Traffic membranaire Flashcards
Qu’est-ce qu’une endomembrane?
Membrane interne délimitant un compartiment intraçR
Elle sépare les organites qui jouent différents rôles
Quels organites de la ç ont des endomembranes?
Endosome
Peroxysome
Lysosome
RER
Quelles sont les deux voies principales de trafic membranaire intraçR
Voie endosomale (endocytose, recyclage, dégradation) Voie de sécrétion (biosynthèse, exocytose)
L’appareil de golgi et le RE son associés à quelle voie: endosomale ou sécrétion?
Sécrétion
Les endosomes et lysosomes sont associés à quelle voie: endosomale ou sécrétion?
Endosomale
V ou f: la MP est le compartiment receveur pour l’endocytose
F: donneur
Un compartiment donneur est celui qui forme la vésicule par bourgeonnement
V ou f: la MP est le compartiment cible pour l’exocytose
V
Un compartiment cible est celui qui se fusionne avec la vésicule
Comment peut-on caractériser le traffic membranaire?
Très dynamique
Comment peut-on caractériser le cytoplasme dans lequel se passe le traffic membranaire
Très dense
Comment se fait le transport de molécules entre les différents compartiments (organites)
par la formation + fusion de vésicules
Comment les ç contrôlent la spécificité de transport?
Elles utilisent des étiquettes
Différence entre exocytose et endocytose
L’exocytose est la sécrétion de contenu intravésiculaire dans le milieu extérieur par fusion à la membrane plasmique, tandisque l’endocytose est l’internalisation de particule formant une vésicule par bourgeonnement de la membrane plasmique
Qu’est-ce qu’on retrouve dans chacun des feuillets de la membrane plasmique?
Interne:
- PS phosphadidylsérine
- PI phosphadidylinsositol
- PE phosphadidyléthanolamine
- Cholestérol
Externe:
- PC phosphadidylcholine
- SM sphingomyéline
- GSL glycosphingolipides
- Cholestérol
V ou f: Les endomembranes ont, tout comme les membranes plasmiques, une asymétrie entre leurs feuillets
V
Quel feuillet de l’endomembrane devient le feuillet externe et lequel devient le feuillet interne lors de l’exocytose (mm chose pour endocytose)?
Feuillet collé à la lumière de la vésicule= Feuillet externe
Feuillet collé au cytoplasme= Feuillet interne
Quelles sont les 4 différents mécanismes d’internalisation à la membrane plasmique?
1) Phagocytose
2) Macropinocytose
3) Endocytose
- Dépendante à la clathrine
- Dépendante à la cavéoline
- Indépendante de la cavéoline et la clathrine
4) Micropinocytose
*Il y a aussi l’autophagie
Classez les différents mécanismes d’internalisation selon s’ils sont spécifiques ou pas
Spécifiques:
Endocytose dépendante à la clathrine
Phagocytose
Non-spécifiques: Macropinocytose Micropinocytose Endocytose dépendante à la cavéoline Endocytose indépendante cavéoline et clathrine
De quoi est dépendsnt le pseudopode (phagocytose)
Actine
Pourquoi dit on que la phagocytose est spécifique
Car elle reconnaît un signal: PS exposé sur feuillet externe lors de l’apoptose çR et sait alors qu’il faut qu’elle phagocyte
Quelle ç fait la phagocytose
Macrophage
Différence entre macropinocytose et phagocytose
La macropinocytose est l’internalisation de goutelettes de fluide avec nutriments tandisque la phagocytose est l’internalisation de solide
Les deux sont dépendant de l’actine
Quelles sont les 5 étapes de l’endocytose dépendante à clathrine?
1) Recruitement de la clathrine et déformation de la membrane
2) Formation de la vésicule; puit mantelé
3) Scission de la vésicule par hydrolyse de GTP
4) Vésicule mantelé de clathrine
5) Perte du manteau par hydrolyse de l’ATP; vésicule de transport nue
Qu’est-ce qui permet à la clathrine de venir se lier aux récepteurs liés au ligand pour venir former le manteau de clathrine?
Adaptine
Qu’est-ce qui permet de venir faire la scission par hydrolyse de GTP?
Dynamine
Comment appelle t-on une clathrine non-polyméralisée (dans le cytosol)
Triskèle
Que forment les tryskèles lorsqu’elles s’assemblent et forment la vésicule
Treillis polyédral
Comment fait la dynamine pour faire la scission de la vésicule?
