ביותא א Flashcards

1
Q

כמה מולקולות ליפידיות ניתן למצוא בממברנת תא שלם?

A

עשר בחזקת 9

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מהן המולקולות הנפוצות ביותר על הממברנה?

A

פוספוליפידים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

מה מבדיל בין ממברנה אאוקריוטית לפרוקריוטית?

A

וריאביליות גבוהה יותר באאו, אצל חיידקים גן לא קיים כולסטרול
האאו מכילה בין 500 ל2000 ליפידים שונים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

מהו מבנה הפוספוליפידים ?

A

2 זנבות הידרופוביים
פוספט
ראש פולארי
הם המרכיב העיקרי בממברנה- מעל50 אחוז מהמרכיב השומני בה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

אילו סוגי פוספוליפידים יש?
אילו מהם בעלי מטען?

A

פוספוגליצרידים- פוספוליפידים מ2 חומצות שומן מחובר לקב’ פוספט מחוברים לשלד גליצול. לרוב תהיה חש אחת רוויה ואחת שלא.
ספינגוליפידים- מורכבים משלד ספינגוזין- צרמיד- מכיל NH
פוספטידיל סרין הוא היחיד שטעון חשמלית. שאר הפוספוליפידים הם מעין צוויטרון ולכן מגיעים לאיזון חשמלי.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מה הוא פוספטידיל?

A

גליצרול המחובר לשתי חש ופוספט

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

כיצד ישפיעו חש בלתי רוויות/ קצרות על הממברנה?

A

טמפ’ הקפאון שלה תרד- משמע יותר קשה להקפיא אותה. בנוסף הממברנה תהיה יותר דקה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

מה יחס הכולסטרול בממברנה?

A

1:1 עם המרכיבים הפוספוליפידיים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מה תפקידי הכולסטרול?

A

כולסטרול מקשיח את הממברנה
מגן על הממברנה גם מפני התמצקות וגם מפני התנזלות- בופריזציה- כיוון שמייצב אינט’ בין חו”ש- עושה הרבה קשרים הידרופוביים.
הורמונים סטרואידים
ויטמינים
מלחי מרה
- מפחית את פרמביליות הממברנה- מונע תזוזה של השרשרת הפחמנית מימנית של חומצות השומן.
- מוריד את נקודת הקיפאון של הממברנה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מה משמעות התכונה של הממברנה- אטימה עצמית?

A

כשיש חור בממברנה, נוצרת הפרעה תרמודינמית וסגירת החור הינו מועדף תרמודינמית. - נוצר מבנה דמוי ליפוזום ללא קצוות חופשיים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מה ההבדל בין מיצלה לליפוזום?

A

כאשר הדטרגנט בצורת חרוט- ראש פולארי וזנב יחיד- נקבל מיצלה.
כשהוא בצורת גליל- ראש פולרי ו2 זנבות- נקבל ליפוזום.
הממברנה שלנו נותנת ליפוזום.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

באילו דרכים עשו שימוש החוקרים בכדי ללמוד תנועת ליפידים?

A
  1. הצמדת ראש פלורסנטי/חלקיק זהב לראש הפולארי(לתנועת מולקולה בודדת)
  2. סימון ספין-
    הוספת NO לקבוצה ליפידת
    יש לו אלקטרון 1 לא קושר, לכן יש לו ספין לא מאוזן- את הסיגנל המגנטי הזה מזהים בטכניקת ESR
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

אילו סוגי תנועות קיימות לפוספוליפידים בממברנה?

A

באותו עלעל:
תנועה לטראלית- קורה 10 בשביעית פעמים בשניה, דיפוזיה פשוטה של הפוספוליפידים בעלעל שלהם.
רוטציה- סיבוב פשוט על הציר של הפוספוליפיד
פלקסיה- בזכות הקשרים היחידים בחש- פיסוק של הפוספוליפיד בגלל גמישות שר האסתרי עם הגליצרול.

על ידי אנזימי פוספוליפיד טרנסלוקייטורז:
1. סקראמבלז- תלויי סידן, ללא אייטיפי, פועלים דו כיוונית (על שני העלעלים)- משמע באופן ספונטני יותר- מאפשרים סביבה נוחה לתנועה הפוספוליפידים.
2. פליפאז- משתמשים באייטיפי ומעבירים מהעלעל החיצוני לפנימי
3. פלופאז- משתמשים באייטיפי ומעבירים מהעלעל הפנימי לחיצוני.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מדוע ליפוזומים סינתתים לא מתאחים אחד עם השני בסביבה מימית?

A

בגלל שהראש הפולרי קושר מולקולות מים שצריך להסיר לפני איחוי. זו הסיבה שאין התאחות אברונים בציטוזול.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מה זה PHASE TRANSITION?

A

מעבר מדו שכבה ממברנלית נוזלית לכזו דמויית קריסטל או ג’ל.
מושפע מאורך השרשראות והאם רוויות או לא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

כיצד משפיע כולסטרול על תכונות הממברנה?

A

מפחית את פרמביליות הממברנה למולקולות מסיסות במים. הטבעות הקשיחות שלו עושות אינט’ עם קב’ הפחמן מימן בפוספוליפידים ולכן הן נוטות פחות לזוז- מוביל לחדירות נמוכה יותר.
הוא לא גורם לירידה בפלואידיות על אף מיקסום הקשרים- הוא מונע את פירוק הממברנה מצד אחד בזכות הקשרים עם הפוספוליפידים ומצד שני מונע קריסטליזציה כי הזנבות לא יכולים ליצור מקסימום קשרים אחד עם השני והשרשראות פחמן מימן לא יתהדקו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

כיצד ישפיעו קשרים כפולים בציס על הממברנה?

A

יהיה יותר קשה להקפיא את הממברנה כי הקשרים לא ימוקסמו בין פוספוליפיד אחד לשני
ממברנה של חש בלתי רוויות תהיה דקה יותר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

מהי תופעת הPHASE SEGRAGATION?

A

הנטיה של חלק מהליפידים ליצור תתי מדורי ליפידים מסוג מסוים בממברנה. נוצרים דומיינים שונים של ליפידיים בחד שכבה. קורה בעיקר בממברנות מלאכותיות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

מה הם LIPID RAFTS?

A

תופעה דומה לפייז סגרגיישן שקורית אין ויבו.
אזורים פונקציונליים בממברנה של חלבונים וליפידים. יכולים לנוע לטראלית על הממברנה כיח’ עצמאית.
אזורים אלו עשירים בגליקופרוטאינים, גליקוליפידים, חלבוני GPI, כולסטרול
אזורי רפסודה מגדילים את עובי הממברנה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

מהו מקור הממברנה של טיפת השומן?

A

ER

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

ממה מורכבות טיפות השומן?

A

ממברנה שמקורה בER
הממברנה מורכבת מפוספוליפידים ועשיק בטריגליצרידים וכולסטריל אסתר שמסונתזים עי אנזימים שיושבים על ממברנת האי אר

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

מה ההבדלים במרכיבי העלעלים של הממברנה?

