Traffic membranaire Flashcards

1
Q

Que font les différentes membranes

A

Séparent différents compartiments (organites) qui jouent différents rôles

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Q

Quelles sont les 2 voies principales de traffic membranaire intracellulaire

A

La voie endosomale/de dégradation
La voie de sécrétion/de biosynthèse

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Q

Comment agit la membrane plasmique pour les différentes voies

A

À la fois comme compartiment donneur pour l’endocytose et comme compartiment cible pour la sécrétion

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4
Q

Le traffic membranaire est-il dynamique

A

OUI

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5
Q

Par quel intermédiaire se fait le transport intracellulaire

A

Via la formation et la fusion de vésicules
Les vésicules servent comme intermédiaire de transport de molécules de chargements entre les différents compartiements

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6
Q

Qu’utilise la cellule pour contrôler la spécificité de transport

A

Plusieurs étiquettes

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7
Q

que fait l’exocytose

A

Sécréton (fusion avec la membrane plasmique)

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8
Q

Que fait l’endocytose

A

Internalisation (formation de vésicules à partir de la membrane plasmique)

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9
Q

Y-a-t’il une asymtérie pour les endomembranes

A

OUI

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10
Q

Que devient le feuillet face à la lumière des vésicules

A

Le feuillet externe à la membrane plasmique

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11
Q

Quels sont les mécanismes d’internalisation à la membrane plasmique

A

Phagocytose: particules larges
Macropinocytose: liquide, non-spécifique
Endocytose dépendante de la clathrine ou de la cavéoline : spécifique, taille moyenne
Endocytose indépendante de la cavéoline et la clathrine:plutôt non-spécifique, taille petite
Micropinocytose

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12
Q

COmment se fait la phagocytose

A

Pseudopode dépendant de l’actine
Va dans des lysosomes

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13
Q

Quel signal induit la phagocytose des corps apoptotiques

A

LA PS, qui devient exposée à la membrane externe

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14
Q

Comment se fait la macropinocytose

A

Similaire à la phagocytose, mais ne prends pas de particules solides
Ingestion de goutelettes de fluide avec nutriments (comme les aa)
Dépendant de l’actine
VA dans des endosomes précoces

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15
Q

Comment se fait la polymérisation de l’actine lors de la macropinocytose

A

Autour d’une région activée par la phospholipide PIP3

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16
Q

Comment se fait l’endocytose médiée par des récepteurs et dépendant de la clathrine

A

Des récepteurs de chargements liés à leur chargement sont captés par des adaptatines qui lient aussi la clathrine à la face cytosolique de la vésicule en bourgeonnement. Déformation de la membrane
Les protéines de type dynamine s’assemblent autour du col de la vésicule. Une fois assemblées, elles hydrolysent leur GTP lié, et avec l’Aide d’autres protéines recrutées dans la région, elles détachent la vésicule
Le manteau de la vésicule mantelée de clathrine est retiré par hydrolyse d’ATP et la vésicule nue peut fusionner avec sa membrane cible

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17
Q

Quelle est la structure de la clathrine

A

En forme de triskèle dans le cytosol
Sa polymérisation en forme polyédrale à la membrane forme la vésicule

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18
Q

Le manteau de COPII forme quelle vésicule

A

Allant du RE à Golgi

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19
Q

Le manteau de COPI forme quelle vésicule

A

Allant de Golgi à RE
Exemple d’étiquetage et de triage

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20
Q

Que sont les endosomes

A

Vésicules entourées d’une simple membrane, qui proviennent de la membrane plasmique à la suite de l’endocytose

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21
Q

Comment maturent les endosomes

A

En devenant de plus en plus acides

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22
Q

Quelle est la chaine d’endosomes

A

Endosome précoce (pH 6,5)
Endosome de recyclage (pH 6,5)
Endosome tardif/ corps multi-vésiculaire (CMV) (pH 6)
Endolysosome (pH 5,5)
Lysosome (pH 5)