Forme des oligomères en hélices autour du cou de la vésicule en formation et hydrolyse le GTP
Différence et ressemblance entre endocytose médiée par cavéoline et clathrine
Différence: les vésicules formées par endocytose par cavéoline sont plus petites
Ressemblance: la scission est également contrôlée par dynamine
v ou f: le manteau est toujours le mm peu important la membrane donneuse
F; différents manteaux forment les vésicules à partir de différentes membranes donneuses
COP1 forme manteau sur quoi
AG
COP II forme manteau sur quoi
RE
Remettre dans l’ordre à partir de l’internalisation à la membrane plasmique jusqu’au centre de la ç:
endosome tardif (CMV) lysosome endosome précoce
1) Endsosome précoce
2) Endosome tardif (CMV)
3) Lysosome
Que fait l’endosome de recyclage
Retourne à la membrane plasmique pour être recyclé, transporte le récepteur
Caractéristiques des endosomes
- Vésicule
- Simple membrane
- Origine= MP, par endocytose
3 types d’endosomes
Tardif, précoce et de recyclage
V ou faux; un endomse à pH=6,8 est plus mature qu’un endosome à pH=5,2
f: les endosomes se maturent en devenant de plus en plus acide
Quels endosomes ont pour fonction le tri+recyclage
Endosome précoce et de recyclage
Quels endosomes ont pour fonction la dégradation
Endosomes tardif/corps multi vésiculaires, endolysosome, lysosome
pH de 6,5 correspond à
Endosome précoce et de recyclage
pH de 6 correspond à
Endosome tardi/CMV
pH de 5 correspond à
lysosome
Par quoi s’effectue le transport du cholestérol
Lipoprotéines de basse densité (LDL) (viendront se lier aux récepteur de LDL)
Qu’est-ce qui libère le cholestérol à l’intérieur des lysosomes
Enzymes hydrolitiques
Caractéristiques des lysosomes
- Acides
- Riches en hydrolases
- Site de dégradation du système endomemembranaire
Quelles sont les hydrolases
Nucléases Protéases Glycosidases Lipases Phosphatases Sulfatases Phospholipases
V ou f; les enzymes hydrolitiques sont actives seulement à PH bas donc sont inactives avant d’entrer dans le lysosome
V
Comment se nomme la pompe à protons chargée d’hydroliser de l’ATP en ADP qui s’insère dans les lysosomes
V-ATPase
Ph cytosolique
7,2
Comment nomme t-on un vésicule extraçR libéré quand les endosomes tarifs se fusionnent avec la membrane plasmique et formé à partir de bourgeonnement de l’endosome
Exosome
L’endosome précoce devient l’endosome tardif. Celui-ci peut alors faire 2 choses, quelles sont-elles
Soit aller se fusionner à la MP et libérer exosomes
Soit devenir un lysosome pour faire dégradation
Qu’est-ce qui est précurseur des endosomes de recyclage
Endosome précoce
Qu’est-ce que la mitophagie
Dégradation sélective des mitochondries par l’autophagie
Les lysosomes peuvent recevoir du matériel de quelles sources
Phagocytose (phagosome)
Endocytose (endosome)
Autophagie (autophagosome)
Caractéristiques des autophagosomes
- Membrane double
- Transportent mitochondries et peroxisomes
- Doit se fusionner à lysosome pour faire dégradation (autophagolysosome)
Caract.ristiques des peroxysomes
-Dans toutes ç eucaryotes
-Ressemblent lysosomes
-mmebrane simple
-fonction pour métabolisme (oxydation acides gras) et détoxification (produit et dégrade H202 et métabolisme des esèes réactives d’oxygène)
-Périphérie= bicouche lipidique
Centre=corps cristallin
-Contient plus de 50 enzymes: catalse ROS, synthèse des acides biliaires pour foie et synthèse des lipides
Comment se forment les peroxysomes?
