wiederholen Flashcards
Nennen Sie vier prinzipielle Regulationsmechanismen, mit denen die Cdk-Aktivität während des Zellzyklus reguliert werden kann. 1. 2. 3. 4.
1) Aktivierung durch Cyclinbindung
2) (De-)Phosphorylierung
3) Bindung von Inhibitoren an Komplex
4) Transkriptionskontrolle
5) Proteindegradation
Der Wnt / beta-catenin Signal-Pathway spielt bei der Induktion des Nieuwkoop-Zentrums im
Xenopus-Embryo eine wichtige Rolle. Welche Aussagen sind richtig? Ja/Nein
1) Das Protein Frizzled bildet den Wnt Rezeptor.
2) Das Dishevelled-Protein bindet an der Regulatorregion zygotischer Gene.
3) Die Kinase GSK-3 phosphoryliert das Protein Frizzled.
4) Wnt-Proteine binden an den Rezeptor.
5) Wnt-Proteine werden vom Rezeptor phosphoryliert.
6) Das Dishevelled-Protein bildet Dimere.
1) Ja
2) Nein
3) Nein
4) Ja
5) Nein
6) Nein
(Frage kommt sehr oft in verschiedenen Reihenfolgen)
Nennen Sie zwei am RNA-Stoffwechsel beteiligte Subkompartimente im Zellkern und ihre
Funktion.
1) Nucleolus: Ribosom Synthese
2) Specules: Spleißen
3) Cajalkörper: Biogenese RNA modifizierender Komplexe
Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Aussagen.
1) Bei der Verhinderung einer mehrfachen Replikation der DNA spielt {ein Inhibitor der DNAPolymerase
| der proteolytische Abbau der DNA-Polymerase | die Ubiquitinylierung des
Proteins Cdc6 | die Phosphorylierung des ORC (origin recognition complex)} eine wichtige
Rolle.
2) Das Protein Mcm {wird nach Phosphorylierung abgebaut | wird nach Phosphorylierung aus
dem Zellkern exportiert | liegt immer DNA-gebunden vor}.
3) Der präreplikative Komplex bildet sich in der {M-Phase | G1-Phase | S-Phase | G2-Phase}.
1) die Ubiquitinylierung des
Proteins Cdc6 | die Phosphorylierung des ORC (origin recognition complex)
2) wird nach Phosphorylierung aus
dem Zellkern exportiert
3) G1-Phase
2) Das Protein p53 {ist ein Regulator der Transkription | kann durch Phosphorylierung
stabilisiert und aktiviert werden | ist das Produkt eines Onkogens | wird durch das Protein
Mdm2 aktiviert}.
2) ist ein Regulator der Transkription, kann durch Phosphorylierung
stabilisiert und aktiviert werden
Die Rindenrotation spielt eine wichtige Rolle bei der Festlegung der dorso-ventralen
Körperachse bei Xenopus. Von Bedeutung ist hierbei das Protein “disheveled”.
Kreuzen Sie jeweils „ja“ oder „nein“ an.
1) Es wird nach dorsal verlagert.
2) Es spielt im TGF-beta Signalweg eine wichtige Rolle.
3) Es ist ein maternales Protein.
4) Es ist Bestandteil des Wnt-Signalwegs.
5) Es bindet an der Regulatorregion des siamois Gens.
1) Ja
2) Nein
3) Ja
4) Ja
5) Nein
Welche Aussagen sind richtig? Ja/Nein
1) Das 26S Proteasom hydrolysiert ATP.
2) Seine 19S cap‐Untereinheit besteht aus 5 Polypeptiden.
3) Die direkte Bindung der lid‐Region an das 20S core‐Partikel ermöglicht den
Zutritt des abzubauenden Polypeptids zu den katalytischen Zentren.
4) Die 11S cap‐Untereinheit enthält ATPasen des AAA‐Typs.
1) Ja
2) Nein
3) Nein
4) Nein
a) Nennen Sie vier interne Modifikationen an Proteinen, die im Zytoplasma erfolgen und zu
einer Vergrößerung des Molekulargewichtes führen.
