Traffic Flashcards
Quelles sont les deux voies principales du traffic intracellulaire?
1) Endosomale
2) De sécrétion
Grossièrement, que comprend la voie endosomale?
L’endocytose, le recyclage et la dégradation.
Grossièrement que comprend la voie de sécrétion?
Biosynthèse et exocytose
Vrai ou faux, la membrane plasmique est impliqué dans les deux voies de trafic intracellulaire?
Vrai. Elle est le compartiment donneur (endocytose) et le compartiment cible (exocytose)
Vrai ou faux, le cytoplasme n’est pas très dense?
Faux. Extrêmement dense.
Que permet la formation et la fusion de vésicules?
Le transport intracellulaire.
Comment appelle t’on la formation de vésicules à partir de la MP?
Endocytose (internalisation)
Comment appelle t’on la fusion de vésicule avec la membrane plasmique?
Exocytose (sécrétion)
Lors de l’endocytose où de l’exocytose, le feuillet côté lumière est équivalent à quel feuille de la MP?
Le feuillet externe.
Quels sont les trois mécanismes d’internalisation à la MP et qu’est-ce qu’ils ciblent?
1) Phagocytose ; particules larges
2) Macropinocytose; liquide, non spécifique
3) Endocytose; particules moyennes petites
Nomme un synonyme d’endocytose?
Micropinocytose
Quels sont les trois types d’endocytose?
1) Dépendante à la Clathrine
2) Dépendante à la cavéoline
3) Indépendante à la clathrine et à la cavéoline
Comment est-ce qu’un vésicule est formé durant la phagocytose?
Formation de pseudopodes (ACTINE), qui vont “manger” la particule
Quel est le rôle des phosphatylserines dans la phagocytose?
Agissent comme un signal qui induit la phagocytose des corps apoptotiques.
De quoi dépend la macropinocytose?
De l’actine
Par quelle protéine est activé la macropinocytose?
Ras-GTP (voie Pl3K…) Bonus
Quelles sont les étapes de l’endocytose dépendante à la clatherine?
1) Recrutement de clatherine
2) Formation d’un puit mantelé
3) Scission du vésicule mantelée
4) Perte du manteau de clatherine
Comment est-ce que la clathrine est recrutée?
Elles sont attachées à des récepteurs de chargements liés à leur chargement.
De quelle forme est la clathrine dans le cytosol?
En forme de triskèle
Par quoi est médiée la scission?
Par la dynamine et aidée par l’actine.
Quelle molécule est hydrolyser lors de la scission?
GTP
Quelle molécule est hydrolysée lors de la perte du manteau?
ATP
Vrai ou faux; il existe différents types de manteaux dépendant du type de membrane donneuse?
Vrai (ie: COPI, COPII)
Quelle est la grosse différence entre endocytose dépendant à la clathrine et endocytose dépendant à la cavéoline?
Vésicules plus petits
Comment appelle t’on les vésicules formés par la cavéoline?
Cavéolae
Comment se forme les calveolae?
La calvéoline (prot membranaire) s’associe avec les radeaux lipidiques (donc présence de PL, SL et chol.)
Qu’est-ce qu’un endosome?
Une vésicule entourée d’une simple membrane.
Comment est-ce qu’un endosome précoce peut maturer en endosome tardif?
En devenant de plus en plus acide
Quelle est la fonction de l’endosome précoce?
Tri et recyclage
Quelle est la fonction de l’endosome tardif?
Dégradation
Qu’est-ce que l’endosome recycle?
Il va trier les récepteurs et leur contenu et recycler les récepteurs à la MP.
Vrai ou faux; les lysosomes sont acides?
Vrai (pH~5)
Quels types d’enzymes retrouvons nous dans un lysosome?
Hydrolases (nucléases, protéases…)
Vrai ou faux: les hydrolases sont activés dans le cytosol?
Faux, ils sont actifs seulement à bas pH donc pas avant d’entrer dans un lysosome mature.
Quel est le site de dégradation du système endomembranaire?
Les lysosomes
D’où proviennent les exosomes?
Système endosomale: ils sont libérés lorsque les corps multivésiculaires (MVB) fusionnent avec la MP.
Le bourgeonnement des exosomes se fait où?
Dans les endosomes tardifs. (ce qui crée des MVB)
Quelles sont les trois sources de matériel pouvant se rendre au lysosome?
- Endocytose
- Phagocytose
- Autophagie
Qu’est-ce que l’autophagie?
C’est un mécanisme qui capture la molécule problématique entre deux membranes.
Où peut se dérouler l’autophagie?
Dans le cytosol
Quelles sont les étapes de l’autophagie?
- Nucléation
- Extension
- Maturation
- Fusion
Qu’est-ce qu’un autophagosome?
C’est le vésicule formé des organelles, de cytosol entre les deux membranes.
Via quoi sont formés les autophagosomes?
Via les phagophores
La fusion autophalgique se fait entre quoi et quoi? Et quel est le résultat?
Entre l’autophagosome et le lysosome et donne l’autophagolysosome.
A quoi sert l’autophagie dans une cellule?
- Maintenir l’homéostasie
- Promouvoir la survie en cas de deprivation de nutriments
Explique rapidement comment l’autophagie peut répondre à la deprivation de nutriments?
Lorsqu’on mange moins, nos cellules reçoivent moins de nutriments.
Il y a détection de cette baisse et stimulation de lautophagie pour aller chercher des ÀA et des AG pour faire de la synthèse de protéine et de l’ATP.
Quelles sont les caractéristiques d’un peroxysomes?
- Présent dans toutes les c eucaryotes
- Ressemble au lysosome
- Organite sphérique
- Simple membrane
- Important pour la detoxification
Quel est le rôle principal des peroxysomes
Oxydation des acides gras
Que permet le pH légèrement plus élevé dans l’endosome précoce?
