TIBBİ MOLEKÜLER VE BİYOLOJİ Flashcards
MORFOLOJİ
YAPILARI İNCELER
FİZYOLOJİ
SİSTEM VE ORGANLARI İNCELER
TIBBİ BİYOLOJİ
Canlıları birbirleriyle kıyaslayarak onları tanımayı ve insanlarla olan ilişkilerini ortaya koymayı amaçlar
MOLEKÜLER BİYOLOJİ
Hücrede kalıtsal maddeyi içeren genlerin yapısını ve gen kontrolü altında yapılan biyolojik olayları moleküler düzeyde inceler
EVRENİN EVOLÜSYONU HİPOTEZİ
Evren ve parçaları önce çok yoğun durumda bulunan başlangıç maddesinin patlamasıyla oluşmaya başlamış ve o zamandan beri yayılıp büyümesini sürdürmüştür.
STROMATOLİT
FOSİLLEŞMİŞ KİTLE demektir. Prokaryotların en eski fosillerinin çoğu stromatolitlerin içinde bulunur.
DÜNYA,NIN ORİJİNİ VE YAŞI
1) Primordial (ilkel) maddenin patlamasıyla oluştu. Küçük kütleliydi. Etrafına kozmik parçalar eklenerek kütlesi arttı.
2) Kütle arttıkça çekim gücü arttı ve toz partikülleri sıkıştı. Sıkışma arttığından sürtünme dolayısıyla sıcaklık da arttı.
3) Uzun yıllar sonra kütle soğudu. Isıma ve soğuma evrelerinde kimyasal olayla oldu. Ağır metaller merkezi , hafif metaller ise dış kısmı oluşturdu.
4) Yerküre soğuma dolayısıyla yüzeyin sıvı halden katı hale geçmesiyle oluşur. Yerkabuğu ise volkanik püskürmeler ile merkezdeki sıvı kütlelerin yeryüzüne çıkıp katılaşmasıyla oluştu.
5) Dünya’nın sahip olduğu yerçekimi sayesinde atmosfer tutulabildi ve hava küre oluştu.
ENDOSİMBİYOTİK HİPOTEZ
Ökaryot hücrelerin içinde yer alan mitokondri ve kloroplastların evrimsel sürecin içinde oksijensiz solunum yapan hücrelerin oksijenli solunum yapan bir hücreli prokaryotların girmesiyle oluşmuştur.
SOLVENT
Katı ya da sıvı haldeki maddeleri ayrıştırmak ve seyreltmek için kullanılan çözücülerdir.
En fazla yayılış ve çeşitlilik gösteren karasal hayvanlar nelerdir ?
Bazı eklem bacaklılar ve bazı omurgalılar.
TETRAPODA
KARASAL OMURGALILAR
Canlıların meydana gelişi ile ilgili ilk hipotez?
Aristo’nun ABİYOGENEZ=SPONTAN GENERESYON(kendiliğinden oluş) HİPOTEZİ
Aristo ABİYOGENEZ HİPOTEZİ neyi savunur?
Aristo cansız maddeler içinde aktif öz bulunduğunu ve canlıların bu sayede oluştuğunu savunmuştur
BİYOGENEZ HİPOTEZİ’ni kim ileri sürmüştür ve neyi savunur?
REDİ öne sürmüştür. Canlıların kendiliğinden oluşamayacağını ve bir canlının ancak başka bir canlıdan meydana geleceğini savunmuş ve ispat etmiştir. BİYOGENEZ: Canlıların canlılardan türemesi olarak adlandırılır.
İlk mikroskobu kim bulmuştur?
LEEUWENHOEK
Biyogenez’den sonra ilk canlı nasıl oluştu?
sorusuna cevap arandı. Buna göre ilk organizmalar 4 evrede gerçekleşen kimyasal evrimin ürünleridir. Kimyasal evrimin 4 evresi nelerdir?
1) Aminoasitler ve nükleotitler gibi küçük organik moleküllerin cansız olarak sentezlenmesi,
2) Bu moleküllerin birleşerek protein ve nükleik asit gibi polimerlere dönüşmesi,
3) Kalıtımı mümkün kılan kendi kendini eşleyen moleküllerin ortaya çıkması
4) Tüm bu moleküllerin PROTOBİONT şeklinde paketlenmesi
PROTOBİONT
Zarla çevrili, iç kimyası çevrelerinden farklı olan damlacıklar
Oparin HAYATIN BAŞLANGICI adlı eserinde neyi neye benzetmiştir ve neyi öne sürmüştür?
Cansız sistemlerin çok yavaş gelişen değişimler sonucu canlı sistemleri oluşturduğunu öne sürmüştür.
İlk denizleri sıcak bir çorbaya benzetmiştir.
Wöhler ilk olarak neyi sentezlemiştir ve deneysel olarak neyi ileri sürmüştür?
Sadece hücrenin içinde olan mevcut bazı maddelerin hücre dışında da olabileceğine dair ilk fikri deneysel olarak sürmüş ve organik bir madde olan üreyi ilk defa laboratuvar ortamında sentezlemiştir.
OTOKALİTİK nedir?
