Unité 3 Flashcards

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1
Q

C’est quoi la différence entre les purines et les pyrimidines?

A

Purine on 2 cycles - base A et G
Pyrimidines on 1 cycle - base C, U et T

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Q

C’est quoi l’unité de base de l’ADN?

A

Les nucléotides
- base azoté + sucre + groupe phosphate

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3
Q

Comment les nucléotides sont-ils liés?

A

Entre eux via les sucres et phosphates

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4
Q

Dans quel sens est lu l’ADN?

A

5’ - 3’

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5
Q

C’est quoi l’extrémité 5’?

A

La tête du brin
Le carbone 5 du désoxyribose du nucléotide est libre qui porte un groupement phosphate. C’est le premier nucléotide

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6
Q

C’est quoi l’extrémité 3’?

A

La queue du brin
Le carbone 3 du désoxyribose porte un groupe OH libre.
C’est le dernier nucléotide

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7
Q

C’est quoi la différence entre la liaison G-C et A-T?

A

G-C a 3 ponts hydrogènes donc lier plus fort ensemble
A-T a 1 pont hydrogène

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8
Q

Pourquoi est-ce que c’est important que les 2 brins d’ADN soit antiparallèles?

A

Pour pouvoir lire, transcrire et copier l’ADN

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9
Q

C’est quoi un génome?

A

Le génome est l’ensemble du matériel génétique d’un organisme.
Peu importe si les organismes sont cellulaires (ex. bactéries) ou non (ex. virus), qu’ils aient des génomes d’ADN, d’ARN ou que ce matériel soit extra-chromosomique.

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10
Q

Est-ce que tout les organismes ont le même génome?

A

Non

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11
Q

Quelles sont les caractéristiques de différents génomes?

A

• Types de nucléotides (ARN vs ADN)
• Taille
• Nombre de gènes codants
• Complexité (densité des gènes)
• Structure/composition
• Simple brin vs double brin
• Entouré d’un squelette protéique ou non
• Linéaire ou circulaire - bactérie = circulaire
• Matériel extra-chromosomique ou non

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12
Q

Quel organisme à le plus grand génome?

A

Protozoa

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13
Q

Les mimiviridae et pandoraviridae peuvent avoir jusqu’à plus de______ gènes.

A

2500

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14
Q

Le HIV possède environ ____ gènes?

A

10

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15
Q

C’est quoi l’ADN chez les procaryotes?

A

ADN condensé dans un nucléotide et le plasmide

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16
Q

Quelles sont les 4 étapes de la réplication de l’ADN?

A
  1. Origine de réplication
  2. Séparation des brins d’ADN
    • Hélicase, ADN gyrase (topoisomérase), protéines fixatrices
  3. Synthèse des nouveaux brins (directeur et discontinu)
    • Primase
    • ADN polymérase I et ADN polymérase III
    • Ligase
    • Élongation antiparallèle
  4. Correction et réparation
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17
Q

C’est quoi l’œil de réplication?

A

Le point de départ de la division d’ADN
où les brins commence à se séparer

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18
Q

Quelle est la forme des chromosomes des procaryotes et eucaryotes?

A

Procaryotes = chromosomes circulaire
Eucaryotes = chromosomes linéaire

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19
Q

C’est quoi l’origine de réplication des procaryotes?

A

Chromosome CIRCULAIRE
Un seul site d’origine (ori)
Séquence d’ADN spécifique, toujours la même

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20
Q

C’est quoi l’origine de réplication des eucaryotes?

A
  • Plusieurs sites de réplication (des milliers parfois)
  • Forment des RÉPLICONS
  • Séquences d’origine de réplication sont sûrement spécifiques aussi mais sont largement moins bien connues
  • Ordre de formation des réplicons n’est pas aléatoire, mais spécifique au type cellulaire!
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21
Q

Comment se fait la réplication d’ADN?

A

1- Séparer les brins d’ADN
• Hélicase, gyrase/topoisomérase, protéines fixatrices
2- Amorces d’ARN
• primase
3- Synthèse des brins directeur et discontinu
• primase
• ADN polymérase I et III (procaryote)
• ADN polymérase α, γ, δ, et ε (eucaryote)

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22
Q

Quelles sont les protéines ciblées durant la réplication d’ADN?

A
  1. ADN gyrase (topoisomérase): Diminue tension (2 brins) et enlève les noeux de l’ADN
  2. Hélicase: Sépare les brins
  3. Fixatrices: Stabilise, empêche le réappariement des 2 brins
  4. Primase: Synthétise amorces (primer) d’ARN
    - ajoute nucléotide d’ARN pour amorcer la réplication par l’ADN polymérase
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23
Q

Comment se produit la synthèse du brin directeur?

