור הממברנה של הפרוקסיזום?
A
או מהנצה של הפרוקסיזום ל2, או מהאי אר.
8
Q
מהו הגליאוקסוזום?
A
פרוקסיזום מומחה בצמחים שמקיים את מעגל הגליאוקסילט- נמצא בזרעי צמחים וממיר אצטיל קו איי לסוכר. 2 אצטיל קו איי מתחברים ליצירת סוקסינט, שיוצא לציטוזול ומשמש לבנית גלוקוז.
9
Q
כיצד חלבונים מגיעים אל הפרוקסיזום?
A
מהציטוזול:
מכילים סיגנל של 3 חא בקצה הקרבוקסילי- סיגנל סרין ליזין לאוצין. לחלקם יש רצף בקצה האמיני אך מדובר במקרה פחות נפוץ.
תהליך הכניסה עצמו מתווך עי פרוקסינים ואייטיפי. 6 פרוקסינים על ממברנת הפרוקסיזום מאפשרים כניסת קומפלקסים אוליגומרים תוך שמירה על המבנה המרחבי שלהם.
שימוש בסיגנל סי טרמינאלי- חלבון פקס 5 מזהה את הסיגנל בחלבון בקצה הקרבוקסילי שמתורגם בציטוזול, ומלווה אותו לפרוקסיזום. פקס 7 מזהה את הסיגנל בציטוזול מהקצה האמיני הפחות נפוץ.
החלבונים קודם יתקפלו למבנה התפקודי שלהם ואז יעברו לציטוזול. פקס 5 יתעגן לממברנת הפרוקסיזום בעזרת חלבוני פקס נוספים שנמצאים על הממברנה. פקס 5 נדחק לממברנה ומשחרר לתוך הלומן את החלבון הפרוקסיזומלי.
כדי למחזר את רצפטור פקס 5, פקס 4 מגיע עם יוביקוויטין עליו ומעביר אותו לפקס 5 שמעוגן לממברנה. פקס 1 ו6 יעזרו לחלץ את הפקס עם היוביקוויטילציה עליו מהממברנה
מהאיאר:
פקס 3 מתעגן לממברנת האיאר, בעזרת חלבון סק 61.
ביחד עם פקס 3 ו15 הוזיקולה שעתידה להתאחות אל הפרוקסיזום מניצה וזאת יחד עם פקס 19 הציטוזולי.
וזיקולות הפרקורסר של הפרוקסיזום מתאחות אחת לשניה או לפרוקסיזומים קיימים.
10
Q
מה היא זלווגר סינדרום?
A
מחלה מולדת בה יש פגיעה קשה בשלמות הפרוקסיזום או בהעברת חלבונים אליו.
למשל מוטציה בפקס 5 תגרום לפרוקסיזום ריק. פגיעה בפקס 7 שהוא מזהה את הקצה האמיני תוביל למחלה קלה. האיברים שנפגעים הם המוח, הכליות, והכבד. ימותו זמן קצר לאחר הלידה
11
Q
איך נקרא פנים האיאר?
A
ציסטרנל ספייס
12
Q
ER מה תפקידיו של ה?
A
א. בעל תפקיד מרכזי בביוסינתזה של ליפידים וחלבונים
ב. אתר מרכזי לאגירת סידן.
ג. האתר המרכזי לביוסינתזה של כלל החלבונים חוצי הממברנה (עם יוצא דופן שהוא חלבוני ממברנת המיטו’) ושל כמעט כל הליפידים שמרכיבים את הממברנוץ של האברונים בתא.
ד. מייצר את מרבית הליפידים עבור מיטוכונדריה ופרוקסיזום.
ה. כלל החלבונים שצריכים להיות במערכת החיצונית- גולג’י, איאר, ליזוזום/אנדוזו וממברנת התא לשכבה החוץ תאית מיוצרים אל חלל האיאר.
13
Q
באילו סוגי תאים נמצא אי אר חלק גדול יחסית?
A
תאים המתמחים במטבוליזם של ליפידים, כולסטרול או הורמונים סטרואידים- באיאר החלק הם יהיו את מרבית האנזימים שמעורבים בסינתזת כולסטרול/סטרואידים.
בתאי כבד- באיאר החלק הם מרכיבים את רכיבי הליפופרוטאינים- כאשר האנזימים שבעיקר אחראיים ליצירת המרכיב הליפידי נמצאים על ממברנת האיאר.
בתאי הכבד בממברנת האיאר החלק יש גם אנזימים שאחראיים על דה טוקסיפיקציה של תרכובות אורגניות ותרופות, ביניהם סיפ450 שהופכים תרכובות אורגניות למסיסות במים כדי להפרישן בשתן.
14
Q
האם ישנה תמיד הפרדה מוחלטת בין החלק למחוספס?
A
לא
ישנם איזורים שהם גם וגם
15
Q
כיצד מפרקים את האיאר לצורך מחקר?
A
הומוגנציה של תאים- עי כוח מכני.
שברי האיאר יתארגנו לוזיקולות שחלקן חלקות וחלקן מחוספסות- נקראות מיקרוזומים.
מיקרוזומים אלו שומרים על תכונות האיאר ומקיימים אותם תהליכים. לאחר ההומוגנציה קל להפריד את המיקרוזומים- על ידי סנדימנטציה בגרדיאנט של סוכרוז נפריד בין חלק למחוספס על ידי צנטריפוגה- כשהחלק יצוף והמחוספס ישקע.
16
Q
מה הסיגנל סיקוונס אל האיאר?
A
עשרים חא, מתוכן לפחות 8 הידרופוביות, ממוקם בקצה האמיני של החלבון.
17
Q
ממה מורכב החלקיק SRP?
A
תת יחידות חלבוניות- 6, ומולקולת רנא קטנה.
החלקיק היונקי הוא בעל מבנה דמוי מתג
18
Q
כיצד חלקיק אסארפי יכול להקשר למגוון רחב של סיגנלים?
A
בזכות הכיס ההידרופובי של חלקיק האסארפי שנוצר ממס חא מתיונין.
מתיונין בעלת שייר אר לא מסועף אבל גמיש- מקנה לכיס פלסטיות רבה בנוגע לזיהוי הסיגנל בתנאי שהוא הידרופובי.
19
Q
היכן נוצר הSRP?
A
בגרעינון- שם קורת ההרכבה בין הרנא לחלבונים
20
Q
SRP מה מנגנון הפעולה של?
A
חלבון מתחיל להתרגם בציטוזול- מתרגם את רצף הסיגנל- החלקיק מזהה את הסיגנל וקושר אותו תוך שהוא עוטף את הריבוזום וחוסם את אתר הקישור לפקטורי האלונגציה- כך שהתרגום נעצר. החלקיק נושא את הריבוזום שנעצר בו השעתוק אל ממברנת האיאר, שם הוא פוגש ברצפטור שקושר אסארפי ומאפשר לחלבון להגיע לטראנסלוקטור. הידרוליזה של ג’יטיפי על האסארפי והרצפטור שלו, תגרום לפתיחת הטרנסלוקטור והחדרת הסיגנל אליו תוך שיחרור החלקיק שיעבור מיחזור ויוכל ללכת לקשור חלבון אחר
21
Q
לאן תלך מולקולת המרנא לאחר תרגומה אל הלומן של האיאר?
A
היא תשאר בסמוך לממברנה כי באאוקריוטים ישנו פוליזום שכל הזמן ימשיך לתרגם אותה אל האי אר
22
Q
מהו המבנה ואופן הפעולה של תעלת הטראנסלוקייטור באיאר?
A
ראשית, קומפלקס הטרנסלוקייטור פלוס החלבונים שלה באאוקריה נקרא טרנסלוקון
הליבה של הטראנסלוקייטור זה חלבון סק61 שמורכב מ3 תת יחידות- אלפא בטא וגמא שהן מאוד שמורות באבולוציה.
לתעלה יש פלאג- שזה כמו פקק שחוסם אותה לכל זמן שבו אין פפטיד שצריך לעבור דרכה. הפלאג הוא מבנה אלפא הליקס עם חא הידרופוביות. כדי שיפתח צריך שינוי במבנה המרחבי שמושג הודות להידרוליזת ג’יטיפי על האסארפי והרצפטור שלו.
מבנה הטרסלוקייטור מאפשר גם אינט של הפפטטיד עם הממברנה מהצד.
חיתוך סיגנל הפפטיד עי סיגנל פפטידז מאפשר לסיגנל להפלט אל הממברנה ולהיות מפורק עי פרוטאזות.
23
Q
כיצד מועברים חלבונים פוסט טרנזליישן אל האיאר?
A
לאחר תרגום החלבונים בציטוזול הם מוחזקים על ידי צפרונים כדי שלא יתקפלו. חלבון שהוא אייטיפיאז והומולוגי להייצ’אספי 70 נקרא ביפ. ביפ נמצא מהצד של הלומן של האיאר, ומושך את החלבון פנימה תוך היצמדות אליו כשהוא מבצבץ מהטראנסלוקון והשינוי במבנה המרחבי ופעולת המשיכה נעשית הודות להידרוליזה של אייטיפי.
תעלת הטרנסלוקון שממנה עובר החלבון בפוסט טרנזליישן נעזרת בחלבונים סק 62,63,71,72
24
Q
איזה מנגנון חיידקי דומה לפוסט טרנזליישן שמתבצע באיאר?
A
הפרשת חלבונים החוצה מהתא לאחר שתורגמו לחלוטין בציטוזול.
החיידקים משתמשים בחלבון סק איי, שהוא אייטיפיאז ונמצא בציטוזול. הידרוליזת אייטיפי גורמת לסק איי לדחוף חתיכה של הפפטיד לתעלה- הפוך מביפ, התעלה הומולוגית לסק 61 ונקראת סק וואי.
25
איזה מנגנון מונע מחלבונים שאינם רצויים לעבור תרגום אל האי אר?
הזיהוי הכפול- בתחילה זיהוי הסיגנל עי האסאר פי ולאחר מכן זיהוי עי תעלת הטרנסלוקון.
26
כיצד פועל מנגנון אינטגרציה של חלבונים חוצי ממברנה פעם אחת אל ממברנת האיאר?
מדובר בקו טרנזליישנל- החלבון מזוהה עי חלקיק האסארפי. החלבון מגיע ואז תעלת הטרנסלוקון מזהה את הרצף של הסטארט טרנספר.
ישנם 3 סוגי העברה.
א. רצף הסיגנל בקצה האמיני משמש כסטארט טרנספר, שעובר ביקוע עי סיגנל פפטידז. בהמשך הפפטיד יופיע רצף הידרופובי סטופ טרנספר שיפלט מהתעלה אל הממברנה וינעץ שם כשרצף הסטופ ישמש בהליקס חוצה ממברנה.
ב. הסטרט טרנספר הוא גם סטופ טרנספר ומופיע באמצע השרשרת הפפטידית, כך שאמצע הפפטיד מתחיל את המעבר מהתעלה ונתקע, וקצה אמיני בציטוזול וקרבוקסילי בלומן.
ג. אותו דבר כמו ב רק שהקרבוקסילי בציטוזול והאמיני בלומן.
מה שקובע אם מדובר בב או ג אלו המטענים סביב ההליקס. הציטוזול שלילי ביחס לאיאר שעמוס יוני סידן.
27
כיצד פועל מנגנון אינטגרציה של חלבונים חוצי מס פעמים אל ממברנת האיאר?
בחלבונים אלון יש מס רב של רצפי התחלה ועצירה- שתלויים בקונטקסט בו הם נמצאים ולא ברצף עצמו.
החלקיק אסארפי סורק את הפפטיד מהקצה האמיני עד החלק ההידרופובי הראשון. לאחר התחלת הטרנסלוקציה, הטראנסלוקון יזהה את הרצף ההידרופובי הבא שישמש כסטופ ויפלוט אותו אל הממברנה וכן הלאה.
ההטענה על האי אר אינה מאפיין של החלבון אלא של אופן ההטענה על האיאר.
כמובן שהאוריינטציה של רצף הסטארט הראשון תלויה במטענים.