OTOKALİTİK: Tepkime sonucu ürün olarak çıkıp yeniden aynı tepkimeye girmesi. Kendini tekrarlama tarzı bir şey denilebilir.
RNA OTOKALİTİKTİR.
Dünya’da seçilen ilk molekülün RNA olması tamamen evrimsel bir seçimdir. Bu evremsel seçimde rol oynayan etmenler nelerdir?
1) RNA molekülünün daha kararlı olması
2) RNA molekülünün tek zincirli olması
3) RNA moleküllerinin kendilerine özgü 3 boyutlu yapılarının olması
4) Kendini daha hızlı eşleyebilmesi
5) Daha az hata ile kendini eşleyebilmesi
Lipoid ve konservat terimleri nedir?
İlkel atmosfer gazları varlığında hücrenin temel organik molekülleri elde edilmiştir. Daha sonra bunların etrafı LİPOİD denilen bir zarla çevrilmiştir. Bu zar çevreden madde alışverişini engellememiş ve etrafındaki su moleküllerini tutarak KONSERVAT denilen yapıları oluşturmuştur.
22 tane flashcardın özeti kısaca?
İlk canlı inorganik maddelerin milyarlarca yıl süren evrimi sonucu meydana gelmiş. Heterotrof olarak difüzyonla beslenmiş ve oksijensiz solunum yapmıştır.
İNORGANİK EVRİM
Evrenin ve dünyanın kimyasal bileşiklerini uğradığı evrimdir.
ORGANİK EVRİM
İlk hücrenin meydana gelişinden itibaren çeşitli mutasyonların birikmesiyle canlılarda meydana gelen değişikliklerdir.
DOMAİN ne demektir?
ALEM
Canlılar alemi kaça ayrılır?
Canlılar alemi üçe ayrılır.
ÖKARYA ,ARKEA ve BAKTERİ DOMAİNİ olarak
ÖKARYA DOMAİNİ ise 4’e ayrılır: Protista, bitki, mntar, hayvan olmak üzere
İkili adlandırma nasıl oluşur?
TÜR ADI+ÖZEL AD
Hücrenin varlığı ilk kez kim tarafından bulunmuştur?
ROBERT HOOKE
Robert Hooke hücreyi nasıl keşfetmiş ve ne isim vermiştir?
Kendi yaptığı mikroskobunda şişe mantarı hücrelerini boşluk halinde görmüş ve bu boşluklara CELLULA=HÜCRE adını vermiştir.
HÜCRE
Bağımsız metabolizma yeteneğine sahip canlının en küçük fizyolojik birimidir.
VİTAL İNCELEME
Mikroskobik incelemelerde incelenecek materyal canlı halde bir işlemden geçirilmeden veya toksik olmayan boyalar kullanılarak incelenmesine denir.
Hücre kültürleri nelerde kullanılır?
- Çeşitli hastalıkların tedavilerinde kullanılan ilaçların araştırılması,
- Hücrenin moleküler düzeyde incelenmesi,
- Kromozomların araştırılması,
- Hücresel olayların invitro incelenmesinde kullanılır.
İNVİTRO ve İNVİVO incelemeler nedir?
Organizma DIŞINDA yapılan incelemeler İNVİTRO İNCELEMELER, organizma ÜZERİNDE yapılan incelemelere İNVİVO İNCELEMELER denir
Tek tip hücre çoğaltılması nedir?
Aynı tip hücreler çoğaltılarak bu hücre tipi ile ilgili problemlere invitro olarak çözümler aranır. (Cell line )
KÖK HÜCRE (STEM CELL)
Kök hücreler vücudun bütün doku ve organlarını oluşturan ana hücrelerdir. Farklılaşmamış bu hücrelerin kendini yenileme, sınırsız bölünme, doku ve organlara dönüşebilme yetenekleri vardır. Bu sebeple birçok hastalığın tedavisinde kullanılırlar.
İnvitro olarak üretilebilen 3 tip hücre kaynağı nelerdir?
1) Kordon kanından elde edilen kök hücre
2) Yetişkin kök hücre
3) Embriyonik kök hücre
Fiksasyon işlemi nasıl yapılır?
Fiksasyon işlemi ile doku aniden öldürülerek dokunun mümkün olduğunca canlı haline en yakın şekliyle incelenmesi sağlanır.
FİKSATİF nedir?
Fiksasyon işlemi sırasında kullanılan maddeye denir.
Fiksasyon sırasında dikkat edilmesi gereken hususlar?
1) Uygum fiksatif seçilmelidir.
2) Fiksasyon çabuk yapılmalıdır.
3) Uygun fiksasyon süresi tespit edilmeli ve süreye dikkat edilmelidir.
4) Dokunun kurumaması gerekli.
5) Fiksasyondan önce kan uzaklaştırılmalı=PERFÜZYON
6) Parçanın büyüklüğüne dikkat edilmelidir.
7) Parçalar fiksatife gömülmelidir. Fiksasyon süresi boyunca fiksatif birkaç kez değiştirilmelidir.
8) Fiksasyon uygun sıcaklıkta yapılmalıdır.