1.
2.
3.
4.
b) Nennen Sie zwei grundsätzliche Eigenschaften des Zytoplasmas und der darin
ablaufenden Proteinbiosynthese, die die Faltung von Proteinen negativ beeinflussen können.
1.
2.
a)
- Acetylierung
- Methylierung
- N-Phosphorylierung
- Nitrosylierung
- O-Phoshporylierung
b)
1. reduktive Umgebung erschwert Disulfidbrückenbildung
2. andere Proteine fördern Aggregate
In SS11 Musterlösung:
1. Molecular Crowding
2. Polysomen
a) Ist die folgende Aussage richtig oder falsch?
„Alle Kompartimente der Zelle sind durch vesikulären Transport miteinander verbunden.“
………………………………….
Begründen Sie!
b) Nennen Sie zwei wichtige Funktionen, die die Assemblierung des coats bei der Bildung von
Transportvesikeln hat.
1.
2.
a) Nein, beispielsweise in den Nucleus findet kein vesikulärer Transport statt.
SS11 Musterlösung: Mitochondrien oder Chloroplasten sind nicht mit den Kompartimenten des sekretorischen Weges über Vesikel verbunden
b)
1. Binden von Coatproteinen trägt zur Form bei
2. Binden von Cargo-Adaptern
SS11 Musterlösung: Abschnürung des Vesikels
Erläutern Sie die Begriffe „Plasmodesmos“ und „Plasmodium“
Plasmodesmos:
Plasmodium:
Plasmodesmos: Plasmaverbindung zwischen Zellen höherer Pflanzen
Plasmodium: mehrkernige Zelle oder Malariaerreger
An der Regulation des M‐Cdk‐Komplexes sind die Enzyme Wee1, CAK, Cdc20‐APC und Cdc25
beteiligt.
Ordnen Sie die Enzyme einer Enzymklasse zu und kreuzen Sie die entsprechende Funktion
der Enzyme in Bezug auf die Regulation der M‐Cdk‐Aktivität an.
Enzyme: Wee1, CAK, Cdc20‐APC und Cdc25
Funktion: aktivierend oder hemmend
Enzymklasse: Protease, Kinase, Ubiquitinligase oder Phosphatase
CAK: aktivierend, Kinase
Cdc25: aktivierend, Phosphatase
Wee1: hemmend, Kinase
Cdc20-APC: hemmend, Ubiquitinligase
Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Antworten.
1) Zur Verhinderung der CDK‐Aktivität in der frühen G1‐Phase wird das Protein Sic1
{phosphoryliert | dephosphoryliert | ubiquitinyliert | dimerisiert}.
2) Sic1 ist {eine Phoaphatase | eine Protease | ein CDK‐Inhibitor}.
3) Eine hohe Aktivität des Proteinkomplexes Hct1‐APC {führt zum Abbau von M‐Cyclinen |
führt zum Abbau des Proteins Securin | führt zum Abbau der M‐Cdk (Kinase) | benötigt eine
hohe M‐Cdk‐Aktivität}.
1) dephosphoryliert
2) CDK-Inhibitor
3) führt zum Abbau von M-Cyclinen
a) Wie heißen die drei Kompartimente, in die sich die Somiten differenzieren?
1.
2.
3.
b) Nennen Sie jeweils ein Gewebe, das sich aus den Kompartimenten ableitet:
Kompartiment Gewebe
1. 1.
2. 2.
3. 3.
a)
- Dermatom
- Myotom
- Sklerotom
b)
1. Dermatom -> Dermis
2. Myotom -> Skelettmuskeln
3. Sklerotom ->Achsenskelett
Erläutern Sie den Begriff „Chaperonin“ und nennen Sie ein Beispiel.
Große Multidomäne-Proteine, die einen geschützten Faltungsraum für Proteine schaffen und zwar ATP-Abhängig.
Beispiel: GroES und GroEL
Füllen Sie die Tabelle aus. Zu jeder Frage sind 3 Felder auszufüllen. 1 Feld Aktinsystem, 2 Feld Tubilinssystem, Intermediärfilamentsystem.