A

L’ADN polymérase III a besoin d’une amorce d’ARN pour commencer à synthétiser à partir de l’origine de réplication.
L’amorce d’ARN est ajoutée par la primase
Le brin directeur est synthétiser 5’-3’ par l’ADN pol III de façon continue, jusqu’à ce que la bulle de réplication fusionne avec la bulle adjacente.

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24
Q

Comment se produit la synthèse du brin discontinu?

A
  • La primase ajoute une amorce d’ARN.
  • Cette amorce permet à l’ADN polymérase III de commencer à synthétiser dans la direction 5’è3’ le brin discontinu, jusqu’à ce qu’elle arrive à la prochaine amorce puis se détache.
  • On appelle ce fragment nouvellement synthétisé un fragment d’Okazaki.
  • L’ADN polymérase I vient remplacer les amorces d’ARN par de l’ADN.
  • Cette polymérase travaille toujours dans le sens 5’-3’ et ne peut former le lien phosphodiester entre les 2 fragments d’Okazaki.
    -Une ligase vient lier les deux fragments d’Okazaki et complète la synthèse du brin discontinu.
25
Q

Que fait l’hélicase?

A

Déroule la double hélice parentale

26
Q

Que font les molécules de protéines fixatrice d’ADN?

A

Stabilisent les brins matrices qui ont été séparés

27
Q

Que fait l’ADN polymérase 3?

A

Synthétise de façon continue le brin directeur dans le sens 5’-3’

Synthétise les fragments du brin discontinu en partant de l’amorce d’ARN et ajouté des nucléotides d’ADN à l’extrémité 3’ de l’amorce

28
Q

Que fait la primase?

A

Commence la synthèse de l’amorce d’ARN du fragment d’Okazaki

29
Q

Que fait l’ADN polymérase 1?

A

Enlève l’amorce de l’extrémité 5’ du fragment et le remplace par des nucléotide d’ADN qu’elle ajoute un à un à l’extrémité 3’ du fragment.

30
Q

Question fait l’ADN ligase?

A

Joint l’extrémité 3’ du 2e fragment à l’extrémité 5’ du 1e fragment

31
Q

C’est quoi les extrémités des chromosomes d’ADN?

A

Télomères
• séquence de 6 nucléotides
• non codante
• répétée 500-5000 fois

32
Q

Que font les télomèrases?

A

sont les enzymes qui maintiennent la séquence de télomères
• Protège les extrémités
• Empêche les chromosomes de fusionner ensemble

33
Q

Comment se fait la correction des épreuves?

A

La polymérase refait la lecture de chaque base synthétisée au fur et à mesure qu’elle accomplit son travail, changeant le mauvais appariement quand elle le trouve (activité 3’-5’ exonucléase). C’est ce que l’on appelle la correction des épreuves (proofreading).

34
Q

Comment she fait la correction de mésappariement des bases?

A

Quand les nucléotides mésappariés échappent à la vigilance de la polymérase.
Endonucléase: coupe environ 30 pb où se trouve la « mutation ».
ADN polymérase: vient ajouter les nucléotides dans leur séquence correcte.
ADN ligase: catalyse la formation du lien phosphodiester entre les deux fragments discontinus.

35
Q

Comment est-ce qu’on condense 2 mètres d’ADN dans un noyau?

A

• L’ADN (2nm) est entouré autour d’histones
• 8 histones forment 1 nucléosome (fibre de 10nM)
• L’histone 1 permet de condensé davantage la chromatine (fibre de 30nM)
• Des boucles de fibre de 30nm forment des domaines en boucles (300nM)
• Lors de la mitose, la chromatine est à sont niveau le plus condensée (700nm)

36
Q

Quelles sont les 2 formes générales de la chromatine?

A

Euchromatine
• Peu condensée
• ADN plus accessible
• Transcription active
• Fibre de 30nm, 10nm lorsque Pol II passe

Hétérochromatine
- Condensée
- ADN peu accessible
- Peu de transcription

37
Q

Comment se fait la division cellulaire chez les procaryotes?

A

par fission binaire ou par bourgeonnement
• Reproduction de l’organisme entier
• Reproduction asexuée

38
Q

Comment se fait la division cellulaire chez les eucaryotes?

A

Par bourgeonnement ou par mitose
Chez les unicellulaires:
• reproduction de l’organisme en entier
• Reproduction sexué et/ou asexué
Chez les pluricellulaires:
• Production de nouveaux organismes par reproduction sexué
• Mais aussi de nouvelles cellules pour croissance, développement et réparation

39
Q

C’est quoi la fission binaire?

A

Division égale du matériel génétique ou contenu cellulaire.

40
Q

C’est quoi le bourgeonnement?