9) Çalkalayarak ya da döner bir tabla kullanılarak fiksatifin parça içine daha iyi nüfuz etmesi sağlanmalıdır.
İyi bir fiksatifte aranan özellikler nelerdir?
1) Dokuya ve hücreye çabuk nüfuz etmelidir. Böylece ölüm sonrası değişikler önlenebilir.
2) Hücre içeriğini erimeyen maddeler halinde çöktürmelidir. Böylece daha sonraki serilerden geçirilirken hücrenin kısımları kaybedilmeyecektir.
3) Fiksatif izotonik olmalı. Dokunun şişmesi veya büzüşmesi önlenir
4) Fiksatifin PH’ı önemlidir.
5) Fiksatif daha sonra kullanılacak boyalarla uyumlu olmalıdır.
DOKU TAKİBİ nedir?
Dokuların mikroskobik incelemeye hazır hale getirilmesi için yapılan işlemler serisine denir.
Doku takibinin aşamaları nelerdir?
1) DEHİDRASYON
2) ŞEFFAFLAŞTIRMA
3) SERTLEŞTİRME
Dehidrasyon işlemi ve ajanları nelerdir?
Dehidrasyon işlemi dokudan suyun uzaklaştırılması amacı ile yapılmaktadır. Etil alkol ve aseton dehidrasyon ajanlarıdır. İŞLEM: Takibi yapılacak dokunun düşük dereceli alkollerden başlayarak artan derecelerdeki alkol banyolarından geçirilerek yapılır.
ŞEFFAFLAŞTIRMA nasıl yapılır ve ajanları nelerdir?
Şeffaflaştırıcı ajan olarak dehidrasyon maddesini temizleyebilen ,sertleştirici madde ile uyumlu olabilen ve dokuya nazik davranan kimyasallar seçilmelidir.
Şeffaflaştırıcı ajan olarak KSİLEN, TOLUEN GİBİ BENZENLER kullanılır
SERTLEŞTİRME neden yapılır?
Dokuların mikrotom ile kesilebilmesi için sertleştirilmesi gerekir.
İMPREGNASYON (doyurma, doldurma) nedir?
Sertleştirme aşamasında solüsyonların tutucu bir madde ile yer değiştirmesidir.
PARAFİN nedir?
En yaygın kullanılan sertleştirici maddedir.
Parafin kesitlerinin daimi hale getirilmesi işlemi nelerdir?
1) 4-5 nanomikro kalınlığında alınan parafin kesitler deparafinize edilir.
2) Hidrasyon serisinde geçirilir.
3) Hematoksilin ile nukleuslar boyanır. Çeşme suyunda çalkalanır.
4) Eosin ile sitoplazma boyanır.
5) Dehidrasyon yapılır.
6) Entellonla kapatılır.
Işık mikroskobu örnekleri?
1) Polarizasyon mikroskobu
2) Faz-kontrast mikroskobu
3) Karanlık alan mikroskobu
4) Ultraviyole (floresans) mikroskobu
5) İnvert mikroskop
Işık mikroskobu nasıl çalışır?
Mikroskobun tabanına yerleştirilmiş bir ışık kaynağından ya da yakındaki bir ışık kaynağından ayna yardımıyla görünür ışık elde edilir. Elde edilen ışık KONDANSÖR aracılığı ile obje üzerine düşürülür.
KONDANSÖR nedir?
Dağınık halde gelen ışığı bir ışık konisi şeklinde objenin üstüne düşürülmesini sağlar.
Polarizasyon mikroskobu nedir, nasıl çalışır ve hangi durumlarda kullanılır?
Bazı hücre ve doku bileşenlerinin polarize ışıkta gösterdikleri özel davranışlardan geliştirilmiştir. Normal ışık mikroskobundan farklı olarak ışık kaynağı polarize ışıktır. Tırnak, boynuz ve kemik kesitlerinin incelenmesinde özellikle mineral yapılar, vitaminler ve hormonların araştırılmasında kullanılır.
Faz- kontrast mikroskobu nedir?
Özellikle canlı hücrelerin incelenmesinde yaygın şekilde kullanılan bir ışık kaynağıdır. Işık mikroskobundan farklı olarak obje üzerine düşen ışıklar arasındaki faz farkını arttıracak bir parça eklenmiştir.
Karanlık alan mikroskobu nedir?
Canlı boyanmamış hücrelerin incelenmesinde kullanılır. Işık mikroskobundaki kondansörün yerine karanlık alan kondasörü yerleştirilmiştir. Bu kondansör objektife sadece objeden yansıyan ışıkları iletir. Bu nedenle objeler karanlık alan içinde parlak bir şekilde gözükür. Özellikle tıp ve mikrobiyolojide bakterilerin sayımı ve incelenmesinde kullanılır.
Ultraviyole=floresans mikroskobu nedir?
Bu mikroskopta obje üzerin UV ışık düşürülür. İncelenen objenin floresans olma özelliğinden yararlanılarak ya da bazı floresans boyalar kullanılarak çalışılır.
Elektron mikroskobu örnekleri nelerdir?
TEM ve SEM olarak 2 tiptir.
