Virologie Flashcards
Caractéristique des Poxviridae (ADN)
lésions vésiculeuses
Maladies d’importance:
- pseudo variole
- Ecthyma contagieux du mouton
Caractéristiques des Herpesviridae (ADN)
Tendance à la latence (difficile de contrôler les populations) Signes cliniques : - prob mucocutanés (ulcère) - Prob respi - Prob reproducteur - prob neurologique Maladies d'importance : - Rhinotrachéite infectieuse bovine et féline - Rhinopneumonie équine
Caractéristiques des Adenoviridae (ADN)
infection localisée (sauf chien) souvent asymptomatique Maladie d'importance : - hépatite infectieuse canine - syndrome de la chute de ponte
Caractéristiques des Papillomaviridae (ADN)
Transforme les cellules épithéliales qui finiront par produire des masses tumorales généralement bénignes (verrues)
Caractéristiques des Parvoviridae (ADN)
Se réplique ds les cellules en phase de division active
Maladies d’importance :
- Panleucopénie féline
- Parvovirose canine et porcine
Caractéristiques des Iridoviridae (ADN)
Infectent différentes espèces de bactraciens et de poissons.
Réplication dans le cytoplasme.
Cause souvent des lésions de type tumorale.
Caractéristiques des Asfarviridae (ADN)
African swine Fever
Lésions de type hémorragique sous forme de pétéchies.
Caractéristiques des Circoviridae (ADN)
ADN circulaire
Maladie d’importance :
- Syndrome de dépérissement en post-sevrage du porc (SDPS)
Caractéristiques des Hepadnaviridae (ADN)
Maladie d’importance :
- Hépatite B
Peu d’importance en medvet
Caractéristiques des Anelloviridae (ADN)
Associé au Gyrovirus
Maladie d’importance
- Anémie infectieuse du poulet
Caractéristiques des Alloherpesviridae (ADN)
Hôtes : diverses espèces de poissons
Caractéristiques des Reoviridae (ARN)
Respiratory-enteric-oprhan
Hôtes : mammifère, insectes, plantes, poissons
Certains transmis par des insectes piqueurs.
Maladie d’importance:
- Gastroentérite à rotavirus
Caractéristiques des Birnaviridae (ARN)
Espèces cibles : volailles, poissons, mollusques et insectes
Maladie d’importance :
- Bursite infectieuse du poulet
- Pancréatite infectieuse du poisson
Caractéristiques des Orthomyxoviridae (ARN)
Divisé en 7 genres
Le plus importante : Alphainfluenzavirus (grippe)
Myxo pour «mucus».
Transmission : oral-fécal, aérosol.
Maladie d’importance :
- influencavirus équin, aviaire et porcin
- Influenza aviaire hautement pathogène
Caractéristiques des Paramyxoviridae (ARN)
Maladie d’importance :
- Parainfluenza bovin 3
- Sendai
- Oreillon
- Rougeole
Caractéristiques des Pneurviridae (ARN)
Virus : virus respiratoire syncytial bovin
Caractéristiques des Rhabdoviridae (ARN)
Rhabdo = bâtonnet ou forme cylindrique. (balle de fusil). Certains transmis par insectes Maladie d'importance : - Lyssavirus (rage) - Vésiculovirus - Ephemorovirus
Caractéristiques des Filoviridae (ARN)
En forme de fil. Zoonose transmis des singes à l’humain.
Transmission par contact direct, rarement aérosol.
Mortel pour l’homme
Carctéristiques des Bornaviridae (ARN)
Maladie d’importance :
- Maladie de dilatation du proventricule (perroquet)
Caractéristiques des Coronaviridae (ARN)
En forme de couronne. Systèmes infectés: - Respiratoire, digestif Maladie d'importance : - Diarrhée épidémique porcine - Gastroentérite transmissible du porc - Péritonite infectieuse féline
Caractéristiques des Arteriviridae (ARN)
Artérite.
Se réplique préférentiellement chez les macrophages, spectre cellulaire très petit.
Capable de causer des problèmes de reproduction chez plusieurs espèces
Maladie d’importance :
- Artérite virale équine
- Virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin
Caractéristiques des Hantaviridae (ARN)
Zoonoses importantes et mortelles.
