Transport d’électrons et phosphorylations oxydatives Flashcards

1
Q

Quelles sont les deux demi-réactions qui représentent le transfert d’électrons?

A

D’abord, les atomes de carbones sont oxydés : C6H12O6 + 6H2O = 6CO2 + 24H+ + 24e-

Ensuite, l’oxygène moléculaire est réduit : 6O2 + 24H+ + 24e- = 12H2O

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2
Q

Où vont les 12 paires d’électrons issues de l’oxydation d’une molécule de glucose?

A

Les 12 paires d’électrons issues de l’oxydation d’une molécule de glucose ne sont pas directement transférées à l’oxygène mais plutôt aux coenzymes NAD+ et FAD pour former 10 NADH et 2 FADH2.

Les e- ne vont pas directement du NADH/FADH2 vers l’O2 mais passent plutôt par une série d’intermédiaires, les transporteurs d’électrons.

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3
Q

Quelles sont les quantités d’ATP produites avec la respiration cellulaire?

A

La réoxydation de chaque NADH permet la synthèse de ~3 ATP et la réoxydation de FADH2 permet la synthèse de ~2 ATP. Le grand total de production d’ATP pour une molécule de glucose complètement oxydée en CO2 et en H2O est de 38 ATP.

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4
Q

Pourquoi les e- ne vont pas directement du NADH/FADH2 vers l’O2 mais passent plutôt par une série d’intermédiaires, les transporteurs d’électrons?

A

Les électrons passent dans la chaîne de transport d’électrons où, suite à la réoxydation du NADH et FADH2, ils participent aux réactions d’oxydo-réduction de plus de 10 centres rédox avant de réduire O2 en H2O.

Au cours de ce processus, des protons (H+) sortent de la matrice de la mitochondrie vers l’espace intermembranaire et l’énergie libre résultant de la formation de ce gradient de pH (ou gradient de protons) est utilisée pour la synthèse d’ATP à partir d’ADP et de Pi (phosphorylations oxydatives).

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5
Q

Qu’est-ce qui est lié à la membrane interne de la mitochondrie?

A

Les protéines qui assurent le transport d’électrons et les phosphorylations oxydatives sont liées à la membrane interne de la mitochondrie.

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6
Q

Vrai ou faux? L’espace intermembranaire de la mitochondrie est en équilibre avec l’extérieur.

A

Vrai. Car elle est très perméable.

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7
Q

Le transport d’électrons et les phosphorylation oxydatives se déroulent où?

A

Le transport d’électrons et les phosphorylations oxydatives se déroulent dans la membrane interne et la matrice de la mitochondrie où doivent se retrouver toutes les composantes : ex. NADH résultant de la glycolyse est dans le cytoplasme.

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8
Q

Le gradient électrochimique de la mitochondrie est composé de quoi?

A

Le gradient électrochimique est composé à la fois d’un :
• gradient chimique ou de pH (espace intermembranaire plus acide que matrice; différence de pH de ~0.75). Ce pH plus acide est essentiel à l’activité de certaines enzymes.

• gradient électrique où le potentiel de membrane Em est positif de + 0,14 V (espace intermembranaire est chargé positivement). Même principe qu’une pile.

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9
Q

Comment appelle-t-on souvent le grandient électrochimiques de protons? Pourquoi?

A

Il est souvent appelé force protomotrice (FPM) car la rentrée ou le retour d’un proton par diffusion vers la matrice génère de l’énergie libre (DGo’ ~-21.5 kJ/mol) nécessaire à la synthèse de l’ATP.

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10
Q

Comment fonctionne le gradient de H+ qui existe à travers la membrane mitochondriale?

A

Le gradient de H+ qui existe à travers la membrane mitochondriale fonctionne comme un barrage hydroélectrique. L’énergie libérée par l’oxydation des aliments (via une série d’étapes) est utilisée pour pomper des protons à travers une membrane, le barrage, créant ainsi un réservoir de protons d’un côté de la membrane. Le flux de protons à travers des turbines protéiques enfouies dans cette membrane (ATP synthase) fournit l’énergie nécessaire à la synthèse d’ATP de la même manière que le débit d’eau dans les turbines génère de l’électricité. Cette phénomène est également appelée chimiosmose.

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11
Q

Qu’est-ce que la chimiosmose?

