Virus Flashcards
Kolmioviridae
Quelle est la maladie associée?
Hépatite D
Méthode pour identifier de nouveaux virus et faire la surveillance des maladies virales?
- Biologie moléculaire***
- PCR
- Séquencage Sanger
- Séquencage à haut débit***
Hepeviridae
Maladies associées?
Hépatite E porc et humains
(truc: hepe –> HÉPatite E)
Big liver and spleen disease (BLS) aviaire
Hepeviridae
Zoonose?
Zoonose mortelle du porc à l’humain
Retroviridae
Maladie associée?
BIBLE
Produisent des lésions tumorales, infections lentes
Phénomène de transcription inverse donc de retour en arrière c-à-d faire de l’ADN à partir de l’ARN
(retro= retour en arrière)
Flaviviridae
Maladies importantes?
BIBLE Fièvre jaune Fièvre du Nil Diarrhée virale bovine (BVD) et maladie des muqueuses (attrapée in vitro) Encéphalite du mouton Peste porcine classique
(truc: un Fils DE Pute (l’autre F tu t’arranges))
Transmission des flaviviridae?
Insectes piqueurs
Est-ce qu’il y a une zoonose chez les Flaviviridae? Sont-elles mortelles?
oui, souvent mortelles
Togaviridae
Maladies d’importance?
Encéphalomyélite équine vénézuelienne (VEE)
Encéphalomyélite équine de l’est (EEE), et de l’ouest (WEE)
Togaviridae: zoonose?
Oui, potentiellement mortelles. Causent des encéphalites
truc: causent des ENCÉPHALomyélite chez les chevaux
Avastrovirus
Quels sont les signes cliniques?
Entérite
Diarrhée
Néphropathie
Hépatite
Astroviridae
Chez quelle espèce est-il important?
Volaille
Infection du système digestif et respiratoire
Calciviridae
Maladies importantes?
- Virus Norwalk (bateau de croisière en quarantaine)
- Exanthème vésiculaire du porc
- Calicivirose féline
- Maladie hémorragique du lapin
Picornaviridae
Maladie à déclaration?
BIBLE Fièvre aphteuse (footh and mouth disease) MADO Encéphalomyélite aviaire Encéphalomyocardite porcine Poliomyélite (atrophie d'un membre) Maladie vésiculeuse du porc
*Les rhinovirus sont un genre de picorna= gros facteur dans les rhumes
Picornaviridae
Caractéristiques à retenir?
Tout petit. Très très résistant et sans enveloppe. Lui donne une grande facilité à se transmettre (capable de se propager à des kms par les airs)
Nairoviridae
Transmission?
Insectes piqueurs
(truc: Nairobi dans la Casa de Papel c’est une petite vite, comme les petits criss de moustiques autour du feu qui vont te donner pleins de maladies)
Nairoviridae
Maladie importante?
Maladie de Nairobi (mouton)
Hantaviridae
Transmission?
Urine et salive
Hantaviridae
Maladies importantes en Amérique?
Hôte réservoir?
Fièvre hémorragique et syndrome rénal
Hôte réservoir: rongeur
Arenaviridae
Zoonose?
Réservoir?
Zoonose mortelle
Réservoir par les rongeurs
(truc: c’est trop mortel aller à l’aréna, mais par contre les gars de hockey c’est des rats)
Arenaviridae
Maladie importante?
LCMV (virus de la lymphochorioméningite)
Signes cliniques faibles chez l’humain, sauf chez la femme enceinte en présence de rongeurs (exemple de l’animalerie)
(truc: me fait penser à la LHJMQ (ne pas poser de question, je comprends pas le rapport non plus) et c’est dans une aréna alors..)
Ordre Bunyavirales
Zoonose et transmission?
Zoonose mortelle, transmis par les insectes
Type d’infection causé par les Bunyviridae?
Problèmes respiratoires
Arteriviridae
Maladies?
Artérite principalement (arteriviridae)
Problèmes reproducteurs chez plrs espèces
Maladies d’importance:
- Artérite virale équine
- SRRP (virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin)
Coronaviridae
Maladies d’importance?
Diarrhée épidémique porcine Diarrhée néonatale du veau / dysentérie d’hiver Gastro-entérite transmissible du porc (GET) Péritonite infectieuse féline (PIF) Hépatite virale de la souris Bronchite infectieuse aviaire (IBV) Entérite transmissible du dindon Covid 19
Systèmes infectés par les coronaviridae?
BIBLE
Respiratoire et digestif
(encéphalite, hépatite et système vasculaire moins fréquent)
Particularité dans la structure des Corona?
Couronne formé par des péplomères
Bornaviridae
Maladie d’importance?
Maladie de dilatation du proventricule (perroquet)
Filoviridae
Zoonose?
Transmission?
Oui, du singe à l’homme et mortel
Transmission par contact direct, rarement en aérosol
(truc: Filo = faut filer au plus vite quand un singe te cours après pour pas qu’il te touche)
Rhabdoviridae
Maladies d’importances?
