Transcripción generalidades Flashcards
¿Qué es la transcripción?
Corresponde al segundo paso del dogma central de la biología molecular.
Consiste en tomar un molde de DNA en el cual una de las hebras, o las dos van a funcionar como molde para generar un RNA.
Transcrito primario
Es una molécula de ARN de una sola cadena que se obtiene inmediatamente después de la transcripción. Depende de la DNA polimerasa que actue si este se convierte en RNAm, RNAt o RNAr
De transcrito primario a RNAm
Necesita pasar por modificaciones postrasduccionales, si pasa al splaicing, si se le adiciona la caperuza y si se le adiciona la cola de poliar se considera RNAm.
¿Qué es un gen?
Desde el punto de vista molecular, el
gen es una secuencia lineal de nucleótidos en la molécula de ADN, que contiene la información necesaria para la síntesis de un ARN funcional, que puede ser ARNm, ARNt o ARNr
¿Qué son los operones?
Son un conjunto de genes situados en el mismo fragmento de ADN que se transcriben como una unidad y que generan varios productos funcionales que participan en una vía metabólica común; aunque también pueden existir unidades que codifiquen para un solo producto funcional.
Inicio de transcripción
El inicio del sitio de transcripción se denomina +1, y la numeración aumenta conforme se dirige al extremo 3’. Esta dirección se conoce como corriente abajo, donde se encuentran las secuencias codificantes del
gen.
Hacia el extremo 5’, en la dirección opuesta, conocida
como corriente arriba, la numeración se indica como —1, y es allí donde se encuentra la mayoría de regiones regulatorias del gen.
Regiones codificantes del ADN
Exones
Regiones no codificantes del ADN
Intrones, se eliminan por medio del corte y del empalme
Promotor mínimo
Es la región regulatoria indispensable para la transcripción del gen.
¿Qué es un promotor?
Un tipo de secuencias de ADN regulatorias que no
codifican para el producto génico, pero regulan su expresión.
Determinada región del ADN con determinada secuencia que va a indicar que desde ese punto en adelante se va a codificar un determinado ARN
¿Cuánto porcentaje del genoma se expresa del gen y del genoma codificante total?
1% y 4% respectivamente
Estructura del gen
Exones Intrones 5´UTR (Untraslated Region) 3´UTR (Untraslated Region) Elementos moléculares: (players) TATAAT Promotor Potenciador Elemnetos proteícos: (Players) TBO Factores de transcripción basales o inducibles.
Menciona y explica cuáles son los elementos moleculares.
Elementos moléculares: (players)
TATAAT Box: es una secuencia de del gen que sirve para el anclaje de los elementos proteicos en un futuro (es una secuencia consenso porque se encuentra en todos los genes)
Promotor: es una secuencia del gen que incluye a la caja TATA.
Potenciador o enhancer: secuencia de ADN que puede estar cerca o muy lejos del promotor. Regularmente se encuentra pegado al promotor.
Los procariontes no necesitan de este porque tienen promotores fuertes.
Menciana que RNA genera cada RNA pol
RNA pol I: RNAr
RNA pol ll: RNAm RNAsn
RNA pol lll: RNAt, RNAs y RNAst
Menciona los elementos proteícos
TBP: es una proteína que se une a TATA ensu región promotora y permite que otros elementos se añadan.
Factores de transcripción Basales: Si no existen estos, no se da nada. TFFIA TFFIB TFIID TFFIE TFIIF TFIIH
Factores de transcripción inducibles:
Su expresión no se dará siempre, necesitan de un estímulo para que se presenten.
NF-KB: Fomenta la transcripción de proteínas pro inflamatorias.
Se presenta en infección.
Muchos de los genes que activa NF-κB tienen un efecto regulatorio sobre sí mismos (en algunos casos este efecto se traduce en una amplificación de la señal) por ejemplo,
Interlucina 1
Prostaglandinas
Interlucina 6
TNFalfa
Interferon Gamma
Proteína activadora 1 (AP-1): Induce la transcripción de citosinas. Desinflama. Controla a NF-KB para que no mate al cuerpo. controla, de este modo, diversos procesos celulares incluyendo diferenciación, proliferación y apoptosis.
AP-1: inflama cuando hay golpes, no infección
IL-10
TGF-beta
IL-4
Myeloid differentiation primary response 88 (MYD88): induce que la célula se replique, de igual manera sirve como un adaptador del receptor tipo Toll, los cuales sirven para generar que se produzcan citocinas proinflamatorias. IL2 IL22 PDGF VEGF
C-Fos/C-jun: es un dímero (2 proteínas). Tiene que ver con la remodelación de tejidos.
Se une a los genes para aumentar su regeneración, induciendo a que se incrementen las proteínas de remodelación.
Colágeno I y II
Laminina
Fibronectina
Eparán sulfato