A

העלעל החיצוני- עשיר בקב כולין, למשל:
ספינגומיאלין- בעל ראש כולין- נמצא על ממברנה העוטפת אקסונים.
פוספטידיל-כולין: קיים אנזים שמשנע אותו בין ממברנות- פוספטידיל כולין טרנספר פרוטאין (פיסיטיפי) וישנם אנזימים שמוציאים ממנו חש ומצמדים לכולסטרול ליצירת כולסטריל אסתר- LCAT
בנוסף, ימצאו בעלעל זה שיירי סוכרים, וקשרי אסאס
העלעל הפנימי:
עשיר בקב אמינו טרמינליות:
פוספטידיל סרין- נוטה להמצא בעלעל הפנימי, במצב של אפופטוזיס יעבור לעלעל החיצוני- יעזור לזיהוי התא והתא יעבור פגוציטוזה עי הפסקת פליפאז וכך סקרמבלאז ישווה ריכוזים בין העלעל הפנימי לחיצוני.
האנזים PKC
נקשר למטען השלילי של פוספטידיל סרין
פוספטידיל אתנול אמין
פוספטידיל אינוזיטול- משמעותי להולכת אותות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

היכן נמצא גליקוליפידים ומדוע?

A

על העלעל החיצוני, כיוון שהוספת קב הסוכר נעשית בחלל הגולגי שתואם לחוץ התא
נוטות ליצור ליפיד ראפטס בגלל קשרי המימן שיוצרות קב הסוכר זו עם זו והואןדרואלס שיוצרים הזנבות ההידרופוביים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

כמה אחוזים מהווים הגליקוליפידים מהליפידים בממברנה?

A

5

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

מהו מבנה הגליקוליפידים?

A

שרשרת שומנית, זנב של חש, שלד של ספינגוזין ושייר סוכרי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

מהם גנגליוזידים?

A

גליקוליפידים בעלי שייר סוכרי אוליגוסכרידי. בעלי קבוצה אחת או יותר של חומצה סיאלית, שהנפוצה ביותר היא NANA
נפוצים מאוד בתאי עצב

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

מה תפקידי הגליקוליפידים?

A

בתאי האפיתל של המעי בצד האפיקלי- מגנים מפני חומציות נמוכה ומפני אנזימים פרוטאליטים.
המטענים השליליים בעלי תפקיד במשיכת יונים חיוביים אל פני התא (בעיקר סידן)
בנוסף, בעלי תפקיד באינטרקציה וזיהוי בין תאים על ידי מתווכים חלבוניים ממשפחת הלקטינים שקושרים סוכרים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

מהי מחלת טאיי זקס?

A

חוסר באנזים המפרק גנגליוזיד GM2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

מהי מחלת גושה?

A

חוסר באנזים גלוקוצרברוזידאז שמפרק את הספינגוליפיד גליקוזיל-צרמיד שקיים במע העצבים המרכזית ובתאי דם אדומים.- משפיעה גם על הטחול וגם על המוח

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

מה המנגנון של מחלת הכולרה?

A

היקשרות לגנגליוזיד GM1
כך הטוקסין יקשר לתאים הללו ויכנס אליהם, יגרום לייצור מוגבר של AMP
כך יפתחו תעלור כלור שיצא בכמות גדולה מהתאים ויופרשו כך החוצה גם נתרן ביקרבורנט ומים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

אילו סוגי חלבונים ממברנליים ישנם?

A

אינטגרליים- חוצי ממברנה, בעלי אופי אמפיפילי. מתורגמים אל תוך ה אי אר
פריפריאליים- חלבונים שמחוברים לממברנה באינטרקציות חלבון חלבון
מצומדים- עברו ליפידיזציה ע י ליפיד שמשאיר אותם צמודים לממברנה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

באילו סוגי קשרים חלבונים יכולים להיות מעוגנים לח”ש בממברנה?

A

חומצה מיריסטית בעלת 14 פחמ’- נקשרת לגליצין בקצה האמיני ומקושרת אליו בקשר אמידי.
חומצה פלמיטית 16 פחמ’- נקשרת לקב’ תיול של ציסטאין בחלבון שסונתז בציטוזול בקשר תיואסתרי
קבוצה פרנילית- נקשרת לתיול של ציסטאין בחלבון שסונתז בציטוזול בקשר תיו אתרי.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

כיצד חלבוני SRC מעוגנים לממברנה?

A

עי קבוצת מריסטיול (גליצין וקשר אמידי). בשביל להיות יציבים יותר חלבונים אלו פעמים רבות מתעגנים גם עי שייר ציסטאין- מתבצע עי סיגנל חוץ תאי- ללא סיגנל החומצה הפלמיטית מוסרת ואין קשר דרך הציסטאין.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

כיצד חלבוני SRC מעוגנים לממברנה?

A

עי קבוצת מריסטיול (גליצין וקשר אמידי). בשביל להיות יציבים יותר חלבונים אלו פעמים רבות מתעגנים גם עי שייר ציסטאין- מתבצע עי סיגנל חוץ תאי- ללא סיגנל החומצה הפלמיטית מוסרת ואין קשר דרך הציסטאין.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

כיצד חלבוני RAS מעוגנים לממברנה?

A

עי קומבינציה של קב פרניל וחומצה פלמיטית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

כיצד מתעגנים חלבוני RAB לממברנה?

A

מצויים לחלוטין בציטוזול, כתוצאה מסיגנל חוץ/תוך תאי עוברים שחלוף GDP לGTP
ונחשף אזור הידרופובי הליקלי או אזור המקושר לליפיד.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

מדוע ניתן למצוא אלפא הליקס בשכיחות גבוהה באזורים חוצי ממברנה?

A

מכיוון שאלפא הליקס רווי שיירים הידרופוביים. נוסף על כך, בגלל מיקסום קשרי המימן בהליקס, קשרים פפטידים פולריים ממקסמים קשרים וכעת נמצאים באופן חסר מטען.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

האם ניתן למצוא סדין בטא באתרים חוצי ממברנה?

A

כן. ניתן למצוא סדין בטא בתצורה של חבית בטא- מעין סדין בטא מגולגל כ10 חא בכל סגמנט חוצה ממברנה. כל ח”א שניה היא הידרופובית.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

מהו המדד ההידרופאתי?

A

מתאר את הנטייה ההידרופובית של חא בודדת. מעל האפס- הידרופובי, מתחת לאפס- הידרופילי. מתאים לתיאור אלפא הליקס ולא חביות בטא.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

מהי התכונה הייחודית של חלבוני מולטיפאס?
לאילו תפקודי חלבונים ממברנליים היא חשובה?

A

חלבונים חוצי ממברנה מס’ פעמים המורכבים ממס’ אלפא הליקסים נוטים לעשות אינטרקציות אחד עם השני ולכן לא ממקסמים קשרי מימן. בזכות העובדה הזו האזורים הפנימיים של ההליקס יכולים להיות הידרופיליים
הם חיוניים תפקוד תקין של תעלות מים ויונים, להעברת מולקולות מצד אחד לשני של הממברנה, ולהוליך סיגנלים חוץ תאיים אל תוך התא.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

היכן חביות בטא נפוצות?