A

La chimiosmose se définie comme le mouvement des ions, en fonction de leur gradient électrochimique, à travers une membrane sélectivement perméable (différent de semi-perméable).

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12
Q

Puisque les réactions de transport d’électrons et les phosphorylations oxydatives s’y produisent, la membrane interne de la mitochondrie doit contenir des systèmes de transport permettant quels processus?

A
  1. NADH produit lors de la glycolyse dans le cytoplasme doit accéder à la chaîne de transport d’électrons afin d’y être oxydé ultimement par l’O2.
  2. métabolites produits par la mitochondrie comme l’oxaloacétate et l’acétyl-CoA (précurseurs de la biosynthèse du glucose et des acides gras respectivement) doivent atteindre leurs destinations métaboliques.
  3. l’ATP produit par la mitochondrie doit parvenir au cytoplasme où se déroulent la plupart des réactions qui utilisent l’ATP tandis que l’ADP et le Pi, substrats des phosphorylations oxydatives, doivent entrer dans la mitochondrie.
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13
Q

Quels sont les différents systèmes de transport? Quelles sont leurs caractéristiques?

A

Une seule molécule à la fois (passif)

2 molécules différentes dans le même sens (symport) : Pi et H+ ou pyruvate et H+

2 molécules différentes dans des sens opposées (antiport) : ADP et ATP

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14
Q

Comment les mitochondries transportent l’ATP et l’ADP?

A

La membrane interne mitochondriale contient un système qui transporte l’ATP de la matrice mitochondriale vers le cytoplasme en échange d’ADP.

Le système antiport impliqué ici s’appelle translocase des nucléotides adényliques, un dimère de sous-unités identiques.

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15
Q

Comment les mitochondries transportent le Pi?

A

Le Pi revient dans la mitochondrie par le transporteur de phosphate, un système symport Pi—H+ sous la dépendance d’un gradient de pH (DpH).

Le H+ qui accompagne le Pi avait auparavant été exclu par les pompes de la chaîne de transport d’électrons couplées aux réactions d’oxydo-réductions (à venir).

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16
Q

Comment les mitochondries transportent le NADH?

A

Le NADH produit dans le cytoplasme lors de la glycolyse doit être transporté dans la membrane interne de la mitochondrie pour être réoxydé en NAD+ par transport d’électrons et phosphorylations oxydatives.

Cela s’effectue par des systèmes de navette dont la navette malate-aspartate (dans le coeur, foie, rein) où le NAD+ mitochondrial est réduit par le NADH cytosolique moyennant la réduction de l’oxaloacétate suivie de sa régénération. Il s’agit d’un processus en 2 phases de 3 étapes chacunes.

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17
Q

Comment décrire la phase A du transport du NADH dans les mitochondries par la navette malate-aspartate? Par quelle enzyme?

A

Phase A (transport d’électrons dans la matrice) :

  1. dans le cytosol, le NADH réduit l’oxaloacétate pour donner du NAD+ et du malate lors d’une réaction catalysée par la malate déshydrogénase cytosolique.
  2. le transporteur malate-a-cétoglutarate transporte le malate du cytosol vers la matrice mitochondriale en échange d’a-cétoglutarate provenant de la matrice.
  3. dans la matrice mitochondriale, le NAD+ réoxyde le malate pour donner du NADH et de l’oxaloacétate, réaction catalysée par la malate déshydrogénase mitochondriale.
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18
Q

Vrai ou faux? Le NADH n’entre jamais dans la matrice mitochondriale.

A

Vrai.

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19
Q

Comment décrire la phase B du transport du NADH dans la mitochondries par la navette malate-aspartate?

A

Phase B (régénération de l’oxaloacétate cytosolique) :

  1. dans la matrice, une transaminase (métabolisme des acides aminés) transforme l’oxaloacétate en aspartate avec transformation concomitante de glutamate en a-cétoglutarate.
  2. l’aspartate est transporté de la matrice vers le cytoplasme par le transporteur glutamate-aspartate en échange de glutamate cytosolique.
  3. dans le cytoplasme, l’aspartate est transformé en oxaloacétate par une transaminase en même temps que l’a-cétoglutarate est transformé en glutamate.
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20
Q

Comment expliquer le transport du NADH par les mitochondries dans le CERVEAU?

A

Il existe également la navette du glycérophosphate (dans cerveau et muscle squelettique) plus simple (3 étapes) mais moins efficace sur le plan énergétique.

