Virus basala mekanismer

Question 1

Virus = ?

Answer 1

Metalliskt inert, infektiöst ämne som reproducerar endast inne i levande värdcell. Består av RNA- eller DNA-kärna, ett proteinhölje och i vissa fall även ett omgivande hölje.

Question 2

Viruspartikelns delar:

Answer 2

• nukleinsyra (DNA eller RNA)
• kapsid, skyddande skal av protein
• Ev: lipidhölje på utsidan av kapsiden (en del virus)

Question 3

Kapsid: ikosahedral symmetri:

Answer 3

Subenheter = kapsomerer, varje kapsomer bygg upp av minst 3 proteinstrukturer - virus får olika stolrik på kapsomer - kan vara polyhedrala eller sfäriska

• stabilt, hållbart
• ej flexibel - begränsar genomets storlek

Question 4

Kapsid: helikal symmetri:

Answer 4

Proteinstrukturer (protomerer) går runt genomet i spiralform - helixstruktur. RNA-genomet formar en RNA-helix mellan protomererna.

• Flexibel struktur - genomet kan bli större genom att spiralen blir längre
• begränsad stabilitet

Question 5

Har virus gemensamt ursprung?

Answer 5

Nej

Question 6

Virusklassificering: hierarkiskt system:

Answer 6

Klassificeras efter hur höljet är format. Lwoff

Question 7

Virusklassificering 2:

Answer 7

Typ av genom samt syntes av mRNA (Baltimore). 7 familjer (ds DNA, ss DNA, ds RNA osv)

Question 8

Grupp 6 o 7 i klassificering 2 särskiljer sig genom att:

Answer 8

de använder revers transcriptase (tex HIV = RNA-virus). Unikt enzym som kan göra om RNA till DNA

Question 9

Virus infektionscykel 7 steg:

Answer 9

1. Adsorption till specifik receptor på cellytan
2. Penetration genom cellmembranet
3. Uncoating av viruspartikeln
4. Expression och realisation av virusgenomet
5. Syntes av virusproteiner
6. Ihopsättning av nya viruspartiklar
7. Frisläppande av nya viruspartiklar genom avknoppning (budding, böljebärande virus) eller cell-lys

Question 10

Hur fastnar viruset på celler det ska infektera?

Answer 10

Ytstrukturer på celler används som virusreceptorer

Question 11

Hur sker fusion mellan virushölje och plasmamembran?

Answer 11

Virus: hölje med receptorbindande protein och fusionsprotein. Receptorbindande proteinet kopplar ihop med receptorer - bindning inducerar en konformationsföränding av virusets fusionsprotein. En hydrofon piptid hos fusionsproteinet skär in i cellens plasmamembran och inducerar fusionen med virushöljet –> virusets hölje/membran kopplas ihop med cellen.

Question 12

Vad innehåller kapsiden?

Answer 12

Genomet

Question 13

2 huvudgrupper av hur virus kommer in i cellen:

Answer 13

1. Smälta ihop med membran

2. Ta sig in via endosom (receptormedierad endocytos)

Question 14

Frisläppande av böljebärande virus: 2 sätt

Answer 14

1. Icosahedral kapsid tar sig till cellmembranet och snor lite membran av cellen = budding
2. Färdigt virus med hölje finns i golgi –> snor membran och gör en endosom som kan fusera med cellmembranet (cellens membran går ej ut)

Question 15

Replikation av DNA-virus vs replikation av RNA-virus?

Answer 15

DNA-virus kan använda cellens mekanismer. Använder en replikationsgaffel. Använder viralt helikas pga cellens helikas ger bara 1 replikation per cellcykel!
Stora DNA-virus: kan koda alla proteiner som behövs för replikationen
Små DNA-virus (litet genom): lånar alla proteiner för replikationen förutom helikaset
RNA-virus: använder virus-kodat RNA-polymeras för sin replikation genom en process som liknar cellens RNA-syntes, utan bildande av gaffel

Question 16

Varför har RNa-virus sämre kontroll på gen-expressionen?

Answer 16

DNA-virus använder samma mekanismer som cellen för sin gen-expression (dvs med transkriptionell och post-transkriptionell kontroll
RNA-virus kan inte använda cellens RNA-polymeras (=DNA-beroende) för syntes av mRNA

Question 17

Speciellt med positivt RNA?

Answer 17

Kan fungera direkt som mRNA - translation kan initieras av en primer vid 5´-änden. Behöver bara stöta på en ribosom. Bildas stort polyprotein som klipps i mindre bitar
(för realisationen behöver det bilda en negativ spegelbild)

Question 18

Replikation av negativt RNA-virus genom?

Answer 18

Viralt RNA-polymeras måste arbeta för att göra positiva kopior som kan användas som mRNA. Bär med sig sitt RNA-polymeras. Poleras ramlar av negativt RNA (stoppar efter varje gen och antingen ramlar av eller börjar nästa gen) så att det blir fler kopior i första delen och färre i slutdelen –> olika mängder mRNA –> vi får för mkt protein av de vi har många av och kanske för lite i andra änden —> procedur för att göra nya kopior blir ineffektiv

Question 19

Hur påverkar närvaro av nukleokapsidprotein RNA-replikation/mRNA-syntes?

Answer 19

Vid avsaknad av fritt N bildas mRNA
Vid närvaro av fritt N bildas istället full-längds RNA (+) som sedan replikeras till genomiskt RNA
(N hämmar syntes av mRNA - istället görs nya kopior av genomet för att stoppa in i viruspartiklarna)

Question 20

Cytopatogen effekt kan ge…?

Answer 20

• Dysfunktion eller transformation av cell

- nekros eller apoptos av cell

Question 21

Värdcellens svar mot virusinfektioner

Answer 21

Interferoner, apoptos

Question 22

Vad virus gör i cellen:

Answer 22

Tar över transkriptionsmaskineri, translationsmaskineri, DNA-replikationsmaskineri, transportmaskineri, omdirigerar cellulära signalvägar