TD1

Question 1

Nomme différents moyens de classification des virus et quelques exemples de sous classes pour chaque classe.

Answer 1

Classification selon le type de génome (ADN, ARN, db, sb)
Classification le type d’organisme parasité (bactéries, végétaux, animaux)
Classification selon la géométrie (capside icosaédrique ou hélicoïdale)
Classification selon la présence ou non d’enveloppe
Classification selon le mode de transmission (ingestion, inhalation)
Classification selon le type de maladie occasionné par le virus

Question 2

Nomme les 7 groupes de virus en fonction du type de génome et décrit les brièvement

Answer 2

I: ADN db
II: ADN sb
III: ARN db
IV: ARN sb +
V: ARN sb -
VI: Rétrovirus ARN sb
VII: Rétrovirus ARN db

Question 3

Quel est le nom de la classification non officielle des virus et sur sur quoi cette classification est-elle basée?

Answer 3

Classification épidémiologique. Basée sur les effets pathologiques et le mode de transmission

Question 4

Quel est le nom de la classification officielle des virus et sur quoi est-elle basée?

Answer 4

Classification de l’ICTV:
3 critères: Nature du génome, Stratégie de réplication, Morphologie du virion

Question 5

Nomme les principales étapes du cycle infectieux des virus

Answer 5

1) Attachement du virus
2) Entrée du virus
3) Décapsidation
4) Transcription
5) Traduction
6) Réplication
7) Assemblage
8) Libération

Question 6

Donne une estimation du nombre de virions libérés par cellule ainsi que le temps du cycle lytique

Answer 6

10^2 à 10^5 virions/cellule
10 heures à 30 heures

Question 7

Nomme les différentes voie possible d’entrée d’un virus dans la cellule hôte selon le type de virus

Answer 7

Virus nu: endocytose (après l’adsorption à la surface de la cellule)
Virus enveloppée: Fusion de la membrane (après l’adsorption à la surface de la cellule)
Phytovirus: Vecteurs (moustique), par une blessure
Bactériophage: injection de SEULEMENT le génome grâce à la contraction de la queue (après l’adsorption à la surface de la cellule)

Question 8

Où se déroule la réplication des virus à ADN? À ARN?

Answer 8

Noyau. Cytoplasme

Question 9

Quel est le type de protéine produite d’abord lors du cycle de multiplication des virus? Comment nomme-t-on chaque phase associée à la production de ces protéines

Answer 9

1) Protéines de réplication (Phase précoce)
2) Protéines structurales (Phase tardive)

Question 10

Comment s’effectue la réplication des virus à ARN+

Answer 10

Le brin - est synthétisé. Il devient alors le gabarit pour la réplication du brin +. Les brins + peuvent directement être traduits

Question 11

Vrai ou Faux?

Plusieurs complexes de réplication de l’ARN agissent en même temps sur un même gabarit?

Answer 11

Vrai

Question 12

Comment s’effectue la réplication des virus à ARN-?

Answer 12

Ils sont transcrits en ARN +, puis traduits en protéines

Question 13

Comment se déroule l’infection, puis la multiplication des rétrovirus

Answer 13

Ils entrent la cellule et leur réverse transcriptase produit de l’ADNc db qui est ensuite intégré dans le génome de l’hôte. Lorsque l’organisme hôte se réplique et est transcrit, l’ARN + viral est synthétisé et le cycle viral débute

Question 14

Quelle est la différence entre l’infection et la multiplication des pararétrovius comparé aux rétrovirus?

Answer 14

L’ADN double brin du pararétrovirus d’intègre dans le génome de l’hôte dès son arrivée. Suite à la transcription du génome de l’hôte le virus peut dès lors utiliser sa reverse transcriptase pour retrouver l’ADNc db

Question 15

Décrit la stratégie d’expression des génomes à ARN+ suivante:
Synthèse d’une polyprotéine suivie de clivage protéolytique

Answer 15

Différentes protéases virales clivent une longue protéine produite à différents endroit, ce qui mène à la production de différentes protéines pour un même ORF

Question 16

Décrit la stratégie d’expression des génomes à ARN+ suivante:
Synthèse d’ARN subgénomique

Answer 16

C’est un processus qui implique la production de plus petits ARN afin de synthétiser des protéines spécifiques

Question 17

Décrit la stratégie d’expression des génomes à ARN+ suivante:
Segmentation de l’information génétique

Answer 17

Division du génome en plusieurs sous sections pouvants être exprimées différemment

Question 18

Décrit la stratégie d’expression des génomes à ARN+ suivante:
Translecture d’un codon stop de la traduction (readthrough)

Answer 18

Suppression d’un codon stop par un tRNA suppressor, ce qui mène à la production d’une plus longue protéines (C-term), ayant souvent une fonction différente

Question 19

Décrit la stratégie d’expression des génomes à ARN+ suivante:
Initiation de la traduction par leaky scanning

Answer 19

C’est le processus par lequel le ribosome “skip” un premier codon start, car ce codon n’est pas entouré d’une séquence optimale. Ainsi, la traduction début au prochain codon start qui peut, OU PAS être dans le même cadre de lecture. Ainsi on peut obtenir des protéines différentes.

Question 20

Décrit la stratégie d’expression des génomes à ARN+ suivante:
Décalage du cadre de lecture

Answer 20

Le ribosome peut glisser sur l’ARN (-1/ +1) causant ainsi une décalage du cadre de lecture

Question 21

Décrit la stratégie d’expression des génomes à ARN- suivante:
Synthèse des ARNm viraux par cap-snatching

Answer 21

Processus par lequel le virus vole la coiffe 5’ de l’ARNm de l’hôte afin d’induire sa traduction