28
tail anchored כיצד מוטענים על האיאר חלבוני?
החלבון מתורגם כולו בציטוזול. לאחר יציאתו יש לו סיגנל אמיני של 20 חא הידרופוביות שאותם מזהה חלבון פרה טרגטינג קומפלקס. את הפרה טרגטינג מזהה חלבון גט 3, שהוא אייטיפיאז וכאשר הוא קושר אייטיפי הוא דימר ויכול לקשור את החלבון במקום הפרה טרגטינג. הוא מביא את החלבון לחלבוני גט 1 וגט 2 שנמצאים על ממברנת האי אר, ומעגנים את הקצה הקרבוקסילי של החלבון בממברנה- חלבון גט 3 משתחרר תוך הידרוליזה של אייטיפי לאיידיפי ופוספט והופך למונומרים.
29
ERכיצד מסומנים חלבונים שהם "דיירי קבע" ב?
er retention signal הם בעלי סיגנל הכולל 4 חא בקצה הקרבוקסילי שמסמן אותם ונקרא
30
דוגמאות לחלבונים תושבי קבע באיאר?
PDI- תפקידו לחמצן שיירי תיול של ציסטאינים ליצירת קשרים די סולפידיים בתוך הלומן.
מרבית שיירי הציסטאין בלומן יהיו מחומצנים.
הצ'פרון ביפ- שמסייע למשוך חלבונים דרך סק 61. מונע אגרגציה של חלבונים ומונע מהם לעזוב את האיאר ולהגיע לגולג'י כי הוא מסומן בסיגנל דיירי קבע.
31
מה אחוז החלבונים שיעברו אן-גליקוזילציה באיאר?
כ50 אחוזים מהחלבונים שנכנסים לאיאר
32
מה תפקידו של האנזים אוליגו סאכריל טרנספראז?
יושב על ממברנת האיאר סמוך לכל טרנסלוקון, ועושה גליקוזילציה על הקצה האמיני על גבי שייר אספרגין.
לא כל שייר אספרגין עובר גליקוזילציה- הוא צריך להיות בקונטקסט מסוים. באמצע רצף הפפטיד: N X S/T
כשאיקס יעולה להיות כל חא חוץ מפרולין. סיגנל נקסט
האוליגוסכריד נמצא מעוגן לממברנה, ובתהליך אנזימטי של שלב אחד עי האוליגוסכריל טרנספראז הוא מועבר לשייר האספרגין- האנ' ליצירת הקשר נמצאת בקשר הפירופוספט- ממש הצד שמעוגן לממברנה על גבי דוליכול פוספט.
33
איזה גליקוזילציות עוברים חלבונים גרעיניים וציטוזולים?
n-acetyl-glucose amine הם נושאים עליהם
שמחובר לשיירי סרין ותראונין.
34
האם מתרחשות עוד גליקוזילציות חוץ מסוג אן גליקוזילציה באיאר?
O כן, גליקוזילציות מסוג
על שיירי סרין ותראונין- תהליך שמתחיל באיאר וממשיך בגולג'י.
35
כיצד נבנה האוליגוסכריד לפני שמועבר בשלמותו באן גליקוזילציה?
התהליך מתחיל בציטוזול ועושה שימוש במונומרים של גלוקוז מאנוז וגלוקנאק כשהם מאוקטבים- יודיפי מאקטב גלוקוז וגלוקנאק וג'ידיפי מאקטב מאנוז.
בציטוזול, שם התהליך מתחיל- מנוצל נוקלאוטיד סיטיפי כדי לזרחן דוליכול, ורק כשמגיעים ל7 מונומרים- 2 גלוקנק ו5 מאנוז- העץ המתהווה עושה פליפפלופ ומתהפך לתוך חלל האיאר- שם הסינתזה ממשיכה עד ל14 שיירי סוכר.
בכדי לבקר קיפול נכון של החלבון, יוסרו באי אר 3 גלוקוזים קיצוניים פלוס מאנוז.
36
מהם חלבוני קלנקסין וקלרטיקולין?
שני חלבונים תלויי סידן- לקטינים= חלבונים קושרי גלוקוז
צ'פרוני איאר שאחראיים על בקרת קיפול החלבונים באיאר נקשרים לאוליגוסכרידים על חלבונים שאינם מקופלים כראוי ומחזיקים אותם באיאר- מונעים אגרגציה של חלבונים שאינם מקופלים.
קלנקסין וקלרטיקולין בעלי אותו תפקוד, רק שקלנקסין חלבון ממברנלי וקלרטיקולין הוא חלבון מסיס.
37
ERכיצד משפיעה גליקוזילציה מסוג אן על בקרת קיפול החלבונים ב?
בקצה האוליגורסכריד של האן גליקוזילציה יש שלושה גלוקוזים. גליקוזילאז חותך את שתי מולקולות הגלוקוז האחרונות ונותרת מולקולה אחת. קלנקסין/קלרטיקולין יודעים להקשר לגלוקוז בודד, יקשרו וימנעו את יציאת החלבון מהאיאר.
הגלוקוז האחרון נחתך תוך כדי הקישור לקלנקסין ומגיע לחלבון גליקוזיל טרנספראז שידע לזהות האם קופל כראוי או שלא. אם לא קופל כראוי- הוא "יסמן" אותו באן גליקוזילציה של תוספת של הגלוקוז הבודד תוך שימוש ביודיפי גלוקוז.
כעת שוב הוא יפגוש בקלנקסין או קלרטיקולין שישאירו אותו באיאר וחוזר חלילה.
38
ERP57איך משפיע על קיפול החלבונים באיאר הצפרון ?
הוא משתף פעולה עם קלנקסין וקלרטיקולין, וגם הוא משאיר את החלבון שלא קופל באיאר-קלנקסין וקלרטיקולין מעבירים אליו את החלבון והוא נקשר לציסטאינים- הוא יודע לזהות קבוצות סולפדריל חופשיות- מה שמצביע על קשר דיסולפידי לא שלם.
בנוסף, הצפרונים מסתירים את סיגנל היציאה מהאיאר לציטוזול של החלבונים.
39
כיצד מסומן חלבון מהאיאר לפירוק?
חלבונים מהאיאר שלא הצליחו להתקפל יוצאים חזרה לציטוזול שם יפורקו בפרוטאוזומים.
האן גליקוזילציה משמשת כטיימר. חלבון מאנוזדאז בעל פעילות איטית וחותך מאנוז. חלבוני שמתקפלים לאט מדי- המאנוזידאז יצליח לחתוך מהם מאנוז והם יטורגטו על ידי לקטינים שיוציאו אותם מהתא לפירוק. חלבונים שמתקפלים מהר ויוצאים- לא יספיקו להחתך.
40
כיצד חלבון שסומן לפירוק באיאר יצא לציטוזול?
ראשית, הלקטינים מזהים את האוליגוסכריד שנחתך על ידי המאנוזידאז. אל הלקטינים מצטרפים צפרונים ואנזימי דיסולפיד איזומרז שמתירים קשרים דיסולפידיים. כל הקומפלקס הנל סוחב את החלבון הלינארי אל קומפלקס טראנסלוקציה. בפתח הציטוזולי של הקומפלקס ממתין אנזים 3אי שיסמן בפוליוביקוויטין את החלבון שיוצא מהתעלה.
n glycnate .גם בצד הציטוזולי ישנו חלבון אייאייאיי אייטיפיאז שמושך את החלבון דרך התעלה תוך הידרוליזת אייטיפי.
הוא חלבון שמסיר את כל שרשרת האוליגוסכריד. והחלבון המסומן בפוליוביקוויטין יעבור במהרה לפרוטאוזום.
41
מדוע על התא לייצר עודף גדול של חלבונים?
כיוון שרבים מהם לא יצליחו להתקפל כראוי וישלחו לפירוק.
42
מה מנגנון המחלה של ציסטיק פיברוזיס?
זוהי מחלה תורשתית רצסיבית שנובעת מפגיעה בתעלות כלור. החלבון המוטנטי מזוהה כלא תקין באיאר ונשלח לפירוק- אעפ שאם היה מגיע לתעלה היה מתפקד כרגיל. המחלה נגרמת בגלל מנכנון קיפול החלבונים הקפדני באיאר.
43
UNFOLDED PROTEIN RESPONSE מה היא תגובת?
לאור הצטברות חלבונים רבים שאינם מקופלים כראוי באי אר תגובה זו תופעל, ותגרום ל:
שעתוק מוגבר של גנים המקודדים לחלבונים שמוציאים את החלבון לציטוזול שם יפורק
שעתוק מוגבר של חלבונים שמקודדים לצאפרוני איאר
חלבונים שמסייעים להגדיל את קיבולת קיפול החלבונים של האיאר.
44
UNFOLDED PROTEIN RESPONSE כיצד מעוררים חלבונים שלא קופלו כראוי את תגובת ?
ישנם מספר מסלולים.
IRE1:
רצפטור דימרי אינטרגלי, המזהה מתוך האיאר חלבון שגוי, יוצר דימר וזרחון הדדי ובעצם יוצר זרחונים בצד הציטוזולי באזור שנקרא ריבונוקלאז דומיין. הדטמיין עושה רגולציה לספלייסינג של מרנא, וגורם לספליסינג- חותך בשני אתרים מרנא ומוציא אינטרון- שני האקסונים שנותרו עוברים ליגציה. נוצר מראנ שמקודד לאקטיב טרנסקריפשיין רגולטורי פרוטאין, שנכנס לגרעין שם מאקטב שיעתוק גנים שיוצרים צ'פרונים נוספים.
PERK:
רצפטור דימרי אינטגרלי שמצדו של תוך האיאר נקשר אליו חלבון שלא קופל כראוי, שגורר תגובה של זרחון בצד הציטוזולי, שמעכב פקטורי איניציאציה של תרגום, מה שגורם להפחתה בכמות החלבונים המיוצרים ולכן גם בכמות החלבונים שאינם מקופלים. בנוסף הזרחון הזה, לאור עיכוב פקטור איניציאציית התרגום, ישנם חלבונים אחרים שמשועתקים בעדיפות ואחד מהם הוא פקטור שעתוק שמשעתק חלבונים שקשורים לתגובת החלבונים הלא מקופלים.
6ATF:
מונומר- חלבון איאר טרנסממברנלי. כשנקשר אליו מהצד של האיאר חלבון לא מקופל, הרצפטור הזה מופעל ועובר לממברנת הגולג'י, שם יעבור ביקוע פרוטאליטי, הדומיין הציטוזולי ישוחרר ויעבור לגרעין שם יעודד שעתוק של חלבונים שקשורים לתגובת אי קיפול חלבונים באיאר.
45
GPI כיצד מתבצע עיגון חלבונים דרך?
מדובר בחלבונים שיתעגנו לממברנת האיאר ועתידים להיות מעוגנים לממברנה הפלזמטית ופונים לחוץ התא כשהם מחוברים לגליקוזיל פוספטידיל אינוזיטול.
חלבונים אלו עוברים קו טרנסליישן לאיאר, והקצה הקרבוקסילי שלהם הידרופובי ומשמש כסטופ טרנספר. הוא נפלט החוצה מתעלת הטרנסלוקון וננעץ בממברנה. בהמשך, תתבצע התקפה נוקלאופילית על הקרבוניל שנמצא בין החלבון לקצה הסטופ טרנספר הנעוץ בממברנה בקשר פפטידי, על ידי הקצה האמיני של הפוספוליפיד ג'יפיאיי. האזור ההידרופובי מבוקע ונשאר נעוץ בממברנה, ואחכ יפורק עי פרוטאזות. כך החלבון הופך להיות מעוגן לג'יפיאיי.
46
מה הקשר בין גליקופרוטאינים לפרזיטי טריפוזונומה? (מחלת השינה האפריקאית)
הפרזיטים משתמשים בחלבונים מעוגנים לג'יפיאיי כדי לכסות את הממברנות שלהם, כך שמערכת החיסון לא תוכל לזהות אותם. הם מחליפים דפוסי גליקופרוטאינים כל בערך 100 מחזורי שכפול כך שמערכת החיסון לא תוכל לזהות אותם.
