Virology Flashcards
3 parties de la structure des virus
- enveloppe
- capside
- acide nucleique
les virus sont des agents infectieux qui
- affectent tous les organismes
- sont impliquer dans de nombreuses pathologies
- il ya des nouveaux virus
description de virus extracellulaire
molécule organique qui sont inertes, et ne possède pas de métabolisme
description de virus intracellulaire
réactions et molécules caractéristique des organismes vivants. réplication d’acides nucléiques, composition protéique
définition de virion
structure acellulaire, unité infectieuse de base
comment les virus sont the parasites intracellulaires obligatoires
il monopolisent les activités cellulaires pour produire des particules virales
origine evolutive des virus
sujet à des débats
caractéristique de virus
- nombre limitée d’espèces moléculaire
- acide nucléique
- capside
- enveloppe (fréquente)
différence entre cellules et virus
- ils ont l ADN ( 1 ou 2) ou l ARN ( 1 ou 2)
quels sont les formes virales d’acide nucléique
- circulaires
- linéaires
- uniques
- multiple
quel est la taille de l’acide nucléique
4 à 1200 kb
peut aller jusqu’a 2.5e3 kb
1 gène = 1kb
présents chez tous les virus
combien de bp e coli
4e3 kb
combien de bp homo sapiens
3.2e6 kb
haploide ou diploide?
haploide, mais quelque diploide
role de l acide nucleique virale
porter l info gen.
- proteine de structures
- enzymes
- reprogrammation cellulaire
description de capside
structure protéique extérieur à l’acide nucléique
assemblage de capsomères = donne la forme au virion
définition de capsomères
sous unités structurales
type de symétrie de la capside
- polyèdrale
- hélicoidale
- binaire (mixte complexe)
description de capside polyèdrale
- icosaèdre = 20 côtés
- assemblage de triangles
- rapport surface/volume élevé
- donne des virus de taille varié ( polio, fièvre aphteuse
quels sont les 3 types de capsomèsres
- faces
- arêtes
- sommets
description de capside hélicoidale
- 1 type de capsomère
- assemblage hélicoidal autour de l’acide nucléique
- batonnet creux
exemple de virus avec une capsule hélicoidale
- virus de la mosaique du tabac
- rage
- oreillons
- rougeole
- Ébola
- Bactériophage M13
description de capside binaire
- ils ont 2 types de symétries
- ils sont exclusif aux bactériophages
- ils sont une tête polyèdrale, queu hélicoidales
- assemblage complexe
Exemple de bactériophage
T paires (2,4,6...) E coli DT1 streptococcus thermophilus
Rôle de la capside
- protection de l’acide nucleique
- attachement à la cellule cible
- présente chez tous les virus
quels sont les parties du virus qui s’attache au cellule
protéine de capsides
fibre et spicules
queu
description des enveloppe
structure fréquente
- membrane extérieure de la capside
d ou provient l’enveloppe
de la membrane cytoplasmique ou nucléaire de la cellule infectée - elle est liée au mécanisme de sortie
composition de l’enveloppe
phospholipides
proteines cellulaires
glycoproteines virales
définition de péplomère
glycoprotéines virales
ex du virus de l’influenza
- hémagglutinine ( agglutine les hématies)
- neuramidase ( digère acide neuraminique)
- identifier selon leur type H+N
- H1N1
- H+N utilise pour faire les vaccins
rôle de l’enveloppe
protection ( hémagglutinine)
pénétration dans la cellule hôte ( neuramidase)
reconnaissance des récepteurs spécifiques sur la cellules hôte
définition d’un virion
acide nucléique + capside
nucléocapside
acide nucléique + capside
enveloppe taille
10-400nm ou 0.01 à 0.4 um
mimivirus 600 à 1000 nm
description de la réplication virale
- différent de la reproduction
- il n y a aucune croissance
- production de répliques
- assemblage de constituants viraux
description du cycle viral ( APRAS)
- adsoprtion à la surface de la cellule
- pénetration
- replication des constituants viraux
- assemblages des constituants viraux
- sortie des virus
