Tenta Flashcards
Beskriv de 3 transportmekanismerna
- Enkel diffusion
- Underlättad diffusion
- Aktiv transport
Enkel diffusion
- passiv transport
- hydrofoba fettlösliga ämnen kan diffundera med sin elektrokemiska gradient
- kräver ingen energi
- Ex syrgas, koldioxid, steroider
Underlättad diffusion
- Passiv transport
- Hydrofila ämnen får hjälp genom membranet av protein som binder dem specifikt
- Ex. Glykos
Aktiv transport
Ex. Na+/k+ pumpen
- Finns i cellmembranet
- Upprätthåller skillnad i jonkoncentration
- Na+ på utsidan & K+ på insidan. 3 Na+ binds på insidan & släpps av på utsidan. 2 K+ binds på utsidan & släpps av på insidan
- transporteras mot sin koncentrations gradient
- Energi fås av ATP
Förklara tvådimensionell page/ elektrofores
Med tvådimensionell PAGE avser man en analys i vilken man först gör en isoelektrisk fokusering av ett prov i en gel och därefter körs SDS-PAGE på samma prov, vinkelrätt mot den förra körningen. Metoden har högre upplösningsförmåga än den enkla gelelektroforesen och med den kan man separera mycket stora mängder olika proteiner samtidigt.
Med isolektrisk fokuseringen separeras proteinerna enligt deras isolelektriska punkter. Körningen görs i en tunn kapillär med en gjuten gel med en pH gradient. När proteinerna hamnar i gradientens elektriska fält rör de sig enligt laddning mot anod eller katod. När de närmar sig sig egen isoelektriska punkt, där deras laddning = 0, stannar de upp.
Efter detta körs en SDS-PAGE körning i vinkelrätt riktning mot den förra körningen. Nu separeras proteinerna enligt molekylvikt. Proteinbanden lokaliseras genom färgning och analyseras vidare.
Vilka är de 3 katalytiska mekanismerna?
- Kovalent katalys, en tillfällig kovalent bindning bildas mellan enzym och substrat, polära aminosyror.
- Allmän syra/bas katalys, enzymet fungerar som protonavgivare/protonupptagare, laddade aminosyror.
- Metalljon-katalys, en kofaktor deltar i redoxreaktioner, stabiliserar negativa laddningar mm
Vad påverkar fettsyrors smältpunkter?
Ju kortare kedja desto lägre smälttemperatur.
Ju fler dubbelbindningar i cis desto lägre smälttemperatur. Beror på att en dubbelbindning i cis böjer kedjan så att den inte kan interagera lika bra med andra kedjor.
Dubbelbindningar i trans packas också bra. Jmf cis-fetter!
Omättade har dubbelbindningar, vilket gör att de kan ha cis, och packas sämre. Omättade har mindre hydrofoba interaktioner så de kan släppa lättare.
Mättade har hög smälttemperatur. Packas bra = binds samman.
Vilka är de 4 kvävebaserna i DNA och RNA?
RNA - Adenin, Guanin, Cytosin, Uracil
DNA - Adenin, Guanin, Cytosin, Tymin
Vilka är de två sockermolekylerna, i DNA och RNA?
DNA - Detoxyribos
RNA - Ribos
Vilka är de två Watson-Crick basparen som förekommer i DNA och RNA?
C - G
A - U - RNA
A - T - DNA
Vilka är de 10 stegen i glykolysen?
- ATP bildar ADP via substratnivåfosforylering
- Isomeriseras, (förberedelse)
- ATP bildar ADP via Fosforylas
- Klyvs
- Isomeriseras
2X - Pi + NAD+ bildar NADH Via Oxidering och Fosforylering
- ADP bildar ATP via substratnivåfosforylering
- Omarrangeras
- släpper ifrån ett H2O via dehydrering
- ADP bildar ATP via Defosforylering
Vilka är de 8 stegen i Citronsyracykeln?
- H2O bildar CoA genom att kondenseras
- Isomeriseras
- NAD+ bildar NADH + CO2 via Oxidativ Dekarboxylering
- NAD+ bildar NADH + CO2 med hjälp av CoA via Oxidativ Dekarboxylering.
- ADP + Pi bildar ATP med hjälp av CoA via spjälkning
- FAD bildar FADH2 via oxidation och FAD reduceras
- Hydreras med H2O
- NAD+ bildar NADH + H+ via oxidation och NAD+ reduceras.
Hur många ATP-molekyler skulle maximalt kunna bildas med hjälp av de elektroner som
frigörs under ett varv av citronsyracykeln i de fall då ATP-syntaset har 8 st c-subenheter och
samtliga protoner som transporteras ut i intermembranutrymmet med hjälp av
elektrontransportkedjan används för ATP-syntes?
Under ett varv av citronsyracykeln frigörs 8e-. Dessa transporteras av 1 FADH och 3 NADH molekyler.
Vid oxidering av 1 NADH molekyler i elektrontransportkedjan transporteras totalt 10 protoner ut i intermembranutrymmet. ( 4 komplex I, 4 Komplex 2 & 2 komplex IV).
3 NADH * 10 protoner = 30 protroner
Vid oxidering av 1 FADH2 transporteras totalt 6 protoner ut i intermembranutrymet. ( 4 komplex II & 2 komplex IV)
- 30 + 6 = 36 protoner
8c - subenheter för ATP syntas betyder att vid transport av 8 protoner tillbaka i matrix tillverkas 3 ATP molekyler.
- (36 protoner + 3 ATP)/8 protoner = 13,5 ATP
om energin inte används för andra processer.
Förklara hur en isoelektrisk fokusering går till.
Isoelektrisk fokusering är en separationsmetod som bygger på att laddade proteiner vandrar i ett medium (gel) med ett elektriskt fält, samtidigt som dess pH-värde ökar från gelens ena sida till den andra. Proteiner med skilda pI-värden kommer då att vandra tills de når den punkt där dess pI-värde blir lika med gelens pH-värde, alltså pI = pH. Där har proteinet ingen nettoladdning och slutar vandra.
Olika proteiner har olika pI och hamnar därför på olika platser i mediet.
Beskriv replikation.
- Helikas + hjälp protein separerar DNA strängarna.
- Primasen bygger en bas (primer) av RNA som blir en start punkt.
- Sen kommer DNA polymeras III som behöver primern för att påbörja synten och syntetiserar DNA’t.
- På leading strand så kan DNA’t syntiseras i en lång sträng. Medans på lagging så syntiseras den i korta strängar ( okazaki fragment).
- Primrarna städas bort med polymeras I så att RNA ersätts med DNA.
- Ligas enzymet klistrar ihop fragmenten så att hela DNA’t sitter ihop.
Vad sker i microorganismer med pyruvat?
pyruvat -> acetaldehyde + CO2 + NADH -> etanol + NAD+
Sker i svampar och jäst!
Vad är maximala ATP som bildas när ett glykol oxiderar
ca 32 ATP om 8c, 30 om 10c
Oxidation av 1 NADH leder till att 10 protoner transporteras från matrix till intermembranutrymmet. För ett AT P-syntas med 8 c-subenheter innebär det att 3 AT P10 protoner/8 protoner = 3,75 ATP skulle kunna bildas då dessa 10 protonerströmmar tillbaka till matrix. MEN protongradientens energi utnyttjas också till andra processer så vi räknar med att det verkliga talet är ca 2,5 ATP. För FADH2 blir motsvarande beräkning 36/8 = 2,25 ATP och vi räknar med 1,5 ATP.
Vad heter de två cykliska förlopp i växter?
Fotosyntes om ljust
Calvin cykeln om det är mörkt
