VL 8&9 Flashcards
Was ist das Capping und wozu dient es?
Anheftung eines Guanosins mittels einer ungewöhnlichen Verknüpfung (5‘-5
Triphosphatbrücke); dient zur Stabilisierung der RNA gegen 5‘-3’Exonukleasen und
zur Verbesserung der Translationseffizienz
Erläutern Sie kurz den Vorgang des mRNA Splicing
es handelt sich um eine doppelte Transesterifizierung. Ein Adenosin im Intron attackiert die 5’-Spleißstelle. Dadurch kommt es zu einer Ausbildung eines Lariats und zu einem freien 3’OH am Ende des 1. Exons.
Was sind Introns und Exons, und wie können Sie die exakte Lage von Introns
bestimmen?
Introns kodieren keine Proteine.
Introns sind Bereiche einer RNA die mittels Spleißen entfernt werden können.
Exons sind Bereiche einer RNA, die nach dem Spleißen in der reifen RNA verbleiben
GTAG-Regel. Jedes Intron beginnt mit einem GT und endet mit AG.
Die Lage der Introns kann man durch den Vergleich von reifer RNA und dem Primärtranskript betimmen
Beschreiben Sie den Mechanismus der Polyadenylierung.
Poly-A-Schwanz am Ende der reifen RNA.
4 Schritte. RNA-Polymerase II passiert die Polyadenylierungssequenz.
1. Diese Sequenz wird von einer RNA-Endonuklease geschnitten.
2. Das 3’ gelegene Fragment dieses Schnittes wird von einer Exunuklease verdaut.
3. Der 5‘ vom Schnitt gelegene RNA-Bereich wird von polyadenyliert (Anheftung eines
PolyA-Schwanzes durch PolyA-Polymerase)
Die Spleißreaktion durch das Spleißosom verbraucht viel ATP. Warum?
An sich müsste das Spleißreaktion keine Energie benøtigen, aber fuer Umlagerungen
Es kommt zu multiplen Umlagerungen zwischen snRNPs und Intronsequenzen, in
deren Verlauf RNA-Helices von RNA-Helikasen aufgespalten werden müssen. Dies
verbraucht ATP.
Was sind snRNPs?
small nuclear Ribonucleoprotein particles
die aktiven Komponenten des Spleißosoms,
die einen RNA und Proteinanteil aufweisen. Die in den snRNPs enthaltene snRNAs
hybridisieren mit den Spleißsequenzen in Introns.
Wer ist Träger der katalytischen Aktivität im Spleißosom: Proteine oder RNA?
RNA. Das Spleißosom ist ein Ribozym.
Was bedeutet konstitutives, bzw. konditionales alternatives Spleißen?
konstitutives alternatives Spleissen
zwei RNA-Isoformen werden in allen Geweben
und zu jedem Zeitpunkt mittels alternativem Spleißen produziert
konditionales alternatives Spleissen
Bestimmte Spleißformen werden nur in
speziellen Zelltypen / Geweben / Entwicklungszeitpunkten /Stresszuständen erzeugt.
Was ist RNA-Edierung?
die post-transkriptionale chemische Modifikation von einzelnen RNA-Basen, die zu
einer Veränderung der Information an dieser Stelle führt (z.B. eine Veränderung eines
Kodons an dieser Stelle)
In welcher Gruppe von RNAs kommt RNA Edierung im Menschen besonders
häufig vor?
In mRNAs für Neurorezeptoren