Zaliczenie Flashcards
Oligorybonukleotyd, punkt startowy syntezy DNA
PRIMER
Enzym rozplątujący DNA
HELIKAZA
Reakcja DNAn + H2O -> DNAn-1 + dNMP katalizowana jest przez
AKTYWNOŚĆ 3’->5’ EGZONUKLEAZY
Nukleoproteina
TELOMERAZA
Deaminacja cytozyny
URACYL
Fałduje białka
BIAŁKA SZOKU TERMICZNEGO
Heterogenny jądrowy RNA (hnRNA) jest prekursorem dla
mRNA
8S syntetyzowany jest przez
POLIMERAZĘ RNA I
Kompleksy TIM i TOM biorą udział w przenoszeniu białek do
MITOCHONDRIUM
Gdzie znajduje się receptor witaminy D
JĄDRO KOMÓRKOWE
Czym wytrącamy kwasy nukleinowe
ALKOHOL IZOPROPYLOWY
Zmiana kodonu na terminacyjny, jaka to mutacja
SUBSTYTUCJA
Funkcja RFC
SKŁADA PCNA, POTRZEBNE DO ZŁOŻENIA KOMPLEKSU DNA-POLIMERAZA
Reakcja 3-5 egzonukleazy
DNA n + H2O = DNA n-1 + dNMP
System naprawy DNA podczas replikacji
EGZONUKLEAZA 3-5
7-metyloguanozyna służy do
SYNTEZY CZAPECZKI mRNA
Czy ogon i czapeczka łączą się z rybosomem 60s
OGON I CZAPECZKA ŁĄCZĄ SIĘ Z RYBOSOMEM 40S
SRP białko syntetyzujące nowopowstały peptyd jest zlokalizowane w
CYTOZOLU
Co fosforyluje białka
KINAZA
Motywem wiążącym białka do DNA jest
PALEC CYNKOWY
Co nie fałduje białka
UBIKWIDYNA (degraduje)
Metodą wykorzystującą przeciwciała do detekcji białek jest
WESTERN BLOTTING
O sekwencjach LINE co robią
KODUJĄ WŁASNĄ ODWROTNĄ TRANSKRYPTAZĘ, PRZEMIESZCZAJĄ SIĘ LOSOWO W NEURONACH LUDZKICH
Przerwanie genu czynnika VIII krzepnięcia krwi
HEMOFILIA
Insercja w ekson 48 genu dystrofiny
DYSTROFIA MIĘŚNIOWA
Pytanie o apoptozę, czynnik wypływający przez zewn błonę mitochondrium aktywujący apoptoson
CYTOCHROM C
Chromosom Philadelphia powstaje w wyniku mutacji typu
TRANSLOKACJA
PCR polega na
SELEKTYWNEJ AMPLIFIKACJI BIAŁKA
Podczas izolacji DNA na ćwiczeniach po wprowadzeniu do roztworu chloroformu i odwirowaniu, DNA znajduje się
W GÓRNEJ FAZIE WODNEJ, A PO ALKOHOLACH NA DOLE
Która polimeraza odpowiedzialna jest za syntezę primera
ALFA POLIMERAZA – PRIMAZA
Fałsz
WYCINANIE INTRONÓW ZACHODZI TYLKO W MODYFIKACJI POTRANSKRYPCYJNEJ mRNA
Fałsz
OGON I CZAPECZKA ŁĄCZĄ SIĘ Z RYBOSOMEM 60S
Co to pseudourydyna
tRNA
Oligorybonukleotyd (ok. 12 reszt rybonukleotydowych) komplementarny do nici DNA, syntetyzowany przez primazę i służący jako punkt startowy dla syntezy DNA z monodeoksyrybonukleotydów to
PRIMER
Jaka polimeraza odpowiada za w ludzkim mitochondrium
GAMMA
RNAza H funkcja
USUWA FRAGMENT iRNA Z WYJĄTKIEM OSTATNIEGO RYBONUKLEOTYDU
Reakcja katalizowana przez ligazę
ATP + DNAn + DNAm = AMP + Ppi + DNAn+m
Wycinanie intronów w
mRNA
TATA box element promotora wiąże
TBP
Łańcuch poli A
SYNTETYZUJE GO POLIMERAZA poliA
Białko p53 należy do
GENÓW SUPRESOROWYCH
Typowa modyfikacja potranslacyjna kolagenu to
HYDROKSYLACJA
Aby proteasom mógł degradować białko musi być związany z
UBIKWITYNĄ
Acetylacja histonów powoduje
INDUKCJĘ TRANSKRYPCJI
Przy elektroforezie z bromkiem etydyny lub midori green… z enzymem EcoR1 widać
KILKA PRĄŻKÓW (U BAKTERIOFAGA), SMUGĘ (U SZCZURA BEZ SOND)
Do reakcji PCR nie potrzeba
FOSFORYLAZY
Weryfikacja komórek bakteryjnych wektorem plazmidowym na jakim podłożu