Elektron mikroskobunu ve örneklerini açıklayınız?
Elektron mikroskoplarının büyütme gücü ışık mikroskoplarından oldukça fazladır.
Elektron mikroskoplarında ışık kullanılmaz.
TEM =Transmisyon E.M. kesit alarak inceleme yapar.
SEM=Scanning E.M. objelerin total görüntüleri incelenir.
Yoğunluk gradiyent santrifüj metodu ne işe yarar?
Farklı büyüklük ve yoğunluktaki hücre organelleri değişik çökme hızlarına göre ayrı ayrı elde edilir. Bu metod hücrelerde enzim araştırılmalarında ve kimyasal yapının aydınlatılmasına yönelik çalışmalarda fayda sağlar.
Hücreyi moleküler düzeyde inceleme teknikleri nelerdir?
1) Rekombinant DNA teknolojisi (rDNA)
2) Elektroforetik yöntemler
3) İmmünolojik yöntemler=klasik yöntemler
4) İşaretlenmiş antikor teknikleri
Rekombinant DNA nedir?
Farklı türlerden elde edilen DNA molekülü veya gen bölgelerinin kesilerek birbirleriyle birleştirilmesi sonucu elde edilen DNA molekülüne verilen isimdir.
1)Rekombinant DNA teknolojisinde uygulanan yöntemler nelerdir?
1) KLASİK UYGULAMALAR
2) HİBRİDİZASYON =MELEZLEME YÖNTEMLERİ
3) PCR=Polimeraz Zincir Reaksiyonu yöntemi
Hibridizasyon=melezleme yöntemleri nasıl yapılır?
Tek iplikli nükleik asit moleküllerinin tamamlayıcı dizileri ile uygun koşullar altında kendiliğinden eşleşerek çift iplikli hibrid moleküller oluşturma özelliğine dayanır.
PROB adı verilen polinükleotitlerden yararlanılır. Problar izlenen genin tamamı veya bir kısmını içerir.
PCR yöntemi nedir ? Kullanım alanları nerelerdir?
DNA’nın belirli bir bölgesinin lab. ortamında bir tüp içerisinde çoğaltılması işlemidir.
Tek bir lenfoid hücreden veya insan saçından DNA’nın analiz edilebileceği kadar güçlü ve duyarlı sistemdir.
Adli tıp ,mikrobiyoloji , immünoloji gibi birçok alanlarda geniş kullanım imkanı bulmuştur.
2)Hücrnin moleküler düzeyinde incelenmesinde kullanılan ELEKTROFORETİK yöntemi kısaca açıklayınız?
Elektroforez bir çözeltide asılı olan taneciklerin elektrik alan etkisiyle ayrılmasıdır. Elektroforez tekniği protein ve nükleik asitlerin büyüklerindeki ,yüklerindeki ve biçimlerindeki farklılıklar göz önüne alınarak oluşturulmuştur. BU YÖNTEMLE ; protein ve nükleik asit çeşitleri tayin edilir.
3)Hücrenin moleküler düzeyde incelenmesinde kullanılan İMMÜNOLOJİK yöntemler nedir?
Antikorlar florasan boyalar ile işaretlenir. Florasan mikroskobu veya elektron mikroskobu ile bu yerler tespit edilebilir.
Virüslerin ve bakterilerin tanımlanmasında (EM yardımıyla) kullanılabilir.
4)Hücrenin moleküler düzeyde incelenmesinde kullanılan İŞARETLENMİŞ ANTİKOR TESTLERİ nedir? Kısaca açıklayınız.
Serolojik çalışmalarda kullanılır. Serolojik deneylerin amacı bilinen antijen veya antikorlardan birini kullanarak kullanılanın karşılığını saptamaktır.
Bilinen 3 teknik vardır(ELİSA-RİA-FAT). Her 3 teknikte de temel prensip bilinen bir antijenin sabit bir yere önceden tespit edilmesidir. Bunu takiben ortamın içine antikoru belirlenecek hastanın serumu konur. Serum içinde aranan antikor varsa bu antikor tespit edilmiş antijenle bağlanarak kompleks oluşturur. Buna takiben 2. işaretli bir antikor konularak komplekse bağlanması sağlanır. Daha sonra işaretli antikor miktarı ölçülür. Eğer serumda aranan antikor yoksa immun kompleks oluşmaz ve sonradan katılan antikorda bağlanamaz. Deneyin negatif olduğu görülür.
Hücreler kaça ayrılır? nelerdr?
Hücreler 2’ye ayrılır.
PROKARYOT ve ÖKARYOT olmak üzere
Prokaryotik hücreler nelerdir?
VİRÜSLER
BAKTERİLER
ARKEALAR
Ökaryotik hücreler nelerdir?
BİTKİLER
HAYVANLAR
FUNGUSLAR
PROTİSTLER
PROKARYOT hücreyi kısaca açıklayınız?
Plazma zarı ile çevrelenmiş kapalı tek bir kompartımana sahip olup genetik materyalleri zarla çevrili değildir ve nispeten basit bir iç organizasyona sahiptirler.