47
GPI היכן ניתן למצוא בשכיחות גבוהה חלבוני?
LIPID RAFTSב
48
היכן נוצרים מרבית הליפידים בתא?
על ממברנת האיאר
מיוצרים על העלעל הציטוזולי
49
CTP באיזה תהליך נעשה שימוש ב?
בסינתזה של פוספטידיל כולין- המקור לפוספט בראש של הפוספוליפיד
50
כיצד מיוצר פוספטידיל כולין?
ראשית, מגיעה חומצת שומן מהציטוזול כאשר היא קשורה לחלבון קושר חש- בוא מטעים אותה על העלעל החיצוני של האיאר.
חומצת השומן תשופעל על ידי קו אנזים איי- צורך אייטיפי שהופך לאיימפי. כשיש שתי חש משופעלות אחת ליד השניה, מגיע פוספוגליצרול שמתחבר אליהן הודות לאנרגיה שקיימת בקשר התיואסטרי עם הקו איי שישתחרר לציטוזול. פוספטאז מסיר פוספט מהפוספוגליצרול. מגיע סיטיפי כולין- שהוא בעצם עם 3 פוספטים, משץחרר סיאםפי ומתחבר פוספוכולין אל הראש של הגליצרול.
51
כיצד האיאר מייצר ממברנות?
לאחר שהאיאר סינתז פוספוליפידים שונים ובראשם פוספטידיל כולין עג הממברנה החיצונית, ממברנת האיאר תרצה להגיע לשומ ותבצע זאת באמצעות פליפ פלופ נרחב עי סקראמבלז, שאינו צורך אנרגיה, עד להגעה לממברנה יחסית סימטרית בשני העלעלים.
52
אילו טרנספורטרים פועלים בממברנת התא?
פליפאז- מעביר בדרך פוספוליפידים בעלי קבוצות אמינו חופשיות בראש הפולרי- כמו פוספטידיל סרין- יעבירו מהסביבה הציטוזולית אל הסביבה הפנימית, כשדרך הפעולה היא של משאבת פי טייפ= שעוברת זרחון תוך כדי הפעולה.
פלופאז- מבפנים החוצה. דורשת אייטיפי.
סקרמבלאז- באיאר הוא פועל בצורה אקסטנסיבית, אך בממברנת התא הוא לא פעיל כלל חו. מכאשר משופעל למטרה ספציפית.
53
מה הם תפקידי האיאר?
סינתזת פוספוליפידים, ייצור ממברנות, סינתזת כולסטרול, ביוסינתזה של צרמיד- שנוצר על ידי דחיסה של חש לחומצה אמינית סרין.
54
לאילו אברונים מייצר האיאר ממברנות?
לכל חברי מע ההפרשה- גולג'י, ליזוזום, ממברנה פלזמטית. את ממברנות הגרעין (מהווה המשך ישיר שלהן). המיטוכונדריה מסנתזת חלק מהליפידים שלה בעצמה, אבל עושה שימוש בפרוקורסרים שמגיעים מהאיאר.
55
מה הוא מסלול ההפרשה מהתא?
מהאיאר מועברות מולקולות חלבון לגולגי ומשם לממברנה הפלסמטית או דרך האנדוזומים לליזוזומים.
56
מה הוא המסלול האנדוציטי- הכניסה אל התא?
מולקולות נבלעות בוסיקולות אנדוציטיות שמקורן בממברנה הפלזמטית ומועברות לאנדוזומים המוקדמים ומשם לליזוזומים. מולקולות רבות מהאנדוזום המוקדם ממוחזרות לממברנת התא.
חלק מהמולקולות האנדוציטיות יכולות לעבור מהאנדוזומים לגולג'י ומשם לאיאר.
57
מה הם חלבוני מעטפת?
חלבונים העוטפים את הוזיקולה מרגע שמניצה מהממברנה לציטוזול עד לרגע האיחוי עם ממברנת המטרה.
החלבונים מהווים מעין כלוב סביב הוזיקולה, מטרתם לייצב את הוזיקולה בזמן שהיא נוצרת ועד שמגיעה ליעדה.
קלתרין- חלבון מעטפת של מע' ההפרשה המאוחרת, נא אל ומהממברנה ובין מדורי הגולג'י והאנדוזומים.
COP-
שייכים למע' ההפרשה המוקדמת, מהאיאר אל הגולג'י ולהיפך.
קופ 1- מהגולג'י לאיאר.
קופ 2- מהאיאר לגולג'י.
58
מהו תהליך יצירת וזיקולות עטופות קלתרין?
רצפטור שנעוץ בממברנה קולט מטען מהצד הציטוזולי. לאחר קשירתו למטען הוא מגייס חלבונים מתאמים- למשל החלבון 2אייפי מגייס את קלתרין שמתחילים בביצוע ההנצה של הוזיקולה. כדי לחתוך את הצוואר צריך חלבונים שמעקמים את הממברנה וחותכים את הצוואר- בשביל עיקום והרמת הממברנה יש צורך בחלבונים מסוג ממבריין בנדינג פרוטאין, BARשמכילים דומיין.
החיתוך עצמו של הוסיקולה מהממברנה מתבצע הודות לפעילות חלבונים מסיסים וביניהם דינמין.
לאחר ניתוק מוחלט של הוסיקולה, היא מאבדת את הציפוי- בגלל שפיפ פוספטז עושה הידרוליזה לפוספוליפידים ולכן הקשר לחלבון המתאם נחלש.
צ'פרוני הייצאספי 70 יגויסו ויבצעו הידרוליזה של אייטיפי- הם מתפקדים כאנקואוטד אייטיפיאז- כך הוזיקולה תשאר ערומה לגמרי.
59
מהו מבנה הקלתרין?
הקסמר- בנוי 3 יח' כבדות- משושה ו3 יח' קלות- מחומשים. יחד הן יוצרות את מבנה הטריסקליון. טריסקליונים של קלתרין מתאספים למסגרת דמוית סל או כלוב של משושים, מחומשים או משובעים.
תפקיד השרשראות הקלות: להתחבר לשלד האקטין- מה שמסייע ליצור כוח להנצת הממברנה ותנועת הוזיקולה. בנוסף, פוספורילציה על השרשראות הקלות מבקרת את הרכבת ציפוי הקלתרין.
אתרי האן טרמינל של הטריסקליון יקשרו לחלבון המתאים בפנים.
לקלתרין יש יכולת של סלף אסמבלי.
60
מהו תפקיד החלבונים המתאמים?
ראשית, חלבונים אלו הם ספציפיים, חלקם טטרמרים וחלקם מונומרים. הם קושרים מצד אחד את הקארגו רצפטורז ומצד שני את הקלתרין. זאת אומרת שהם פעילים רק מחוץ לתא.
61
AP2 כיצד פועל חלבון מתאם ?
החלבון אייפי2 הוא בעל 4 תת יח- אלפא, בטא,2 סיגמא2 ומיו2.
PIP(4,5)P2 הוא עושה אינטרקציה עם פוספואינוזיטיד על הממברנה הציטוזולית
סהכ אייפי2 קושר 4 מולקולות פיפ.
הקישור של אייפי2 עם הפוספואינוזיטיד גורם לו לחשוף את אתר הקישור לרצפטורי המטען- על ידי מיו 2 וסיגמא2.
קישור של אייפי2 לרצפטור יוצר קינק בממברנה שמעודד קישור אייפי2 נוספים- זה בעצם תהליך שעובר הגברה עצמית. כשקלתרין נקשר לאייפי 2 זה יוביל להנצת וסיקולות.
62
כמה אחוזים מהפוספוליפידים בממברנה מהווים הפוספואינוזיטידים?
פחות מ10 אחוזים
63
מה תפקידם של הפוספואינוזיטידים בתא?
היכן מיוצרים?
מיוצרים באיאר
בעלי תפקידים רגולטוריים: קביעת המיקום והתזמון של הולכת וזיקולות בתא- לפי זרחון ודה זרחון ניתן לגרום לחלבונים שונים לזהות את הפי או הפיפ בהתאם לצרכי התא
תפקיד חשוב בהולכת אותות
תפקיד חשוב באנדוציטוזה ואקסוציטוזה
תפקיד במחזור התא
64
מה הוא מבנה הפוספואינוזיטידים?
נגזרת של פוספטידיל אינוזיטול- גליצרול, 2 חש, ראש פולרי של פוספט, אינוזיטול. הם עוברים זרחון ודה זרחון על ידי פי , קינאזות ופי פוספטזות שספציפיים לכל מדור. הזרחון נעשה על אחת, 2 או 3 מקבוצות ההידרוקסיל על הפוספטידיל אינוזיטול. הזרחון השונה נותן בעצם אפיון שונה לפוספטידיל אינוזיטול פוספט.
התפלגות הפיפים שונה מאיברון לאברון ומאזור לאזור- יכולים להגדיר אזורים בממברנה.
65
BAR מהם חלבוני?
חלבונים קושרי ממברנה מסוג חלבונים מכופפי ממברנה, בעלי דומיין בר. הם עושים אינט' אלקטרוסטטיות עם הראשים הפולריים של הממברנה.
מסייעים לאנדוציטוזה תלוית קלתרין- מעצבים את הממברנה על מנת לאפשר את הנצת הוזיקולה.
היקשרות חלבוני בר לממברנה יוצרת משוב חיובי של חלבונים אלו ובכך שנקשר חלבון אחד זה יגרום לאחרים לבוא.
לחלבוני הבר יש הליקסים אמפיפיליים שמעודדים את עקמומיות הממברנה לאחר שהם מוחדרים לצד הציטוזולי.
הם בנויים כדימר המתארגן לצורת קוילד קויל. בעלי אזורים חיוביים ולכן יעדיפו אינט' עם ראשים שליליים בממברנה.
66
מהו מנגנון הצביטה של הוזיקולה מהממברנה?
עם התקדמות יצירת הוזיקולה עטופת הקלתרין, חלבונים ציטופלזמטיים ובראשם דינמין מגיעים לצוואר הוסיקולה. לדינמין PI(4,5)P2 יש דומיין קושר
שמחבר אותו לממברנה ודומיין ג'יטיפירז שעושה הידרוליזה לג'יטיפי ומבקר את קצב צביטת הוזיקולות.
הצביטה עצמה נעשית עי דינמין וחלבונים אחרים שהוא מגייס שאחראיים על כיפוף הממברנה והם מעקמים את מבנה הדו שכבה או משנים את הרכב הליפידים בה.
67
מהו תפקיד הדינמין הספציפי בצביטת הוזיקולות?
מולקולות דינמין רבות יוצרות מבנה ספירלי בצוואר הוסיקולה. הם מגייסים עוד חלבונים ויחד איתם מערערים את יציבות הדו שכבה. ללא דינמין תהליך אנדוציטוזה מתווכת קלתרין בדרוזופילה למשל נפסק לחלוטין והוזיקולות לא הצליחו להתמחזר.
68
כיצד מתבצע הסרת הציפוי מהוזיקולות?
לאחר צביטת הוסיקולה היא מאבדת מהר את ציפוי הקלתרין שלה.
זה נובע מהעובד שפיפ פוספטז נארז בתוך הוזיקולה, ומדלל את מאגר הפיפ(4,5)2 - וזה מחליש את הקשר של הקלתרין עם החלבון המתאם.
בנוסף, צפרוני הייצ'אספי70 משמשים כאנקואוטינג אייטיפיאז ומשתמשים באנ' הידרוליזת האייטיפי כדי לקלף את הציפוי קלתרין.
חלבון האוקסילין שנמצא על הוזיקולות, מהווה מעין טיימר שמאתחל את פעילות האייטיפיאז.
69
כיצד פועל תהליך יצירת הוסיקולות על ידי חלבוני ג'י מונומרים?
כיצד פועל המנגנון של סר 1?