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21
Q

Quelles sont les 3 étapes du transport du NADH dans les mitochondries dans le cerveau et les muscles squelettiques?

A
  1. glycérol-3-phosphate déshydrogénase catalyse l’oxydation du NADH cytosolique via le dihydroxyacétone phosphate (DHAP, intermédiaire glycolyse) pour donner NAD+ et glycérol- 3-phosphate (G3P).
  2. les électrons du glycérol-3- phosphate sont transférés à une déshydrogénase flavoprotéique pour donner du FADH2
  3. cette enzyme est localisée sur le côté externe de la membrane interne de la mitochondrie et elle fournit des électrons à la chaîne de transport.
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22
Q

Pourquoi la navette du glycérophosphate (dans le cerveau et dans le muscle) est moins efficace sur le plan énergétique?

A

Parce que le NADH fait 3 ATP tandis que le FADH en fait juste 2.

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23
Q

Quel est l’accepteur terminal des électrons dans les mitochondries?

A

Le O2. Donc pas de O2 = pas de chaîne de transport d’électrons.

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24
Q

La direction du flux d’électrons le long de la chaîne de transport est déterminée par quoi?

A

La direction du flux d’électrons le long de la chaîne de transport est déterminée par la faculté des composantes à perdre ou à gagner ces électrons.
• le NAD+ a une affinité modérée pour les électrons. Sa forme réduite (NADH) peut facilement céder ses 2 électrons.
• O2 a une très forte affinité pour les électrons et est donc un très bon agent oxydant (accepte électrons facilement—les attirent essentiellement).
• La capacité à « donner » ou à « capter » des électrons est exprimée par un paramètre nommé potentiel d’oxydoréduction (Eo’), NAD+ ayant un potentiel de -315 mV et O2, un potentiel de +815 mV.

Les électrons se déplacent des molécules à faible potentiel rédox vers les molécules possédant un potentiel fort; donc dans le cas de la chaîne mitochondriale de transport d’électrons, du NADH à l’O2

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25
Q

La chaîne de transport d’électrons est une succession de 4 complexes protéiques parcourus par les électrons. Quels sont-ils?

A

Les électrons du NADH sont transférés au Complexe I et ceux du FADH2 au Complexe II. Ensuite ils sont transférés au Complexe III grâce au coenzyme Q (CoQ ou ubiquinone), et du Complexe III au Complexe IV par la protéine membranaire périphérique, le cytochrome c.

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26
Q

Au cours du transport d’électrons, l’énergie libre du transport d’électrons du NADH ou FADH2 vers l’O2 pour donner H2O (via l’intermédiaire de centres rédox liés à des protéines) est couplée à quoi?

A

À la synthèse d’ATP (phosphorylations oxydatives).

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27
Q

Quelle est la réaction globale de la chaîne de transport d’électrons?

A

NADH = NAD+ +H+ +2e- …………………. 2e- +2H+ +1⁄2O2 = H2O

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28
Q

Quelle est la relation entre DE et DG?

A

Un DEo’ positif dans une équation résulte en un DGo’ négatif, un DEo’ positif est indicatif d’une réaction spontanée.

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29
Q

Durant la chaîne de transport des électrons, comment le potentiel de redox varie?

A

Plus on avance dans la chaîne, plus il augmente. C’est donc thermodynamiquement favorable.

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30
Q

Que se passe-t-il lorsque les électrons du NADH ou du FADH2 s’écoulent dans la chaîne respiratoire? Que permet cela?

A

Lorsque les électrons du NADH ou du FADH2 s’écoulent dans la chaîne respiratoire, des protons (H+) sont pompés à travers la membrane interne, de la matrice vers l’espace intermembranaire. Ultimement, de l’ATP sera synthétisé quand les protons reviendront dans la matrice à travers l’ATP synthase (force protomotrice). L’oxydation du NADH/FADH2 et la phosphorylation de l’ADP sont donc couplées grâce à ce flux transmembranaire de protons.

Cette réaction est très exergonique (DGo’ = -215 kJ/mol pour le NADH et -170 kJ/mol pour le FADH2). Cette énergie est suffisante pour permettre la formation endergonique de plusieurs molécules d’ATP, étant donné que la variation d’énergie libre physiologique (DG) pour la formation d’une molécule d’ATP à partir d’ADP et de Pi n’est que de +50 kJ/mol (énergie libre standard DGo’ est de +30.5).