DNA molekülleri halkasal yapıdadır. Kendilerine ait ribozomları, RNA molekülleri ve enzimleri vardır. Özellikle solunum enzimleri plazma zarının MEZOZOM adı verilen kıvrımlarında konumlanmıştır.
ÖKARYOT hücreyi kısaca açıklayınız?
Zarla çevrili belirli bir nukleusa ve organellere sahiptirler. Çok hücreli ve tek hücreli formları bulunmaktadır.
Ökaryot hücre ve prokaryot hücrede ortak bulunan yapılar nelerdir?
RİBOZOM
HÜCRE ZARI
Hücrenn şeklinin belirlenmesinde önemli olan 4 etmen nedir?
1) YÜZEY GERİLİMİ
2) SİTOPLAZMANIN VİSKOZİTESİ
3) ÇEVREDEKİ HÜCRELERİN MEKANİK ETKİSİ
4) HÜCRE ZARI
Amoboid şekil nedir?
AMİPSİ ŞEKİL
Lökosit ve lenf hücreleri normale küre şeklinde fakat kan dokudan bağ dokuya geçerken amoboid şekil alırlar.
Ökaryotik hücrenin yapısındaki 3 kısım nedir?
HÜCRE ZARI
SİTOPLAZMA
NUKLEUS
Hücre zarı nedir? Diğer adları?
HÜCRE ZARI=PLASMALEMMA=PLAZMA (hücre) MEMBRANI
Hücre membranı, hücreyi ve hücre organellerini sararak dış ortamlardan ayıran , hücreye yapısal ve mekanik bir bütünlük sağlayan seçici geçirgen yapıdır.
Singer-Nicolson tarafından belirtilen sıvı-mozaik zar modeline göre hücre zarının yapısı neye benzetilmektedir?
ÜNİT MEMBRAN MODELİ
Zardaki bütünlüğün sağlanmasında hangi etkileşimler önemlidir?
HİDROFOBİK ETKİLEŞİMLER önemlidir. Hidrofobik etkileşimler kovalent bağlardan çok daha zayıf etkileşimlerdir.
1970’li yıllara kadar geçerliliğini koruyan Davson-Danielli hücre zarı modeli nasıldır?
Bu modele göre çift katlı fosfolipit tabakası iki protein tabakası arasında yer almaktadır ve bir sandviçe benzemektedir.
Günümüzde de geçerli olan sıvı-mozaik zar modeli nasıldır?
Bu model proteinleri birbirinden ayırmakta ve onları sıvı haldeki çift tabakalı fosfolipid tabakada yüzer halde göstermektedir. Yani diğer modele göre farka protein tabaka fosfolipid tabaka içerisine uzanmış haldedir.
Fosfolipit, protein ve lipitlerin zar içerisindeki hareket durumları nasıldır?
Fosfolipitlerin lateral hareketleri oldukça hızlıdır. Proteinler ise lipitlerden daha büyük oldukları için daha yavaş hareket ederler.
SUPRAMOLEKÜLER yapı nedir?
Supramoleküler yapılar çok sayıda molekülün bir araya gelmesiyle oluşan organizasyon düzeylerini ifade etmektedir. Bu yapılar seçici geçirgenliğe yol açar.
Hücre membranının=zarının görevleri nelerdir?
- Hücreyi kuşatarak bulunduğu ortamdan ayırır.
- Hücre ile bulunduğu ortm arasında 2 yönlü madde geçişini kontrollü şekilde sağlar.
- Hücreler arası tanımada rol oynar.
- Hücre adezyonunu sağlar.
- Hücreyi korur ve şekil verir.
- Hücre içi ve hücreler arası bilgi iletimini sağlar.
Protein ,lipid ve karbonhidratların zarda bulunma sıralaması nasıldır?
KOD: PLaKa
PROTEİN>LİPİD>KARBONHİDRAT
Lipid çeşitlerinin hücre zarında bulunma oranları nasıldır?
FOSFOLİPİDLER>KOLESTROL>GLİKOLİPİDLER
Hücre zarı lipitlerini oluşturan temel unsurlar nelerdir?
YAĞ ASİTLERİ
KÖPRÜ MOLEKÜLLERİ(Gliserin ve sfingosin)
ÇEŞİTLİ POLAR MOLEKÜLLER
Lipitler suda çözünür mü?
Lipitler kloroform gibi organik çözücülerde yüksek oranda erirken suda çözünemeyen biyomoleküllerdir.
Lipitlerin hepsi amfipatik yapı mıdır? AMFİPATİK yapı nedir?
AMFİPATİK:Hidrofilik ve hidrofobik molekkülleri birlikte bulundurur.
Lipitlerin hepsinde bir hidrofilik baş ve hidrofobik kuyruk kısmı bulunur.
Fosfolipitlerde bulunu hidrofilik polar baş ve hidrofobik apolar kuyruk kısımlarını kısaca açıklayınız.
Fosfoliptlerin hidrofilik baş kısmı suda erir ve membranın iç ve dış yüzeyine yöneliktir.
Hidrofobik kuyruk kısımları ise suda erimez ve birbirlerine yöneliktir.
