Week 7 (11) Flashcards
Introduction Pro- and Eukaryote cells
Hvad er Organeller?
Et organel er en lille, membran-afgrænset struktur, der har en bestemt funktion i cellen (eukaryot)
Hvad er Plasma membran/cellemembran?
Selektiv dobbelt-lag fosfolipid membran, der adskiller det indre af en celle fra omgivelserne.
Hvad er Cytoplasma/cytosol?
Jelly lignende væske i celler
Hvad er Typisk størrelse af bakterie?
1-5 mikro meter i diameter
Hvad er Typisk størrelse af eukaryot celle?
10-100 mikro meter i diameter
Hvad er Kernemembranen?
Dobbelt lag membran om kernen af eukaryote celler med porer
Hvad er Kromosomer?
Strukturer der indeholder arvemateriale (DNA)
Hvad er Ribosomer?
Komplekser af rRNA og protein. Laver proteinsyntesen. (er IKKE organeller!)
Hvad er Endomembran-systemet?
Kernemembranen, ER, Golgi, Lysosomer, Vesikler, Vakuoler og plasma membranen
Hvad er ER?
Endoplasmatisk Reticulum.
Hvad er Glat Endoplasmatisk Reticulum?
Ingen ribosomer
Hvad er Ru Endoplasmatisk Reticulum?
Har bundet ribosomer (mange proteiner, der skal ud af cellen dannes her)
Hvad er Golgi apparatet overordnet?
“Varehuset”, modtager, sorterer, sender og i nogle tilfælde danner proteiner.
Hvad består Golgi apparatet af?
Lagrede flade membranvesikler (cisternae)
Hvad er Lysosomer?
Nedbrydningssystem. Membranomsluttet organel med hydrolytiske enzymer (eukaryote celler)
Hvor foregår den intracellulære fordøjelse?
I lysosomerne
Hvad er Autofagi?
Naturlig regulerede nedbrydning af cellens bestanddele, der foregår i cellens lysosomer
Hvad er Vakuoler?
Store vesikler, er en del af endo-membransystemet
Hvad er Cytoskelletet?
Består af: Mikrotubuli, Intermediate Filamenter og Mikrofilamenter (actin-filamenter)
Hvad er Mikrobutuli?
25nm i diameter, hult rør af proteinet tubulin
Mikrobutuli og bevægelse
Motorproteiner “går” på mikrotubuli fra minus ende til plus ende med last
Hvad gør Mikrotubuli?
Holde cellens form, organiserer celle organeller, organiserer kromosomer i celle-deling og bruges til transport af last i cellen
Hvad er intermediate filamenter?
10nm i diameter, tvistede filamenter
Intermediate filamenter bevægelse
Både moter proteinerne og filamenterne flyttes ikke, men de bøjer
Hvad gør intermediate filamenter?
Holder cellens form
Giver cellen mekanisk styrke
Hvad er actin filaments?
7nm i diameter, spirale filamenter, har en plus og en minus ende
Actin filaments og bevægelse
Motor proteiner sidder fast et sted og får filamentet til at bevæge sig mod venstre
Hvad gør actin filaments?
Holder cellens form, vigtig for muskel bevægelse og bevægelse
Hvad er vacuolers funktion?
Oplagring af energi, udskillelse af vand, optage fødeemner
Hvad er lysosomers funktion?
Nedbryde og genanvende organeller, nedbryde fødeemner
Hvad er peroxisomers funktion?
Indeholder enzymer som nedbryder molekyler
Hvad er forskellen på diffusion og osmose?
Diffusion: Noget der er opløst i en væske som bevæger sig
Osmose: Væsken der bevæger sig
Hvad er de 3 systemer for aktiv transport?
Simpel transport
Gruppetranslokation
ABC transporter
Hvad er simpel transport?
Drives at protongradient
Hvad er group translocation?
Stoffet som transporteres ændres kemisk, fx ved fosforylering
Hvad er ABC transporter?
Periplasmisk protein binder til stoffet som skal transporteres
Hvad er forskellen på gram negativ og gram positiv bakterier?
Gram negativ:
- Har et mindre peptidoglycan lag
- Har en ydre membran og indre membran
- Har lipopolysakkarider (LPS)
- Negativ for gram farvning
Gram positiv:
- Har et stort peptidoglycan lag
- Har kun en indre membran
- Positiv for gram farvning
Hvad er PHB/PHA?
Carbon og energi lagrende polymerer
(poly-beta-hydroxybutyric acid/poly-beta-hydroxyalkananoate)
Hvad er gas vesikler(1) og magnetosomer(2)?
1: gas vesikler, der giver cellen opdrift
2: Danner en dipol i cellen, så den kan orientere sig i et magnetisk felt (magnetotaxis)
Hvad er endosporer?
Bakteriers beskyttelsesrum (meget modstandsdygtige eks. med ris)
Hvordan bevæger bakterier sig i væske?
Ved flagel bevægelse
Hvordan bevæger bakterier sig på overflader?
Swarming (med flagel)
Twiching (med pili)
Gliding (med slim)
Sliding (ved celledeling)
Hvad er formålet med celledeling?
Reproduktion
Vækst
Regenerering af væv
Hvad er de tre typer af celledeling?