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31
Q

Vrai ou faux? Le complexe II pompe des protons.

A

Faux. Il n’en pompe pas.

32
Q

Quels sont les différents inhibiteurs des différents complexes?

A

Complexe I : roténone, amital et MPTP

Complexe III : antimycine A (antibiotique)

Complexe IV : cyanure et CO

33
Q

Vrai ou faux? Les complexes peuvent se déplacer latéralement à l’intérieur de la membrane de la mitochondrie.

A

Vrai.

34
Q

De quoi sont formés les complexes?

A

Chaque complexe est formé de plusieurs constituants protéiques associés à différents groupes prosthétiques d’oxydo-réduction.

35
Q

De quoi est composé le complexe I (NADH déshydrogénase)?

A

C’est un large complexe de 46 sous-unités protéiques qui contient :
− une flavine mononucléotide (FMN) : groupement prosthétique d’oxydo-réduction qui ne diffère du FAD que par l‘absence du groupement AMP
− 6-7 centres fer-soufre (Fe-S)

36
Q

Comment expliquer ce qui se passe dans le complexe I?

A

Le NADH donne ses 2 électrons au FMN qui est réduit en FMNH2. Les électrons du FMNH2 passent ensuite sur d’autres protéines dont les groupes prosthétiques sous la forme de centres Fe-S au sein desquels les atomes de fer peuvent alterner entre la forme oxydée Fe3+ et la forme réduite Fe2+. Les électrons sont alors transférés à une molécule de CoQ dont la réduction conduit à la formation de CoQH2. Ce dernier transférera ensuite les électrons au Complexe III.

Parallèlement, 4 protons seront pompés hors de la matrice et contribueront à la création du gradient électrochimique.

37
Q

De quoi est formé le complexe II (succinate déshydrogénase)?

A

4 sous-unités protéiques dont la succinate déshydrogénase et 4 cofacteurs :
− une molécule de FAD
− 3 centres fer-soufre (Fe-S)

38
Q

Que se passe-t-il dans le complexe II?

A

FADH2 associé à la succinate déshydrogénase transfère ses électrons au CoQ (devient CoQH2) via Fe-S (Fe3+/Fe2+).

Le CoQH2 transférera ensuite les électrons au Complexe III (aucun proton pompé hors de la matrice par le Complexe II).

39
Q

De quoi est composé le complexe III (Q-cytochrome c oxydoréductase ou Complexe du cytochrome bc1)?

A

C’est un large complexe constitué de nombreuses sous-unités protéiques et de 4 groupes prosthétiques qui participent au transfert d’électron :
• 2 cytochromes de type b : bL (low) et bH (high)
• 1 centre fer-soufre (Fe-S)
• 1 cytochrome de type c

40
Q

Que se passe-t-il dans le complexe III?

A

Le Complexe III assure le transfert des 2 électrons du CoQH2 vers le cytochrome c. Ce processus connu comme “cycle Q” s’effectue en 2 phases (ou cycles) puisque le cytochrome c ne peut accepter qu’un électron à la fois.

Au total, 4 protons seront pompés dans l’espace intermembranaire par le Complexe III.

41
Q

Qu’est-ce que le cytochrome c? Quels sont ses rôles?

A

C’est une petite hémoprotéine (ou protéine à hème) associée à la membrane interne de la mitochondrie qui se retrouve chez tous les organismes sauf quelques anaérobies obligatoires.

En raison de sa mobilité, le cytochrome c agit comme une navette et transporte les électrons du Complexe III à la cytochrome c oxydase (Complexe IV). Le fer du noyau hème du cytochrome c transporte un seul électron à la fois en passant réversiblement de l’état oxydé ferrique Fe3+ (ou Fe(III)) à l’état réduit ferreux Fe2+ (ou Fe(II)).

42
Q

Quelle est la structure du complexe IV (cytochrome c oxydase ou cytochrome aa3)?

A

Large complexe constitué de nombreuses protéines et de 4 groupes prosthétiques:
• 2 cytochromes (Fe) de type a (a et a3)
• 2 centres cuivre (CuA et CuB)

43
Q

Quels sont les rôles du complexe IV?

A

Catalyse le transfert de 4 électrons du cytochrome c à l’O2. Assume ainsi la réduction de O2 en 2 H2O.