Böyle hidrofilik ve hidrofobik kısımlara sahip olma fosfoliptleri kendiliğinden çift tabaka yapar.
Hücre membranında yer alan başlıca lipitler?
I) FOSFOLİPİTLER II)GLİKOLİPİDLER III)KOLESTROL
1) Gliserofosfolipitler 1)Serebrozid
- Fosfatidilkolin 2)Gangliozidler
- Fosfatidiletanolamin
- Fosfatidilserin
- Fosfatidilinozitol
- Fosfatidilgliserol
2) Sfingofosfoliptler=sfingomiyelin
Fosfolipitlerin yapısı nasıldır? Neye göre isimlendirilirler?
Fosfolipitlerin hidrofilik baş kısımları alkol, fosfat ve gliserolden, hidrofobik kuyruk kısımları ise yağ asidi zincirinden oluşur.
Fosfolipitler alkol kısmında bulunan moleküle göre isimlendirilir.
Fosfolipitin yapısında bulun yağ asidi zincirlerindeki çift ve tek bağ durumlarını açıklayınız?
Kuyruk kısmını oluşturan 2 yağ asidi zincirinden biri çift bağ taşımaz diğeri taşır.
Çift bağ taşımayan doymuş yağ asitidir ve düzdür.
Çift bağ taşıyan doymaış yağ asitidir ve düz değildir.Çift bağ bölgede bükülmeye neden olur ve membran akıcılığını arttırır.
Hücre zarına asimetrik özellik kazandıran olay nedir?
Çift lipit tabakanın her iki yüzünde bulunan lipitlerin aynı olmaması membrana asimetrik özellik kazandırır.
Hücre zarınıniç ve dış kısmında konumlanan fosfolipit çeşitlerine örnek veriniz?
Fosfatidilkolin ve sfingomiyelin membranın dış kısmında,
Fosfatidiletanomilamin, fosfatidilserin ve fosfatidilositol membranın iç tabakasında bulunur.
Çift tabaka yapısındaki lipitlerin hareket edebilme özelliği vardır. Membran liptlerinin yaptığı 4 tip hareketi kısaca açıklayınız?
1) YANAL HAREKET=LATERAL DİFÜZYON: Aynı tabakadaki fosfolipitlerin kayarak yer değiştirmesi
2) DÖNME=ROTASYON DİFÜZYON: Molekül bir tabakadan diğerine geçmesi flapazlar sayesinde gerçekleşir.
3) FLİP FLOP= TAKLA HAREKETİ: Bir fosfolipit molekülünün kendi ekseni etrafında çok hızlı dönme hareketi
4) BÜKÜLME
Lipitlerin hücre membranı açısından önemli 2 yanı nedir?
1) Amfipatik özellikleri
2) Membran akışkanlığı
Membran akışkanlığına etki eden faktörler nelerdir?
1) Çift tabaka termal hareket nedeniyle belirli bir geçiş sıcaklığının üzerinde sıvıdır. Sıcaklık azaldıkça jel hale döner.
2) Kısa zincirli ve çok doymamış yağ asitleri membranı daha akıcı hale getirir.
3) Kolestrol molekülünün bağlanma tarzı zarın dayanıklılığını arttırır ve suda çözünen küçük moleküllerin, yabancı partiküllerin lipid tabakadan geçişini arttırır ya da engeller.
Hücre zarında akışkanlık tamponu olarak görev yapan molekülü ve bu olayı kısaca açıklayınız?
KOLESTROL iki komşu fosfolipidin hidrokarbon zinciri arasına girer zarın dayanıklılığını sürdürmesini sağlar.
Akışkanlık tamponu olarak görev yapan kolestrol düşük ısıda akışkanlığı arttırırken yüksek ısıda akışkanlığı azaltmaktadır.
Hücre zarı proteinleri nelerdir?
1) İNTEGRAL =TRANSMEMBRAN PROTEİNLER
2) PERFERAL PROTEİNLER
Zar proteinleri olan integral ve periferal proteinlerin hücre mebranındaki konumları nasıldır?
İNTEGRAL PROTEİNLER zarı boydan boya kat ederek zarın her iki tarafına doğru yerleşim gösterirler.
PERİFERAL PROTEİNLER zarın yalnızca bir yüzeyine tutunur ve zarı boydan boya geçmez. Ya iç tabakada ya da dış tabakada bulunurlar.
İNTEGRAL PROTEİNLERİ KISACA AÇIKLAYINIZ.
Lipit tabakayı boydan boya kateden veya lipit tabakanın iç ve dış yüzeyinde hafif gömülü olarak bulunan proteinlerdir.
İntegral proteinler zara kovalent biçimde bağlanırlar.
Zardan kolayca ekstre edilemezler.(kovalent bağ ile zara bağlı çünkü)
PERİFERAL PROTEİNLERİ KISACA AÇIKLAYINIZ.
Globüler yapıdadırlar. Genellikle hücre zarının dışa bakan dış yüzeyi ve sitoplazmaya bakan iç yüzeylerinde yer alır, hidrofobik bölgeye kadar uzanmazlar.