La dissociation possible du ligand et de son récepteur. (Permet le recyclage de ce dernier)
Par quelles protéines transmembranaires se fait la fusion des membranes?
V-SNARE (sur le vesicule)
T-SNARE (target cell)
Pourquoi les complexes v- / t- SNARE sont hydrolyser?
Pour pouvoir recycler les composantes
Quelle autre protéine est nécessaire pour appareiller Le vésicule à la membrane?
RAB-GTP
Vrai ou faux; GEF active RAB?
Vrai, il échange son GDP pour un GTP.
Vrai ou faux; GAP désactive RAB
Vrai; il phosphoryle son GTP en GDP
Comment appelle t’on les phosphadidylinositol phosphorylés?
Les phosphoinositides
A quoi servent les phosphoinositides?
À distinguer les compartiments, puisqu’elles sont différentes sur les différentes membranes.
Quel RE a un réseau de tubules?
REL
Quel RE a un réseau de citerne?
RER
Quels sont les rôles du REL
- Synthèse lipidique
- Réservoir de Ca
Quels sont les rôles du RER?
- Synthèse protéique
- Repliement des protéines
- Contrôle de qualité des protéines
- Glycosylation des protéines
Comment produire des protéines destinées à être sécrétées hors de la c ou à être insérer dans la MP?
Grâce à une “séquence signal” N-Terminal.
Comment appelle t-on un sequence signal?
Signal peptide / etiquette
Comment fonctionne le séquencé signal?
Dirige le ribosome vers le RE
Quelle est la différence entre les ribosomes libres et ceux du RE?
Les ribosomes libres vont coder les protéines cytosoliques (ou nucléaires ou mitochondriales)
Alors que les ribosomes du RE vont coder les protéines destinées à être sécrétées ou transmembranaires
Vrai ou faux; il existe un pool commun de sous-unités ribosomiques dans le cytosol?
Vrai
Comment se déroule la translocation co-traductionnelle au RER?
- La séquence signal amène les ribosomes chevauchant l’ARNm à la surface du RE
- La protéine qui se forme s’allonge dans la citerne du RER grâce au translocon
- La séquence signal est clivée par un peptidase
- Les modifications se font au fur et à mesure sur la protéine (glycosylation, contrôle de qualité…)
Qu’est-ce qui distingue les protéines transmembranaires des autres protéines lors de la traduction dans le RER?
Elles ont une séquence hydrophobe de départ de transfert et une d’arrêt de transfert, permettant d’avoir une partie interne et une partie externe.
A quoi sert le glycocalyx retrouvé sur certaines protéines transmembranaires?
Protection chimique
Reconnaissance immunitaire
Quels sont les deux mécanismes de glycosylation et où se passent-ils?
N-Glycosylation (RE)
O-Glycosylation (AG)
A quoi sert le contrôle de qualité et où se passe t’il?
S’assurer que les protéines sont bien repliées.
Dans la lumière du RE
Où vont les protéines correctement repliées?
Vers AG
A quoi servent les chaperonnes calnexin?
Retenir les protéines mal repliées.
Qu’est-ce que la UPR?
“Unfolded protein response”
A quoi sert la UPR?
Va augmenter la transcription des gènes de chaperons (calnexine).
Cela va augmenter la quantité de RE.
Décrire grossièrement la UPR.
- IRE1 va être activé par la protéine mal pliée
- Va activer XBP1
- XBP1 est un facteur de transcription qui va augmenter la capacité de synthèse de chaperons
Qu’est-ce qui arrive aux protéines qui sont ANORMALEMENT repliées?
Signal puis broyées dans le proteasome
Quelle est la porte d’entrée de la voie de sécrétion?
Le RE
Lors de la translocation co-traductionnelle, la protéine va prendre une forme secondaire?
Oui
Quels sont les trois réseaux de l’appareil de Golgi?
Cis
Médian
Trans
Comment appelle-t-on l’espace entre le RE et le premier réseau de l’appareil de Golgi?
Compartiment intermédiaire RE-Golgien (ERGIC)
Quelle est la direction du transport antérograde?
RE —> ERGIC
Quelle est la direction du transport rétrograde?
AG —> ERGIC —> RE
Quelles molécules sont responsable de former les vésicules nécessaires au transport antérograde? Au transport rétrograde?
COPII
COPI
Qu’est-ce qu’un cluster tubulo-vestibulaire?
?
Comment se déplace le cluster tubulo-vestibulaire?
Sur des MT a l’aide de protéines motrices (kinesine et dyneine)
Quelle séquence signal permet à une protéine de retourner au RE par transport rétrograde?
KDEL
Vrai ou faux; le transport rétrograde peut se faire d’un réseau golgien a un autre?
Vrai
Quels sont les rôles de l’appareil de Golgi?
- Maturation des protéines du RER
- Étiquetage des protéines
- Triage dans des vésicules de sécrétion
Comment vont cheminer les vésicules de sécrétion entre l’AG et la membrane plasmique?
Le long de MT grâce à des protéines motrices (kinesine, dyneine)
Vrai ou faux; la
Glycosylation commence dans l’appareil de Golgi?
Faux, elle commence dans le RE puis se termine dans l’AG
Qu’est-ce que la sécrétion constitutive?
Protéines solubles sécrétées en permanence.
Qu’est-ce que la sécrétion régulée
Protéines sécrétoires
Où se fait la sécrétion régulée?
Cellules sécrétoires
Ou se fait la sécrétion constitutive?
Toutes les c
Où se fait le tri (entre sécrétions)?
Au niveau du réseau trans Golgien
Comment se fait le transport endosomale dans les c polarisées (pole apical et pôle basal)
Par transcytose