A

בממברנה חיצונית של חיידקים, מיטוכונדריה וכלורופלסט.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

מה הם פורינים?

A

המבנה הנפוץ ביותר של חביות בטא- לרוב 16 גדילי בטא אנטי פרללי שמתכלכל לחבית.
פנים החבית הידרופילי והחוץ הידרופובי
לולאות מסוימות שלר חוצות ממברנה יכולות לפלוש לחבית ולהוות מחסום- מה שעושה את החביות ספציפיות.
דוגמאות לחביות בטאL
FEP A
מעבירה יוני ברזל בחיידק
MALTAPORIN
פורין סלקטיבי מאוד באי קולי שמעביר מלטוז בלבד

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

למה משמשות חביות בטא?

A

רובן משמשות לטרנספורט.
בנוסף, ישנן חביות קטנות יותר שמלאות בשיירי חא. לרוב ישמשו כרצפטורים או אנזימים ממברנליים. החבית בעצם שומרת על החלבון באוריינטציה נכונה לתפקידו בממברנה
בניגוד לאלפא הליקס מבני חביות הבטא קשיחים ולא משנים מבנה בגלל קשרי המימן.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

מדוע נראה פחות קשרים דיסולפידיים בצד הציטוזולי?

A

כיוון שהציטוזול הוא סביבה מחזרת. לפיכך קשרים אלו אופייניים לחוץ התא.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

כיצד ניתן לצבוע את מעטפת התא מכוסת הסוכרים?

A

RUTHENIUM RED

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

absorbed molecules מה הם?
מה תפקידם?

A

גליקופרוטאינים ופרוטאוגליקנים שמופרשים לחלוטין מהתא ושייכים למטריקס החוץ תאי. מהווים חציצה נוספת בין הממברנה למטריקס החוץ תאי.
תפקידם:
הגנה מפני סטרס מכני על התא
בגלל שהם בעלי וריאביליות גבוהה- מאפשרים ספציפיות לתא
בעזרת אינט’ עם לקטינים שיש אליהם אפיניות גבוהה באיזור, הסוכרים יכולים לאפשר תנועה או הדבקה של תאים- כמו בתגובה חיסונית.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

מה זה הגליקוקליקס?

A

אזור בממברנה עשיר בסוכרים- גליקופרוטאינים/פרוטאוגליקנים. בעל אפיניות מאוד גבוהה ללקטינים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

מה הם דטרגנטים? כיצד הם פועלים?

A

חומרים שהורסים אינט’ הידרופוביות בין החלבונים לממברנה. הם מולקולות אמפיפטיות קטנות, שבריכוזים נמוכים מסתובבים כמונומרים בתמיסה והחל מריכוז מסוים מתארגנים למבנה של מיצלה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

מה הוא CMC

A

הריכוז שהחל ממנו דטרגנטים מתחילים להתארגן למיצלות.
תכונה אינטרינזית של כל מונומר, שמושפעת גם מתנאי הסביבה- טמפ, PH, ריכוז מלחים
מעל ריכוז הCMC
מונומרים נעים בדיפוזיה פנימה והחוצה מהמיצלות וכך שומרים על ריכוז מונומרים קבוע בתממיסה ללא קשר למיצלות הקיימות בה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

מה החיסרון בדטרגנטים יוניים חזקים כמו SDS?

A

הורסים את המבנה המרחבי של החלבון מאחר והם נוטים להקשר לליבה ההידרופובית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

מה היתרון של דטרגנטים לא יוניים?

A

שומרים על המבנה הנטיבי של החלבון ולכן גם על תפקודו בזמן ההפרדה.
נוח כדי לחקור תפקודי חלבונים ממברנליים ולהטעין על ננו דיסק/ליפוזומים

52
Q

מה החיסרון של דטרגנט לא יוני?

A

ריכוז הסיאםסי הרבה יותר גבוה כי הוא יותר חלש מהיוני
בנוסף, הדטרגנט מאוד תלוי בריכוזים- אם פתאום נמהול את התמיסה במים החלבונים יעזבו והמיצלות יעזבו

53
Q

מה הם ננו-דיסקים?

A

מדמה חתיכה של ממברנה- דו שכבה של פוספוליפידים שביניהם ישנם חלבונים, מעין מקבץ שמוקף בחלבון HDL שמטרתו להוות “חגורה” ןלשמור את הפוספוליפידים כדו שכבה
הם מאפשרים למידה על תפקודי חלבון בממברנות באופן פשוט יותר.
השיטה שמשמשת לפענח חלבונים על הננו דיסק היא סינגל אלקטרון פרטיקל

54
Q

נגזרת של איזה ויטמין חלבון רטינאל?

A

A ויטמין

55
Q

כיצד פועל חלבון הבקטריודופסין?

A

חלבון הקולט אור ושואב פרוטונים בארכאה.
מורכב מ7 אלפא הליקסים חוצי ממברנה שעושים אינטרקציות הידרו’ ביניהם. במרכזם ישנה מולקולת הרטינל (קיימת גם בעין של חולייתנים) שקשורה קוולנטית לליזין בחלבון. בבליעת אור משתנה המבנה של רטינל- הוא קולט פרוטון שיעביר לאחר מכן לחא אספרטט ומשם הלאה לשיירי חא הידרופיליוץ , שגורר שינוי במבנה החלבון כולו ושאיבת פרוטונים- הוא יוצר גרדיאנט- שישמש בהמשך ליצירת אייטיפי. עי חלבון אחר

56
Q

מה כיווניות פמפום הפרוטונים בבקטריודופסין?

A

מפנים התא אל חוץ התא

57
Q

מה זה כרומופור?

A

מולקולה קולטת אור. לדוג’- רטינל

58
Q

מה גילו בזכות פענוח מבנה הבקטריודופסין?

A

שבחלבונים ממברנליים לפעמים יש אינט’ עם הליפידים שסביבם שתפקידם ליצבם בממברנה.

59
Q

לאיזו משפחה של חלבונים חוצי ממברנה משתייך הבקטריודופסין?

A

7 TRANS MEMBRANE.
בנוסף, הוא רחוק משפחה אבולוציוני של GPCR.

60
Q

מה הן הCHANNELRHODOPSIN

A

תחת אותו ענף אבולוציוני של הבקטריודופסין, חלבון של אצות ירוקות, בחשיפה לאור הופעות לתעלות יוניות.

61
Q

בשביל מה משתמשים בשיטת פוטובליצ’ינג?

A

מדידת קצב דיפוזיה לטרלית של חלבונים ממברנליים- למדוד מדדית קינטיים של החלבון- קבוע הדיפוזיה, קצב העברה אקטיבית של החלבון וקצב ההתנתקות וההתחברות של חלבון מסוים מחלבונים אחרים.
ככל שקבוע הדיפוזיה של החלבון יותר גדול, ההתאוששות מהירה יותר.