ANTYBIOTYKI
Ilość chromosomów w komórkach somatycznych
46
Crispr Cas9 przecina
2 NICI DNA
Enzymy restrykcyjne to
ENDONUKLEAZY
Która polimeraza syntetyzuje tRNA
POLIMERAZA RNA III
Pierwszy aminokwas w łańcuchu u eukarionta
METIONINA
Jakie białko uniemożliwia odtworzenie wiązań wodorowych
RPA
Nieaktywny receptor glikokortykodowy znajduje się w
CYTOZOLU
Jaki nukleozyd na końcu 5’ i 3’ mRNA
5’ – CZAPECZKA (7-METYLOGUANOZYNA) 3’ – poli(A) ADENOZYNA
W systemie naprawy BER błędna zasada azotowa jest usuwana przez
GLIKOZYDAZĘ
Gdzie zachodzi glikozylacja
W RETIKULUM ENDOPLAZMATYCZNYM
P53 funkcja w apoptozie:
HAMUJE CYKL KOMÓRKOWY, INDUKUJE APOPTOZĘ, INDUKUJE BIAŁKO P21
Jaka polimeraza tworzy koliste DNA u ssaka
GAMMA
W jakiej temperaturze najlepiej działa polimeraza DNA – (jest termostabilna)
72°C
W procesie apoptozy dochodzi do aktywacji
KASPAZY
Geny supresorowe w procesie transformacji nowotworowej są mutacjami powodującymi
UTRATĘ FUNKCJI
Pacjent z zespołem Downa posiada w swoich komórkach po
47 CHROMOSOMÓW
Kaspazy inicjujące to odpowiednio
8, 9, 2, 10
Enzym zmieniający topologię DNA i usuwający napięcia cząsteczki DNA w czasie replikacji to
TOPOIZOMERAZA
tRNA w komórkach eukariotycznych jest syntetyzowane przez
POLIMERAZĘ RNA III
Białka z rodziny Bcl2
KONTROLUJĄ PRZEPUSZCZALNOŚĆ BŁONY MITOCHONDRIALNEJ, BIAŁKA PROAPOPTYCZNE, ANTYAPOPTYCZNE
Ostatni nukleozyd na końcu 5’ mRNA to
METYLOGUANOZYNA
Fosforylacja kompleksu cykliny z Cdk przez Wee1 prowadzi do
DEZAKTYWACJI TEJ CYKLINY
Aktywność ligazy jest potrzebna w następującym procesie
REPLIKACJA, NAPRAWA DNA PRZEZ SYSTEM BER I NER
Synteza tej cykliny rozpoczyna się zaraz po podziale komórki, a gdy osiągnie ona określony poziom w komórce to wraz z kinazą Cdk kieruje komórkę do mitozy, chodzi o cyklinę
M
Za składanie i umieszczenie białka PCNA na nici DNA w czasie replikacji odpowiedzialne jest białko
RFC
Wybierz poprawny opis faz cyklu komórkowego
G1 G0 S G2
Białka do jądra komórki są kierowane za pomocą
SEKWENCJI NLS
Fosforylacja białka p53
W PRZYPADKU NIEWIELKICH USZKODZEŃ DNA PROWADZI DO ZATRZYMANIA CYKLU KOMÓRKOWEGO
Reakcja DNAn + H2O = DNA n-1 + dNMP katalizowana jest przez
AKTYWNOŚĆ EGZONUKLEAZOWĄ POLIMERAZY SIGMA
Fosforylacja kompleksu cykliny z Cdk przez CAK prowadzi do
AKTYWACJI TEJ CYKLINY
Białko p27
JEST DEGRADOWANE PRZEZ SCF
Która z mutacji powoduje przesunięcie ramki odczytu
DELECJA (lub insercja)
Reakcja aktywacji aminokwasów to
AMINOKWAS + tRNA + ATP = AMINOACETYLO-tRNA + APM + PPi
Zasada azotowa widoczna niżej powstaje w wyniku deaminacji
CYTOZYNY
SRP
BIORĄ UDZIAŁ W KOTRANSLACYJNYM ZWIJANIU BIAŁEK, WIĄŻĄ RYBOSOMY I RNA, HAMUJĄ TRANSLACJĘ
Apoptozie towarzyszy
AKTYWACJA KASPAZ
Inhibitory replikacji mogą być stosowane w leczeniu
NOWOTWORÓW
Czynnikiem inaktywującym represor operonu laktozowego jest
LAKTOZA
Sekwencja TATA-box znajduje się w DNA w obrębie
PROMOTORÓW
Podczas metafazy zachodzi
UŁOŻENIE CHROMOSOMÓW W PŁASZCZYŹNIE RÓWNIKOWEJ KOMÓRKI
Prawidłowe twierdzenie dot. fragmentów Okazaki
SĄ ŁĄCZONE PRZEZ LIGAZĘ
Jaka jest funkcja RFC?