מנגנוני הנצת ממברנות באמצעות חלבוני ג'יטיפיאז ניתן למצוא בממברנות מצופות קלתרין באנדוזומים, ובגולג'י ובאיאר בוסיקולות מצופות קופ 1 ו2
החלבון ג'י שפועל בהולכת הוסיקולות מהאיאר אל הגולג'י יחד עם חלבוני קופ 2 הוא חלבון סר1.
כשסר 1 קושר ג'ידיפי, הוא מסיס בציטוזול. סר1 ג'ף יושב על ממברנת האיאר, והוא משחלף את סר 1 שכעת יקשור ג'יטיפי, וכתוצאה מכך ישנה קונפורמציה, יחשוף סליל אמפיפילי, ויצמד במצב פעיל לממברנה.
כאשר מגיע חלבון שצריך להיות מופרש אל הגולג'י ונקשר לרצפטור, מצטרפים אל סר 1 מהצד הציטוזולי (מחוץ לאי אר) חלבוני קופ 2- על סר אחד מתיישב סק23 ואת הצד החיצוני של הרצפטור תופס סק 24- והם נוגעים אחד בשני.
מעליהם, שכבה נוספת של קופ 2- סק 13 ו31 מצטרפים ויחד הם מניצים את הוזיקולה.
70
באיזה שלב מוסרים חלבוני קופ 2 מהוזיקולה?
כאשר סר עובר הידרוליזה, מוסרים חלבוני הקופ2 מהמעטפת. נראה שהגאפ של סר הוא בעצם הזמן- סר עצמו אולי, הסבירות היא שממש כשהוזיקולה תגיע ליעדה, קינאז יזרחן את חלבוני הציפוי והוזיקולה תתפשט.
71
מה הוא חלבון ARF?
חלבון ג'י מונומרי, מקביל של סר1, שמשמש להנצת וזיקולות מהגולג'י
מגייס את קופ1
72
באיזה שלב מוסרים חלבוני הקלתרין והקופ 1?
ממש לאחר הנצת הוזיקולה.
ARF-GAP העקמומיות של קרום הוזיקולה מהווה טריגר להתפשטות שלה. חלבון
מגויס לציפוי קופ 1, יוצר אינט' עם הממברנה ומרגיש את צפיפות הליפידים. מופעל כשעקמומיות הממברנה מתקרבת לזו של וזיקולה, ולפיכך הוא עובר אינקטיבציה ומפרק את ציפוי הוזיקולה עם הנצתה.
73
האם כלל הוזיקולות בעלות מבנה ספרי? (עגול)
לא.
לדוג, מולקולת ענק כמו פוקולגן נארז בוזיקולה בצורת מתג.
חלבוני אריזה מיוחדים מרגישים את המטען החריג ומשנים את הליך הרכבת הציפוי הרגיל עם חלבוני קופ2. אינט' זו מגייסת את חלבון סק 24 שישפר את סיבוב חלבון סר 1. לחלבון סק 31 מוסף מונויוביקוויטין שמשנה את תכונות ההרכבה על הכלוב החיצוני. כך נוצרת וזיקולה גדולה בצורת צינור.
מוטציות בחלבוני האריזה המיוחדים גורמת למומים בקולגן.
74
RAB מה הם חלבוני?
הם תת משפחה של חלבוני ג'י מונומריים של ראס.
אלו חלבונים ואנזימים שנותנים זהות לממברנה. לכל ראב יש את הממברנות עליהן הוא נמצא.
חלבוני ראב וראב אפקטורז מכוונים את הוזיקולה לממברנת היעד הנכונה.
ישנם למעלה מ60 חלבונים כאלו- המשפחה הגדולה ביותר מבין חלבוני הג'י המונומריים.
מצויים עג הממברנה על הצד הפונה לציטוזול באברונים ווזיקולות.
במצב לא פעיל, יקשרו ג'ידיפי ומעוכבים עי ג'ידיאיי שמרתקים אותם לציטוזול ומונעים מהם להקשר לממברנה. במצב פעיל, קושרים ג'יטיפי, וקשורים חזק לממברנה.
75
כיצד מופעלים חלבוני ראב?
החלפת הג'ידיפי בג'יטיפי על החלבון גורמת לו להתנתק מהג'יפיאיי שקושר אותו בציטוזול ולחשוף הליקס אמפיפטי שינעץ אותו בממברנה. לאחר מכן, חלבוני הראב נקשרים לראב אפקטורז, שמתווכים את הובלת הוזיקולות וקירובן לממברנה שעליה יש ראב מאותו סוג. כדוגמה ניתן ראב אפקטור שהוא חלבון הטטרינג, שבזכות הקירוב של הוזיקולה אל הממברנה היא יכולה ליצור אינט' עם חלבוני הסנק ולהגיע לאיחוי ממברנלי.
ראב גאפ יעשה הידרוליזה לראב המשופעל, ראב יתנתק מהממברנה ויחזור לחבק ג'ידיאיי בציטוזול.
76
מה הגורם שקובע את ריכוזי הראב הפעיל וריכוז האפקטורים שלו על הממברנה?
קצב הידרוליזת הג'יטיפי.
77
מה הם חלבוני ראב אפקטור?
מאוד וריאבילים ולא שמורים. יכולים להיות בעלי פעילות של ג'ף או גאפ. מסייעים בקירוב הממברנות והצלחת איחויין. משמשים כחלבוני מנוע על גבי אקטין ומיקרוטובולי שמניעים את הוזיקולות אל היעד שלהן.
חלקם בעלי פעילות משולבת של חכה ושל קינאז המזרחן את חלבוני המעטפת (כמו בקופ 2) מה שמסייע להסרת הציפוח והבטחת כיווניות ההעברה ועשייתה כראוי.
ראב מסויים יכול להתקשר לראב אפקטורז רבים ולפי זה לשנות את יעודו.
78
מה יקרה אם נפגע בחלבון ראב 5?
כל מערכת האנדוזום והליזוזום נעלמה.
79
מה מנגנון הפעילות של חלבון ראב 5?
ראב 5 נמצא בציטוזול מוחזק עי ג'ידיאי כשישוחלף עי ראב 5 ג'ף שיושב על הממברנה החיצונית של האנדוזום, הוא PI3Kמשתפעל, קושר ג'יטיפי ומתעגן לממברנה. שם הוא משפעל את חלבון
שמזרחן פוספטידיל אינוזיטול על הממברנה- התהליך הזה חשוב כדי לזהות את הממברנה כממברנת אנדוזום. כי עוד אפקטורים ראב 5 מגייס עוד ראב 5 ג'ף וכתוצאה מכך עוד ראבים נצמדים לממברנה. זה משוב חיובי. מה שמשפיע על עוצמת התהליך זה קצב ההידרוליזה והשחלוף.
80
מה תפקידם של ראב 4 וראב 11 באנדוזום?
חלבונים אלו באותה הממבנה בה נעוץ ראב 5, שמקבל וזיקולות שנכנסות, הם מארגנים את הנצת הוזיקולות המיחזור המחזירות חלבונים מהאנדוזום לממברנה הפלזמטית.
81
כיצד פועלת קסקדת הראב?
כשראב מסוים משופעל הוא מגייס חלבוני אפקטור שלו אבל גם של הראב הבא אחריו- האפקטור של הבא יהיה ג'ף שישפעל אותו. כך למשל ניתן להחליף את חלבוני הראב על האנדוזום המוקדם מראב 5 לראב 7- ראב 5 מגייס את הג'ף של ראב 7 ויפעיל אותו, כשראב 7 מופעל הוא יגייס את הגאפ של ראב 5.
זאת אומרת, מזמנים את ההבא, ההבא מגיע ומעכב את הקודם וכך התהליך יכול להתקדם בכיוון הרצוי.
82
מה צריך לקרות כדי שממברנות יתאחו?
הן צריכות להיות במרחק של 1.5 נמ אחת מהשניה ולהרחיק מים מהחלקים ההידרופיליים של הממברנה.
83
SNAREמה תפקידם ואופן פעילותם של חלבוני ה?
על גבי הוסיקולה- וי סנייר. על גבי האיברון טרגט- טי סנייר.
וי בדרכ שרשרת פוליפפטידית אחת וטי לרוב מ3 שרשראות. המבנה ההליקאלי המרכזי של החלבונים הללו מאפשר להם להתלפף זה על זה וליצור קומפלקס 4 הליקאלי יציב מאוד שנקרא טראנס סנייר. האינטרקציות בין הוי לטי מאוד ספציות- מבטיחות איחוי רק במקום הנכון.
ראקציית הליפוף של הקומפלקסים היא אקסרגונית- משמע ספונטנית, כי כשנזיז את המים מאיזור החיבור, האנטרופיה של המים תעלה. לכן הסניירים מזרזים את איחוי הוזיקולה.
84
CONECTING STALKמה זה ה?
כאשר ויסנייר וטי סנייר מתלפפים והממברנות מתקרבות, נוצרת זרימה של ליפידים של העלעלים הציטוזוליים בין הממברנות. שלב זה נקרא קונקטינג סטולק.
85
מדוע בעת חיבור ליפוזומים לסנייר במעבדה האיחוי איטי משמעותית?
א. כיוון שחלבוני הראב (טטרינג) משפיעים על מהירות האיחוי
ב. ניתן לעכב/להאיץ קצב איחוי בתא עי אלוסטריקה (למשל יוני סידן שמזרזים איחוי)
ג. חלבוני ראב יכולים לעכב מעכבים של הסנייר
86
כיצד מתמחזרים חלבוני הסנייר?
חלבון הקסמרי שהוא אייאייאיי אייטיפיאז,NSF בעזרת אנזים.
הוא עושה שימוש בהידרוליזת אייטיפי כדי להפריד את האינט' החזקות בין הדומיינים של חלבוני הסנייר. הוא משמש כמעין הליקאז של החלבונים ומפריד.
87
באילו עוד מקרים יש צורך באיחוי ממברנות מלבד מוזיקולות טרנספורט?
א. הממברנה של זרע וביצית מתאחות בהפריה
ב. המיובלסטים מתאחים במהלך התפתחות סיבי שריר.
ג. איחוי בין האיאר והמיטוכונדריה כשהן מחליפות ממברנות
ד. חלבוני איחוי ויראליים- כשוירוסים נקשרים לרצפטור על תא המטרה והממברנות מתאחות- מאפשר כניסת חומצות גרעין של הנגיף- ניתן לראות בשימוש במיקרוגרפיית אלקטרונים.
ד. נגיף השפעת- נכנס לתא עי אנדוציטוזה מתווכת רצפטור, ונמסרים לאנדוזומים. החומציות הנמוכה באנדוזומים מפעילה חלבון איחוי שקיים במעטפת הנגיף, הוא מתאחה עם האנדוזום ומשחרר חומצות גרעין לציטוזול.
88
מהו תפקידו המרכזי של הגולג'י?
אתר מרכזי לסינתזת פחממות, מיון ותחנת שיגור לתוצרים שמגיעים מהאיאר.
89
מאיזה איזור באיאר יוצאות וזיקולות אל הגולג'י?
אזור שאינו מכוסה ריבוזומים, ER EXIT SITE
90
כיצד נארזים חלבוני המטען באיאר לשינוע לגולג'י?
א. חלבונים בעלי סיגנל יציאה בזנב ההידרופובי שלהם- הסיגנל הוא טראנס ממברנלי ומצידו החיצוני של ממברנ האאר נקשרים אל סיגנל זה חלבון מתאם ששייך לקופ 2. החלבונים הממברנליים נארזים לוסיקולת טרנספורט כאשר חלקם מתפקדים גם כקרגו רצפטור ולוקחים איתם חלבונים נוספים.
חלבונים אחרים יכולים להכנס לוזיקולה בזרימת תפזורת- אלו חלבונים שאין להם אותות יציאה, וגם חלבונים שהם תושבי קבע של האיאר יכולים להשתרברב לוסיקולה הזו.
91
מה הם החלבונים הממברנליים שמשמשים כקרגו רצפטור בוזיקולות הטרנספורט מהאיאר אל הגולג'י?
חלבונים אלו הם לקטינים, נקשרים לאוליגוסכריד לעל החלבונים המופרשים (העץ הסוכרי שמוטען עי גליקוזיל טרנספרז באיאר)
92
כיצד השפיע חוסר בלקטין שנקשר למנוז בפקטורי קרישה 5 ו8?