1) Welche kovalenten Bindungen verknüpfen die Untereinheiten zum Filament? 2) Können häufiger Verzweigungen der Filamente vorkommen? 3) Welche Nukleotidtriphosphate können durch die Untereinheiten der Polymere gebunden werden? 4) Welche Klassen von Motorproteinen interagieren mit den Filamenten? 5) Welche Strukturen werden in jedem Zellkern einer Säugerzelle durch die Systeme gebildet?
1) Aktinsystem: Keine Tubulinsystem: Keine Intermediärfilamentsystem: Keine 2) Aktinsystem: Ja Tubulinsystem: Nein Intermediärfilamentsystem: Nein 3) Aktinsystem: ATP Tubulinsystem: GTP Intermediärfilamentsystem: / 4) Aktinsystem: Myosin Tubulinsystem: Kinesine, Dynein Intermediärfilamentsystem: / 5) Aktinsystem: Keine Tubulinsystem: Mikrotubuli (eigentlich müsste die Kernmembran in der Anaphase schon aufgelöst sein, damit ist es ja nicht mehr so richtig im Kern) Intermediärfilamentsystem: Kernhülle
a) Nennen Sie drei Organellen, die nicht dem Endomembransystem des sekretorischen
Weges zugeordnet werden.
b) Nennen Sie eine Organelle des sekretorischen Weges, die aus mehreren Kompartimenten
besteht.
a)
- Mitochondrium
- Centrosom
- Plastiden
b)
Golgi-Apparat
Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Aussagen.
1) Die Bildung von COPII coated Vesiklen benötigt {die Aktivität von Sar1p | Inositol-4,5-
diphosphat | Rab29}.
2) Der Clathrin-Coat kommt {nur an der Plasmamembran | auch am ER | auch an Endosomen}
vor.
3) Das docking der Vesikel an die Zielmembran {beinhaltet die Formierung eines SNARE-Bündels
aus zwei SNARE-Domänen | wird in der Regel durch Rab-Proteine reguliert | erfolgt
erst nach dem uncoating der Vesikel}.
1) die Aktivität von Sar1p
2) auch an Endosomen
3) wird in der Regel durch RAB-Proteine reguliert, erfolgt erst nach dem uncoating der Vesikel ( geändert: Folie 44 (Docking/Fusion), Folie 40(QM Control in trafficking and RAB proteins) + Torbens Altklausur)
b) Nennen Sie drei prinzipielle Signalwege (Namen der Schlüsselenzyme) , die durch
Rezeptor-Tyrosinkinasen aktiviert werden können.
b)
1. MAP-Kinase
2. PI3-Kinase
3. Phospholipase C
Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Antworten.
1) Effektor-Caspasen besitzen Domänen, die als {DED | CARD | RING} bezeichnet werden.
2) Das für die Aktivierung der Procaspase-9 erforderliche Apoptosom enthält {Cytochrom c |
Bcl-2 | Apaf-1 | Fas-Ligand}.
3) Caspasen haben im aktiven Zentrum ein {Serin | Cystein | Methionin}.
4) Die Umwandlung einer Procaspase in eine Caspase ist unter physiologischen Bedingungen
ein {vollständig | teilweise | nicht} reversibler Prozess.
1) Alles falsch
2) Cytochrom C, Apaf-1
3) Cystein
4) nicht
Der M-Cdk-Komplex (MPF) ist für das Durchlaufen der M-Phase von essentieller Bedeutung.
Welche Aussagen sind richtig?
1) Der M-Cdk-Komplex kann durch Phosphorylierung aktiviert werden
2) Der M-Cdk-Komplex kann durch Phosphorylierung inaktiviert werden
3) Der M-Cdk-Komplex kann durch Dephosphorylierung aktiviert werden
4) Der M-Cdk-Komplex kann durch Dephosphorylierung inaktiviert werden
5) Der M-Cdk-Komplex aktiviert Myosin für die Zytokinese
1) Ja
2) Ja
3) Ja
4) Nein (wird gehemmt und nicht inaktiviert) VL2 Folie31
5) Nein
Die extrazelluläre Kontrolle des Zellzyklus kann durch Mitogene erfolgen. Dabei wird u.a. das
Protein Myc aktiviert.
