Transcripcion Flashcards
Definición de gen
Secuencia de nucleotidos en la molécula de DNA, que contiene la información necesaria para hacer un RNA de cualquier tipo funcional.
Inicio del sitio de transcripción (nombre y mecanismo)
Se denomina +1 y la numeración aumenta conforme se dirige al extremo 3’.
Secuencia aisladora
Puede inhibir potencidores o silenciadores. Bloquea la transmisión de la señal de un sitio a otro en el DNA e impide el silenciamiento. Actúan sobre el promotor vecino.
Tipos de secuencias regulatorias
- promotoras
- potenciadoras
- silenciadores
Tipos de secuencias codificantes
- Intrones: No son traducidas, son retiradas por medio del proceso de corte y empalme del mRNA primario
- Exones: Codifican el producto, de ahi se pone la caperuza y el poli A y pasa a un RNA mensajero y de ahi a una proteína.
Promotor
Secuencia de DNA que no codifican para el producto genico, pero regulan su expresión.
Promotores proximales
- GC, CAAT
- Dispersos pero próximos al origen, determinan la frecuencia de inicio.
- “Promotores débiles”
Promotores basales
- Secuencia minima requerida para la union de la maquina basal de la transcripción. Definan la secuencia de DNA.
- Union de diferentes RNA polimerasas y sitio de origen de transcripción del gen. Se unen a factores de transcripción.
- Son reconocidos por la RNA pol II.
Potenciadores
Secuencias cortas que aumentan la la transcripción del gen y alternan la estructura del DNA. Inducen el superenrrolamiento en la zona del promotor basal y aumentan la union de TF.
Silenciadores
- Modifican la estructura de la cromatina y evitan que los genes se activen.
- Recluta factores transcripcionales represores y evita que TF inductores se unan al DNA.
- Altera el proceso de corte y empalme del hnRNA y evita su maduración.
- Crea señales que bloquean la traducción.
ARN pol I
Transcribe los genes que codifican para los rRNA. Sintetiza un transcripto único, el rRNA 45S, precursor de RNA r 18S, 28S y 5.8S
ARN pol II
Sintetiza moléculas RNA m y miRNA
ARN pol III
Sintetiza snRNA, RNAt y ARNr 5S
Subunidades de las RNA polimerasas
Una grande con el dominio terminal carboxilo, que puede ser altamente fosforilada en los residuos de serina y treonina. Las otras dos subunidades son de reconocimiento de la secuencia de DNA y la del sitio catalítico.
Formación del complejo de preinicacion (transcripción)
- Iniciador (Inr): punto de inicio de elongacion
- Identificar promotor (caja tata)
- Union de factores de transcripción (proteínas que reconocen)
Union de la proteína TFIID 🐕 a la caja TATA
- TBP (proteína de union específica TATA). Se une al DNA por el surco menor.
- La union de TBP provoca una deformación de la estructura del DNA. (80)
- Componente clave en el posicionamiento de la RNA pol II y delimita la distancia desde el punto de inicio hasta la caja TATA.
TFIIA 🍎
- Estabiliza la union de TBP al DNA
- Permite que el TFIID reconozca el extremo 5 prima
TFIIB ⚽️
- Se une al TBP
- Proporciona mayor anclaje a la ARN pol II
TFIIF 🪭
Fija la RNA pol II al DNA
TFIIE 🐘
Regula la función de TFIIH
TFIIH 🚁
- (HELICASA) Utiliza ATP para desenrollar la doble hélice
- Expone el ADN templete
- Fosgorila la RNA pol II
- Fosforila el dominio carboxyterminal de la RNA pol II. Abandono del promotor.
Proceso de iniciación (transcripción)
- Síntesis de los primeros enlaces nucleotidos de RNA
- RNA pol II permanece en el promotor
- Termina cuando la enzima comienza a alargar la cadena y abandona el promotor en el complejo de iniciación.
Mediador (iniciación en la transcripción)
Permite que las proteínas activadoras se comuniquen con la polimerasa y FT
Complejo de remodelación de cromatina (inciacion en la transcripción)
Conforme se desempaca el ADN se tiene que volver a compactar atrás, este complejo son proteínas que quitan a las histonas.