גרם לדימומים מסיביים כיוון שהלקטין הוא שאחראי על אריזת הפקטורים בוזיקולות.
93
HOMOTYPIC FUSIONמה הוא תהליך ה?
HETEROTYPIC FUSION מה הוא תהליך?
לאחר שהוזיקולות מניצות מהאיאר ומשילות את הציפוי שלהם הן מתחילות להתמזג זו עם זו- איחוי ממברנות של אותו מדור.- פיז'ן הומוטיפי.
פיוז'ן הטרוטיפי זה איחוי ממברנות של מדורים שונים.
94
מה הדמיון והשוני בין האיחוי ההומוטיפי להטרוטיפי מבחינת מנגנון?
כמו להטרוטיפי גם ה יש שימוש בחלבוני סנייר.
בשונה מההטרוטיפי, שתי הממברנות תורמות את הוי סנייר והטי סנייר- אינטרקציה סימטרית.
גם בהווטופי יש שימוש בחלבון אןאסאף לפתיחת הסנייר.
95
VESICULAR TUBULAR CLUSTER מה הוא ה?
המבנה שנוצר לאחר איחוי הוזיקולות שהונצו מהאיאר באיחוי הומוטופי. הקלסטרים הללו מהווים מדור נפרד מהאיאר- הם מובליפ במהירות לאורך המיקרוטובולי ומתאחים עם הגולגרי.
הקלסטרים הללו מחזירים וזיקולות לאיאר. הוזיקולות המניצות מהקלסטרים מצופות קופ 1.
תוך התקדמותם אל הגולג'י הקלאסטרים הצינוריים הללו מתבגרים ומשנים את הרכבם.
96
COATOMER מה זה ?
הוזיקולות המניצות חזרה אל האיאר מהקלסטרים הצינוריים, ייחודיות בכך שהרכיבים שמרכיבים את הציפוי הפנימי והחיצוני מגוייסים כקומפלקס שמורכב מראש ונקרא קואוטומר.
97
מה הם הסורטינג זיגנלז?
בסורטינג סיגנלז הכוונה לאותות אחזור לאיאר.
לחלבונים אינטרינזיים של האיאר, כמו ביפ ופידיאיי, יש KDEL בקצה הקרבוקסילי סינגל אם הם מסיסים
KKXX והרצף של החלבונים הממברנלים
בזכות הסיגנלים הללו המצויים בחלבונים, אם יגיעו לגולג'י הן בכוונה והן בטעות, הם ישובו לאיאר.
האותות על גבי חלבונים ממברנליים באיאר יכולים ליצור אינט' ישירה עם קופ 1. חלבונים מסיסים חייבים קודם להקשר לרצפטור.
98
KDEL?מה הוא רצפטור ה
רצפטור טראנס ממבראנלי מסוג מולטי פאס שקושר רצף קיידיאיאל ומאגד את החלבונים שיש להם את הרצף הזה לוזיקולה רטרוגרדית אל האיאר.
אפיניות הרצפטור הזה לרצף משתנה לפי "התבגרות" הממברנה מהאי אר אל הקלאסטר הצינורי- באי אר האפיניות נורא נמוכה כי אין בו צורך, ועם הבשלתו אל הקלסטר הצינורי ואחכ אל הגולג'י האפיניות שלו לרצף מתגברת. האפיניות משתנה ככל הנראה לאור העובדה שהחומציות משתנה- הגולג'י חומצי יותר כי יש עליו משאבות פרוטונים ולכן גורם לרצפטור להיות פעיל.
99
מה יקרה אם נסיר את רצף הקיידיאיאל מתושבי הקבע של האיאר?
קצב ההפרשה שלהם יהיה הרבה יותר נמוך משל חלבונים רגילים. משהו מונע מהתא להפריש חלבונים אלו.
הסברה היא שקצב ההפרשה איטי בגלל שחלבונים אלו נוהגים ליצור מגה קומפלקסים שגדולים מדי בשביל מע ההפרשה. מכיוון שחלבוני האיאר קיימים בו בריכוזים גבוהים מאוד, אינט' בעלות זיקה נמוכה יספיקו כדי לשמור על מרבית החלבונים שם.
ניתן ללמוד מכך על מנגנון האגרגציה של חלבונים הפועלים באותו מדור- כך התאים שומרים על המדורים שלהם. למשל אנזימי גולג'י שפועלים יחד נקשרים זה לזה ולכן לא יכנסו לשלפוחיות ההפרשה מהגולג'י.
100
מה מיקומו של הגולג'י בבעלי חיים?
ליד הגרעין וסמוך לצנטרוזום- בזכות מיקרוטובולי וחלבוני מנוע. כדי לשמר את הציסטרנות קרובות ובמרחק מסוים מהאיאר יש צורך בהשקעת אנרגיה.
101
היכן ממוקם הגולג'י ברוב תאי הצמח?
מאוד ערימות גולג'י בודדות שמפוזרות בכל הציטופלזמה, שם נמצאות בדרכ בסמוך לאתרי יציאה לאיאר.
102
אילו ליפידים חשובים מיוצרים בגולג'י?
ספינגומיאלין, גליקוליפידים
103
מה הם מדורי הגולג'י השונים? מה תפקידם?
ציס גולג'י נטוורק- מיון ראשוני- מי ימשיך הלאה לעיבוד ומי יחזור לאיאר. בנוסף מתבצע זרחון על אוליגוסכרידים על גבי מנוז בחלבונים ליזוזומליים. חלבונים בעלי מנוז 6 פוספס שזורחן בציס גולג'י ישלחו אל האנדוזום והליזוזום.
בציס ציסטרנה- התחלה של טרימינג של מאנוז
מדיאל ציסטרנה- המשך טרימינג של מנוז, הוספת גלוקנק.
טראנס ציסטרנה- הוספה של גלקטוז ונאנא.
טרנס גולג'י נטוורק- סולפיטציה של טירוזין ופחממות- שיירי סוכר שהוספו בדרך. על גבי קב' ההידרוקסיל. בנוסף, נעשה מיון סופי של החלבונים- הליזוזום, ממברנה פלזמטית ווזיקולות הפרשה.
104
מה מאפיין את חלבוני הגולג'י?
כולם קשורים לממברנה
כל הגליקוזידאזות והגליקוזיל טרנספרזות הם חלבונים טרנסממברנליים מסוג סינגל פאס.
105
אילו שני סוגים של אוליגוסכרידים מסוג אן לינקד יש ביונקים?
א. קומפלקס אוליגוסכרידים- בעלי ליבת האן לינקד שהתווספה באיאר המכילה 2 גלוקנק ושלושה מנוזים שזה אזור הליבה שקיים גם בסוג השני של האוליגוסכריד. ישנו חיתוך של האוליגוסכריד שהתווסף באיאר, על ידי מאנוזידאז ועליו מתווספים סוכרים בהמשך. יכולים להצטרף נאנא, גלקטוז וקלוקנק.
ישנם שני שלבי חיתוך מאנוז עי מאנוזידאז, עי מאנוזידאז 1 נחתכים 3 מאנוזים ומאנוזידאז 2 חותך עוד 2 מנוזים לאחר שהצווסף עוד גלוקנק לעץ. לאחר הסרת המאנוז השניה, הקשר בין שני גלוקנאז בליבה הופך להיות עמיד ENDO H בפני התקפה עי אנדוגליקוזידאז ספציפי.
העמידות בפני אנדו הייצ' מהווה דרך להבדיל בין אוליגוסכריד מורכב לאוליגוסכריד עשיר במנוז.
לבסוף, מתווספים גלוקנקים, גלקטוזים וחומצה סיאלית (נאנא). השלב האחרון של העצים המורכבים קורת בציסטרנות הגולגי. הסוכרים שמוספים לעץ הסוכרים המורכב הם סוכרים המאוקטבים על ידי נוקלאוטידים. הם מועברים על ידי אנזימי גליקוזיל טרנספרז שפועלים ברצף. הממברנות של ציסטרנות הגולג'י מכילות חלבונים נשאים ספצ' לכל נוקלאוטיד סוכרי.
ב. אוליגוסכרידים בעלי הרבה מנוז- נחתך חלק מהעץ הסוכרי שהגיע מהאיאר עד נקודה מסוימת. אין הוספת סוכרים חדשים בגולג'י כמו נאנא, אלא רק מנוזים נוספים.
ניתן לראות גם אוליגוסכרידים היברידיים עם ענף מנוז וענק גלוקנז וגלקטוז.
לפעמים שני סוגי האוליגוסכרידים מחוברים במקומות שונים לאותה שרשרת פוליפפטידית.
106
מדוע לנאנא יש חשיבות מיוחדת באוליגוסכרידים?
כיוון שיש עליה מטען שלילי
107
מתי אוליגוסכריד נשאר בעל מנוז גבוה או מעובד?
תלוי במיקומו בחלבון. אם הוא נגיש לאנזימי העיבוד של הגולג'י, סביר להניח שיומר להיות אוליגוסכריד מורכב.
108
מה ההבדל בין הביוסינתזה שקורית בגולג'י לזו הקורית באיאר?
בגולג'י הסוכרים כולם מורכבים בתוך הלומן, מהנוקלאוטידים הסוכריים ובאיאר עובר עץ סוכרים מלא שמורכב חלקית בציטוזול וחלקית באיאר. בנוסף באיאר מרבית התגובות שנעשות עושות שימוש בסוכרים מחוברים לדוליכול.
109
מה הם סוגי הגליקוזילציות?
N גליקוזילציות:
על גבי החנקן האמידי על שייר האר של אספרגין.
מתרחשות בעיקר באיאר. בגולג'י מתבצעת על גלוקנק בלבד, שמוסף על אספרגין כמונוסכריד ואחריו מתווספות עוד יח סוכריות.
O גליקוזילציות:
על גבי ההידרוקסיל בשייר האר של סרין ותראונין ובמקרים מסוימים גם על הידרוקסיליזין והידרוקסיפרולין.
מתבצעות בגולג'י. באיאר או גליקוזילציות קיימות אך לא שכיחות.
בגרעין ובציטוזול או גליקוזילציות נעשות רק על מונוסכריד של גלוקנק.
האו גליקוזילציה נעשית באמצעות גליקוזיל טראנספרזות שמשתמשות בסוכרים משופעלים בלומן הגולג'י. בדרכ הראשון שמתווסף זה גלוקנק ואחריו מס וריאבילי של סוכרים.
110
מה ההבדל המשמעותי בין סינתזה של מאקרומולקולות אחרות כמו דנא רנא וכו' לבין בניית אוליכוסכריד?
באוליגוסכריד לא מדובר בסדרת צעדים זהים שעושים שימוש באנזים/אנזימים שחוזרים על עצמם, אלא מדובר באנזים אחר בכל פעם.
111
מה תפקיד הגליקוזילציות?
א. גליקוזילציות מסוג אן מקדמות קיפול חלבונים ב2 דרכים: 1) גורמת לתוצרי הביניים של הקיפול להיות יותר מסיסים כי השיירים הסוכריים מסיסים וככה נמנעת אגרגציה. 2) יוצרת "גליקו-קוד"- מודיע היכן החלבון כבר עבר, מאפשר את קישור החלבון לצפרונים ומדריך את החלבון לאן הוא צריך ללכת עי קישור לחלבונים אחרים שקושרים את הגליקוזילציה.
ב. מאפשר ספיחת מולקולות מים באמצ' מטענים חשמליים. (נאנא טעון שלילית)
ג. נוכחות אוליגוסכרידים הופכת את הגליקופרוטאין ליותר עמיד לעיכול של אנזימים פרוטאליטים- מאריך את זמן מחצית החיים של החלבון. שרשראות אוליגוסכרידים בעלות גמישות מוגבלת ושרשרת שכזו שבולטת על שטח הפנים של החלבון יכולה להגביל גישת מקרומולקולות אליו. במקור ככהנ הגליקוזילציות על חלבוני מעטפת התא סיפקו שכבת הגנה.