Lyssavirus (rage MADO)
Vesiculovirus (stomatite vésiculeuse MADO)
Ephemerovirus (virémie pintanière de la carpe)
Novirhabdovirus (nécrose virale hématopoïétique de la truite et septicémie virale hémorragique)
Rhabdoviridae
Transmissions et zoonose?
Certains transmis par des insectes
Quelques zoonoses
Quel test est utilisé pour détecter des anticorps?
ELISA
Quel test est utilisé pour la détection de pathogènes?
PCR
Pneumoviridae
Maladies importantes?
Virus respiratoire syncytial bovin
Quelle est l’approche la plus utilisée en diagnostic moléculaire?
PCR en temps réel
qPCR
Paramyxoviridae
Possible chez l’homme?
Maladies très graves chez l’homme et chez les animaux dont certaines MADO
Paramyxoviridae
Maladies importantes?
Parainfluenza bovin 3 (PI3)
Peste bovine (MADO)
Distemper (Maladie de Carré)
Maladie de Newcastle (MADO)
Orthomyxoviridae
Zoonose?
Oui, importante (grippe espagnole)
Orthomyxoviridae
Genre le plus important?
Influenza A virus:
Grippe
Réservoir des Orthomyxoviridae?
Oiseaux migrateurs et aquatiques
Vrai ou faux?
Les PCR en temps réel sont plus sensibles que les PCR classiques?
Oui, 100 à 1000x plus sensibles
Avantages de la PCR?
- Haute sensibilité et spécificité
- Différentie les génotypes d’un même pathogène
- Plus rapide que l’isolement
Désavantages de la PCR?
- Bcp personnel qualifié
- Risque de contamination = présence de faux positifs
- Présence de nucléases
- Faux négatifs (mutation de virus)
Maladies importantes dans les Orthomyxoviridae?
Myxo= mucus = affecte système respiratoire
Influenza (grippe) équin, aviaire et porcin
Influenza aviaire hautement pathogène (Influenza A de type H5N1) (MADO)
Transmission des Orthomyxoviridae?
Oral, fécal et aérosol
Birnaviridae
Espèces sensibles?
Volailles, poissons, reptiles, mollusques et insectes
Maladies importantes dans les Birnaviridae?
Bursite infectieuse du poulet (maladie de Gumboro)
Pancréatite infectieuse du poisson
(truc: BIrna = Boursite Infectieuse (bi)
Isolement vs PCR: lequel est le plus sensible?
PCR! Après le même nb de jours, pour le même échantillon, il continuera de détecter des positifs alors que l’isolement ne sera plus concluant. Beaucoup plus sensible, mais encore là, la sensibilité dépend toujours du type d’échantillon que l’on a.
À quoi sert le séquencage de type Sanger?
Suivi et identification de plusieurs pathogènes sur une base régulière au LDM.
Exemple: un vet bovin pourrait vérifier si les anticorps produit chez les animaux ont été fait avec le vaccin ou si le pathogène est présent dans l’étable.
Reoviridae
hôtes spécifiques?
Mammifères, insectes, plantes, poissons
Transmission des reoviridae?
Insectes piqueurs
Maladies importantes des Reoviridae?
BIBLE
- Gastroentérite à rotavirus
- Arthrite et ténosynovite aviaire
- Fièvre catarrhale du mouton. (Bluetongue) MADO
Hôtes des Alloherpesviridae?
Diverses espèces de poissons
allo l’herpès = partie génitale = pue le pouéssson
Anelloviridae
Quelle genre est le plus important?
Gyrovirus Virus TTV (Torque Teno Virus) : potentiel zoonotique
Maladie importante liée aux Anelloviridae?
Anémie infectieuse du poulet
truc: Anello = anémie pollo = anémie du poulet
Hepadnaviridae
Maladie importante chez l’humain?
Hépatite B
Circoviridae
Maladie d’importance?
Syndrome de dépérissement en post-sevrage du porc (SDPS)
Caractéristiques importantes des circoviridae?
Circo= ADN circulaire
Plus petits virus: 17 nm
Asfaviridae
Maladie importante?
BIBLE
African Swine Fever (peste porcine africaine) MADO
Épidémie mondiale en cours.
Lésions de type hémorragique sous forme de pétéchies
Iridoviridae
Quel type de lésions et qui infectent-ils?
Tumorales
Infectent les batraciens (amphibiens) et les poissons
Parvoviridae
Qu’est-ce qu’il y a de particuliers dans leurs réplications?
BIBLE Se réplique dans les cellules en phase de division active. Cellules lymphoïdes = leucopénie Fœtus = avortement et malformation Entérocyte (crypte) = diarrhée sévère
Maladies d’importance dans les Parvoviridae?
Panleucopénie féline
Parvovirose canine
Parvovirose porcine
*Agent étiologique: Porcine parvovirus 1 (PPV1)
Comment fonctionne les Papillomavirus?
