VB HC's Flashcards
Mammals
zoogdieren
Blymfocyten
Maken antilichamen
Transcriptie regluators
Eiwitten die binden aan een specifieke DNA sequentie en de gentranscriptie reguleren, in heel veel organismen werken heel veel van deze regulators samen
Promotor region
Dit bindt het enzym DNA polymerase en zorgt ervoor da de enzym aan zijn taak, een RNA kopie maken het gen, begint, hebben een transcription initiatation site en een recognition site
Regulatory DNA sequences
Deze worden gebruikt om de genen aan en uit te zetten
Transcription regulators
Deze eiwitten moeten de sequentie van het DNA herkennen om het te laten werken, binden aan de control region van een gen
Operons
Een cluster van genen op het chromosoom, deze worden getranscribeerd van een enkele promotor als 1 lang mRNA teken
Operator
Een korte DNA sequentie die wordt herkent door een transcriptie regulator, als deze bindt dan blokkeert de toegang naar de promotor voor RNApolymerase
Tryptophan respressor
De transcriptie regulator, deze kan alleen aan DNA binden als hij al gebonden is aan tryptophan, een allosteric protein
Transcriptional repressor protein
Het zet genen uit/represses them, in actieve vorm
Transcriptional activator protien
Zet genen aan als het in actieve vorm is
Enhancer
De DNA sites waar activators aan binden, het kan ver weg van de promotor zitten maar het DNA wat er dan tussen zit loops out
Mediator
Deze eiwitten functioneren als adapter om de loop te sluiten
Transcription initiation complex
Alle eiwitten die samen het RNA polymerase en de general transcriptiefactoren bij de promotor houden
Histone acetyltransferase
Het promoot de aantrekkingkracht van fosfaatgroepen naar lysines in de staart van histon eiwitten
Histon deacetylase
Enzymen die de acetyl groep juist weghalen
Cell memory
De veranderingen in de genexpressie moeten worden onthouden van de cel, wanneer een cel commited is to differentiatie dan wordt dat ook gehandhaafd door de verdere celdeling, daarom moet dit onthouden worden door de cellmemory
Combinatorial control
Het proces waarbij meerder (heel veel) transcriptie regulatoren samen werken om de expressie van een gen te laten voorkomen, het kan verschillende cel type genereren
Hitherto
Tot nu toe
Induced pluripotent stem cells (iPS)
Gereprogrammeerde cellen die zich gedragen als normale stamcellen en dus nog van alles kunnen worden
Terminally differentiated
Cellen die niet meer delen zodra ze gedifferentieerd zijn (skeletspiercellen en levercellen)k
Positive feedback loop
Een master transcriptie regulator activeert de transcriptie van het eigen gen zodat de dochter cellen weten welke cellen zij moeten worden
Epigenetic inheritance
De cellmemory die van moeder tot dochter cel wordt overgedragen
Posttranscriptional controls
Checkpoints die plaats vinden na de transcriptie
MicroRNA
MiRNA, kleine RNA moleculen die de genexpressie reguleren door te ‘paren’ met specifieke basen en hun stabiliteit en translatie verminderen
RNA interference
RNAi, een vorm van RNA targeting, het houdt de destructieve elementen van RNA in toom
RNA targeting
Het proces waarbij translatiepatronen, locaties en degradatie van het RNA kan veranderen
Small interfering RNAs
siRNAs, double stranded RNA moluculen die voort gekomen zijn uit de eerste stap van RNA interfering, worden gescheiden door het enzym RISC, ze worden gebruikt om complementaire RNA moluculen op te sporen en te vernietigen, zo wordt geinfecteerd RNA opgeriumd
Long non coding RNA
Meer dan 200 nucleotiden lang, het speelt een sleutelrol in de X/inactifatie
Centromeren
Zorgt ervoor dat het dna kan splitsen tijdens de M-fase, het midden van het kruis
Nucleolus
Stukken chromosoom die genen bevatten die coderen voor ribosomaal RNA
M-fase
Het Dna krult op om zo mitotische chromosomen te vormen
Chromatine
Het complex van DNA met de histonen
Histonen
Eiwitten waar DNA omheen zit, Zijn verantwoordelijk voor de formatie van de nucleosoom, Ze zijn positief geladen terwijl DNA negatief geladen is, daarom vormen ze ionbindingen (zoutbruggen)
Chromatine fiber
Nucleosomen veranderen DNA in de interfase hierin, ze bevatten clusters van nucleosomen, DNA om de histonen, dat niveau
Linker DNA
DNA dat tussen twee nucleosoomkernen zit, het houdt de kernen bij elkaar, het DNA dat je ziet bij het ‘beads-on-a-string’ plaatje, het DNA dat niet om de histonen zit
Chromatne-remodeling complexes
Zo een groen komma, door middel va ATP kunnen ze bewegen en zo het DNA wel of niet bereikbaar te maken
Histone modifying enzymes
Zorgen voor de modificatie van de histonen zodat ze bruikbaar zijn
Interfase chromosoom
langgerekt, tijdens de replicatie of transcriptie
Replication origins
Specifieke DNA sequenties waar de initiator proteins aan binden in het begin van de DNA synthese
Replicatievork
De vorm die ontstaat wanneer de strengen van het DNA worden gesplitst door de initiator proteins
DNA polymerase
Een enzym dat katalyseert het proces waarbij er nucleotide aan de 3’ kant worden geplakt op basis van de parental strengen
Lagging strand
De DNA streng die wordt gesynthtiseerd van de 3’ naar de 5’ kant (de verkeerde richting)
Leading strand
De DNA streng die wordt gesynthetiseerd van de 5’ naar de 3’ kant (de goede kant op dus)
Primase
Het enzym dat de primer (voor het begin van de maak van RNA aan de hand van DNA) synthetiseert
RNA
RiboNucleic Acid
Nuclease
Verwijdert de primer die geplakt zit aan de lagging strand bij de synthese van RNA
DNA ligase
Plakt de Okazaki fragmenten aan elkaar
DNA helicase
Haalt de twee DNA strengen uit elkaar zodat ze afgelezen kunnen worden en RNA kan worden gemaakt
DNA topoisomerase
Het enzym haalt de tension weg die is ontstaan doordat de helicase de twee strengen uit elkaar wilde halen, het maakt een gat in de leadingstrand en maakt deze later weer heel
Sliding clamp
Zorgt ervoor dat de DNA polymerase niet van de strand afvalt als deze aan het synthetiseren is
Clamp loader
orgt ervoor dat slising clmap kan binden door ATP te hydrolyseren
SIngle-strand DNA binding protein
Bindt de single DNA strands weer aan elkaar na de synthese
Telomeren
Repeterende sequenties aan het eind van den DNA dat eraan wordt gemaakt zodat de lagging strand ook helemaal kan worden afgelezen
Telomerase
Maakt de telomeren
Depurination
Een spontaan proces waarbij de purine base (A en G) uit het DNA gaan, het veroorzaakt het missen van tanden
Non homologous end joining
De gebroken DNA strengen worden heel snel aan elkaar geplakt, maar er is een risico omdat er vaak wel wat nucleotide verdwijnen en het DNA dus niet meer in de goede normale staat is zoals het was
Homologous recombination
Het princiepe waarbij een dubbel streng DNA dat gebroken is weer wordt gemaakt door middel van het schuiven, het is uitgelegd in de men. gen. hc’s