ד. מאפשר קישור ללקטינים בסביבה החוץ-תאית. מאפשר תקשורת בין תאית וחיוני להתפתחות תקינה של העובר. ציפוי הריר באיברים כמו ריאות ומעי חיוני להגנה מפני פתוגנים. בנוסף, הכרת שרשראות הסוכר עי לקטינים בחוץ התא חשובה בתהליכים התפתחות רבים ובזיהוי בין תאי. לדוג, סלקטינים- הם לקטינים טרנסממברנלים שפועלים באדהזיה של תאים בנדידת תאי דם.
ה. נוכחות אוליגוסכרידים יכולה לשנות א התכונות האנטיגניות ותפקודיות של חלבון- השפעה על קישור חלבון-נוגדן.
ו. תפקידים רגולטוריים חשובים - כמו העברת אותות דרך פני התא- גליקוזילציות שונות שנעשות על חלבון יכולות לשנות את הספציפיות של החלבון לאותות שונים ויכולים לשנות את יעוד התא.
112
על מי נעשות סולפיטציות בגולג'י? וכיצד?
סולפיטציות נרחבות בגולג'י מתבצעות על גליקוזאמינוגליקנים, שהם גאגים שמחוברים לחלבון, וכך מתווסף אליהם מטען שלישי. חלק מהטירוזינים בחלבונים עוברים סולפיטציות לפני יציאתם מהגולג'י.
PAPS הסולפיטציה נעשית על ידי תורם הסולפט
אדנוזין שמחובר לפוספט אלפא ובמקום פוספאט בטא מחובר לאלפא סולפט. תורם הסולפט מגיע מהציטוזול אל הלומן של הטראנס גולג'י נטוורק.
113
אלו מודלים מסבירים את התארגנות מדורי הגולג'י ותנועת החלבונים בהם?
א. מודל התבגרות הציסטרנות- ציסטרנות הגולג'י עוברות התבגרות- תוך רכישת ואיבוד חלבוני גולג'י ספציפיים.
נוצרות כל הזמן ציסטרנות חדשות כקלסטרים צינוריים שהגיעו מהאיאר, שהם מתבגרים בהדרגתיות והופכים להיות ציסטרנה מדיאלית ואז טראנס. מבנה דינאמי שמשתנה.
ב. מודל וזיקולות טרנספורט- הציסטרנות הן מבנים ארוכי חיים ששומרים על מע' החלבונים שלהם באופן קבוע במקום. חלבוני מטען עוברים מציסטרנה אחת לאחרת באמצ' וזיקולות טרנספורט.
נרהא כי ככהנ שני המודלים מתקיימים- יתכן שהגרעין של הציסטרנה במרכז יציב ואילו בפריפריה האזורים עוברים התבגרות.
114
מה תפקידם של חלבוני המטריקס של הגולג'י?
על ידי מיקרוטובולי שמייצבים מעגנים ומובילים את ציסטרנות הגולגי, ובנוסף ישנם חלבונים שמהווים את המטריקס של הגולגי ומצויים בציטוזול- מקנים לו את שלמותו המבנית.
בין חלבונים אלו ישנם הגולג'ינים- חלבונים שבנויים כמו חכות ארוכות. הם בנויים מדומיינים של קוילד קויל ושזורים זה בזה. הם עוזרים בשמירה על העברת וזיקולות הגולג'י קרוב לאברון באמצ' אינט' עם חלבוני ראב. הם דגים את ממברנות הגולג'י ואת הוזזיקולות שמניצות מציסטרנה אחת לשניה.
בנוסף, חלבוני המטריקס של הגולג'י עוברים זרחונים בזמן המיטוזה, מה שיגרום לפרגמנטציה של הגולג'י ולחתיכון להתפזר בציטוזול. הם יעברו לתאי הבת שם יעברו דה זרחון וזה יאפשר להם בניה מחדש של הגולג'י. באפופטוזיס מתבצע ביקוע פרוטאוליטי של הגולג'ינים עי קספאזות- משאיר פרגמנטים של גולג'י לאחר שהתא משמיד עצמו.
115
כמה סוגי אנזימים מכילים הליזוזומים?
מה משותף לכולם?
כ40 סוגים של אנזימים הידרוליטיים, כולל נוקלאזות, גליקוזידאזות, ליפאזות, פוספוליפאזות, פוספטאזות וסולפטאזות.
חומצי PHהמשותף לכולם הוא שהם עובדים ב
עומד על 4.5-5PHה
116
מה תפקיד ממברנת הליזוזום?
שמירה על הציטוזול מפני יציאת הידרולאזות מהציטוזול
שונה מבציטוזול וכך האנזימים PH בנוסף, היא מאפשרת
הללו גם אם יצאו לציטוזול לא יפעלו כמעט כיוון שהחומציות שונה באופן משמעותי.
117
כיצד חלבוני הממברנה הליזוזומלית לא מפורקים על ידי אנזימים ההידרוליטיים?
מה שמגן עליהם זו הגליקוליזציה הגבוהה שיש עליהם.
118
מה ההבדל בין משאבת הפרוטונים של הליזוזום למשאבת הפרוטונים של המיטוכונדריה והכלורופלסט?
פועלת בכיוון ההפוך- המשאווה הליזוזומלית מכניסה פרוטונים כדי להחמיץ את הלומן שלה ולא ההיפך.
119
מה תפקידי משאבות הפרוטונים מסוג וי טייפ שנמצאות על אברוני מע ההפרשה?
ראשית, מספקות סביבה חומצית שמתאימה לתגובות שמתרחשות שם, הן מספקות מעבר פרוטונים שמספק מקור אנ להובלת מטבוליטים קטנים על פני ממברנת האברון.
120
כיצד נוצר הליזוזום?
אנדוזומים מאוחרים מכילים חומרים שקיבלו הן מאנדוציטוזה ממברנלית והן מהידרוליזות ליזוזומליות חדשות שסונתזו באיאר. הם מתמזגים עם ליזוזומים קיימים או עם אנדוזומים מאוחרים אחרים והופכים להיום אנדוליזוזום. אנדוליזוזומים יתבגרו להיות ליזוזום כאשר תהליכי הפירוק בהם יסתיימו. בליזוזום אין תהליכי פירוק!
אנדוליזוזום וליזוזום זהים למעט העובדה ששהם בשלבים שונים של מחזור ההתבגרות.
121
מה הן וקואולות?
וזיקולות מלאות בנוזל שנמצאות בצמחים. תופסות בדרכ כ30 אחוזים מנפח התא (יש תאים בהם תופסת 90 אחוז) הן גם מכילות אנזימים הידרוליטיים כמו הליזוזומים.
וקואולות מאוד ורסטיליות בתפקידיהן. הן משמשות כאחסון פסולת, אחסון נוטריינטים, אברון מפרק, כדרך חסכונית להגדלת נפח התא ומשמשת כבקר ללחץ טורגור. לאותו תא יכולות להיות וקואולות שונות בעלות פונקציות שונות.
בנוסף, וקואולות יכולות לשמש כבקר הומאוסטטי שיעזור לצמחים לעמוד בשינויים סביבתיים. למשל, כאשר הפ.ה. בסביבה יורד, שטף הפרוטונים לציטוזול מאוזן, עי הובלה מוגברת של פרוטונים לוקואולה וכך היא שומרת על הפ.ה. בציטוזול.
צמחים שומרים על לחץ טורגור כמעט קבוע למרות השינויים בסביבתם. זאת על ידי שינוי הלחץ האוסמוטי של הציטוזול והוקואולה, בחלקם עי פירוק ויצירת פולימרים כמו פוליפוספט בואקואולה, וחלקם על ידי שינוי שיעורי ההובלה של סוכרים, חא, ומטבוליטים אחרים סביב הממברנה הפלזמטית והממברנה של הוקואולה. לחץ טורגור מווסת את הפעילות של טרנספורטרים מובחנים בכל ממברנה כדי לשמור על השטפים הללו.
122
באילו חומרים המאוחסנים בוקואולות הצמחים בני"א משתמשים?
גומי, אופיום, תבלין שום.
123
ANTOCYANINE PIGMENT מה הוא ה?
מאוחסנים בוקואולות צבעוניות- בהן תפקידם לצבוע אותן כך שימשכו לצמח חרקים מאביקים.
124
כיצד הוקואולה עוזרת בהגנה על הצמח ממזיקים?
כשהיא נפגעת ונוצר בה חתך יוצאות ממנה מולקולות רעילות לטורף.
125
מה הוא האוטופגוזום?
כשהתא מקיים אוטופגיה- למשל של מיטוכונדריון פגום, לאחר האוטופגיה מיוצרת סביב החומר שנבלע ממברנה כפולה ליצירת וטופגוזום שבהמשך יתאחה לליזוזום.
כנל לגבי תהליך הפאגוציטוזה, יש גם אברון ביניים שנקרא פאגוזום.
126
לשם מה מבוצעת אוטופגיה?
כלל התאים מבצעים אוטופגיה, חיונית בגדילה והתפתחות של התא שכן היא מסייעת בדיפרנציאציה של התאים וגם בתגובות הסתגלות. זהו תהליך שרידות תאי בין אם התא מצוי בסטרס ובין אם יש צורך לפנות איברון שחוק שסיים את תפקידו.
127
למה יכול לגרום פגם באוטופגיה?
יכול למנוע מתאים לפנות חיידקים הפולשים אליהם, להוביל להיווצרות אגרגטים של חלבונים שאינם פועלים כראוי ולגרום למחלות.
128
כיצד פועל תהליך האוטופגיה?
,בקומפלקס מס 1 שלו MTORפרוטאין קינאזות ו
עוברים אקטיבציה ושולחים אותות על מצב מטבולי.
החלבון הטרנסממברנלי שחשוב להתחלת התהליך ATG9
גורם ליצירת ממברנה כפולה סביב האזור המיועד לבליעה- אבל טרם הממברנה הכפולה אזור זה יסומן על ידי פוליוביקוויטין- שרשראות של מעל 20 יוביקוויטינים. היוביקוויטין יקשר קוולנטית לפוספוליפיד פוספטידיל אתנולאמין. אייטיג'י9 לא מצוי באוטופגוזום השלם. הממברנות הולכות ומתאחות ומתרחשת סגירה של הממברנה ונוצר אוטופגוזום עם ממברנה כפולה. חלבוני סנייר מניעים איחוי בין אוטופגוזום לליזוזום.
הממברנה הפנימים של האוטופגוזום ותוכן הלומן שלו יעוכל עי ההידרולזות שיושבות בפנים. נשאר עם ליזוזום בעל ממברנה אחת ותוצרי הפירוק של ההידרולזות בפנים.
129
אילו סוגי אוטופגיה קיימים?
לא סלקטיבית:
חלק גדול מהזיטופלזמה תהיה באוטופגוזום. יכולה להופיע במצבי רעב- כשהנוטריינטים החיצוניים מוגבלים, עיכול הציטופלזמה תפיק נוטריינטים שיעזרו בשרידות התא.
אוטופגיה סלקטיבית:
מטען ספציפי נארז באוטופגוזום עם מעט ציטופלזמה. זהו מנגנון שנועד לעכל מיטוכונדריות שחוקות, /פגועות= מיטופגיה, פרוקסיזומים, ריבוזומים ואיאר. מנגד, מנגנון זה יכול לשמש גם כהגנה מפולשים.
130
מהו מנגנון המיטופגיה?
מיטופגיה= אוטופגיה של מיטוכונדריה.
במיטוכונדריה פגועה נפגע מפל הפרוטונים ולכן חלבונים לא נכנסים אליה.
בין החלבונים שלא נכנסים נמצא הפרוטאין קינאז פינק 1 שבדרכ נמצא בתוך המיטו'. כשבמקום זאת הוא נשמר על PARKIN פני השטח המיטו' הוא מגייס יוביקוויטין ליגאז מהציטוזול. הפרקין יסמן את חלבוני הממברנה החיצונית של המיטו' וכך המיטו' תובל להרס באוטופגוזום. מוטציוץ בפינק1/ פרקין מובילות לסוג של מחלת פרקינסון מוקדמת.