62
Q

מה היא שיטת
SINGLE PARTICLE TRACKING?

A

מעקב אחרי חלבון בודד בעזרת סימון נוגדן בפלורופור או חלקיק זהב

63
Q

מה משותף לממברנה של תא זרע ושל נוירון?

A

שעל אף שמדובר בממברנה רציפה, היא בעלת 3 דומיינים מובחנים מבחנת חלבונים- בזכות מעין “גדר מולקולרית”

64
Q

אלו טכניקות קיימות למניעת תנועת חלבונים בין מדורי הממברנה?

A

א. יצירת אגרגטים/קומפלקסים חלבוניים גדולים (כמו בקטריודופסין)
ב. אינט’ עם חלבונים או מקרומולקולות חוץ תאיות (כמו פרוטאוגליקנים)
ג. אינט’ עם חלבונים/ מקרומולקולות תוך תאיות (כמו שלד התא)
ד. אינט’ עם חלבונים המצויים על פני השטח של תא אחר

65
Q

כיצד צורתן של כדוריות הדם האדומות מושפעת מחלבוני שלד התא?

A

כתוצאה מנוכחות של חלבון ספקטרין, סיב דק, גמיש וארוך בצורת מתג.
הספקטרין יוצר אינט’ עם חלבונים ממברנלים של הכדורית האדומה ויוצר רשת המכסה את הצד הציטוזולי של הממברנה.
תכונה זו מאפשרת לכדוריות הדם להמתח ולהתעוות תוך מעבר בקפילרות.

66
Q

איזו מחלה תקיים כשספקטרין מוטנטי (גם חלבונים שקשורים בצמתים)?

A

מחלת HS-
ספרוציטוזיס תורשתי
כדוריות הדם יהיו בצורה ספרית/כדורית ויהיו שבריריות.
יכולות להתפוצץ משינויים אוסמוטיים

67
Q

מהו מבנה הספקטרין?

A

הטרודימר של שתי שרשראות- אלפא ובטא, כל אחת מהן מורכבת מחזרות רבות של אותן ח”א, הן מתגלגלות להליקס ואז עושות הטרודימר אנטימקבילי זו עם זו באינט’ של קצה לקצה. הן יוצרות קשר בלתי קוולנטי אך חזק שנובע מנקודות השקה רבות ביניהן.
ההטרודימר מתחבר משני קצותיו לג’נקשיינל קומפלקס- ובזכות הטרודימרים רבים שמתחברים לג’נקשיינל לאורך התא נוצרת רשת.

68
Q

JUNCTIONAL COMPLEX ממה מורכב ה?

A

שרשראות אקטין קצרות בנות 13 מונומרים
החלבונים- ADDUCIN, TROPOMYOSIN, BAND 4.1
החלבונים הטראנס ממברנליים BAND 3 וגליקופורין
החלבון אנקרין שמקשר בין הספקטרין לבנד 3

69
Q

מה הם corals?

A

דומיינים ממברנליים שנוצרים בגלל עיגון סיבי שלד התא על הממברנה. יכולים להיות קבועים/זמניים. דיפוזיית החלבונים מוגבלת מאזורים אלו בגלל מחסום פיזי.
שינויים קטנים, לדוג בטמפ, יכולים לגרום לתזוזת המחסומים ובריחת חלבונים מהדומיין.

70
Q

BENDING PROTEINS מה הם?

A

חלבונים שביכולתם לגרום לדה פורמציה של הממברנה.
חלבונים אלו יכולים להקשר באמצ א. אזורים הידרופוביים של החלבונים עצמם שיחדרו לחד שכבה
ב. חלבון שקושר את הראשים הפולריים של הפוספוליפידים
ג. החלבון נקשר לצבר של ראשים פולריים
גודל הראשים הפולריים והקב’ יכולים להשפיע על קצב וכיוון הדפורמציה. למשל- פוספואינוזיטידים

71
Q

כמה סטרנדים יהיו לפורינים בממברנה?

A

16

72
Q

כמה אחוזים מנפח התא תופס הגרעין?

A

10 אחוזים

73
Q

היכן ימצאו לרוב אזורי היוכרומטין?

A

סמוך לממברנת הגרעין

74
Q

מה הם תפקידי הלמינה הגרעינית?

A

א. תמיכה מכאנית עי אינטרקציה עם חלבונים ממברנליים של הגרעין.
ב. אינט’ עם חלבונים טראנסממברנליים על מעטפת הגרעין
ג.אינט’ ישירה עם NPC
ד. אינט’ ישירה עם הכרומטין שיוצר אינט עם חלבונים טראנסממברנליים של הגרעין- קשר בין הממברנה של הגרעין לדנא.
ה. אינט’ עם חלבוני שלד התא ציטוםלזמתיים
ו.בזמן המיטוזה, לצורך פירוק הגרעין, חלבוני סידיקיי יזרחנו את הלמינה הגרעינית וחלבונים נוספים. חלבוני הלמינה הגרעינית שזורחנו יחזרו לאחר מכן להיות לא מזורחנים ב2 הגרעינים החדשים.

75
Q

כמה חלבונים מרכיבים את הפורות בגרעין?

A

30 חלבונים שוני שנקראים נוקלאופורינס

76
Q

אילו חלבונים קשורים אבולוציונית לחלבוני הנוקלאר פור?

A

חלבוני מעטפת של וזיקולות
ככהנ שני סוגי החלבונים צאצאים של אותו אב קדמון- ממבריין בנדינג פרוטאין

77
Q

NPC מה הכמות בתא של

A

בין 3000 ל4000
אך זה משתנה, למשל בתאי פורקינייה יש כ20 אלף

78
Q

מה קצב הולכת המולקולות בNPC?

A

אלף מולקולות בשניה לשני הכיוונים

79
Q

אילו מולקולות עוברות דרך הNPC?

A

מולקולות קטנות מ5000 ק”ד ומסיסות יכולותלעבור בחופשיות
גדולות מ5000- עוברות באיטיות
חלבונים מעל 60 אלף קד עוברים רק אקטיבית- זקוקים לרצפטור שיזהה עליהם סיגנל יעודי

80
Q

אילו ח”א חוזרות בחלבונים הפונים אל תוך החור המרכזי של הנוקלאר פור קומפלקס?
מה תפקידן?

A

חזרות של פנילאלנין גליצין- יוצרים מבנה דמוי ג’ל שמגביל את הפרמביליות לחלבונים גדולים.
בנוסף הן מהוות אתר קישור לחלבוני אימפורטין/אקספורטין

81
Q

אלו ח”א חוזרות ברצף הNLS?

A

ליזין וארגינין- והן חלק מרצף החלבון המקורי
חא חיוביות

82
Q

מה היתרון בקומפלקס NLS אל מול טרנספורטר חלבוני?

A

הנלס מאפשר העברה של קומפלקסים שלמים ומוכנים אל תוך/ מחוץ לגרעין.

