Viktiga ord

Question 1

Behövs för att proteiner ska hitta rätt.

Answer 1

Sorting signal, antingen:
- signal sequence (linjär aa-sekvens på N-terminal)
- signal patch (3D-struktur)

Question 2

Den typ av transport som medieras av ett translokas.

Answer 2

Protein translocation

Question 3

Känner igen signal sequences vid transport in i ER.

Answer 3

Signal recognition particle, SRP

Question 4

Binder till SRP vid transport in i ER.

Answer 4

SRP-receptor

Question 5

Klyver signalsekvensen när ett protein kommit in i translokaset.

Answer 5

Signalpeptidas

Question 6

Proteintranslokaset i ER.

Answer 6

• Sec61-komplexet (co-translational protein translocation).
• Sec61-komplexet + Sec62-Sec63-komplexet (post-translational protein translocation).

Question 7

Protein som drar proteinet genom translokaset vid post-translational protein translocation, hjälper till med veckning och ser till att veckningen är korrekt.

Answer 7

Binding protein, BiP.

Question 8

Proteiner som stannar kvar i ER.

Answer 8

ER resident proteins

Question 9

Signal som ser till att vissa proteiner stannar kvar i ER.

Answer 9

ER retention signal

Question 10

Addition av socker till protein.

Answer 10

Glykosylering

Question 11

Det socker som adderas till protein vid glykosylering.

Answer 11

Prekursor-oligosackarid.

Question 12

Den aminosyra som prekursor-oligosackariden adderas till vid N-länkad glykosylering.

Answer 12

Asparagin

Question 13

Förankrar prekursor-oligosackariden i membranet bredvid translokaset i ER.

Answer 13

Dolichol

Question 14

Det enzym som adderar prekursor-oligosackariden till proteinet.

Answer 14

Oligosaccharyltransferas

Question 15

Två exempel på protein som binder till protein med N-länkade oligosackarider, samt de enzym som klyver av och adderar glukos.

Answer 15

Detta sker i ER:

Calnexin (hanterar membranproteiner) och calreticulin (hanterar lösliga proteiner).

Glukosidas (klyver), glycosyl transferase enzyme (känner av veckning och adderar vid behov en ny glukos).

Question 16

Två protein som känner igen om ett protein är inkorrekt veckat och via translokas ser till att proteinet transporteras ut ur ER.

Answer 16

Chaperoneprotein och lektiner.

Question 17

Det protein som ser till att ett inkorrekt veckat protein som transporterats ut från ER inte tar sig tillbaka in i ER.

Answer 17

E3-ubiquitinligas.

Question 18

Proteinkomplex som utför proteolys.

Answer 18

Proteasom.

Question 19

Fyra olika coats som täcker vesiklar till och från Golgi-apparaten.

Answer 19

1. Clathrin (Golgi -> endosom eller plasmamembran -> endosom -> Golgi)
2. COPI (Golgi -> Golgi)
3. COPII (ER -> Golgi)
4. Retromer (endosom -> Golgi)

Question 20

Protein som bestämmer vad som ska transporteras i vesiklarna.

Answer 20

Adaptin/adaptorprotein.

Question 21

Adaptorproteinerna binder till dessa.

Answer 21

Fosfoinositid, PIP.

Question 22

Det bäst utforskade adaptorproteinet.

Answer 22

AP2.

Question 23

De böjningar som formas i membranet när coating proteins binder in.

Answer 23

Coated buds
Coated pits i plasmamembranet

Question 24

Det protein som binder vid vesikelns bas och knipsar av den från membranet med hjälp av GTP-hydrolys.

Answer 24

Dynamin.

Question 25

Ytmarkörer som hjälper vesikeln att hitta rätt och fusera med målmembranet.

Answer 25

Rab-proteiner hjälper vesikeln hitta rätt:
Rab-GTP på vesikel, Rab effector på membranet.
SNARE-proteiner hjälper vesikeln att fusera med membranet:
- v-SNARE
- t-SNARE
- trans-SNARE-komplex

Question 26

Det som behövs för att få trans-SNARE-komplexet att dissociera.

Answer 26

NSF och accessoriska proteiner.

Question 27

Den plats på ER där vesiklar till Golgi uppstår.

Answer 27

ER exit sites

Question 28

Det som bildas när vesiklar från ER till Golgi fuserar.

Answer 28

Vesicular tubular clusters

Question 29

Den sorts transport som tar ER resident proteins tillbaka till ER om de råkat komma med i en vesikel till Golgi och de signaler som krävs.

Answer 29

Retrieval transport, retrieval signals.

Question 30

Den retrieval signal som de lösliga ER-proteinerna bär, samt dess receptor

Answer 30

KDEL-sekvensen, KDEL-receptor.

Question 31

Proteiner som stannar kvar i Golgi-apparaten.

Answer 31

Golgi-resident proteins.

Question 32

Den sekretoriska väg som förser plasmamembranet med lipider och proteiner och kan sekretera direkt till cellens utsida.

Answer 32

Constitutive exocytosis pathway.

Question 33

Den sekretoriska väg som bara finns i sekreterande celler.

Answer 33

Regulatory exocytosis pathway.

Question 34

Ett samlingsnamn för de enzym som finns i lysosomen.

Answer 34

Lysosomala hydrolaser.

Question 35

Den markör som finns på de lysosomala hydrolaserna och ser till att de går till en endosom (för att sedan gå till en lysosom)

Answer 35

Mannos-6-fosfat, M6P

Question 36

Det steg som den synaptiska vesikeln genomgår vid plasmamembranet för att vara redo för snabb exocytos.

Answer 36

Priming step.

Question 37

Det protein som hjälper till att hålla SNARE-proteinerna löst bundna till varandra i pre-synapsen.

Answer 37

Complexin.

Question 38

De fyra vägarna som lysosomen kan få material att bryta ner ifrån.

Answer 38

1. Endocytos
2. Fagocytos
3. Makropinocytos
4. Autofagi