BIBLE
Virus qui transforme les cellules épithéliales qui finiront par produire des masses tumorales généralement bénignes (verrues) chez une multitude d’espèces
Exemple de la bouche chien pleine de masse tumorale sur les muqueuses. À ce moment là, ça devient problématique
Maladies d’importance des Adenoviridae?
BIBLE
Hépatite infectieuse canine
Hépatite corps d’inclusion(IBH)
Syndrome de la chute de ponte (canard)
Comment se passe l’infection par Adenoviridae?
Normalement, infection localisée (digestif, respiratoire, urinaire) SAUF chez le chien
Plusieurs sérotypes, la plupart du temps asymptomatiques
Vrai ou faux: les Herpesvirus infectent rapidement et disparaissent ensuite?
BIBLE
Faux! Tendance à la latence; infecté une fois, infecté pour la vie
Quels systèmes sont infectés par Herpesviridae?
BIBLE
Problèmes mucocutanés, respiratoires, reproducteurs et neurologiques
Transformations tumorales parfois
Maladies d’importance Herpesviridae?
BIBLE Herpès B (virus B) Rhinotrachéite infectieuse bovine Rhinotrachéite infectieuse féline Pseudorage (Porc) (MADO) (avortements) Catarrhe malin des bovins Maladie de Mareck (volaille) Maladie hémorragique du chiot Rhinopneumonie équine
Poxviridae
Maladies d’importance?
Dermatose nodulaire contagieuse (Lumpy skin disease) MADO
Clavelée ou variole caprine (sheep and goat cowpox) MADO
Pseudo variole
Ecthyma contagieux du mouton
Types de lésions associés aux Poxvirus?
Type vésiculaires et pustulaires.
Souvent observés suite à la vaccination contre la variole.
Plus gros virus (300nm)
(truc: POXvirus et PUStulaire: dans les deux cas tu POStillonnes à fond quand tu les dis. Pis pour vésiculaire, tu t’arranges pour l’associer avec)
Comment se fait la classification des virus?
Domaine Règne Embranchement Classe Ordre
Quelle méthode a permis de découvrir de façon fulgurante plusieurs virus dans les dernières années?
BIBLE
Séquençage à haut débit, une nouvelle approche révolutionnaire
L’une des caractéristiques des herpesvirus est de produire des infections virales latentes. Ainsi, les chats infectés (et donc porteurs) par l’herpesvirus félin de type 1 (FeHV1, agent étiologique de la rhinotrachéite infectieuse féline) peuvent réexcréter le virus suite à sa réactivation. Ainsi, veuillez nommer les trois conditions qui sont très bien documentées et qui favorisent la réactivation du virus et donc sa réexcrétion:
BIBLE
- Traitement aux glucocorticoïdes (70%)
- Lactation (40%)
- Changement d’habitat (18%)
- Réaction spontanée (1%)
Nommer deux techniques qui permettent d’identifier un virus
BIBLE
ELISA et PCR
Qui sont les virus à ADN?
Adenoviridae (ADeNo) Asfaviridae Anelloviridae Alloherpesviridae Herpesviridae Hepadnaviridae (dna=ADN) Iridoviridae Papillomaviridae Parvoviridae Poxviridae
4A, 3P, 2H, 1I
Qui sont les virus à ARN?
Reoviridae Birnaviridae Orthomyxoviridae Paramyxoviridae Pneumoviridae Rhabdoviridae Filoviridae Bornaviridae Coronaviridae Tobaniviridae Arteriviridae Ordre Bunyavirales Arenaviridae Hantaviridae Nairoviridae Picornaviridae Calciviridae Astroviridae Avastrovirus Togaviridae Flaviviridae Retroviridae Nodaviridae Picobirnaviridae Hepeviridae Kolmioviridae
Quel est le principe d’une infection mixte?
Ce sont des interactions entre les pathogènes, faisant en sorte que certaines maladies vont pouvoir s’exprimer.
Destruction et/ou modulation des cellules de l’hôte par le premier pathogène donne l’avantage au second pathogène
Exemple; Virus se lie à Strep suis et ensuite à une cellule. Comme les virus entrent dans les cellules, il va apporter Strep suis avec lui.
Pourquoi l’étude des virus est importante?
- Démontrer l’origine virale d’une infection, donc procéder à son diagnostic
- Pour réaliser une prophylaxie et préparation d’un vaccin
(diagnostic - prophylaxie - préparation vaccin)
Déf de prophylaxie: Ensemble des mesures à prendre pour prévenir les maladies.
Comment détecter des antigènes viraux?
ELISA de capture
Lateral flow device (SNAP en clinique)
Immunofluorescence
Immunoperoxidase
Principale difficulté lors de l’extraction du génome viral?
séparer les acides nucléiques viraux des autres sources d’acides nucléiques
Quel virus à tendance à la latence?
Herpesviridae
Quels systèmes les Parvoviridae affectent-ils principalement?
Systèmes immunitaire et digestif
