Übungsfragen VL3+4

Question 1

Wie und von wem wurde entdeckt, dass DNA das genetische Material ist?

Answer 1

Griffith und Avery: Transformation von nicht-pathogenen R-Stamm Bakterien mit DNA von S-Stamm-Bakterien

Question 2

Was besagt die Komplementaritätsregel?

Answer 2

dass Adenin mit Thymin und Guanin mit Cytosin paart

Question 3

Sie haben experimentell festgestellt, dass die DNA eines neu isoliertenthermophilen Bakteriums einen GC Gehalt von 70% aufweist. Wie hoch ist der Anteil an A bzw. T?

Answer 3

30%

Question 4

Ergänzen Sie folgenden DNA-Strang zum Doppelstrang: 5 ́-GGATCCCTA-3 ́

Answer 4

5’-TAGGGATCC-3’

Question 5

Welche funktionellen Gruppen sind in doppelsträngiger DNA H-Donatoren und welche Akzeptoren bei der Bildung von Wasserstoffbrücken?

Answer 5

H-Donatoren: Aminogruppen (NH2); Wasserstoffatome an sekundären Aminen

H-Akzeptoren: freie Elektronen von Ketogruppen; freie Elektronen von
sekundären Aminen

Question 6

Welche DNA hat einen höheren Schmelzpunkt? Eine DNA mit einem GC-Gehalt von 30 % oder eine DNA mit einem GC-Gehalt von 70% ?

Answer 6

70%, da die Stapelkräfte größer sind

Question 7

Wie viele Basenpaare entsprechen einer DNA-Windung in B-DNA?

Answer 7

10,5

Question 8

Was versteht man unter der Verknüpfungszahl? Was ist ein Supercoil?

Answer 8

Die Verknüpfungszahl gibt die Häufigkeit an, mit der die beiden Stränge (Doppelstrang) eines fixierten doppelsträngigen DNA-Abschnitts (z.B. eines Plasmid-Rings [Plasmide] oder eines linearen, an seinen Enden fixierten DNA-Stücks) umeinander gewunden sind.

Question 9

Was ist ein Nukleosom?

Answer 9

Die Gesamtheit eines Histonoktamers und der darauf geweundenen DNA (147 Basenpaare)

Question 10

Wie erfolgt die Kondensation eukaryotischer DNA?

Answer 10

Aufwicklung der DNA auf Nukleosomen zur 10 nm Faser. Die Anlagerung von H1 führt zur Ausbildung einer dichteren Packung (30nm Faser). Ausbildung von Schleifen, die durch Kondensine und Kohesine verbunden werden und in nicht verstandener Weise eine weitere eine weitere Kompaktierung erzeugen.

Question 11

Wie unterscheiden sich die A- und B-Form der DNA-Helix?

Answer 11

A: kompakter, keine große/kleine Furche, Ganghöhe 11 Basenpaare, Basen
senkrecht zur Helixachse

B: offener, große Furche vorhanden; Ganghöhe 10, 5 Basenpaare, Basen
schräg zur Helixachse

Question 12

Wie verhalten sich Tw (ist), Lk (Linking number) und Wr (ithe) zueinander?

Answer 12

Lk = Tw + Wr

Question 13

Worin unterscheiden sich Typ I und Typ II Topoisomerasen?

Answer 13

Typ I Topoisomerasen verändern Superhelikalität in Einserschritten, Typ II in Zweierschritten

Question 14

Wie erfolgt bei der Topoisomerasereaktion das Wiederverknüpfen der
DNA Stränge?

Answer 14

Eine Ligasereaktion unter ATP Verbrauch

Question 15

Welche Topoisomerase ist in der Lage, unter Energieverbrauch superhelikale Windungen einzuführen?

Answer 15

Gyrase

Question 16

Welchen Vorteil hat es,

negativ superhelikale DNA zu haben?

Answer 16

DNA lässt sich leichter in Einzelstränge zerlegen; i.e. aufschmelzen und damit transkribieren

Question 17

Auf welche Weise wirkt sich die Transkription auf die lokale Superhelikalität aus?

Answer 17

Sie verstärkt die Superhelikalität der RNA Polymerase

Question 18

Stellen Sie sich vor, 
eine künstliche 
DNA ist 
um Nucleosomen gewunden. Bei
der Präparation fallen diese ab. Welche
n
Typ
Superhelikalität wi
rd die 
gereinigte DNA aufweise?

Answer 18

T
oroidales
s
upercoiling