131
כיצד מסומנים חלבונים להגעה לליזוזום?
M6P בבעח, בכדי שחלבון יגיע לליזוזום הוא צריך סימון.
הסימון הזה נעשה בציס גולג'י נטוורק, על גבי עץ סוכרים עשיר במנוז במתווסף באן גליקוזילציה כבר באיאר- ונעשה עג אנזימים ליזוזומליים.
בציס גולג'י מוסיפים למנוז פוספוגלוקנק ובמדיאל מסיריםן את הגלוקנק ונשאר הפוספט.
M6P בטראנס גולג'י נטוורק יש רצפטורים ל
שממיינים הידרולזות אל האנדוזו המוקדם שבהמשך יתאחה לליזוזום. חלבון המעטפת שאחראי להנצת הוזיקולות מהגולג'י לאנדוזום המוקדם הוא קלתרין.
רצפטור האם6פי משחרר את ההידרולאזה שקשר כשהם מגיעים לאנדוזום, שכן שם הפ.ה נמוך יותר ולכן ישחרר את הרצפטור.
לאחר ההתנתקות מהרצפטור, הרצפטור חוזר לגולג'י בוזיקולה ייעודית מהאנדוזום. וזיקולות אלו מצופות ברטרומר ומחזיר את הקולטן לטראנס גולג'י לשימוש חוזר. לאחר השחרור של ההידרוליזה באנדוזום, מתרחשת הידרוליזה של הפוספט על האם6פי- מהווה חלק מהאקטיבציה.
באמצעות קסקדת הראב האנדוזום יעבור להיות אנדוזום מאוחר ואז ליזוזום.
132
M6P כיצד התא יודע למי להוסיף?
האות להוספת הסימון להגעה לאנדוזום חייב להמצא בשרשרת הפוליפפטיד ולא האוליגוסכריד כיוון שכל האוליגוסכרידים זהים. רצף ח"א המסמן את הצורך signal patch בסימון אם6פי ושליחה לאנדוזום נקרא
133
מה היא מחלת הורלר?
מחלה בה יש מוטציה בגן המקודד להידרולאזה המפרקת סוגים מסוימים של גליקוזאמינוגליקנים.
134
מהי מחלת איי סל? icell
הצורה החמורה ביותר של מחלות אגירה ליזוזומליות - כמעט כל האנזימים ההידרוליטיים חסרים בליזוזומים של תאים רבים, החומרים הבלתי מעוכלים מצטברים בליזוזום וגורמים לגופים ששוקעים בתאים והורגים אותם.
נובעת מפגם בגן אחד היא רצסיבית, וגורמת למוות בגיל מוקדם.
המוטציה נמצאת בגן המקודד לאנזים גלוקנק פוספוטראנפרז,שמעביר פוספט מיודיפי גלוקנק למאנוז על הידרולארז שאמור להיות פעיל בליזוזום. ההידרולזות החסרות בליזוזום נמצאות בדם כיוון שלא יתמיינו כראוי בגולגי וישוחררו אל חוץ התא
135
כיצד במחלת איי סל ניתן לראות בסוגי ליזוזומים בתאים מסוימים אנזימים ליזוזמליים ותפקוד תקין?
בתאים כגון הפטוציטים- ההסבר הוא מסלול אלטרנטיבי להפניית הידרולזות לליזוזום שלא תלוי באם6פי וישנו בתאים מסויימים שיש להם רצפטורים אלטרנטיביים. חלבונים ממברנלים שלא משתמשים במסלול אם 6 פי .כמובן
136
מה היא מחלת טאי זקס?
מחלת אגירה ליזוזומלי בה אין פירוק של גליקוליפיד ספצ'
ששוקע. האנזים החסר במחלה זו הוא בטא הקסוז אמינידז שמפרק גנגליוזידים.
נצפה לראות נזקים נוירולוגיים.
137
מה היא מחלת גושה
מחלת אגירה ליזוזומלית בה יש חוסר באנזים גלוקוסרברוזידאז, שחיוני כדי לפרק גליקוזיל צרמיד. שמצוי בשפע במע' העצבים המרכזית ותאי דם אדומים. המחלה משפיעה על המוח בו יש גנגליונים ועל הטחול שם מפורקים אריתרוציטים.
138
כיצד צבע עור קשור לליזוזומים?
מלנוציטים בעור מייצרים ומאחסנים פיגמנטים בליזוזומים שלהם. המלנוזומים משחררים את הפיגמנט באקסוציטוזה לחלל החוץ תאי של האפידרמיס. לאחר מכן קרטינוציטים יתפסו את הפיגמנטים מה שיוביל לפיגמנטציה של העור. באלביניזם- יש פגמים ביציאת המלנוזומים.
139
לאן יגיעו רוב הוזיקולות האנדוציטיות מהממברנה הפלסמטית?
לאנדוזום המוקדם.
החומרים שיגיעו יעברו מיון- חלק לפירוק עי אנדוזום מאוחר וחלק חזרה לממברנה עי אנדוזום ממחזר.
140
מה כולל תהליך ההתבגרות הליזוזומלי?
שינוי הרכב החלבונים על גבי הממברנה האנדוזומית. האנדוזום עצמו עובר מהסביבה של הפריפריה התאית ומתקרב לגרעין.
לאנדוזום המוקדם יש טובולר פרוג'קשין שבהמרה שלו לאנדוזום המאוחר הם "יאבדו" כיוון שיהפכו לוסיקולות שנשלחות לאברונים שונים.
לאורך כל ההתבגרות הליזוזום מקבל וסיקולות עם חלבונים חדשים מהטרנס גולג'י .
ככל שהאנדוזום מתבגר הוא מפסיק למחזר חומרים לממברנה וכל תכולתו תעבור פירוק.
141
מדוע יש צורך בצימוד בין אקסוציטוזה לאנדוציטוזה?
בשביל שהתא לא יגדל/ יקטן- על ממברנה שמכניסים לתוך התא צריך להוציא אחת החוצה
האנדוציטוזה של הממברנה בכדי לשמור על גודל תקין בעיקר נעשית עי פינוציטוזה.
142
מה הוא תהליך הפינוציטוזה?
תהליך "שתייה תאית" שמטרתו העיקרית הוא החזרת ממברנות פנימה כחלק מההומאוסטזיס של ממברנות בתא.
התהליך נעשה עי וזיקולות אנדוציטיות עטופות קלתרין בעיקר. תאים יכולים לצור וזיקולות פינוציטיות אחרות. לדוג:
קבאולי. נמצאים בממברנה הפלזמטית של רוב החולייתנים. מצויים לרוב כחלק מליפיד ראפטס. החלבונים הממברנליים העיקריים בקבאולי הם קבאולינים, חלבונים ממברנליים אינטגרליים. הם מחדירים אל הממברנה מצד אחד דומיין הידרופובי ומצד שני בציטוזול עושים אינט' עם חלבונים גדולים מה שעוזר לייצב את עקמומיות הממברנה.
143
מה ההבדל העיקרי בין וזיקולות עטופות קלתרין/קופ לעומת קבאולי?
הקבאולי הם בדרכ מבנים סטטיים, אך ניתן לצבוט אותם גם פנימה באנדוציטוזה- יכולות לשמש כוזיקולות אנדוציטיזיות לאנדוזום המוקדם ויכולות לעשות טראנסציטוזה לצידה השני של הממברנה.
144
אילו וירוסים/ רעלנים יכולים להכנס חלתא דרך קבאולי?
SV40וירוסי בעלי חיים, כג' פפילומה ו
מועברים עי קבאולי לאנדוזומים המוקדמים ומשם עי וזיקולות טרנספורט ללומן האיאר, משם יצא הגנום הנגיפי אל הציטוזול ומשם לגרעין כדי להשתכפל.
כך גם נכנס רעלן הכולרה.
145
מה הוא תהליך המאקרופינוציטוזה?
אינו תלוי בקלתרין בשונה מפינוציטוזה.
תלוי בסיגנל תאי ואינו קורה באופן שוטף. הסיגנל גורם לארגון מחדש של חלבוני האקטין של שלד התא, שיוצר בליטות שנקראות ראפלז.
כשאותם ראפלס קורסים חזרה לתא- בצורה שנקראית סגירה ואקואולית, הם לוקחים איתם באופן לא ספצ' נוזל וחלקיקים חוץ תאיים וכך נוצרות וזיקולות אנדוציטיות גדולות שנקראות מאקרופינוזום.
מקרופינוזומים בהמשך ירדו בחומציות ויתאחו עם אנדוזומים מאוחרים או אנדוליזוזומים.
146
מהי אנדוציטוזה מתווכת רצפטורים?
אנדוציטוזה שמתבצע אל תוך התא בתיווך רצפטור שנמצא על הממברנה. בהשתתפות וזיקולות עטופות קלתרין. אנדוציטוזה כזו מספקת אפשרות להכניס לתא מרכיבים חוץ תאיים גם אם נמצאים בריכוזים נמוכים, ביעילות.
147
לתא LDL כיצד פועלת כניסת?
זהו תהליך שתאי יונקים עושים כדי להכניס לתוכם כולסטרול.
ראשית הרצפטור לאלדיאל יקשר לאדפטור פרוטאין ולקתרין ורק לאחר מכן למטען.
כשלתא יש צורך בכולסטרול, יצטברו רצפטורים לאלדיאל באזורי קלאתרין קואוטד.
הצפטור יודע לזהות מרכיב חלבוני עיקרי באלדיאל- אפובי100.
הרצפטור מוכן לאנדוציטוזה לפני הגעת האלדיאל, ולכן כשאלדיאל יתפס הוא יתחיל באנדוציטוזה תלוית קלתרין. הוזיקולה תתאחה לאנדוזום המוקדם.
כתוצאה מהחומציות באנדוזום, הרצפטור יתנתק מהאלדיאל ויתמחזר אל הממברנה. האל דיאל ימשיך במסלולו אל האנדוליזוזום לפירוק.
כשיש יותר מדי כולסטרול חופשי בתא, התא יפסיק את הכנסת האל די אל פנימה וגם לא ייצר חדש.
כשהרצפטור לאלדיאל יהיה פגום- הן חסר לגמרי, הן פגום באתר החוץ/תוך תאי, האלדיאל יצטבר בדפנות העורקים ויגרום לטרשת עורקים.
148
כיצד נשמרת הספציפיות של תהליך אנדוציטוזה מתווכת רצפטורים?
חלבונים ממברנליים לא נוטים להתרכז באזורים עטופי קלתרין ולכן אותם אזורים ישמשו כמסננים מולקולריים כי הם יעדיפו לאסוף חלבונים ממברנליים מסוימים שקשורים לרפטורים שנקשרים לאזורים אלו.
149
כיצד יתמחזר רצפטור מהאנדוזום לממברנה הציטופלזמטית?
כתוצאה משינוי בחומציות הרצפטור משנה קונפורמציה ומתנתק מהמטען שלו. מהאנדוזום המוקדם הוא עובר הנצה ליצירת מבנה וסיקולרי דמוי צינור.
היחס בין שטח הפנים של הממברנה לנפח גדול בצינור הזה ולפיכך יהיו עליו חלבונים ממברנליים רבים שיחזרו לממברנה.
150
כיצד פועלת אנדוציטוזה מתווכת רצפטור של טרנספרין?
טרנספרין הוא חלבון נושא ברזל בדם. נקלט עי הרצפטור ועובר אנדוציטוזה מתווכת רצפטור. החומציות הנמוכה באנדוזום לא תנתק אותו מהרצפטור שלו אלא רק תנתק ממנו את מולקולת הברזל שתשתחרר לדם.
טרנספרין והרצפטור שלו יתמחזרו לממברנה עי הוזיקולות הצינוריות של האנדוזום המוקדם. בחומציות הניטרלית של הממברנה טרנספרין יתנתק מהרצפטור שלו וילך להקשר לברזל וכן הלאה.
151
EFGמה הוא חלבון ה?