83
Q

איך נקראים הגנים שמקודדים למשפחת החלבונים האימפורטינים/אקספורטינים לגרעין?

A

KARIOPHERINS
קריו- גרעין

84
Q

מהו מנגנון הפעולה של האימפורטינים והאקספורטינים?

A

הם נקשרים מצד אחד לNLS
מצד שני לחזרות הפנילאלנין גליצין שנמצאות בפורות
בזמן המעבר דרך רצפי הפג, הסבך נפתח ומאפשר לחלבון לעבור דרכו. לאחר שנכנס כל הקומפלקס לגרעין, בעזרת מערכת הראן הרצפטור מתנתק מהחלבון.

85
Q

מדוע נמצא בציטוזול ראן ג’ידיפי ובגרעין ראן ג’יטיפי?

A

כיוון שהGAP שלו נמצא בציטוזול- משמע מסיר פוספט
והג’ף שלו נמצא בגרעין מחובר לכרומטידות.

86
Q

כיצד ראן ג’ידיפי מצליח להכנס לגרעין?

A

בזכות אימפורטין מיוחד

87
Q

כיצד פועל מנגנון האימפורטין ?

A

האימפורטינים נקשרים לצד הציטוזולי של הNPC
ומפלסים דרכם דרך סבך הפג.
בכניסת האימפורטין לציטוזול, הוא קושר ראן ג’יטיפי. אם האימפורטין נכנס עם מטען, האינטרקציה עם ראן ג’יטיפי תגרום לו לשחרר אותו.
לאחר שחרור המטען האימפורטין שקשור לראן ג’יטיפי יצא לציטוזול שם ישוחלף על ידי הגאפ להיות ראן ג’ידיפי. ראן ג’ידיפי יחזור לגרעין על ידי אימפורטין משלו שם יעבור על ידי הג’ף שחלוף.

88
Q

כיצד פועל מנגנון האקספורטין?

A

רק כשהאקספורטין יקשור ראן ג’יטיפי בגרעין, הוא יוכל לקשור אליו מטען, ולצאת. בציטוזול תהיה הידרוליזה בעזרת גאפ והמטען ישוחרר.

89
Q

כיצד יוצאות מולקולות רנא מהגרעין?

A

טירנא, מירנא, סירנא- יוצאים עי מערכת האקספורט הרגילה.
מולקולות מרנא- מנגנון שונה:
מולקולות המרנא מתארגנות למגה קומפלקס יחד עם חלבונים גרעיניים ( עד 100 מליון דלטון*
הקומפלקס הענק עובר עיגון לNPC
לאחר העיגון, הקומפלקס מתחיל לעבור רימודלינג
החלבונים הגרעיניים מהקומפלקס יחזרו לגרעין עי מערכת הראן.

90
Q

מה הם השאטלינג פרוטאינז?

A

NLS NES חלבונים המכילים את שני הסיגנלים
שליטה בקצב האימפורט/אקספורט יקבע היכן הם יהיו בתא.
סוגי שאטלינג פרוטאינז:
א. חלבונים שנעים כל הזמן בין הגרעין לציטוזול
ב. חלבונים שנכנסים על ידי מנגנון בקרה לפי התזמון שנוח לתא
ג. הפעלת הטרנספורט פנימה/החוצה לפי זרחון/דה זרחון בסמוך לסיגנל הכניסה/ יציאה.
ד. חלבונים ש”תקועים” בגרעין על ידי אינט’ עם חלבונים מעכבים שעושים אינט’ עם חלבונים גרעיניים ומשאירים אותם בציטוזול. בעת הגעת סיכנל ספצ’ החבון המעכב יתנתק מהחלבון הגרעיני שיוכל להכנס לגרעין..

91
Q

כיצד פועל מנגנון ההפעלה של תאי T?

A

כשתא טי פוגש את האנטיגן שלו לראשונה, הוא עובר אקטיבציה שמלווה בעליה בריכוז הסידן. הסידן מפעיל את חלבון קלצינורין, שהוא פוספטז מרכזי בתא.
לתאי טי יש פקטור אקטיבציה חשוב שנקרא NFAT.
לפקטור יש תפקיד חשוב בשעתוק להפעלת תאי הטי.
במצב לא פעיל, הוא נמצא בציטוזול עם סיגנל יציאה מהגרעין וכשהוא מזורחן. לאחר הפעלת הקלצינורין, הוא עושה לו פוספורילציה שגורמת לשינוי המבנה המרחבי וחשיפת הסיגנל כניסה לגרעין וחסימת סיגנל היציאה מהגרעין עי קלצינורין פיזית
כשרמות הסידן יורדות שוב בתא במנוחה, הקלצינורין עוזב את הNFATונחשף סיגנל היציאה מהתא, תוך כדי זרחון של הנפט בחזרה.

92
Q

כיצד פועל מנגנון הבקרה על ביוסינתזה של כולסטרול?

A

SREBP יש חלבון המשמש כסנסור לרמת הכולסטרול
חלבון זה מתורגם מלכתחילה לתוך ממברנת הER.
בריכוזי כולסטרול גבוהים הוא נשאר מקובע באיאר עם כולסטרול עליו. כשריכוזי הכולסטרול נמוכים הכולסטרול מתנתק ממנו, ואז הוא נארז לוסיקולה ונשלח לגולגי. שם יש 2 פרוטאזות שחותכות אותו ממברנת הגולגי, וחתיכה ממנו נעה לגרעין וגורמת לשעתוק גנים שמעודדים יצור כולסטרול.

93
Q

כיצד פועל הכלרופלסט?

A

ראשית, בכלורופלסט יש ממברנה פנימית נוספת שבערך מקבילה לאינווגינציות במיטוכונדריה שהיא הממברנה התילקואידית- עליה יושבות מערכות האור 1 ו2.
במערכת אור 2 ישנו חלבון שמפצל מים. אור שנקלט עי פיגמנטים מעורר את האלקטרונים, שקופצים על גבי קומפלקסים שיוצרים גרדיאנט אלקטרוכימי.
פוטו סיסטם 2 שובר את המים ומשחרר אלקטרונים ופוטוסיסטם 1 מוסיף, עוד אנרגיה להקפצת האלקטרונים בהמשך הדרך
סיום השרשרת הוא בNADP שהופך לNADPH
כתוצאה מכך נוצרים ATP וNAFPH
הם מנוצלים אחכ לקיבוע פדח שהופך לפחממות בתוך הכלורופלסט במעגל קלווין
גם בכלורופלסט הגרדיאנט מנוצל באיטיפי סינתתאז
במיטוכונדריה האייטיפי מיוצר במטריקס ובכלורופלסט- בסטרומה.

94
Q

כמה אחוזים מהציטופלזמה מהווה המיטוכונדריה?

A

20 אחוזים

95
Q

מה יחס החלבון/ליפידים על ממברנת הקריסטה?

A

חלבונים- 75 ליפידים 25
היחס הגבוה ביותר לטובת חלבון שאפשר למצוא על ממברנות

96
Q

היכן נוטות להמצא מיטוכונדריות בתא?