description d adsorption à la surface de la cellule
- reconnaissance: réversible collision au hasard force électrostatique - Attachement: irréversible complémentarité virus: récepteur récepteur sont spécifique/tropisme
exemple virus- recepteur
phage λ = lamB
VIH CD4/CCR5
Rage: récepteur d’ach
exception d’adsorption
virus de plante
absence de récepteur connus
utilise les piqure d’insecte/abrasion mécanique
description de la pénétration
penetration de l’acide nucléique la capside reste à l’exterieur (bactériophage)
libération de la nucléocapside
décapsidation
liberation de l’acide nucléique au niveau du cytoplasme ou noyau
description de la penetration des virus animals
fusion directe
endocytose (viropexie) = phagocytose
quels sont les évènement de la replication
précoces et tardifs
description évènement tardifs
enzyme de replication et de lecture de l’acide nucléique
ici on produit l’acides nucléique en grande qté
description des évènements tardifs
les protéines de structure
capsomère, glycoprotéines d enveloppe, protéines de queue enzyme de lyse
description d’assemblage des constituants viraux
c’est l’encapsidation
polyèdrale ou helicoidale
description de l’encapsidation polyédrale
interaction capsomères acides nucléique
fermeture de la capside
si il y a une erreur: transduction généralisée
description de l’encapsidation hélicoidale
interaction capsomères-acide nucléique ( empilement hélicoïdal)
description de l’encapsidation binaire
queue et capside
assemblage indépendants
description de sortie des virus
- lyse
- bourgeonnement
- canaux cellulaire
lyse cellulaire
virus nus - mort cellulaire
bourgeonnement
virus enveloppés survie de la cellule
canaux cellulaire
virus à réplication nucléaire, survie de la cellule
nombres de virus que peut produire une cellule
1e3 à 1e6
T paires 1e2 à 1e3
comment on classifie les virus
- type acide nucléique
- présence d enveloppe
- processus de réplication des acides nucléiques
- taille
- nombres de capsomères
- propriètés immunologiques
- nombres de gènes/carte génomique
- site de réplication, tissus ou l’hote
Nomenclature des virus
Linéenne
Ordre des virus
Virales
famille
viridae
autre famille et genre
picornavirus
hepadnavirus
tobamovirus
ex de tobamovirus
tobacco mosaic virus
origine des virus
ADN égoïstes spécialisés
Nombre d’erreur élevé des polymérases
description de l ADN égoïstes
autopropagation
acquisition de gènes ( capsides)
description de nombres d’erreurs élevé des polymérases
évolution rapide (ex, VIH variation intrapatient)
environnement ou on retrouve le plus de virus
Océans
1e6 à 1e9 virion/ml
1mm de surface = 3e31
entités biologiques les plus abondantes dans la biospère
utilité des virus dans la nature
participe au cycles de C N ce sont des sources de nutriments
quels est la fonction écologiques des virus
contrôle de la population ( mono espéce)
ex marées d’algues rouges
description de viroides
Les viroïdes sont des agents subviraux qui existent à l’intérieur des cellules en tant que particules d’ARN uniquement, sans capside ni enveloppe. Ils n’ont qu’un seul ARN circulaire qui contient très peu de nucléotides (250 à 400), leur génome s’organise en bâtonnet (génome à 70 % apparié). Leur ARN ne code aucune protéine. Contrairement au virus dont l’ARN peut être copié dans le cytoplasme ou le noyau, l’ARN des viroïdes est copié dans le noyau ou dans les chloroplastes, selon la famille. Cette réplication se fait grâce aux enzymes de la cellule hôte comme les ARN polymérases.
description de prions
Un prion est un type d’agent pathogène de nature protéique (constitué d’une protéine ayant adopté une conformation ou un repliement anormal) qui au contraire des agents infectieux conventionnels tels que les virus, les bactéries ou encore les parasites, est exempt d’acide nucléique (ADN et ARN) comme support de l’information infectieuse