Presque toutes transmis par des insectes.
Se caractérise par des encéphalites avec des symptômes hémorragiques multiples, également problèmes respiratoires.
Maladie d’importance :
- Fièvre hémorragique et syndrome rénale
Caractéristiques des Arenaviridae (ARN)
Zoonose en majorité et souvent mortelle. Réservoir : rongeurs Contact direct et matériel contaminé Maladie d'importance : - LCMV (virus de la lymphochorioméningite)
Caractéristiques des Picornaviridae (ARN)
plus petit virus ARN.
Maladie d’importance :
- Fièvre aphteuse
- Polomyélite
Caractéristiques des Caliciviridae (ARN)
Se retrouve chez plusieurs espèces de mammifères, reptiles, amphibiens et insectes. Maladie d'importance : - Exanthème vésiculaire du porc - Calicivirose féline - Maladie hémorragique du lapin
Caractéristiques des Astroviridae (ARN)
Peu d’importance en santé animale.
Infection asymptomatique du système digestif, sinon présente en légère gastroentérite car lyse es entérocytes matures.
Caractéristiques des Togaviridae (ARN)
Transmis par insectes piqueurs et causent des zoonoses potentiellement mortelles.
Peu causer des encéphalites légères à mortelles chez l’humain.
Maladie d’importance :
- Encéphalomyélite équine vénézuelienne (VEE)
- Encéphalomyélite équine de l’est (EEE)
Caractéristiques des Flaviviridae (ARN)
Certains transmis par des insectes piqueurs.
Plusieurs zoonoses pouvant être mortelles.
Causent : encéphalite, fièvre hémorragique, gastroentérite, maladie congénitale et systémique
Maladie d’importance :
- Peste porcine classique
- Diarrhée virale bovine et maladie des muqueuses
Caractéristiques des Retroviridae (ARN)
Génome viral s’intègre à celui de son hôte : provirus.
Induit des lésions tumorale
Plusieurs produisent infections lentes.
Prédilection à infecter les cellules monolymphocytaires
Caractéristiques des Nodaviridae (ARN)
Pas d’importance medvet
Infecte principalement des arthropodes et quelques espèces de poissons.
Caractéristiques des Picobirnaviridae (ARN)
Pas d’importance medvet
Infectent oiseaux et mammifères
Caractéristiques des Hepeviridae (ARN)
Peu d’importance medvet.
Hépatite E.
impliqué dans des zoonoses mortelles du porc à l’humain
Caractéristiqes des Deltairus (ARN)
peu d’important medvet
Virus de l’hépatite D humain
Quelle est la méthode phare par excellence qui est utilisée pour identifier de nouveaux virus et faire la surveillance des maladies virales ?
La biologie moléculaire
- PCR
- Séquençage Sanger
- Séquençage à haut débit
Principes acceptés par la communauté scientifique pour les infections mixtes
- Destruction et/ou modulation des cellules de l’hôte par le premier pathogène donne l’avantage au second pathogène
- Immunomodulation
- Destructions des cellules du systèmes immunitaires, épithéliales des voies respiratoires, etc.
(La réalité est plus complexe, par les interactions pathogènes-patho donnent des résultats inattendus)
2 raisons pour lesquelles faire l’étude des virus est nécessaire ?
1) Démontrer l’originale virale d’une infection, donc procéder à son diagnostic
2) Pour réaliser une prophylaxie et préparation d’un vaccin
2 principes majeurs en regard du diagnostic des maladies infectieuses virales
1) Détection des pathogènes (Méthode : PCR)
2) Détection des anticorps (méthode : ELISA)
Par quelle technique se fait la détection des antigènes viraux (par tests immunologiques)
ELISA de capture
Lateral flow device
Immunofluorescence
Immunoperoxidase
Nommer les avantages et désavantages de la microscopie électronique
Avantages : non spécifiques donc permet de visualiser tous les virus
Désavantages : peu sensible donc nécessite un échantillon clinique contenant beaucoup de particules virales (si analyse directe)
Quelle est l’approche la plus utilisée en diagnostic moléculaire
PCR en temps réel ou PCR quantitatif
Nommer les avantages et désavantages de la PCR
Pour :
- haute sensibilité et spécificité
- peut différencier les génotypes d’un même pathogène
- Plus rapide que l’isolement pour confirmer la présence d’un pathogène quelconque
Contre :
- Personnel hautement qualifié
- Risque de contamination donc présence de faux positifs
- Présence de nucléases
- Faux négatifs
Pour quelle raison on fait le séquençage de type Sanger
Pour le suivi et l’identification de plusieurs pathogènes sur une base régulière au LDM (wtf is LDM, idk?)