A

באזורים בהם יש תצרוכת אנרגטית גבוהה.
ברגיל, המיטו’ נעה על שלד התא. במצבים בהם נרצה לקבע אותה היא תעשה אינט’ עם חלבונים אחרי- חלבוני שלד התא.

97
Q

מה קורה בנקודות המגע של מיטוכונדריה עם חלבונים תאיים אחרים?

A

החלפת ליפידים
בנוסף ביונקים בנקודות אלו תתבצע גם ההנצה.

98
Q

כיצד מבצעים פרקציונציה על המיטוכונדריה?

A

מכניסים לתמיסה עם אוסמולריות נמוכה, שטף המים גורמת למיטוכונדריון להתנפח ולממברנה להתפוצץ,
מה שמשחרר את תכולת הטווח הבין ממברנלי ומשאיר את הממברנה הפנימית ללא פגע.
מכניסים לצנטריפוגה להפרדת התוכן של הטווח הבין ממברנלי לממברנה הפנימית הסגורה.
נעביר למדיום בעל אוסמולריות גבוהה שיגרום לכיווץ. נהרוס ונכניס לצנטריפוגה שתפריד בין הממברנה לתוכן המטריקס

99
Q

מה הם תפקידי המיטוכונדריה?

A

א. שרשרת מעבר
ב. מאזן את מצב הרידוקס בתא
ג. מעגל קרבס משמש ליצירת אבני בניין למאקרומולקולות וחא. ביחד עם נאדפה בציטוזול הם יוכלו ליצור מאקרומולקולות. למשל כשציארטא מצטברת היא יוצאת לציטוזול ומשמשת לבניית חא וחש
ד. חלק ממעגל האוראה מתקיים במיטוכונדריה של תאי כבד
ה. יצירת חום
ו. ביוסינתזה של קב HEME נעשית באופן חלקי במיטוכונדריה
ז.יצירה של צברי ברזל גופרית- חיוני לשרשרת המעבר וליציבות הגנום.
ח. ביוסינתזה של פוספוליפידים מסויימים, בעיקר קרדיוליפין- שנוצר בממברנה הפנימית של המיטו’ בלבד, ושם בעיקר מצוי. בין תפקידיו הוא יצירת הרספירזום. גם פוספטידיל אתנול-אמין, פוספטידיל גליצרול וחומצה פוספטידית מסונתזים במיטו’
ט. בופרינג של סידן, מסייעת לאיאר בשמירה על מאגרי סידן בתא.
י. הורמונים סטרואידים ברקמות סטריאוגניות. בכבד- יצירת סטרולים ועיבוד לכולסטרול.
יא. אפופטוזיס

100
Q

מהם הגנים המיטוכונדריאלים המשותפים לכלל האורגניזמים היוקריוטים?

A

rns, rni-מקודדים לקנר קיבוזומלי.
COX3 COX1- מקודדים לגנים של ציטוכרום אוקסידרז= שזה קומפלקס 4 וציטוכורום בי

101
Q

במה יוצא דופן חלבון ציטוכרום סי מיתר החלבונים המסונתזים במיטוכונדריה?

A

שהוא יוצא מהקריסה ספייס דרך הממברנה החיצונית אל הציטוזול. יתר החלבונים המסונתזים במיטוכונדריה נשארים בה.

102
Q

כמה אחוזים מהדנא היונקי מהווה הדנא המיטוכונדריאלי?

A

פחות מאחוז
אך ישנם יוצאי דופן

103
Q

באילו תאים יש דנא מיטוכונדריאלי/כלורופלסט גבוה?

A

תאי העלים של צמח גבוה- משמשים כקולטני שמש
תאי ביצה של דו חיים- מאפשר מטבוליזם אקסטנסיבי
למשל בתאי ביצית של קרפדה- הדנא המיטו’ מהווה 99 אחוזים מכלל הדנא

104
Q

כיצד פועל מנגנון ההנצה?

A

עושה שימוש בדינאמין שמסתובב בציטוזול כדימר. בעת שהדינמין קושר ג’יטיפי, הוא מתארגן למבנה אוליגומרי על הממברנה החיצונית של המיטו’- תוך שימוש באדפטורים. הידרוליזת ג’יטיפי גורמת לביקוע הממברנה כתוצאה מקונסטריקציה (כיווץ) של הטובולי המיטוכונ’ הממברנה החיצונית והפנימית מבוקעות בבת אחת.

105
Q

כיצד פועל מנגנון האיחוי?

A

קודם הממברנה החיצונית ואז הפנימית:
החיצונית: סט חלבונים שיוצרים אוליגומרים הממברנה החיצונית של 2 מיטו’ מקשר ביניהן, והאיחוי יקרה בזכות הידרוליזת ג’יטיפי ומפל פרוטונים בממברנה הפנימית של כל אחת מהמיטוכונדריות- בזכות שרשרת מעבר האלקט’.
הפנימית: סט של חלבונים ממשפ’ הדינמין יוצרים אוליגומרים על הממברנה הפנימית של שני הצדדים שאורים לעבור איחוי- על ידי תת יחד’ המעוגנות על הממברנה. בשביל האיחוי צריך ג’יטיפי וגרדיאנט פרוטונים.

106
Q

מדוע השוואת רצפי גנום מיטוכונדריאלים יכולים לסייע בתארוכים אבולוציונים?

A

כיוון שאחוז המוטציות המיטו’ גדול פי 100 מזה שמתקיים בגרעין בגלל אחזקת גנום פשוטה יותר ומנגנוני הגהה ירודים.

107
Q

אילו גנים מכיל הגנום המיטוכונדריאלי?

A

ל13 חלבונים שקשורים בשרשרת מעבר האלקטרונים/סינתזת דנא
ררנא
טיארנא
ציטוכרום בי
כלל הגנום פחות מ17 אלף בסיסים
הגנום המיטו’ לא מאוד וריאבילי בין מינים שונים רחוקים אבולוציונית

108
Q

מה מייחד את הגנום המיטוכונדריאלי?

A

א.אינו מכיל כמעט אלמנטים שאינם מקודדים
ב.המיטוכונדריה מקודדת רק ל22 טיארנאיי שונים- מעט מאוד ביחס לחיידקים ובני אדם. מתאפשר הודות לגמישות בעמדת וובל.
ג. קוד גנטי וריאבילי- הקוד המיטו’ שונה מזה האוני’. ל4 קודונים מתוך 64 יש משמעו אחרת במיטו’. מיטוכונדריה של אורגניזמים שונים נותנים משמעות שונה לאותם 4 קודונים.
הקודונים השונים:
UGA- קודון סטופ בדרכ, במיטו’ יתורגם לטריפטופן- חוץ מבצמחים שיתורגם לסטופ.
AUA מקודד לאיזולאוצין- גם בצמחים, במיטוכונדריה יקודד ל מתיונין
CUA גם במיטו של כלל האורגניזמים מקודד ללאוצין חוץ מבשמרים שמקודד לתראונין
AGA\AGG- מתורגם לארגינין. במיטו’ של יונקים יתורגם לסטופ. בשמרים וצמחים גם לארגינין

109
Q

כיצד מורשת המיטו’ לדורות הבאים?