- Plupart= par fission et croissance
- Certains= se forment de novo et croient
À quoi sert l’endosome précoce
Fait le tri (endosome de triage) pour voir si l’endosome sera recyclé à la membrane ou s’il sera dégradé via lysosome
V ou f: seulement le ligand est internalisé lors de l’endocytose, pas le récepteur
F: typiquement un récepteur liant un ligand sera endocytosé avec son ligand
La fusion des membranes se fait par quel type de protéine transmembranaire
SNARE (v-SNARE = vésicules et t-SNARE = membrane cible)
Qu’est-ce que ça prend pour faire exocytose (ion)
Ca2+
De quoi dépend le désassemblage des complexes v-/t-SNARE
Hydrolyse ATP
V ou f: GTP est nécessaire pour recycler composantes
f: ATP
V ou f: Il existe plusieurs différents SNARE pour différents organites
V
Étapes pour la fusion d’une vésicule
1) Attachement de la vésicule (qui porte Rab-GTP) à la membrane cible par la protéine d’attachement effecteur de rab
2) Appareillage de la vésicule à la MC
3) Fusion
Rab est active sous-quelle forme?
GTP
Quelle protéine permet l’activation de Rab? son inactivation?
activation=GEF
désactivation= GAP
Qu’est-ce qui diffère entre les membranes cibles des différents compartiments/organites?
Différents SNARES
Différents Rabs
Composition de la bicouche lipidique change
Pourquoi le phosphadidylinositol est très important?
Car l’anneau inositol peut être phosphorylé ou déphosphorylé sur ses portions 3,4,5 par des kinases et phosphates
Elles jouent un rôle clé sur différentes membranes çR de façon que les ç puissent distinguer les compartiments (étiquettage)
Où les protéines sont-elles synthétisées dans la ç
RER
Chemin des protéines destinées à la mp
1) Produits au RER (RE= porte d’entrée voie de sécrétion)
2) Passent par AG
3) MP
Qu’est ce que le RE
- Réseau de citerne/sacs membranaires entourant le noyau
- Surface lisse ou rugueuse
- Fonction= fabrique de membranes de la ç
v ou f: le RE est en continuité avec l’enveloppe nucléaire
V
Pourquoi on dit que le RE est rugueux
Car il est recouvert de ribosomes
Caractéristiques du REL
- Sans ribosomes
- Réseau de tubule
- Continuité avec RER
- Fonctions =
1) Synthèse lipidique (phospholipides, cholestérol, hormones stéroïdes et parties lipidiques des lipoprotéines)
2) Réservoir des Ca2+ dans muscles, forme le réticulum sarcoplasmique
Caractéristiques du RER
- Avec ribosomes
- Réseau de citernes
- Continuité REL
- Fonctions=
1) Synthèse des protéines sécrétoires et membranaires via translocation co-traductionnelle
2) Repliements des protéines dans la lumière (structure secondaire)
3) Contrôle de la qualité grâce aux chaperons
4) Glycosylation des protéines
Caractéristiques des ribosomes
- Composés de ARN ribosomales et protéines
- 2 sous-unités: une grande (50s) et une petite (30s)
- Fonction= traduction des protéines
Qu’est-ce qu’un codon
3 nucléotides
Dans quel sens le ribosome se déplace (translocation) pour faire la synthèse des protéines
5’->3’
Qu’est-ce qui apporte les acides aminés à la chaine polypetidique
ARNt
Qu’est-ce qu’un polysome
Multiples ribosomes en train de traduire le mm ARNmessager simultanément
Où le ribosome commence son travail? Où il l’arrête?
Début= codon initiateur
Fin=codon STOP
Si les ribosomes sont dans le cytoplasme, comment produire des protéines destinées à être sécrétées hors de la ç ou a être insérer dans MP?
Grâce à la séquence signal “signal peptide” N-terminal fait de 23 acides aminés qui dirige le ribosome au RE (étiquettage)
Qu’est ce que le ribsome a besoin pour se mettre sur le RE
Particule de reconnaissance du signal (attachée à séquence signal du RE)
Qu’est-ce qui se passe en mm temps que que la translocation dans la membrane du RE
la traduction
Qu’est-ce qu’un translocon?