Çift katlı fosfolipitler ile doğrudan etkileşmezler. İntegral proteinlerin hidrofilik bölgelerin non-kovalent bağ ile tutunurlar.
Kolayca ekstre edilebilir(non-kovalent bağ ile integral proteinlerine bağlı çünkü)
HÜCRE MEMBRANI PROTEİNLERİNİN 6 GÖREVİ NEDİR?
1) TAŞIYICIDIRLAR.(seçici olarak kanallar yardımıyla madde taşınmasını sağlar)
2)ENZİMDİRLER.(çok sayıda kimyasal reaksiyona girerler ve kolaylaştırırlar)
3HÜCRE-YÜZEY RESEPTÖRÜDÜRLER.(yüzeyde yer alan reseptör proteinler yardımıyla hassas kimyasal mesajları alırlar)
4)HÜCRE-YÜZEY TANIMA İŞARETLEYİCİSİDİRLER.(hücre zarından taşınan maddelere işaretleyiciler bağlanarak zar tarafından daha kolay tanınabilmeleri sağlanır)
5)HÜCRE-HÜCRE TUTUNMA PROTEİNLERİDİR.(özel yapıştırıcı proteinlerdir, hücreler arasında kalıcı bağlar oluşmasını ve bir arada kalmasını sağlarlar.)
6)HÜCRE İSKELETİ VE HÜCRE DIŞI MATRİKSE BAĞLANMA.(zar proteinleri hücre iskeleti elemanlarına bağlanarak hücrenin şeklinin korunmasını sağlar)
Hücre zarından madde taşınımı sırasında ne neye göre zardan kolay geçer?
- Lipitlerde çözünen moleküller kolay geçer
- Küçük moleküller (etanol, gliserol) zardan direkt geçebilirler.
- Polar moleküller (iyonlar, glukoz) eğer geçerlerse dahi yavaş geçiş gösterirler.
- Su molekülleri polar ama küçük olduklarından kolaylıkla geçiş yapar.
Hücre membranından madde taşınımı yolları nelerdir?
1) PASİF TAŞIMA
2) AKTİF TAŞIMA
3) BÜYÜK MOLEKÜLLERİN MEMBRANDA TAŞINMASI
PASİF TAŞIMANIN alt başlıkları nelerdir?
- Serbest difüzyon
- Su dolu kanallar
- Kolaylaştırılmış difüzyon
- Açılır-kapanır porlar (kapılı kapılar)
- İyonoforlar
AKTİF TAŞIMANIN alt başlıkları nelerdir?
- Na-K değişim pompası
- Ca- H pompaları
BÜYÜK MOLEKÜLLERİN MEMBRANDA TAŞINMASININ alt başlıkları nelerdir?
- ENDOSİTOZ
- Pinositoz
- Fagositoz
- Reseptör aracılı endositoz
- EKZOSİTOZ
Serbest difüzyonu kısaca açıklayınız?
Maddenin yüksek yoğunlukta bulunduğu taraftan daha az yoğun olduğu tarafa doğru basit olarak geçmesidir.
KONSANTRASYON GRADİYENTİ nedir?
İki ortam arasındaki konsantrasyon farkını tanımlamaktadır.
Pasif difüzyon nedir?
Moleküllerin konsantrasyon gradiyenti yönünde kendi kinetik enerjileri ile yayılmalarıdır.
Kolaylaştırılmış difüzyonu kısaca açıklayınız?
Kanallar veya taşıyıcı proteinler aracılığıyla konsantrasyon gradiyenti yönünde enerji harcanmadan gerçekleşir.
Açılır-kapanır porları kısaca açıklayınız?
3 adet kapı vardır.
LİGAND KAPILI: asetilkolin gibi bir ligandın reseptörüne bağlanması sonucu açılmakta veya kapanmaktadır.
VOLTAJ KAPILI: membran potansiyelindeki değişime bağlı olarak açılmakta veya kapanmaktadır.
MEKANİK KAPILI: gerilim ve basınca duyarlıdırlar, hücre iskeletinin gerilmesiyle açılırlar.
AKTİF TAŞIMAYI kısaca açıklayınız?
Maddenin düşük yoğunlukta bulunduğu taraftan yüksek yoğunlukta bulunduğu tarafa doğru veya yüklü moleküllerin elektrokimyasal bir yokuşa karşı taşıyıcı bir molekül aracılığıyla taşınmasıdır. Enerji(ATP) gerektiren bir taşımadır. Konsantrasyon gradiyentine karşı taşınma yapılmasıdır.
Büyük moleküllerin membranda taşınması yöntemiyle yapılan taşımada alt maddeleri açıklayınız?
ENDOSİTOZ: Hücre içine giriş
*Fagositoz: katı moleküllerin hücre içine endozom aracılığıyla girmesidir
*Pinositoz: sıvı damlacıkları hücre içine küçük vesiküller içerisinde alınırlar.
*Reseptör aracılı endositoz: transport mekanizmaları taşıyamayacak boyuttaki moleküllerin hücre içine alımı reseptör aracılı endositoz adı verilen bir mekanizma ile olmaktadır.
EKZOSİTOZ: Hücreden atılma
Glikolipidler ve glikoproteinler birleşerek hangi yapıyı oluştururlar ve bu yapı nereyi ifade eder?
