Zellbio2 Flashcards
Does the 30nm fiber exist in vivo?
Nein, sie existiert in vivo nicht, die nötige Konzentration wird nicht erreicht. Nur bei Verdünnung in vitro. In Realität chromatin chrowding.
What are the differences between DNA and RNA helices and what causes those differences?
• Zucker: DNA (Desoxyribonukleinsäure) Desoxyribose verwendet, RNA (Ribonukleinsäure) Ribose.
• Struktur: DNA besitzt die Basen Thymin, Cytosin, Guanin und Adenin und dier RNA die Basen Uracil, Cytosin, Guanin und Adenin. Thymin ist also die vierte Base in DNA, in RNA ist es Uracil.
• Strukturunterschied: DNA besteht aus zwei Strängen, die sich umeinander winden (Doppelhelix), während die RNA zwar auch Paarungen eingehen kann, aber häufig als Einzelstrang existiert
• DNA ist die Erbsubstanz, die vor jeder Zellteilung verdoppelt wird (Replikation).
• Die Ribose der RNA ist mit derjenigen der DNA identisch, bis auf eine Hydroxygruppe an der 2’-Position im Pentose-Ring. Dieser Unterschied macht RNA weniger stabil als DNA, da er eine Hydrolyse durch Basen ermöglicht: Die OH-Gruppe an der 2’-Position des Zuckers wird durch ein negativ geladenes Hydroxidion einer Base ihres Protons beraubt und der dann zurückgebliebene Sauerstoff geht eine Ringbindung mit dem Phosphor ein, wodurch die Bindung zum nächsten Nukleotid gelöst wird. Die RNA wird so in ihre Nukleotide zerlegt. 2’ Hydroxyl Gruppe ist Ursache für die Sekundärstruktur und damit für die unterschiedliche Form von DNA und RNA
o Die Einzelsträngigkeit erhöht die Zahl der Möglichkeiten für dreidimensionale Strukturen der RNA und erlaubt ihr chemische Reaktionen, die der DNA nicht möglich sind. Intramolekulare Basenpaarungen möglich.
o Sekundärstrukturen: Hairpin, Stemloop, Loop
o Tiefere und engere major groove
o Bei RNA-Struktur Loch in der Mitte
Bases in the singel-stranded loop are not paired or in standard interactions
Were does the energy for transcription come from? Why can RNA Pol be so sloppy?
Energie aus Abspaltung von Pyrophosphat aus dNTPs. Energie kommt durch Ribonukleosid-Triphosphate, genauer: deren High-Energy-bonds.
Die mRNA ist kurzfristig und in zahlreichen Kopien vorhanden. Unlike DNA, RNA is not used as the permanent storage form of genetic information in cells, so mistakes in RNA transcripts have relatively minor consequences. Transkription muss nicht so akkurat sein. Fehler bei der Transkription haben keine großen Konsequenzen, da die Information nicht als permanente genetische Information dient (im Gegensatz zur DNA). Es ist weniger schlimm wenn ein Protein falsch ist. Die RNA-Polymerase muss eher schnell sein. Das Erbgut ist nicht betroffen, sondern nur einzelne Proteine. Falsch gefaltete Proteien werden abgebaut, um keinen Schaden anzurichten.
