Transcripcion Flashcards
Que cadena del dna usa se usa para la transcripción
3’ 5’
El arnm está en sentido
5’ a 3’
Arn más abundante en la célula
Arnr
Que es un operon
Conjunto de genes que codifican proteínas diferentes que tienen en común una vida metabólica
Cuantas ARN polimerasa hay en procariotas
1
Cuantas ARN polimerasas hay en eucariotas
3
La parte codificante del gen está
Corriente abajo 3’
Región reguladora del gen
Corriente arriba 5’
Cadena a la que el ARN es complementaria y antiparalela
Cadena molde
Cadena a la que el ARN es idéntica
Cadena codificadora
Como se denomina el inicio de la transcripción
+1
El arnhn es lo mismo que
Arnm primario
Secuencia de adn regulatoria que no codifica para el producto génico pero regula su expresión
Promotor
Región regulatoria indispensable para transcripción de un gen
Promotor mínimo
Secuencia mínima requerida para la unión de la maquinaria basal y la pol, es el inr y la caja tata o el dpe
Promotor basal
Son proteínas que se unen a los promotores que funcionan como regulador o sea aumenta o disminuye la tasa de transcripción
Se unen a promotor, silenciador, potenciador
Factores transcripcionales
Promotores basales
Fuertes y débiles
Donde están los promotores basales débiles
Eucariotas
Donde están los promotores basales fuertes
Procariotas
Fuertes
La maquinaria basal se une de forma eficaz y la transcripción es elevada
Débil
Inicio de transcripción menos frecuente necesita secuencias accesorias
Cual es la unidad de transcripción
Complejo formado por enzima y factor de transcripción
Unidad de transcripción
Complejo formado por enzima y factor de transcripción
Potenciadores, enhancers o amplificadores
Secuencias cortas que potencia transcripción del gen con otra secuencias y altera a estructura del dna induciendo súper enrollamiento en el promotor basal
Silenciadores, silencers
Elementos con regulación negativa, silenciador Por aumento de compactación del dna Mandan factores represores No dejan que madure en rnahn Bloqueando traducción
Se une idas que inhiben la acción de un potenciado o un silenciador bloqueando la transmisión de la señal de un sitio a otro del adn e impide el silenciamiento
Secuencias aisladoras
Arn pol I que está en el núcleolo
Sintetiza ARNr grande 45s: 28s, 18s, y 5.8s
Adn pol II que sintetiza que está en núcleo
Arn, arnm, arnsn, arnmi, arninc
Que sintetiza la arn pol III
Arn pequeño: 5s, ARNt y algunos arnsn
Que hace el TFIID
Tiene estructura tBP que reconoce caja TATA y se une
Que hace el TFIIA
Controla la capacidad de unión a de TBP al adn y permite al TFII D reconocer la región que se extiende al extremo 5’
Que hace el TFII B
Se une de forma adyacente a TBP, en la secuencia del promotor basal BRE cercanas a caja TATA y da más reconocimiento para que se una la ARN pol II
Que hace el TFIIF
Medio de unión de la ARN pol II al complejo de transcripción o sea con TBP y TFIIB, trae dos factores de transcripción, TFIIE y TFIIH
Que hace el TFIIE
Atrae y regula al TFIIH
Que hace el TFIIH
Tiene actividad helicasa para abrir el dna, libera la ARN pol II del promotor para elongación, fosfórica la CTD
Pasó clave para la elongación en la ARN pol II es
Fosforilacion de la cola CTD
Cuando la ARN pol inicia la elongación
Los factores se liberan
La ARN pol debe hacer cuantos enlaces mientras esta en el promotor para poder iniciar
9 enlaces
La elongación requiere de dos factores
TFIIE y TFIIH
La maduración del dna incluye
Adición capuchón 5’
Poliadenilacion
Corte y empalme
Y en algunos proceso de edición
La adición de la 7 metílica guanosina se dan en tres pasos
Eliminación de un grupo fosfato por la ARN trifosfatasa
Adición del nucleotido guanina por la guanilil trasnferasa
Metilacion por metil trasnferasa
Quien recluta las Enzimas de la adición del 7 metíl guanosina y las de poliadenilacion
Factor de elongamienton hspt5 unido a ctd
Como se da el empalme de exones
5’ donante 3’. Recepción
La enzima en corte y empalme es
Ayustosoma
Quien recluta al ayustosoma
Complejo proteico TAT SFI
Quien permite que se una el enhancer al promotor
Coesina
Que hace el factor específico PTEFb y la TFIIS
Evitan la terminación prematura de la transcripción. La TFIIS es la elonguina y participa en la reparación
Que hace el factor específico HSPT5
Factor de procesamiento del extremo 5’ y recluta las enzimas para la cap
Que hace el factor específico CPSF
Específico de la poliadenilacion y escisión
Que hace el factor específico CsTF
Participa en la escisión, corte y empalme
Que hace el factor específico, complejo proteico TAT SFI
Recluta el ayustoma
ARN nuclear pequeño que conforman el ayustoma
U1, 2, 4, 5 y 6
U1 y 2
Identifican la secuencia donante 5’
U4, 5, 6
Formación del plegamiento del ARN para acercar los sitios de corte y empalme
Que medía la U5
La unión de los exones
Quien recluta el ayustoma
Por la CTD a traves de TAT-SFI
Que hace la TBP
Se une a TATA por el surco menor y Permite que el adn se doble y se una la ARN polimerasa
Que inhibe las secuencias aisladoras
Bloquean la transmisión de señales, inhiben a la silencers y enhancers
En el covid y el vih cual es la diferencia de la polimerasa
En el COVID la polimerasa es arn polimerasa dependiente de arn
En el vih la polimerasa es adn polimerasa dependiente de ARN
Secuencias consenso
-50, -35, -10
Diferencia de la terminacion de la transcripción del arnt y arnr, de la del ARNm
En arnt termina en cola poli u y el ARNr termina por proteína parecida a roh