Les centres Cu participent au transfert d’électrons en alternant entre l’état réduit (Cu+) et oxydé (Cu2+). Les cytochromes et le Cu ne transportent qu’un seul électron à la fois. La réduction d’une molécule de O2 nécessite le passage de 4 électrons dans ces transporteurs, un à la fois.

Le Complexe IV assume la réduction de O2 en 2 H2O, ce qui nécessite, outre les 4 électrons venant du cytochrome c, 4 protons (H+) qui sont prélevés dans la matrice mitochondriale.

L’énergie libérée par la ré-oxydation du cytochrome c sert à pomper 4 protons hors de la matrice.

44
Q

Quelle est l’équation du complexe IV?

A

8H+int + 4cyt c2+ + O2 = 4cyt c3+ + 2H2O + 4H+ext

45
Q

Quel est le lien entre le MPTP et la maladie de Parkinson?

A

En 1982, une épidémie d’étranges paralysies est rapportée dans le sud de la Californie. Des jeunes étaient incapable de se mouvoir ou de parler au point d’être immobiles comme des statues. Essentiellement des symptômes similaires à ceux d’une forme sévère de la maladie de Parkinson.

Ces jeunes avaient un point en commun; ils consommaient de l’héroïne “diluée” avec du MPTP, un contaminant.

Dans le cerveau, le MPTP est rapidement transformé en MPP+, un puissant inhibiteur du Complexe I, principalement dans la substantia nigra (substance noire), région du cerveau composée de neurones dopaminergiques.

Sachant que la maladie de Parkinson est due à un défaut de production dopamine, un neurologue décida de donner du L-dopa (qui est décarboxylé en dopamine) à ces jeunes. Les patients traités ont immédiatement gagné de la mobilité. Il a même effectué des transplantations de cellules de cerveau foetal et les patients ont bien répondu.

46
Q

Le complexe V étant sans contact, que se passe-t-il en lien avec l’énergie libérée?

A

Le Complexe V (l’ATP synthase) étant “sans contact” (pas même avec une navette) avec les protéines qui assurent le transfert d’électrons, l’énergie libre libérée par le transfert d’électrons doit être “mise en réserve” sous une forme utilisable par l’ATP synthase. Cette conservation énergétique est appelée couplage énergétique ou transduction d’énergie et implique la chimiosmose (gradient de protons, gradient électrochimique ou encore force protomotrice).

La synthèse endergonique d’ATP à partir d’ADP et de Pi dans les mitochondries, catalysées par l’ATP synthase (ou FoF1 ATPase ou Complexe V), est couplée au transport d’électrons.

47
Q

Chaque H+ qui retourne vers la matrice mitochondriale génère quoi?

A

Chaque H+ qui retourne vers la matrice mitochondriale par diffusion génère de l’énergie libre qui sera requise pour former l’ATP grâce à l’ATP synthase.

48
Q

La synthèse d’une molécule d’ATP nécessite quoi?

A

La synthèse d’une molécule d’ATP nécessite ~ +50 kJ/mol d’énergie libre physiologique (DG) donc trop importante pour être fournie par le retour d’un seul proton dans la matrice mitochondriale; 3 protons sont nécessaires pour la synthèse d’un ATP (donc le retour de chaque H+ générerait au moins -16.5 kJ/mol d’énergie DG).

49
Q

Qu’est-ce que l’ATP synthase?

A

L’ATP synthase est un ensemble enzymatique complexe. L’enzyme contient au moins 16 protéines différentes dans deux régions, appelées Fo et F1.

L’ATP synthase présente deux régions, appelées F0 et F1, auxquelles sont dévolues des fonctions distinctes.

L’ATP synthase est une machine moléculaire remarquable. Elle est une pompe à protons ET un moteur moléculaire rotatif.

50
Q

L’ATP synthase catalyse quoi?

A

L’ATP synthase catalyse une réaction réversible; elle peut synthétiser l’ATP en utilisant la force protomotrice des protons traversant la membrane mitochondriale interne mais aussi hydrolyser l’ATP pour pomper des protons contre un gradient électrochimique.

51
Q

Pourquoi l’ATP synthase fonctionne-t-elle principalement dans un sens?

A

À cause du gradient de protons.

52
Q

Quelles sont les caractéristiques de la région F0 de l’ATP synthase? Quelle est sa fonction?

A

C’est la région ransmembranaire.