Welche Aussagen sind richtig? Ja/Nein
1) Myc ist eine Ubiquitinligase, wodurch der CdK-Inhibitor p27 ubiquitiniert
und abgebaut wird.
2) Myc ist eine Kinase.
3) Myc ist ein Transkriptionsfaktor.
4) Myc ist eine Protease und führt deshalb zum verstärkten Abbau des CdKInhibitors
p27.
5) Eine höhere Myc-Aktivität kann zur vermehrten Bildung von Untereinheiten der Ubiquitinligase SCF führen, wodurch der CdK-Inhibitor
p27 ubiquitiniert und abgebaut wird.
1) Nein
2) Nein
3) Ja
4) Nein
5) Ja
Vg1-mRNA bildet bei Xenopus während der Eireifung einen Gradienten vom animalen zum
vegetativen Pol. Wie wird der Gradient aufrechterhalten? Ja/Nein
1) durch Verankerung der mRNA an Zytoskelettproteinen
2) durch Verankerung der mRNA am ER
3) durch aktiven Transport der mRNA
4) Der Zellkern wandert zum vegetativen Pol.
1) Nein
2) Ja
3) Nein
4) Nein
(1) Signale für die Sortierung innerhalb des sekretorischen Weges sind {Peptidsequenzen | Zuckermodifikationen | Lipidmodifikationen).
(2) Arf-Proteine {sind kleine GTPasen | dienen dem Disassemblieren von Vesikel-coats | kommen nur am ER vor}.
(3) V-SNARES {vermitteln die spezifische Fusion von Transportvesikeln mit der Targetmembran | können in einem Vesikel als aktive Komponenten und als passives Cargo vorkommen | vermitteln die Interaktion von Vesikeln mit Motorproteinen}.
Lösung:
(1) Peptidsequenzen / Zuckermodifikationen / Lipidmodifikationen
(2) sind kleine GTPasen
(3) vermitteln die spezifische Fusion von Transportvesikeln mit der Targetmembran / können in einem Vesikel als aktive Komponenten und als passives Cargo vorkommen
Kreuzen Sie jeweils “ja” oder “nein” an!
(1) Der Transport von Zuckern für den Aufbau des für die N-linked Glykosylierung verwendeten Core-Zuckers in das ER erfolgt über Antiporter.
(2) An der Faltung von Proteinen im ER sind Homologe des HSP70 beteiligt.
(3) Die Abspaltung einer Mannose vom Core-Zucker ist ein wichtiger Schritt für die Einschleusung eines Glycoproteins aus dem ER in den ERAD-pathway.
(4) Die Bildung einer Disulfidbrücke im ER ist irreversible. Daher werden Proteine, bei denen während der Faltung Disulfidbrücken ,,falsch” geknüpft werden, sofort abgebaut.
Lösung:
(1) nein
(2) ja
(3) ja
(4) nein
(1) Cadherine sind Proteine, deren Interaktion miteinander {Kalzium | Magnesium | Eisen }- abhängig ist.
(2) Cadherine binden auch an {Kollagen | Elastin | Fibronektin}.
(3) Cadherine und zu den Cadherinen homologe Proteine sind an der Ausbildung von {adherens junctions | focal contacts | Desmosomen} beteiligt.
(4) Bei der Kontakthemmung der Zellproliferation {spielen Cadherine keine Rolle | wandern Cadherine in den Zellkern | erfolgt bei Fehlen von Cadherinen eine Translokation von ß-Catenin in den Zellkern}.
Lösung:
(1) Kalzium
(2) alles falsch! (Fibronektin bindet an Integrine!, siehe Thieme Taschenbuch)
(3) adherens junctions / Desmosomen
(4) erfolgt bei Fehlen von Cadherinen eine Translokation von ß-Catenin in den Zellkern
Kreuzen Sie jeweils “ja” oder “nein” an!
(1) HSP90 reguliert die Aktivität von vielen Kernrezeptoren.