Complexe protéique qui sert de canal de translocation
Étapes de la translocation co-traductionelle au RE
1) Séquence signal du RE amène le ribosome chevauchant l’ARNm qui va se faire traduire à la surface extenre du RE
2) La protéine qui se forme s’allonge dans la citerne du RE à travers le translocon
3) Séquence signal clivée par peptidase
4) Les protéines transmembranaires sont insérées dans la bicouche lipidique (pourra être glycolysé)
Qu’est-ce qu’un glycocalyx
Protéine transmembranaire glycolysée de façon intense à l’extérieur de la ç
Rôles glycocalyx (2)
1) Protection chimique (ex; entérocyte intestin)
2) Reconnaissance çR (ex; ç immunitaires)
Où commence la glycolysation des protéines
Dans lumière RE
Quelles sont les deux classes majeures de glycoprotéines
N-glycosylation: Ose lié au N de l’asparagine, produit dans RE par précurseur de glycane (14 sucres)
O-glycosylation: Ose lié au O de la sérine/thr, AG
Qu’est-ce qui effectue le contrôle de la qualité dans la lumière du RE? Comment effectue t-il sa tache?
Chaperon calnexin: retient les glycoprotéines non-repliées pour les empêcher de quitter vers AG
Protéines anormales seront rétro-transloquées et éliminées via dégradation associée au RE (lie à ubiquitine et protéasome)
Qu’arrive t-il s’il y trop de protéines mal repliées (unfolded protein response)
Ç augmente transcription des gènes de chaperons calnexin-> augmente la qté de RE
Forme d’auto-contrôle de la taille du RE
En détail:
IRE1 (endoribonucléase transmembranaire) va contrôler l’épissage spécifique de l’ARN XBP1 + dégradation d’autres ARNm -> réduit la traduction des autres ARNm, mais augmente traduction XBP1 -> XBp1 augmente la capcité de la ç à traduire de l’ARNm de chaperon
Quels sont les deux dispositifs utilisés par la ç pour éliminer des protéines
Lysosomes
Protéasomes
Différence lysosome vs protéasome
Lysosome= traitement spécifique pour protéines enfermées dans vésicules Protéasomes= traitement spécifique pour protéines solubles dans cytosol et nucléoplasme, dégrade par une série de protéase
Une ç qui suit le flux net de transport et entre dans l’AG du côté du RER (=entrée) va traverser quelles partie du AG?
Côté RER=entrée 1)Citernes cis (Réseau cis-Golgien) 2)Citernes médianes (saccules de la région médiane) 3)Citernes trans (Réseau trans-Golgien) Côté membrane plasmique=sortie
V ou f: Seules les ç animales possèdent un AG
f; les ç végétales aussi
Qu’est-ce qui se trouve entre le RE et l’AG
Le compartiment intermédiaire RE-Golgien
COP11 est quel type de transport
Transport antérograde des cluster tubulo-vésiculaires, du RE au réseau cis-Golgien
COP1 est quel type de transport
Transport de récupération/rétrograde, du réseau cis-golgien au RE
Permet la rétention au RE (retour)
Rôles de l’AG
1) Maturation des protéines produites dans RER par glycolysation
2) Étiquetage des protéines pour marquer leur destination finale
3) Triage (dans Réseau trans), concentration et emballage des protéines dans vésicules ou granules de sécrétion qui seront acheminées par transport le long des microtubules par moteur de dynéine et kynésine
Où commence et se termine la glycolysation?
Commence dans le RER (enrichi en manose simple), continu dans l’AG (maturation des glycosylations) et s’y fini (oligosaccharides plus complexes)
Différence entre sécrétion constitutive et régulée
Constitutive:
-Fusion membranire non régulée, la vésicule de transport est constituée d’une couche de lipides de la et de protéines de la membrane plasmique
-Faite par toutes les ç
-Protéines solubles sécrétées en permanence
-Sert à l’homéostasie de la membrane plasmique
Ex: pompe na+/k+ ATPase
Régulée:
-Nécessite un signal extraçr (hormone et neurotransmetteur) pour activer la transduction du signal et la fusion membranaire de la vésicule
-Seulement dans les ç sécrétoires ou ç spécialisées comme adipocytes (augmentent GLUT4 en rep à insuline)
ex: Ç bêta du pancréas qui sécrètent insuline en réponse
Bouton synaptique
V ou f: dans les ç polarisées ou il y 2 membranes plasmiques on retrouve des endosomes précoces basolatéraux et apicaux
V
Comment s’appelle le transport endosomal dans les ç polarisées
Transcytose
Processus de transcytose
1) Endocytose de la MP apicale
2) Transport
3) fusion avec la MP basolatérale