Binær fission
Mitose
Meiose
Hvad er celledeling hos eukaryote celler?
Mitose og meiose
Hvad er celledeling hos prokaryote celler?
Binær fission
Hvad er mitose?
Celledeling som fører til to datter-celler som er identiske med modercellen
Hvad hedder faserne i mitose?
Interfasen, profasen, prometafasen, metafasen, anafasen, telofasen og cytokinese
Hvad sker i interfasen?
Centrosomer er fordoblet
Hvad sker i profasen? (mitose + meiose II)
Centrosomer bevæger sig til hver sin ende af cellen
Hvad sker i prometafasen? (mitose + meiose II)
Kernemembranen opløses
Mikrotubuli organiserer kromosomerne
Hvad sker i metafasen? (mitose + meiose II)
Kromosomerne flyttes til midten (metafase plate)
Hvad sker i anafasen? (mitose + meiose II)
De to søstrekromotider bliver trukket fra hinanden
Hvad sker i telofasen og cytokinesen? (mitose + meiose II)
Kernemembranen gendannes og cellen deles
Hvad gør mikrotubuli under celledeling?
Griber fast i kromosomerne og trækker dem til hver sin side af cellen
Hvad gør mikrofilamenter under celledeling?
Afsnører de to nye celler fra hinanden
Hvad er de 4 stadier i eukaryote cellers cyklus?
G1, S (syntese), G2, M (meiose/mitose)
Hvad sker der i G1?
G1 er når cellen ikke er klar til celledeling
Hvad sker der i S?
Cellereplikation
Hvad sker der i G2?
Klargøring til celledeling
Hvor er de 3 checkpoints?
G1, G2, M
(G1 “restriction point” er vigtigst)
Hvad er G0 fasen?
En tilstand hvor cellen ikke deler sig
Hvad hedder de to protein-typer, der er de mest almindelige ‘regulatory molecules’?
- Protein kinase
- Cyclins
Hvad er Cdk’er og MPF?
Cdk: cyclin-dependent-kinase
MPF: maturation-proting-factor (M-phase-promoting-factor)
Hvad betyder diploid?
Celle med TO kromosom sæt
Hvad betyder haploid?
Celle med ET kromosom sæt
Hvad er meiose?
Celledeling med genetisk variation
Hvad sker i profase I (meiose)?
DNA kondenseres og centrosomer flytter til hver sin ende af cellen
Hvad sker i prometafase I (meiose)?
Mikrotubuli binder til kromosomerne (overlapning sker her)
Hvad sker i metafase I (meiose)?
Hvert kromosom par er koblet til mikrotubuli og ligger på en linje på midten
Hvad sker i anafase I (meiose)?
Kromosomerne afskilles
Hvad sker i telofase I og cytokinese I (meiose)?
Cellen deles
Hvordan foregår binær fission?
Genom kopieres og cellen deles i to
Hvad er “trace elements”?
Metaller, der kræves i små mængder (se evt. tabel i bog)
Hvad er “growth factors”?
Organiske mikronutrienter (se evt. tabel i bog)
Hvordan vokser bakterier?
Eksponentielt
Nt = e^(kΔt) * N0
Hvordan kan bakteriers vækst måles?
Optisk densitet, mikroskopi, tælling af colony forming units (CFU)
Hvad er godt og dårligt ved optisk densitet?
Hurtigt og billigt
Ikke særlig følsom, måler både levende og døde bakterier
Hvad er godt og dårligt ved mikroskopi?
Man ser hvad man tæller
Langsomt, ikke særlig følsom, tæller både levende og døde bakterier
Hvad er godt og dårligt ved tælling af colony forming units (CFU)?
Følsomt, tæller kun levende
Langsomt, tæller ikke dem som ikke vokser på mediet
Hvad er vigtigt at mediet skal indeholde?
En energikilde og en elektronkilde
Hvad er en kemotrofe?
En bakterie som får energi og elektroner fra organisk stof (fx sukker) eller uorganisk stof som kan oxideres (fx ammonium eller sulfid)
Hvad er en fototrofe?
En bakterie som får energi fra lys mens elektroner kommer fra H2O, H2 eller H2S
Hvilke miljøbetingelser skal styres på vækstmedier?
Temperatur, pH, salinitet, oxygen
Hvilke tre overordnede typer medier arbejder vi med?
- Definerede: vi sammensætter det og ved hvad det indeholder
- Komplekse: blanding, indholdet er ukendt
- Selektive: inhiberer udvalgte bakterier
(4. ‘differential medium’)
Hvad står CFU for?
“Colony-forming-unit”
Hvad står OD for?
optical-density (måles ved turbidimetric measuring)
Hvilke fire faser er der i “vækstkurven”?
- Lag
- Eksponentiel
- Stationær
- Aftagende (+dødsfasen)
Hvad er en “chemostat”?
Et åbent system med eksponentiel bakterievækst
(der tilføres medie og fjernes bakterier løbende)
Hvad hedder bakterier, der dannes frit-flydende?
“plancktonic growth”
Hvad hedder bakterier, der dannes på en overflade?
“sessile growth”
Hvad er biofilm?
Noget sessile bakterier danner ????
(mangler et godt svar)