(2) PPI isomerisiert Peptidbindungen zwischen beliebigen Aminosäuren und Alanin.
(3) Langlebige zytosolische Proteine werden bevorzugt im Lysosom abgebaut, kurzlebige dagegen durch das Proteasom.
(4) Kleine HSP stabilisieren bei Hitzestress potentielle Substrate der Glycolyse.
Lösung:
(1) ja
(2) nein
(3) ja
(4) nein
Pause
vorbei
Nennen Sie wenigstens vier Mesodermderivate, die dorsal entlang der anterior-posterioren Achse des Wirbeltier-Embryos gebildet werden.
Lösung:
(1) Intermediate mesoderm
(2) Chorda mesoderm
(3) Paraxial mesoderm
(4) lateral mesoderm
Pause
vorbei
Der Wnt/ beta-Catenin signal pathway spielt bei der Spezifizierung der dorso-ventralen Achse im Xenopus-Embryo eine wichtige Rolle. Welche Aussagen sind richtig? Kreuzen Sie jeweils ja“ oder ,nein” an.
(1) Das Protein beta-Catenin ist ein Transkriptionsfaktor.
(2) Das Protein GSK-3 bindet an der Regulatorregion zygotischer Gene.
(3) Das Protein Disheveled phosphoryliert das Protein beta-Catenin.
(4) Wnt-Proteine binden an den Rezeptor.
(5) Wnt-Proteine werden vom Rezeptor phosphoryliert.
(6) Den Transmembran-Rezeptor des pathways bildet das Protein Frizzled.
Lösung:
(1) ja
(2) nein
(3) nein
(4) ja
(5) nein
(6) ja
a) Welche zwei Moleküle sind am Aufbau elastischer Fasern beteiligt ?
b) Welche extrazellulär erfolgende Modifikation sind charakteristisch für diese Fasern?
c) Gibt es eine vergleichbare Modifikation in Kollagenen
Lösung:
a) Fibrillin/Elastin
b) Crosslinking von Lysinresten und Glutaminsäure resten (VL 3.1 folie 89) durch transglutaminase
c) Ja, kovalentes Crosslinking via Lysyl Oxidase
Nennen Sie fünf Beispiele für in der Regel posttranslational erfolgende interne Modifikationen an Polypeptiden
Lösung: Methylierung an Aminogruppen (His) N-Phosphorylierung (His) O-Phosphorylierung (The, Ser) S-Nitrosylation Acylation
a) Definieren Sie den Begriff “Zellkompartiment”!
b) Definieren Sie den Begriff “Organelle”!
a) membranumschlossener Raum mit speziellen Muster an Proteinen und speziellem Set biochemischer Reaktionen
b) Struktur mit spezieller Funktion, die nicht de Novo entsteht (vererbt), kann kein, ein oder mehrere Kompartimente umfassen
Unterstreichen Sie in den geschweiften Klammern alle richtigen Aussagen.
(1) Calnexin bindet bevorzugt an Substrate mit {N-linked Glykosylierung | O-linked Glykosylierung I GPI-Ankern}.
(2) Calnexin ist {eine ATPase | eine GTPase | keines von beiden}.
(3) Der in der UPR involvierte ATF6-abhängige Signaltransduktionsweg umfasst als Schritte {den Export eines Faktors aus dem ER in den Golgi | die Autophosphorylierung eines Membranrezeptors | das Trimmen durch eine Intermembranprotease}.
Lösung:
(1) N-linked Glykosylierung
(2) keines von beiden
(3) den Export eines Faktors aus dem ER in den Golgi / das Trimmen durch eine Intermembranprotease
Was sind “Clearing chaperone”?
Lösung:
Clearing Chaperone sind HSP100 und AAA-Proteine, die in der Auflösung von Aggregaten involviert sind.
Nennen Sie vier Proteine, die an der Durchschnürung einer eukaryotischen Zelle während der Zytokinese beteiligt sind.
Lösung: Septin Myosin II Formin Actin ( oder Dynamin / Syntaxin / ESCRT III)