SKŁADANIE KOMPLEKSU DNA-POLIMERAZA
System naprawy DNA podczas replikacji
EGZONUKLEAZA 3-5, 5-3, NER I BER
Czynnik wpływający przez zewnętrzną błonę mitochondrium aktywujący apoptoson
Pro-apoptotyczne białka Bcl-2 Bad, Bid, Bax i Bim (uwolnienie cytochromu c)
Co to rybotymidyna albo pseudourdyna
ZMODYFIKOWANE ZASADY AZAOTOWE NA RAMIONACH tRNA
Metoda Sangera
2’3’ DIDEOKSYNUKLEOTYDY
Co jest używane w procesie izolacji DNA do usuwania białek
CHLOROFORM
Czego najwięcej (ilościowo) wytrącamy podczas procesu izolacji kwasów nukleinowych
rRNA
Kwasy nukleinowe są rozpuszczalne w
WODZIE
MidoriGreen widziany jest w
UV
Reakcja katalizowana przez peptydylotransferazę
(peptydylo)n-tRNA + aatRNAaa→(peptydylo)n+1-tRNA + tRNAaa + H2O
Enzymy uczestniczące w posttranskrypcyjnej przemianie pre-tRNA w tRNA
ENDONUKLEAZA INTRONOWA tRNA, LIGAZA RNA, NUKLEOTYDYLOTRANSFERAZA tRNA
Nukleotyd wyst. na końcach 3’ i 5’ intronu graniczącego z egzonami w cząsteczce hnRNA
5’ GU 3’ AG => GMP
Na końcu 3’ tRNA
AMP
3 unikatowe motywy w strukturze białka pośredniczące w wiązaniu białek regulatorowych do DNA
HELISA-SKRĘT-HELISA, PALEC CYNKOWY, ZAMEK LEUCYNOWY
Dipeptyd utw. przez aminokwas destabilizujący α-helisę i aminokwas aromatyczny
PRO-PHE
Reakcja blokowana przez erytromycynę
TRANSLACJA
Nukleotyd znajdujący się na 3’ startera używanego przez retrowirusy do syntezy DNA
AMP
Modyfikacje posttranskrypcyjne jakim może ulec transkrypt II klasy (mRNA)
REDAGOWANIE: DELECJA (NP DEAMINACJA), INSERCJA, SUBSTYTUCJA; POLIADENYLACJA, OCZAPECZKOWANIE, USUWANIE INTRONÓW – ALTERNATYWNY SPLICING
Reakcje pierwszej reakcji w procesie transkrypcji
DNAmat + n(XNTP)→DNAmat + pppA(Np)n-1 + (n-1)Ppi
Inhibitory
REPLIKACJI: MITOMYCYNA C, BLEOMYCYNA, TRANSKRYPCJI: AKTYNOMYCYNA D, Α-AMANITYNA, AZYDOTYMIDYNA, TRANSLACJI: STREPTOMYCYNA, TETRACYKLINA, ERYTROMYCYNA
Białka w replikacji DNA
RFC, PCNA, RPA
Enzymy w replikacji
Polα/primaza, RFC, polδ, RNaza H1, FEN1, DNA ligaza I
3 typy modyfikacji jakim ulegają histony pod wpływem działania podjednostki TAF II czynnika transkrypcyjnego TFIID
ACETYLACJA, METYLACJA, FOSFORYLACJA
Przykłady rybonukleoprotein
TELOMERAZA, RYBOSOM
Tworzenie telomerów (enzymy)
TELOMERAZA, POLIMERAZA Α / PRYMAZA, RNAZA, LIGAZA DNA, FEN1
4 rodzaje eukariotycznych polimeraz i ich produkty
I – rRNA 18S, 5,8S, 28S; II – PREKURSORY mRNA I snRNA; III – tRNA I 5S tRNA; MITOCHONDRIALNA – WSZYSTKIE mtDNA
Reakcja katalizowana przez polimerazę DNA δ (aktywność polimerazy)
Mat (DNA): iRNA-(dNMP)n+dNTP=mat(DNA):iRNA-(dNMP)n+1+Ppi
Białka uczestniczące w kotranskrypcyjnym transporcie polipeptydów przez błonę ER
SRP (ROZPOZN.SEKW.SYGN.), SEC61/C (RECEPTOR RYBOSOMU), TRAM (PRZENIKA PRZEZ BŁONĘ), PEPTYDAZA SYGN.WEWN.RETIKULUM
Modyfikacje kotranlacyjne i postranskrypcyjne
DOŁĄCZENIE CZAPECZKI, POLIADENYLACJA, WYCINANIE INTRONÓW I SKŁ.EKSONÓW, REDAGOWANIE
Aby ulec transkrypcji, polimeraza RNA musi ulec
ZWIĄZANIU Z PROMOTOREM
Heterogenny jądrowy RNA (hnRNA) jest promotorem
POLIMERAZY RNA II/mRNA
5.8S syntetyzowany jest przez
POLIMERAZĘ RNA I
Jaką strukturę tworzą wycinane introny
LASSA
Modyfikacja 3’ nukleotydylotransferazy
DODANIE CCA