Quels sont les virus ciblés par les industries de production animale pour faire un suivi épidémiologique moléculaire (séquençage)
Porcin :
- Virus du syndrome reproducteur et respiratoire porcin
- Influenzavirus procin
Aviaire :
- Réovirus aviaire
- Virus de la bronchite infectieuse aviaire
Vrai ou Faux
Le séquençage à haut débit (SHD) est une approche très puissante mais demande une expertise élevée et est pour le moment relativement dispendieux dans un contexte de diagnostic de routine
VRAI
Quels sont les défis techniques du SHD pour le diagnostic
1- Diminuer la contamination par le génome de l’hôte et d’autres sources
2- Diminuer les coûts de la procédure
3- être capable d’analyser la grande quantité de données (bio-informatique)
Quelle est la principale difficulté lors de l’extraction du génome viral
Séparer les acides nucléiques viraux des autres sources d’acides nucléiques
En quoi consiste les analyses bio-informatiques des données ?
- aligner les lectures au génome de référence de l’hôte et garder uniquement celles qui ne s’y alignent pas.
- Faire parallèlement un assemblage de novo et un alignement sur des génomes de références du virus ciblé avec les lectures restantes.
- Construire les matrices de distances, de similarités et les arbres phylogéniques des génomes entiers.
Qu’est-ce que permet l’isolement virale
Permet de découvrir de nouveaux agents viraux
L’isolement virale peut être fait à partir de quoi
- Inoculation à des animaux de laboratoire
- Inoculation In Ovo
- Inoculation dans des cultures cellulaires
Étapes de l’identification du virus suite à son isolement
- Visualisation des virus en microscopie électronique
- Détection des antigènes
Comment se fait l’évaluation de la réponse en anticorps (tests sérologiques)
Titrage d’anticorps contre un virus
méthode sérique : ELISA,séroneutralisation, immunofluorescence
Comment envoyer les spécimens au laboratoire pour isolement viral
- Le plus rapidement possible
- gelé ou réfrigéré le plus rapidement possible après collection
- milieux souhaitable ppour transport : solution saine, lait écrémé stérile, antibio, écouvillon
- Tissus : séparer les pièces d’intestin des autres organes pour éviter contamination bactérienne.
Comment envoyer les spécimens pour les tests sérologiques
- sérums pairés
- laisser l’échantillon se coaguler à la température de la pièce
- Centrifuger l’échantillon et transférer le sérum dans des tubes stériles aussi aseptiquement que possible
- Réfrigérer l’échantillon et l’envoyer au labo ds la glace
Comment envoyer les spécimens pour l’histopathologie
- Pour exam histopatho traditionnel : tissu ne peut être congelé. Placer des sections de tissus de 2-3cm dans 10% de formaline.
Types d’info qui doient accompagner l’échantillon jusqu’au labo
- espèce animal,
- âge, sexe
- grandeur du cheptel
- nbr d’animaux infectés
- etc
Échantillons avec charges virales moyennes les plus élevées
amygdales ceacales
tissus
trachées
poumons
Quels virus de chien et/ou chat sont reconnus pour infecter les animaux de la famille Mustelidae ?
- Virus Distemper
- Virus de la rage
- rétrovirus félins
- Parvovirus canin
- Herpèsvirus félin
- Calicivirus félin
- Virus Distemper
- Virus de la rage
- Herpèsvirus félin
- Calicivirus félin
Quelles familles virales sont reconnues tout particulièrement comme étant responsable de provoquer des lésions au niveau mucocutanée chez de nombreuses espèces animales ?
- Poxviridae
- Adenoviridae
- Herpesviridae
- Caliciviridae
- Flaviviridae
- PIcornaviridae
- Poxviridae
3. Herpesviridae