חלבון חוץ תאי קטן- אפידרמל גרות' פקטור- שמגרה חלוקה תאית של תאי אפידרמיס ואחרים. נכנס אל התא באנדוציטוזה מתווכת רצפטור .
152
כיצד מתבצעת העברת הרצפטורים שלא ממוחזרים לממברנה לליזוזום?
הדוגמה ניתנת על רצפטורים לאיאפג'י. מצטברים בקלתרין קואוטד פיטס רק לאחר קשירתם לליגנד- בשונה מהאלדיאל.
רצפטורים אלו עוברים רצפטור דאון רגוליישן.
הקולטנים בתחילה יאוקטבו ויסומנו על ידי יוביקוויטין- או מונויוביקוויטין או מולטי יוביקוויטין.
חלבונים מזהי יוביקוויטין נקשרים ומכוונים את הרצפטורים לקלטרין קואוטד פיטס. הרצפטורים ישלחו ESCRT לאנדוזום המוקדם, וחלבוני
מזהים את הרצפטורים המסומנים, ויובילו אותם לוזיקולות שישארו באנדוזום מהאוחר שיתפרק לליזוזום- כך היוביקוויטין מכריח את הרצפטורים לא להתמחזר.
153
מתי קורה תהליך רצפטור דאון רגוליישן?
כשמרבית הרצפטורים לא ממוחזרים אלא עוברים לפירוק תהיה ירידה בריכוז הרצפטורים על הממברנה הפלזמטית.
154
אילו מתחמים קיימים באנדוזום המוקדם?
מתחמים טובולריים בהם קיימות רוב הממברנות, ומתחמים וקואולריים בהם קיימים מרבית הנוזלים.
החלקים הטובולריים מתכווצים והוקואולרים נשמרים והם אלו שיהפכו לאנדוזום המאחור.
155
כיצד נעים אנדוזומים בוגרים?
על גבי מיקרוטובולי לכיוון פנים התא. בדרך הם מאבדים וסיקולות המבנים הצינוריים ומקבלים אליהם חלבונים ליזוזומליים חדשים.
156
אילו שינויים מתרחשים בהתבגרות האנדוזום?
א. שינוי מבנה וצורה על ידי המתחמים הצינוריים.
ב. המאפיינים התפקודיים של האברון משתנים על ידי חלבוני ראב, פוספואינוזיטידים, חלבוני בנייר וחלבוני מנוע משתתפים בהתבגרות האנדוזום.
ג. משאבת וי טייפ אייטיפיאז מחמיצה את לומן האנדוזום המוקדם- מה שהופך את ההידרולזות לפעילות.
ההחמצה ההדרגתית חשובה ליכולת של האנדוזום המוקקדם עוד למחזר חלבונים לממברנה בתחילה ללא סיכון.
ד. וזיקולות אינטרהלומינליות מבודדות איתות אנדוציטי בליזוזום.
ה. העברת חלבונים ליזוזומליים מהטראנס גולגי נטוורק.
156
אילו שינויים מתרחשים בהתבגרות האנדוזום?
א. שינוי מבנה וצורה על ידי המתחמים הצינוריים.
ב. המאפיינים התפקודיים של האברון משתנים על ידי חלבוני ראב, פוספואינוזיטידים, חלבוני בנייר וחלבוני מנוע משתתפים בהתבגרות האנדוזום.
ג. משאבת וי טייפ אייטיפיאז מחמיצה את לומן האנדוזום המוקדם- מה שהופך את ההידרולזות לפעילות.
ההחמצה ההדרגתית חשובה ליכולת של האנדוזום המוקקדם עוד למחזר חלבונים לממברנה בתחילה ללא סיכון.
ד. וזיקולות אינטרהלומינליות מבודדות איתות אנדוציטי בליזוזום. ככל שהאנדוזום מתבגרות יותר ממברנות מחוץ האנדוזום נכנסות כוסיקולה אל הלומן שלו.
ה. העברת חלבונים ליזוזומליים מהטראנס גולגי נטוורק.
157
מה הם המולטיווסיקולר באדיס?
וזיקולות שעוברות אנדוציטוזה ממברנת האנדוזום אל תוך הלומן שלו.
הם נושאים חלבוני ממברנה המיועדים לפירוק וכך האנזימים יוכןלו לעכל אותם.
במולטיוסיקולר באדיז יש גם תוכן מסיס של אנדוזומים מוקדמים שמיועד לעיכול.
בכדי שיכנסו לוסיקולות האינטרהלומינליות הללו חלבונים יש צורך בסימונם עי יוביקוויטין בצידם הציטוזולי- יוביל אותם לאזורים קלאטרין קורוטד.
המולטיווסיקולר באדיס הכרחיים לפירוק כיוון שהלומן עצמו עמיד להידרולזות ורק בו יכול לקרות הפירוק.
158
ESCRT כיצד פועל מנגנון יציר הוסיקולות יחד עם חלבוני
לאחר סימון חלבונים המיועדים לפירוק שנמצאים על הממברנה עי יוביקוויטין הם מובלים לוזיקולות מצופות קלתרין. הם יגיעו לאנדוזום, שם סדרת חלבוני אסקרט יזהו את הסימון ביוביקוויטין. האינווגינציה לווזיקולות אינטרהלומינליות תלוי גם בקינאז שמזרחן פוספטידיל
שמשמש אתר עגינה נוסף לאסקרטPI3P אינוזיטול ויוצר.
חלבוני אסקרט דורשים גם יוביקוויטין וגם פיפ.
אסקרט 3 יוצרים מבנים שמכופפים את הממברנה ומתוו אינווגינציה.
לאחר צביטת הוזיקולה חלבוני אסקרט יחזרו לציטוזול.
חלבוני היוביקוויטין גם יחזרו לממברנה.
159
מה יכול להגרם מפגם בחלבוני אסקרט?
פגיעה בתהליכי האיתות- במקום שחלבונים שמאותתים וצריכים להפסיק את האיתות יכנסו להשתקה הם ממשיכים לפעול. עלול להוביל לפרוליפרציה של תאים וסרטן.
160
אילו שימושים נוספים יש לחלבוני האסקרט?
משמשים גם בציטוקינזה של תאי בעח והנצת וירוסים, שכוללים הנצה הרחק משטח הפנים של הממברנה.
161
מה הוא תהליך הטראנסציטוזה?
העברת מאקרומולקולות ספציפיות על פני שטח של תא אפיתל פולרי באמצעות רצפטורים.
דוגמה- העברת נוגדנים מאם לתינוק באמצעות החלב שלה- במעי יש חומציות גבוהה ולפיכך אפיניות של הרצפטור בשטח המעי האפיקלי. הנוגדנים מהחלב יספגו באנדווציטוזה, יגיעו לאנדוזום ואחכ יתאחו לשטח המעי הבאזולטרלי. בבאזולטרלי החומציות נייטרלית ולכן הנוגדן ישתחרר מהרצפטור אל זרם הדם של התינוק.
בטרנסציטוזה המולקולות לאחר האנדוציטוזה מגיעות לאנדוזום, משם לאנדוזום הממחזר ואז לממברנה.
קצב שחרור המולקולות ממברנת האנדוזום הממחזר מווסת על ידי התא.
כך פועלים טרנספורטרים לגלוקוז בתאי שריר ושומן - מחכים לאות של אינסולין כדי לצאת אל הממברנה. דוגמה נוספת היא תאי הכליה, מווסתים אקוופורינים ווי טייפ אייטיפיאז לפי סיגנלים הורמונליים.
162
אילו תהליכים מתקיימים תוך שימוש במנגנון פאגוציטוזה?
א. בפרוטוזואה- פגוציטוזה היא דרך הזנה. מהפגוזומים החלקיקים שנבלעו עוברים לליזוזומים ומשם לציטוזול לשמש כמזון.
ב. 2 קב תאי דם לבנים ביונקים פועלים בפגוציטוזה- נויטרופילים ומאקרופאגים. הפ מגנים מפני מזיקים באמצעות בליעתם. בנוסף, מאקרופגים בולעים תאים שעברו אפופטוזיס.
163
residual bodies מה הם ?
פאגוזומים מתאחים עם ליזוזומים ותכנם מתפרק. חומרים שלא מתעכלים נשארים בליזוזום ויוצרים את הרזידואל באדיז שיופרשו מהתא באקסוציטוסה.
164
LAGIONELLA PNEUMOPHILA מה מנגנון ההגנה מפני מערכת החיסון של החידק?
החיידק גורם למחלת הלגיונריום. החיידק מזריק לתאי המארח אנזים שמשנה חלבוני ראב מסוימים וגורם להם להכווין לא נכון את תנועת הממברנה וכך נמנע האיחוי בין ליזוזום לפאגוזום וכך החיידק לא מעוכל.
165
כיצד פועל תהליך הפגוציטוזה?
זהו תהליך המופעל עי מטען. בכדי שיתחיל החלקיקים צריכים קודם כל להקשר לפגוציט מה שמפעיל קסקדת תהליכים שיובילו לפאגוציטוזה.
משפחת חלבוני רו ורו ג'פים שמאקטבים אותם גורמים לפלמור מקומי של אקטין- שמעצב את הפסאודופוד.
רו ג'יטיפיאזים מפעילים גם פעילות פעילות קינאז ויוצרים פי4,5פי2 בממברנה- מגביר את פלמור האקטין.ץ
כדי לסגור את הפאגוזום- אקטין עובר דה פולימריזציה פיאיי3 קינאז, שממיר פיפ2 לפיפ3 הנחוץ לסגירת הפאגוזום וגם עיצוב מחדש של אקטין בכדי להניע אינווגינציה של הפאגוזום שנוצר.
166
כיצד תאים וחלבונים שחיוניים לתא לא עוברים פאגוציטוזה?
יש עליהם סיגנל של אל תאכלט אותי בדמות חלבונים על פני התא שמקשרים לרצפטורים מעכבים במאקרופגים, שמגייסים טירוזין פוספטאזות שמגבילים את האיתות התאי שגורר פאגוציטוזה.
167
מה הם שלושת מסלולי ההפרשה האפשריים?
א. מסלול הפרשה קונסטיטוטיבי- קורה בכל התאים
ב. מסלול הפרשה מושרה- בתאים מתמחים כמו נוירונים. החלבונים יועברו לוסיקולות הפרשה שם מאוחסנים עד לסיגנל.
ג. קונסטיטוטיבי לא סלקטיבי- לא דורש אות מסוים- מסלול ברירת מחדל- החלבונים יגיעו מהטרנס גולג'י אל פני התא.
168
אילו תהליכים מצתרשים בעת יצירת הוסיקולה מהטרנס גולג'י?
א. יצירת אגרגטים והחזרת ממברנות
ב. ביקוע פרוטאליטי לשפעול התוכן המופרש
169
מה הוא החלבון השופע ביותר בוזיקולות ההפרשה?
וי סנייר סינפטוברבין- כ70 עותקים פר וסיקולה
170
כיצד מופעל תהליך תיקון ממברנות?
על ידי כניסה של סידן מה"חור" שנוצר
171
אלו שתי שיטות העברת ממברנות בתאים פולריים ישנן?
א. ישירה- העברת חלבונים לתחומי ממברנה מסויימים- נארזים לוזיקולות טרנספורט שונות.
ב. מסלול עקיף- החלבונים נשלחים באופן לא ספציפי ומי שלא במקום שלו מוחזר עי וסיקולות אנדוציטיות ואז יעבור לאזור הנכון על ידי אנדוזום מוקדם
172
כיצד מסווגים החלבונים של התאים הפולריים לאיזה צד עליהם להגיע?
האפיקליים- הממברנה האפיקלית עשירה מאוד בגליקוספינגוליפידים- חלבונים שמעוגנים בג'יפיאיי יקשרו לצד זה של הממברנה כי הם נקשרים לגליקוספינגוליפידים בליפיד ראפטס שנוצרים בטראנס גולג'י.
הבאזולטרליים- בעלי אותות בזנב הציטוזולי. כשהם בהקשר מבני מתאים חלבוני מעטפת יארזו אותם לוזיקולות שיגיעו לבאזולטרלי.