Elle est constituée de 3 types de sous-unités hydrophobes : a, b et c. La sous-unité a possède deux demi-canaux à protons, un pour l’entrée et un pour la sortie.

L’ensemble de la région F0 forme un canal à protons qui traverse la membrane mitochondriale interne.

F0 est responsable de la translocation des protons.

53
Q

Quelles sont les caractéristiques de la région F1 de l’ATP synthase? Quelle est sa fonction?

A

Elle est sur la face matricielle de la membrane mitochondriale interne.

Forme sphérique et constituée de 5 types de polypeptides: a, b, g, d et e:

Les sous-unités g et e forment une tige centrale.

Les 6 sous-unités a et b, disposées selon un anneau hexagonal, fixent les nucléotides, mais seules les sous-unités b possèdent l’activité catalytique permettant de synthétiser l’ATP à partir d’ADP et de Pi (ou de l’hydrolyser).

Elle contient donc 3 sites de liaison pour ADP+Pi/ATP.

F1 catalyse la formation de la liaison pyrophosphate de l’ATP.

54
Q

Par quoi sont connectées les sous-unités F1 et F0 de l’ATP synthase?

A

Les sous-unités Fo et F1 sont connectées par :
• la tige centrale ge qui est fermement liée à l’anneau formé par les sous-unités c.
• une colonne externe constituée de la sous-unité a, des deux sous-unités b et de la sous-unité d.

55
Q

Comment l’ATP synthase utilise l’énergie?

A

Boyer a réalisé des études d’échange de 18O dans l’ATP synthase. Il a étudié la capacité de l’ATP synthase à incorporer l’oxygène marqué de H218O dans du Pi. Cette réaction se produit par la synthèse d’ATP à partir d’ADP et de Pi, suivie de l’hydrolyse de l’ATP avec l’incorporation d’atomes d’oxygène du milieu.

Bien que la production nette d’ATP dans la mitochondrie nécessite un couplage avec un gradient de protons, Boyer a observé que cette réaction d’échange se produit facilement in vitro, même en l’absence d’un gradient de protons.

La réaction d’échange était si facile que tous les quatre oxygènes du Pi deviennent marqués avec 18O. Cette observation importante a révélé que la formation d’ATP lié à l’enzyme ne nécessite pas d’énergie.

Les expériences qui ont suivi, par Boyer et d’autres, ont prouvé que l’étape nécessitant de l’énergie dans l’ATP synthase est la libération de l’ATP nouvellement synthétisé à partir de l’enzyme.

Il a été démontré par la suite que le flux des protons à travers F0 induit des changements conformationnels de l’enzyme (F1) qui aboutissent à la fixation des substrats sur l’ATP synthase, la synthèse d’ATP, et sa libération.

56
Q

Quelles sont les caractéristiques des sites catalytiques de l’ATP synthase? Comment fonctionnent-ils?

A

Il y a trois sites catalytiques dans la région F1 et un mécanisme catalytique propre à l’ATP synthase a été proposé.

Chacun des 3 sites catalytiques ab de l’ATP synthase est dans une conformation différente : ouverte (open), lâche (loose) ou serrée (tight).

Lorsque la force protomotrice active l’ATP synthase, ils passent successivement d’un état conformationnel et fonctionnel à un autre.

57
Q

La synthèse de l’ATP par catalyse rotationnelle nécessite quoi?

A

La synthèse de l’ATP par catalyse rotationnelle nécessite donc une structure qui tourne en réponse à la force protomotrice.

58
Q

L’ATP synthase est formée de deux parties principales. Quelles sont-elles?

A

Un rotor (partie mobile) constitué du dodécamère c12 (bleu) associé aux sous-unités γ et ε (vert et violet)

Un stator (partie fixe) constitué de l’hexamère α3β3 (jaune et gris) et des sous-unités a, b et δ (orange, noir et rouge). Le passage des protons est à l’origine d’un couple qui permet la rotation du rotor.

59
Q

Comment expliquer les différentes étapes de la rotation de l’ATP synthase?