A

מקור המיטו’ בתאים יוקריוטים בוגרים הוא בביצית של האם- הורשה אמהית.
הציטופלזמה של הביצית מכילה 100 אלף עותקים של מיטו’ אל מול עותקים בודדים בתאי הזרע
בזמן הבשלת תאי הזרע ישנו תהליך אקטיבי של עיכול מיטוכונדריאלי
בתאי הזרע מיטוכונדריה עוברת מיטופגיה- שזה מעין עיכול שלה על ידי יוביקוויטילציה.

יוצאי דופן הם שמרי האפיה- הורשת המיטוכונדריה היא בי- פרנטלית. לאחר מס’ חלוקות רק צורה גנטית אחת שהורשה תשתמר. נקרא הורשה ציטופלזמטית.

110
Q

אילו אברים הכי רגישים למיטוכונדריה דפוקה גנטית?

A

תאי עצב ותאי שריר שדורשים הכי הרבה אייטיפי.

111
Q

מדוע הפנוטיפים של מחלות מיטוכונדריאליות הוא וריאבילי מאוד?

A

הורשת המיטוכונדריות הפגומות תלויה במיטוטיק סגרגיישן שהוא רנדומלי לחלוטין- יכולות לעבור חלק מהמיטו’ בריאות וחלק חולות או הכל חולה וכו’. הפנוטיפ מושפע לא רק מהגן הפגום אלא גם מהיחס בין כמות המיטו’ הפגומות לתקינות.
הוריאביליות הזו מתבטאת לא רק בגיל הופעת הסימפטומים אלא גם באיבר שנפגע. ;

112
Q

כיצד משפיעה המיטוכונדריה על הזדקנות?

A

במיטו’ יש נזק חמצוני נרחב בגלל שרשרת מעבר האלקטרונים שיוצרת נזקים חימצוניים. ייצור הROS שעושים נזקים חמצוניים עם הגיל.
מרבית המוטציות המיטו’ שמתחילות להתבטא בילדות הולכות ועוברות פרוליפרציה והופכות יותר נפוצות במיטוכונדריות בגוף- תהליך שנקרא קלונל אקספנשיין- זה גם קורה עם הגיל.
תאים בעלי מיטוכונדריות פגומות שמתחילה להפגשם בהם שרשרת מעבר האלקטרונים נקראים SENSCENT.
ככל שמזדקנים יש יותר כאלו.
תהליך הפיוז’ן לפי סברת מדענים נועד כדי לפזר את מולקולות הדנא הפגומות שווה בשווה במיטו’ כדי שלא יצטברו יותר מדי נזקים רק בצד אחד.

113
Q

אילו גנים מקודד הגנום הכלורופלסטי?

A

בין 80 ל90 חלבונים, ועוד 45 מולקולות רנא שמרביתן הן מולקולות טיארנאיי
הגנומים הכלורופלסטיים מאוד דומיפ אחד לשני גם בזנים רחוקים אבולוציונית

114
Q

האם הגנום הכלורופלסטי דומה לגנום החיידקי? אם כן, במה?

A

כן, הם דומים מאוד.
יש להם דמיון רב ברצפי בקרה- כג פרומוטורים וטרמינטורים של שיעתוק
חלבונים המקודדים בכלורופלסט בעלי רצף חא זהה לשל חלבונים חיידקיים.
צברי גנים בכלורופלסט מאורגנים באותו אופן כמו של חיידקים למשל איקולי או ציאנובקטריה.

115
Q

כיצד מתבצעת חלוקת הכלורופלסט?

A

באופן שונה מהחלוקה המיטוכונדריאלית, ודומה מאוד לאופן החיידקי.
חלבוני ג’יטיפיאז מתוך האיברון נצמדים לממברנה ומאפשרים חלוקה- בשונה מהמיטוכונדריה אליה מגיע דינאמין מבחוץ

116
Q

כיצד פועלת ההנצה החיידקית?

A

FtsZ חלבון מסיס מסוג ג’יטיפיאז
מתארגן למבנה טבעתי דינאמי העשוי פרוטופילמנטים צמודי ממברנה- מפנים הממברנה החיידקית. הטבעת שיוצר החלבון הזה משתמשת פיגום לחלבונים נוספים שיוצרים כח כיווץ ומפצלים את הממברנה

117
Q

האם הכלורופלסט לנוכח דמיונו לחיידק מבצע תהליכי עיבוד רנא?

A

כן, כולם נגזרו מהמארח היוקריוטי שלו.
עיבודים בקצוות 3 ו5, ביקוע וחיתוך של רנא פוליציסטרוני- משמע אין אופרונים, דה אמינציה של סי ליצירת יו.
זאת בשונה מהמיטוכונדריה סה לא קורות הפעולות הללו.

118
Q

כיצד מורש הכלורופלסט?

A

כמו המיטוכונדריה הוא מורש בהורשה אמהית- ברוב המקרים.
במקרים אחרים ישנה הורשה בי פרנטאלית.

119
Q

VARIGATION- מהי תופעת הוריגיישן

A

כאשר יש הורשה בי פרנטלית וחלק מהכלורופלסטים דפוקים וחלק לא, יעברו הפרדה מיטוטית ויתחלקו כך שחלק מהתאים יקבלו כלורופלסט דפוק וחלק לא. כך נקבל ףאטצים של יקו’ ולבן למשל בצמחים כשהדפוק נותן לבן.

120
Q

חאלו קומפלקסים ממברנליים קיימים על המיטוכונדריה לצורך העברת החלבונים פנימה? כיצד הם פועלים?

A

על הממברנה החיצונית
TOM- מהווה את שער הכניסה לכלל החלבונים למיטוכונדריה. מעביר חבונים אל התווך הבין ממברנלי או שעוזר להם להיטען על הממברנה החיצונית.
SAM- לאחר מעבר החלבונים בקומפלקס טום, סאם מאפשר לחלבוני בטא להתקפל ולהטען נכון על הממברנה החיצונית.
על הממברנה הפנימית:
TIM23- מאפשר הכנסת חלבונים מסיסים אל המטריקס/ הטענת חלבונים ממברנליים על הממברנה הפנימית. הוא עובד בצמוד לקומפלקס נוסף- אימפורט אייטיפיאז שעושה שימוש באייטיפי כדי להכניס את החלבון אל תוך המטריקס.
TIM 22- חיוני להטענה של תת משפחה של חלבונים לממברנה הפנימית, כמו אייטיפי איידיפי טראנסלוקייטור או טרנספורטר פוספט פרוטון.
OXA- מטעין חלבונים שיוצרו עי המיטוכונדריה על הממברנה הפנימית

121
Q

כיצד מועברים חלבונים שתורגמו בציטוזול למיוטו’?