Glikolipidler ve glikoproteinler birleşerek GLİKOKALİKSİ oluştururlar. Glikokaliks ökaryotik hücrelerde genellikle membranın dış yüzeyindeki karbonhidratça zengin kısmı ifade eder.
Glikokaliks düz ve ayrı bir tabaka değil, kesintili ve zarın bir parçası halindedir.
Çoğu glikoprotein ve glikolitteki karbonhidrat bileşeni nedir?
OLİGOSAKKARİTTİR
Çoğu glikolipit ve glikoproteinin karbonhidrat bileşeni olan oligosakkarit nasıl oluşur?
Oligosakkarit 6 temel şekerin çeşitli kombinasyonları sonucu oluşur. Bu şekerler *D-GALAKTOZ *D-MANNOZ *L-FUKOZ *N-ASETİLNÖROMİNİK ASİT (SİALİK ASİT) *N-ASETİLGLUKOZAMİN *N-ASETİLGALAKTOZAMİN Glikokaliks yapısı da bu şekerlerin kombinasyonları sonucu oluşmaktadır.
GLİKOKALİKS OLİGOSAKKARİTLERİNİN GÖREVLERİ nelerdir?
- Yapısal belirleyiciler, moleküler etkiler oluştururlar.
- Hücreler arası tanıma, tutunma molekülleridir.
- Tanıma-tutunma ilişkilerini engeller.
- Moleküler köprüler olarak görev yaparlar.
- Farklılaşma sırasında değişirler
- Diğer moleküllerle ilişki için sinyalleri taşırlar.
GLİKOPROTEİNLERİ KISACA AÇIKLAYINIZ VE ÖRNEKLER VERİNİZ?
Glikoprotinler, enzimatik reaksiyonlar sonucu polipeptit zincirlerine kovalent olarak bağlanan bir ya da daha fazla oligosakkarit içeren proteinlerdir.
- ENZİMLER
- ANTİKORLAR
- İNSAN PLAZMA PROTEİNLERİ
- HORMONLAR
- RESEPTÖRLER
- KOLLAJEN gibi yapısal proteinlerin çoğu glikoprotein yapıdadır.
Hücre zarındaki karbonhidrat zincirlerinin görevleri nelerdir?
- Hücreler arası etkileşimleri kolaylaştırmak için hücrelerin birbirlerini tanımasını sağlamak.
- Proteinlerin fizikokimyasal niteliklerini değiştirmek.
- Embriyolojik gelişme ve farklılaşmanın gerçekleşmesinde rol oynamak.
- Hücre içinden ve dışından gelecek proteolizden membran proteinlerini korumak.
- Zarlara yerleşme, hücre içi göç, sınıflandırılma ve salgılama gibi hücre fonksiyonlarını düzenlemek
- Hücrelerin davranışlarını değiştirmek
- Fertilizasyonda rol oynarlar.
- İnflamasyonda rol oynarlar.
- Plazma proteinleri olarak görev yaparlar.
- İmmün sistemin düzenlenmesinde rol oynarlar.
- Kan grubu antijenleri, hormonlar, enzimler olarak görev yaparlar.
- Kanser hücrelerinin metastazında hücre yüzeyinin değişmesine bağlı olarak rol oynarlar.
Bazal yüz , apikal yüz ve lateral yüz nasıl oluşur?
Kutuplaşmış bir hücrenin bazal membran üzerine oturan yüze BAZAL YÜZ, herhangi bir boşluğa bakan kısmı APİKAL YÜZ, birbirlerine bakan yüzleri ise LATERAL YÜZ olarak adlandırılır.
Hücre yüzey farklılaşmalar ile ne sağlanır? 3 madde ile açıklayınız?
1) Madde alışverişini gerçekleştirmek
2) Hücreye farklı hareket kazandırmak
3) Hücrelerin birbirlerine bağlanmalarını, adezyonunu sağlamak.
Eptel hücrelerinin çoğu farklı yüzeylerinde fonksiyonlarından dolayı farklılaşma yaşarlar. Bu farklılaşmalar nelerdir? Alt başlıklarıyla birlikte yazınız?
1) SERBEST YÜZ= APİKAL YÜZ FARKLILAŞMALARI
* Mikrovillus
* Silya fagella
* Kaveol
* Sterosilya
2) YAN YÜZ FARKLILAŞMALARI
* Zonula occludens=sıkı bağlantı
* Zonula adherens=ara bağlantı
* Makula adherens=dezmozom
* Gap junction=neksus
* Plazmodezma
3) BAZAL YÜZ FARKLILAŞMALARI
* Bazal yüz katlanmaları
* Hemidesmozomlar
Serbest yüz farklılaşmalarından olan MİKROVİLLUSLARI kısaca açıklayınız?
Bağırsak hücrelerinin apikal yüzeylerinde genellikle absorbsiyon için özelleşmişlerdir.
EM altında tüp şeklinde silindirik uzantılar şeklinde görüntülenirler. Mikrovilluslar serbest yüzeyde emilim yüzeyini arttırırlar.