A
  1. liaison d’ADP et de Pi au site catalytique de faible affinité lorsque F1 est en conformation lâche (L).
  2. Le passage des protons à travers l’ATP synthase induit des changements conformationnels des trois sites. La conformation L, avec son ADP et son Pi se transforme en conformation serrée (tight, T) où est produit l’ATP. En même temps, les 2 autres sous-unités changent de conformation: le site T qui contient l’ATP passe en configuration ouverte (O) et le site qui se trouvait en O passe en L.
  3. En même temps qu’un ATP est synthétisé sur le site T d’une sous-unité, celui qui est lié au O d’une autre sous-unité se dissocie.
60
Q

Quels sont les deux modèles proposés concernant le gradient de proton pour la synthèse d’ATP?

A

1.Gradient de protons proposé par Mitchell en 1961 est la façon par laquelle la cellule emmagasine l’énergie nécessaire à la synthèse d’ATP.

2.En 1974, Racker et Stoeckenius ont confirmé le modèle de Mitchell dans une expérience de reconstitution :
• Bactériorhodopsine, pompe à protons activée par la lumière.
• Micelle, vésicule de lipides.
• ATP synthase.

61
Q

Comment décrire l’action de l’oligomyocine sur l’ATP synthase?

A

L’oligomycine inhibe l’ATP synthase en bloquant son canal à protons (sous-unité F0) qui est nécessaire à la phosphorylation oxydative d’ADP en ATP (production d’énergie).

L’inhibition de la synthèse d’ATP arrête également la chaîne de transport d’électrons. Pourquoi ?

Parce que la haute concentration de protons n’est pas dissipée, l’énergie libre libérée par l’oxydation biologique de substrats (NADH et FADH2) est insuffisante pour pomper des protons contre un gradient encore plus élevé.

62
Q

Comment se fait le transport de l’ATP hors de la matrice?

A

Par un système antiport d’échange ADP-ATP qui s’appelle translocase des nucléotides adényliques, un dimère de sous-unités identiques.

C’est “coûteux” pour la cellule – comme un système de péage.

63
Q

Comment on transporte le Pi en dehors de la matrice?

A

Par un système de symport. Un autre transport à péage pour la cellule.

64
Q

Quel est le rendement en ATP pour une molécule de glucose?

A

Navette glycérophosphate : 36

Navette malate-aspartate : 38

65
Q

Comment est régulée la respiration cellulaire?

A

Les besoins énergétiques (en ATP) constituent le principal mécanisme de régulation de la respiration cellulaire / phosphorylations oxydatives / synthèse d’ATP.
• [ATP] faibles
• [ADP] élevées

66
Q

De quoi dépend la producition d’ATP?

A

Elle dépend de l’apport en NADH (pour le transport d’électrons) :
• valeur du ratio [NADH]/[NAD+] intramitochondrial.

Apport en O2, ADP et Pi
• activité physique = besoin en énergie
• au repos: ratio [ATP]/[ADP][Pi] élevé : les phosphorylations oxydatives tournent au ralenti.
• a l’effort: ratio [ATP]/[ADP][Pi] s’abaisse du fait de la consommation d’ATP : la vitesse des phosphorylations oxydatives s’accélère.

67
Q

Quels sont les composés chimiques connus pour découpler le processus de transfert d’électrons de la synthèse d’ATP? Comment expliquer l’action de ces composés?

A

Quelques composés chimiques sont connus pour découpler le processus de transfert d’électrons de la synthèse d’ATP: le 2,4-dinitrophénol (DNP) et le carbonylcyanide-para-trifluorométhoxyphénylhydrazone (FCCP).

Ces composés sont des acides faibles liposolubles qui traversent les membranes sous forme neutre ou protonée.

Dans un gradient de pH, ils fixent les protons sur le côté cytosolique, diffusent dans la membrane et libèrent les protons du côté matriciel de la membrane, dissipant ainsi le gradient.

Ce découplage produit de la chaleur.

68
Q

Avant même que le mécanisme de découplage soit identifié, on savait que le DNP et le FCCP accélérait le métabolisme. Pourquoi?

A

Un métabolisme accéléré conduit à une perte de poids.

Dans les années 1920-1930, le DNP a donc été utilisé pendant plusieurs années comme pilule amaigrissante avec des résultats surprenants. Cela causait une diminution de la production d’ATP et de la chaleur.

Le principal danger n’est pas le manque de production d’énergie mais plutôt une hausse excessive de la température corporelle. En conséquence, une surdose de DNP provoque une fièvre fatale.

69
Q

Quel est le mécanisme d’action du DNP?

A

Voir diapo 79.