A

בציטוזול הם נשארים בצורה לא מקופלת לאחר התרגום בזכות צאפרונים הייצ’ספי 70. בנוסף, ישנם חלבונים בציטוזול שנקשרים לרצף הסיגנל של חלבונים

122
Q

כיצד נכנסים חלבונים מהציטוזול אל המטריקס?

A

בכדי להכנס למיטו’ עצמה:
רצף הסיגנל עושה אינט’ עם רצפטור על קומפלקס תום.
החלבונים שליוו את החלבון בציטוזול עוזבים, הוא מועבר דרך תעלת הטראנסלוקציה, ולאחר כניסת הסיגנל אל תוך המטריקס- חותך אותו סיגנל פפטידאז.
בגלל שיש פעמים שהחלבונים יעברו את טום וטים23 יחד, יש מצב שהחלבון יהיה על שתי הממברנות בו”ז
לאחר הגעת החלבון במטריקס הוא יכול להיעזר בהייצ’ספי 60 של המיטוכונדריה להתקפל למבנה סופי.
מהיכן האנ’ בתהליך זה? אייטיפי בהקשרות הייצ’אספי70 בהתחלה, במטריקס עי אימפורט אייטיפיאז, שצמוד לטים23, ששינויי הקונפ’ שלו גורמים לחלבון להמשך פנימה.
בנוסף, ישנו את כח החשמלי- בגלל גרדיאנט הפרוטונים המטריקס שלילי ומושך אליו את החא החיוביות של הסיגנל.

123
Q

כיצד נכנסים חלבונים מהציטוזול לממברנה החיצונית של המיטוכונדריה?

A

ראשית עוברים בקומפלקס תום כמו כלל החלבונים המיטו’ אך מגיעים לתווך הבין ממברנלי, שם יפגשו צ’פרונים שימנעו מהם לעבור אגרגציה. הקומפלקס סאם יטעין אותם על הממברנה החיצונית.
מאוד דומה לחיידקים- להם גם יש חביות בטא כפורינים בממברנה. אחת מתתי היח’ של סאם הומולוגית לחלבון חיידקי בשם באם.
זה מחזק את התאוריה האנדוסימביוטית.

124
Q

כיצד מוטענים חלבונים על הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה?

A

חלבונים חיצוניים: כניסה דרך תום, מעבר דרך טים 23- הקצה האמיני נכנס דרכו ועובר מיד ביקוע במטריקס. מיד לאחר הרצף שבוקע קיים רצף הידרופובי- סטופ טראנספר- שמונע את העברת החלבון. החלק ההידרופובי נפלט אל הממברנה מקומפלקס טים23 ונשאר נעוץ עליה כשיתר החלבון נמצא בטווח הבין ממברנלי.
חלבונים שתורגמו בתוך הממברנה/ דרך אלטרנטיבית לכניסת חיצוניים:
החלבון עובר כולו למטריקס - הסיגנל פפטידאז מבוקע לאחר המעבר כולו וחושף רצף הידרופובי שמכווין את החלבון אל קומפלקס אוקסה שמטעין אותו על הממברנה הפנימית. יש לאוקסה הומולוג חיידקי ובממברנה התילקואידית.

דרך נוספת- על ידי טים 22- מיועד להטענת חלבונים שהם טרנספורטים של מטבוליטים - כמו אייטיפיאיידיפי טרנספורטר.
חלבוני מולטי פאס, נטולי סיגנל בקצה האמינית, אלא סיגנל באמצע השרשרת שלא נחתך. הם נכנסים לבין הממברנלי עי תום בטכניקה היוצרת לופ, ושם נקשרים אליהם צאפרונים יעודיים שמטעינים אותם על טים22. טים 22 יטעין את החלבון על הממברנה הפנימית בתהליך שלא צורך צפרונים או אייטיפי, אלא עושה שימוש בפוטנציאל הממברנה.

125
Q

כיצד מגיעים חלבונים אל הטווח הבין ממברנלי במיטו’?

A

שתי דרכים:
האחת, כמו ההטענה על הממברנה הפנימית כשהחלבון ננעץ מהקצה ההידרופובי, ואז מגיע סיגנל פפטידז בין ממברנלי וחותך בקצה והחלבון נשאר בין הממברנות.
השניה, של חלבונים המכילים שיירי ציסטאין. החלבונים עוברים כמובן דרך תום, ובין הממברנות נקשרים קוולנטית לחלבון מיה40 עי קשרי אסאס. בשחרור ממיה40 החלבון נותר עם קשר אסאס ומיה 40 נותרת מחוזרת. כדי למחזר את מיה 40 מנצלים את פוטנציאל רידוקס של שרשרת מעבר האלקטרונים.

126
Q

?מה התפקיד של חלבון מיה 40

A

לחמצן את החלבון שנכנס אל התא ושישאר בתווך הבין ממברנלי.

127
Q

כיצד נכנסים חלבונים לכלורופלסט ואברון התילקואיד?

A

גם בכלורופלסט זה פוסט תרגום. ישנם תהליכים דומים למיטוכונדריה, מלבד העניין שאין גרדיאנט חשמלי על הממברנה הפנימית שכן שרשרת המעבר נעשית בתילקואיד. לכן הקומפלקס ינצל אייטיפי וג’יטיפי. נמצא דיד קשר בין רצף הסיגנל לכניסה למיטו’ לבין רצף הסיגנל לכניסה לכלורופלסט.
כניסה לתילקואיד:
לחלבונים שצריכים להכנס לתילקואיד או לממברנה שלו יש סיגנל הידרופובי בקצה האמיני נוסף על הרצף שמיעד את החלבון לכלורופלסט. החלבון נכנס לסטרומה של הכלורופלסט, ועי סיגנל פפטידז נחתך סיגנל הכניסה לכלורופלסט ונחשף סיגנל הכניסה לתילקואיד. סטים שונים של חלבונים הייצ’אספי70 שומרים על החלבונים במצב לא מקופל.
בכניסה לכלורופלסט ישנו חלבון המקביל לטום שנקרא טוק ועל הממברנה הפנימית יש חלבון טיק- שמקביל לטים 23
הכניסה לממברנה התילקואידים נעשה ב4 דרכים שונות:
א. מסלול הסק- כניסה לחלל התילקואידי, עושה שימוש באייטיפי ובגרדיאנט הפרוטונים. הומולוגי לסק החיידקי.
SRP-LIKE ב. מסלול
הומולוגיה לחלבון אסארפי- חלבון מוביל את החלבון שטרם מקופל מהסטרומה אל חלבון שיטעין אותו על ממברנת התילקואיד- אנ’ מאייטיפי וגרדיאנט פרוטונים.
ג. מסלול טאט- טווין ארגינין טרנסלוקיישן- שתי חא ארגינין נמצאות ברצף הכניסה לתילקואיד ותלויות בגרדיאנט הפרוטונים על ממברנת התילקואיד- נכנס ממש פנימה ולא נשאר על הממברנה.
ד. החדרה ספונטנית- לא צורך אנרגיה, החלבון נטען יחד עם הסיגנל שלו על הממברנה התילקואידית.