A

La division du contenu cellulaire n’est pas toujours égale

41
Q

Quels sont les concepts clés de la division cellulaire?

A

• Chez les eucaryotes, le cycle cellulaire est une séquence d’événements qui mènent à la division mitotique d’une cellule somatique.
• La plupart des divisions cellulaires génèrent des cellules filles possédant une information génétique (ADN) identique à celle de la cellule mère.
• Les événements du cycle cellulaire sont régulés par diverses protéines ou points de contrôle, qui stimulent ou inhibent la division cellulaire jusqu’à ce que les conditions soient propices à la phase suivante.
• Quand une cellule se spécialise (ou se différencie), elle cesse généralement de se diviser et «quitte» le cycle cellulaire (stade G0). On dit qu’elles sont quiescentes. Une fois différenciées, certaines cellules peuvent à nouveau se diviser, mais le nombre de divisions est limité.
• Le cancer est la division incontrôlée des cellules, qui résulte souvent d’un cycle cellulaire mal régulé.

42
Q

La division cellulaire mitotique des eucaryotes comprennent quels 2 choses?

A

• Mitose: la division du matériel génétique dans le noyau
• Cytocinèse: la division du cytoplasme

43
Q

La méiose donne quoi?

A

Des cellules filles non identiques qui ont deux fois moins de chromosomes que la cellule mère

44
Q

C’est quoi la cohésine et que fait-elle?

A

Une protéine qui maintient les 2 chromatides soeur ensemble

45
Q

Vrai ou faux: certaines cellules de divisent souvent mais d’autres ne we divisent pas?

A

Vrai
Divisent souvent: cellule de peau, racine des plantes, cellules immunitaire
Divisent pas: cellules musculaire, neurones et érythrocytes

46
Q

Quelles sont les phases du cycle cellulaire?

A

Phase mitotique
- mitose et cytocinèse

Interphase
- G1
- S
- G2

47
Q

C’est quoi la cytocinèse?

A

La division du cytoplasme

48
Q

C’est quoi la cytocinèse de la cellule animale?

A

Processus nommé segmentation, qui forme un sillon de division.
La sillon de division est formé par un anneau contractile de microfilament qui finira par séparer les 2 nouvelles cellules filles.

49
Q

C’est quoi la cytocinèse de la cellule végétale?

A

Une plaque cellulaire se forme à l’équateur de la cellule qui deviendra éventuellement une nouvelle paroi cellulaire séparant les 2 nouvelles cellules fille

50
Q

Quels sont les 3 points de contrôle principaux?

A

À la fin de G1 (point de contrôle G1/S)
- S’assure que l’ADN n’est pas endommagé et que la taille de la cellule est suffisante avant de passer en phase S.

À la fin de G2 (point de contrôle G2/M)
- S’assure que l’ADN n’est pas endommagé et que la taille de la cellule est suffisante avant de passer en phase M.

Au point de transition entre la métaphase et l’anaphase pendant la phase M (point de contrôle M)
- Vérifie que la mitose est complète avant de faire la cytocinèse

51
Q

Quel est le signal d’autorisation au point de controle G1?

A

Les facteurs de croissance (présence de nutriments chez les bactéries)

52
Q

Comment les facteurs de croissance signalisent à la cellule de proliférer?

A

Les RTK

53
Q

Quel est le point de contrôle G2?

A

la cellule stimule l’expression et/ou l’activité des protéines qui seront nécessaires pour commencer les processus de division cellulaire:
Ces protéines sont les cyclines et les kinases cyclines-dépendantes (Cdk).

54
Q

Comment functionne les cyclines et Cdk?

A

Les cyclines doivent s’associer à des Cdk afin que les Cdk soient activées. L’association d’une cycline avec un Cdk forme le complexe protéique MPF (mitosis promoting factor).

55
Q

Pourquoi est-ce que MPF est nécessaire?

A

La formation de MPF est nécessaire pour passer le point de contrôle G2 et stimuler la mitose (d’où son nom)

56
Q

Que fait le point de contrôle M?

A

Assure que l’attachement des fuseaux mitotique pour une bonne répartition des chromosomes dans la cellule fille

57
Q

C’est quoi les points d’ancrages?

A

• Certaines cellules ont besoin de s’accrocher à un substrat particulier afin de poursuivre leur cycle cellulaire
• Sans ce substrat (fibre de collagène, matrice extracellulaire, …) les signaux de croissance ne suffisent pas à faire progresser le cycle cellulaire

58
Q

C’est quoi inhibition de contact?

A

• Comment se fait-il qu’un endothélium ne forme qu’une seule couche de cellule ou qu’un épithélium soit limité à un nombre précis de couche cellulaire?
• Les cellules reçoivent des signaux d’arrêt de la division lorsqu’elles atteignent une certaine densité