70
Q

Pour quelle raison le découplage des phosphorylation oxydatives pourrait être utile?

A

Certains animaux adaptés au froid, les animaux en hibernation, et animaux nouveau-nés génèrent naturellement de grandes quantités de chaleur par le découplage des phosphorylations oxydatives.

Le tissu adipeux de ces organismes contient des mitochondries si nombreuses qu’il est appelé tissu adipeux brun pour la couleur conférée par les mitochondries.

La membrane interne des mitochondries du tissu adipeux brun contient une protéine appelée thermogénine (littéralement, «générateur de chaleur»), qui crée un canal à protons passif par lequel s’écoulent les protons de l’espace intermembranaire vers la matrice.

71
Q

Expliquez le processus de découplage de la production d’ATP.

A

Voir diapo 81.

72
Q

En oncologie, qu’est-ce que l’effet Warburg?

A

En oncologie, l’effet Warburg est l’observation que la plupart des cellules cancéreuses tirent leur énergie principalement par un taux élevé de glycolyse suivie de la fermentation dans le cytosol produisant ainsi des niveaux élevés d’acide lactique (par opposition à un taux relativement faible de la glycolyse suivie de l’oxydation du pyruvate dans les mitochondries comme la plupart des cellules normales).

73
Q

Quelle est la différence entre les taux glycolytiques des cellules malignes et des cellules noramles?

A

Les cellules malignes à croissance rapide ont généralement des taux glycolytiques qui sont jusqu’à 200 fois plus élevés que ceux de leurs tissus normaux d’origine, et cela se produit même si l’oxygène est abondant.

74
Q

Qu’est-ce que l’effet Warburg peut être?

A

L’effet Warburg peut être :
• une conséquence d’un dommage à la mitochondrie dans le cancer.
• une adaptation à des environnements pauvres en oxygène dans certaines tumeurs (surtout tumeurs solides).
• les produits de gènes du cancer peuvent “fermer” les mitochondries parce qu’elles sont impliquées dans le programme de l’apoptose cellulaire qui, autrement, tuerait les cellules cancéreuses.

75
Q

Quelles sont différentes pathologies humaines reliées à l’ATP?

A

Maladies cardiovasculaires :
• infarctus du myocarde.
• congestion cérébrale ou accident vasculaire cérébral (AVC).

Causée par manque d’oxygène au coeur et au cerveau :
• arrêt activités cellulaires.
• mort cellulaire

Unique source d’ATP = glycolyse
• énergie insuffisante pour fonctionnement des pompes à ions
— équilibre osmotique est désorganisé.
— cellules et organelles gonflent.
— membranes s’étirent -> perméables.
• abaissement pH intracellulaire :
— activation de certaines enzymes qui dégradent les constituants cellulaires.

76
Q

Comment caractériser le besoin en ATP des êtres humains?

A

La quantité d’ATP que les êtres humains ont besoin pour vivre est impressionnante. Un homme sédentaire de 70 kg (154 livres) a besoin d’environ 8400 kJ (2000 kcal) pour une journée d’activités.

Pour fournir cette énergie, ~83 kg d’ATP sont nécessaires. Cependant, les êtres humains possèdent seulement ~250 g d’ATP.

Solution ?
Recyclage de l’ADP en ATP grâce à la chaîne de transport d’électrons et aux phosphorylations oxydatives.
Chaque molécule d’ATP est recyclée environ 350 fois par jour.

77
Q

Sur le plan du rendement énergétique, sommes-nous efficaces?

A

L’oxydation complète du glucose par l’oxygène moléculaire se traduit par l’équation rédox suivante qui libère de l’énergie libre : C6H12O6 + 6O2 = 6CO2 + 6H2O DG = ~ -2900 kJ/mol

Glycolyse, cycle de Krebs et transports d’électrons+phosphorylations oxydatives génèrent entre 36-38 ATP par molécule de glucose.

Si on assume que l’hydrolyse de l’ATP en conditions physiologiques génère -50 kJ/mol (DG), l’hydrolyse de 36-38 molécules d’ATP produirait entre 1800 - 1900 kJ/mol d’énergie libre, soit 62-66%.

Plutôt impressionnant considérant qu’une partie de l’énergie “non-capturée” en ATP est convertie en chaleur = efficacité augmentée.

3.5 milliard d’années d’évolution ont résulté en un système pas mal efficace sur le plan énergétique !