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23
Q

Quelle est la fonction des endosomes précoce

A

Tri et recyclage

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24
Q

Quelle est la fonction des endosomes tardofs

A

Dégradation

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25
Que fait le LDL (lipoprotéines de basse densité)
Transport de cholestérol
26
Décrit l'enxemple d'endocytose du cholestérol
Cholestérol lié au LDL reconnait le récepteur de LDL à la membrane plasmique Une vésicule se forme, entourée de clathrine Fusion avec un endosome, acidification L'endosome forme des vésicules de transort contenant le récepteur pour le recyclage, ils retourneront à la membrane L'endosome passe par un endosome tardif, puis transfert le cholestérol à un lysosome Des enzymes hydrolytiques dans le lysosome dégradent le cholestérol libre
27
Que sont les lysosomes
Acides, riches en hydrolases et sont le site de dégradation du système endomembranaire
28
Quelles sont les hydrolases acides du lysosome et quand agissent elles
Nucléases Protéases Glycosidases Lipases Phosphatases Sulfatases Phospholipases Agissent seulement à des bas pH, elles sont donc inactives avant leur arrivée dans le lysosome
29
Comment le lysosome devient-il de plus en plus acide
La V-ATPase est une pompe à H+, les faisant entrer en hydrolysant de l'ATP
30
Que sont les exosomes
Vésicules extracellulaires qui proviennent du système endosomale Elles sont libérées quand les MVB se fusionnent avec la membrane plasmique Elles sont dans le MVB et les endosomes tardifs et se forment par bourgeonnement dedans
31
De ou provient le matériel des lysosomes
Endocytose Phagocytose Autophagie
32
Qu'est-ce que l'autophagie
Un mécanisme qui entoure en membrane des régions de cytoplasme, des aggrégats protéiques, et certaines organites tels que les mitochondries et les peroxysomes, permettant leur dégradation via la fusion avec des lysosomes
33
Décrit les autophagosomes
Formés d'une double membrane,
34
Comment sont formés les autophagosomes
Via l'intermédiaire de phagophore qui s'assemblent via le recrutement de protéines spécifiques et la fusion des vésicules en provenance du RE
35
Comment se produit l'autophagie
4 étapes: nucléation, extension, maturation, fusion De façon constitutive pour maintenir l'homéostasie de la cellule Stimuléen cas de déprivation de nutriments pour promouvoir la survie
36
Que sont les peroxysomes
Présent dans tous les eucaryotes Ressemblent aux lysosomes (mais ne font pas partie du système endo-lysosomal) Organite sphérique à simple membrane Diamètre de 200-1000 nm Important pour le métabolisme et la détoxyfication
37
Que font les peroxysomes
Oxidation des acides gras Production et dégradation du H2O2 et métabolisme des espèces réactives d'oxygène (ROS)
38
De quoi sont formés les peroxysomes
Plus de 50 enzymes Catalase la plus abondante (ROS) Synthèse des acides biliaires (foie) Synthèse des lipides (en plus de RE)
39
COmment se fait la biogenèse des peroxysomes
Peuvent se forme de novo, mais la plupart se forment par fission et croissance comme les mito
40
COmment se fait la fusion des membranes
Par l'intermédiaire de protéines, SNARE.
41
Que sont les SNARE
Protéines transmembranaires sur la vésicule (v-SNARE) et sur la membrane cible (t-SNARE)
42
Décrit le processus de fusion des membranes
v-SNARE interagit avec t-SNARE Suite à la fusion, la dégradation de leur interaction nécessite l'hydrolyse d'ATP pour recycler les SNARE
43
Y-a-t'il différents SNARE
OUI, pour différents compartiments
44
Que doit faire une vésicule pour se fusionner
S'Attacher et s'appareiller avec la membrane cible via des GTPases de la famille Rab, faisant partie de la superfamille Ras
45
Y-a-t'il différents Rab
OUI, ils sont spécifiques pour certains compartiments
46
Que sont les phosphoinositides
L'anneau inositol des PI peut être phosphorylé/déphosphorylé sur ses positions 3, 4, 5 par des kinases phosphatases Ce sont des variants phosphorylés des PI
47
Quels sont les types de phosphoinositides
PI3P PI4P PI5P PI(4,5)P2=PIP2 PI(3,4,5)P3=PIP3
48
Y-a-t'il différents phosphoinositides
Oui, sur différentes membranes Façon pour la cellule de distinguer les compartiments
49
Qu'est-ce que la voie de biosynthèse
Lieu de passage des protéines nouvellement synthétisées au RER et destinées à la membrane plasmique, à l'exportation par sécrétion ou encore à d'autres organites comme les lysosomes
50
Qu'est-ce que le RE
Un réseau de citernes ou sacs membranaires qui entoure le noyau et est en continuité avec l'enveloppe nucléaire La surface est lisse (REL) ou rugueuse (RER) à cause de la présence des ribosomes Le RE est la fabrique de membranes de la cellule
51
Qu'est-ce que le REL
Sans ribosomes Réseau de tubules En continuité avec le RER
52
quels sont les roles du REL
Synthèse lipidique: phospholipides, cholestérol, hormones sétroïdes, parties lipidiques des lipoprotéines Réservoir de Ca2+ (réticulum sarcoplasmique dans les muscles)
53
Qu'est-ce que le RER
Avec ribosomes Réseau de citernes En continuité avec le REL
54
Quels sont les roles du REr
Synthèse protéique Repliement des protéines Controle de qualité Glycolysation des protéines
55
Que sont les ribosomes
COmposés d'ARNr et de protéines 20-30 nm 2 sous-unités: petite (30S) et grande (50S) Essentiel pour la traduction
56
Que sont les polysomes
Plusieurs ribosomes traduisant le même ARNm en même temps
57
Que contiennent les protéines destinées à être sécrétées et/ou transmembrnaires
Séquence signal "signal peptide" N-terminale qui dirige le ribosome au RE (23 aa)
58
Que font les ribosomes libres
Protéines cytosoliques, nucléaires ou mitochondriak
59
Que font les ribosomes liés au RE
Protéines destinées à être sécrétées ou transmembranaires ou qui fonctionnent dans le système endomembranaire
60
Décrit la translocation co-traductionnelle au REr
La première séquence du peptide produite à une séquence signal du RE, qui est reconnue par une particule de reconnaissance du signal (SRP), qui est reconnue par un récepteur de SRP dans la membrane du RE La protéine produite passera dans le canal de translocation pour aller dans le RE Séquence signal est ensuite clivée par un peptidase
61
Comment sont insérées les protéines transmembranaires dans la bicouche lipidique
Via le translocon
62
Ou commence la glycosylation des protéines
Dans la lumière du RE
63
Quelles sont les classe de glycoprotéines
N-glycosylation: oses (glucose) liés à un nitrogène de l'asparagine (Asn) dans le RE O-glycosylation: oses (galactose) liés à un oxygène de sérine (Thr) dans l'AG
64
Comment se fait la N-glycosylation
Les N des asparagines deviennent glycosylés avec une chaine initiale de 14 sucres (glycane) dans la lumière du RER par un oligosaccharide protéine transférase Glycane=2GlcNAc, 9 mannoses, 3 glucoses
65
Comment se fait le controle de qualité dans le Re
Protéine avec un glucose se lie à la calnexine/chaperonne qui enlève le glucose. Si la protéine est correctement repliée, elle va vers l'AG Si elle est partiellement repliée, une glycosyl transférase la reconnait et ajoute un glucose. Elle retourne ensuite au chaperonne et recommence laboucle
66
Comment se fait la réponse aux protéines mal repliées
S'il y a trop de protéines mal repliées, la cellule augmente la transcription des gènes chaperons tels que la calnexine pour augmenter la qté et taille de RE Auto-contrôle
67
Qu'est-ce qie IRE1
Endoribonucléase transmembranaire qui contrôle le splicing spécifique de l'ARN de XBP1
68
Qu'est-ce que XBP1
Facteur de transcription qui augmente la capacité de synthèse de la cellule
69
COmment sont éliminés les protéines transmembranaires mal repliées
Rétro-transloquées, polyubiquitinées et dégradées via dégradation associée au RE (ERAD) via des protéasomes
70
De quoi est composé l'AG
Citerne cis (proche du RER) Citerne médiane Citerne trans (proche de la membrane plasmique) , c'est la sortie
71
Comment se nomme l'espace entre le Re et AG
ERGIC compartiment intermédiaire RE-Golgien C'est un cluster tubulo-vésiculaire
72
Que comporte ERGIC
COPII=transport antérograde, via protéines motrices, vers l'AG cis COPI=transport de récupération/rétrograde
73
Comment se fait le transport rétrograde
Dans le golgi cis ou ERGIC, des protéines résidentes comme la calnexine ont une séquence KDEL si liant au récepteur KDEL Un manteau COPI entoure les endroits avec ces récepteurs pour le transport par vésicule
74
Quels sont les roles de l'AG
Finition/maturation des protéines produites dans le RER par glycosilation (ajout d'oses pour activation et stabilisation des protéines, comme pour la N-glycosylation) Étiquetage des protéines pour marquer leur destination finale (ajout d'oses p/e) Triage, concentration et emballage des protéines dans des vésicules ou granules de sécrétion. Ces granules sont acheminées à leur destination par transport le long des MT grâce à des moteurs (kinésine, dynéine)
75
Ou vont les protéines à la sortie de l'AG
lysosomes MP vésicules de sécrétion
76
Qu'est-ce que la sécrétion constitutive
Fait par toutes les cellules Protéine solubles sécrétées en permanence, aussi pour homéostasie de la MP (pompe Na/K p/e)
77
Qu'est-ce que la sécrétion régulée
Uniquement dans les cellules sécrétoires suite à un signal extracellulaire ou dans des cellules spécialisées, comme les adipocytes qui haussent le nombre de transporteurs de glucose GLUT4 à leur MP en réponse à l'insuline Dans ces cellules, le TGN fait le tri pour séparer les composantes des différents types de sécrétion de vésicules sécrétoires
78
Donne un exemple de sécrétion régulée
Bouton synaptique 1. Livraison du contenu des vésicules synaptiques à la MP 2. Endocytose de composantes des vésicules synaptiques pour former de nouvelles vésicules synaptiques 3. Endocytose de composantes des vésicules synaptiques par endocytose 4. Bourgeonnement de vésicules synaptiqes depuis les endosomes 5. Chargement de neurotransmetteurs dans les vésicules 6. Sécrétion de neurotransmetteur par exocytoe en réponse à un PA
79
Qu'est-ce que la trancytose
endocytose de la membrane plasmique apicale, puis transport et fusion avec la MP basolatérale dans les cellules polarisées