T4 Flashcards
Quelles sont les découvertes faies à partir du phage T4 ?
Notion de gène
Restriction de l’ADN
Modofication/réparation de l’ADN
Comment sont appelés les phages ayant des propriétés similaires à T4 ?
Les T-pairs (T-even)
Ou se trouve T4 ?
Dans les intestins de mammifères et dans les eaux d’égouts
Auparavant, les virus de type T4 étaient classés comment ?
Dans la famille Myoviridae dans la classe des Caudoviricetes
Quelle est la particularité des virus de la famille des myoviridae ?
Longues queues contractiles
Comment on classe les phages de type T4 aujourd’hui?
Classe : Caudoviricetes
Ordre : N/A
Famille : Straboviridae
Sous-famille : Tevenviridae
Genre : Tequatrovirus
Les Tevenvirus sont tous ______ et sont capable QUE du cycle _______
Virulents
Lytique
Quelle est la forme de la t^te du T4 ?
Icosaédrique
Que contient la tête du T4 ?
Le génome
V ou F. La tête du T4 est rempli d’ADN à capacité maximale
V
À quoi sert le col du T4 ?
Relie la tête au tube de la queue
À travers quoi l’ADN virale est-il injecté ?
Le tube de la queue
À quoi sert la gaine contractile ?
Agit comme un ressort
Entoure le tube de la queue
Est fixée à la plaque basale
Dans quoi est impliquée la plaque basale ?
Dans la fixation du virus au récepteur de la cellule, et il régule le flux de l’ADN
À quoi servent les crochets ?
À détecter la présence de cellules hôtes
À quoi servent les fbres de la queue ?
Détecter des hôtes, se lier de manière réversible à la surface de la cellule
Quelle est la symétrie de la queue du T4 ?
Hélicoidale
De quelle longueur est le génome du T4 ?
169 903 pb de longueur, donc très gros et complexe
Combien de ORF contient le T4 ?
120
Pour combien de protéine le T4 code-t-il?
160
Comment sont organisés les gènes chez T4?
Ils sont groupés selon leurs fonctions pour faciliter la régulation précise de l’expression des gnes de T4
Combien de % contient un génome de T4 et pourquoi?
104% environ, décalé de manière circulaire avec des répétitions terminales de environ 5000 ob. Répétitions terminales servent
se rejoindre pour former une moécule ADN circulaire
Quelle est la base modifie dans t4?
La 5’-hydroxyméthylcytosine (nucléotide modifié)
Quels sont les avantages à avoir une HMC dans T4 ?
- Protéger ADN vira de ‘action des systèmes de restric de l’hôte
- Permettre de distinguer ADN viral de ADN hôte de sorte que ADN de l’hôte peut être dégradé et utilisé pour la réplication du phage
Quelle est la stratégie de réplication de T4 ?
Puisque le génome de T4 est similaire à celui de son hôte (ADNdb), la répli des génomes et la synthèse de ARNm ressemblent étroitement à celles de l’hôte, donc la réplication et la synthèse des protéiques pour l’assemblage des virus se font en parallèle.
Quelles sont les 4 phases de la réplication de T4 ?
- Adsorption et entrée du mat génétique dans la cellule hôte
- Synthèse acides nucléiques des virions et celle des prot
- Assemblage virions
- libération des virions
Que ce passe-t-il lors de l’arrivé du phage T4 à une cellule hôte ?
- Fibres se déttachent de leurs positions fixes à proxomité des crochets
- Extrémités des fibres se lie de manière RÉVERSIBLE avec soit les LPS ou les protéines OmpC
- La prot virale gp37 se fixe à la surface de la cellule
Que se passe-t-il lors de la fixation du T4 ?
- Virion se déplace sur la surface de la cell until au moins 3 de ses fibres soient attachée
- Ensuite les fibres caudales courtes associées à la plaque basale sont libérées de leur position repliée et se lient de manières IRRÉVERSIBLE avec les LPS de l’hôte
- La plaque basale passe d’une forme hexagonale à une forme en étoile
Que se passe-t-il lors de l’entrée du mat. génétique chez t4?
- Structure en forme d’aiguille en dessous de la plaque basale perfore la memb cellu
- Contraction de la gaine raccourcit le cylindre central (rapprochement de la tête)
- Le tube interne de la queue est poussé à travers la plaque basale et perce la couce de peptido de l’hôte
- L’action lysosyme d’une protéine de plaque basale facilite la pénétration à travers la memb cellu
Que se passe-t-il lors de l’injection du phage T4?
- Aiguille se déttache (ADN trop gros pour passer dans aiguille)
- La protéine étalon de queue se rétracte pour permettre à ADN viral de sortir (elle contrôle quand et comment ADN sort)
- ADN viral est libéré de la capside dans le tube et dans le cytoplasme de la cellule
- La caoside reste attachée à l’extérieur de la cellule
Que se passe-t-il avec l’ARN polymérase de l’hôte que T4 infecte ?
Elle est impliquée et est modifiée par T4 tout au long du cycle de réplication.
De quoi est constituée la structure de l’ARN polymérase ?
Deux subunits alpha et une bêta ET une bêta prime qui forment ensemble le ‘‘noyau’’ de l’enzyme.
Facteur sigma qui est influencé par des facteurs enviro et qui va permettre la fixation de la pol au promoteur
Que se passe-t-il lors de la transcription précoce de T4?
ARN pol de l’hôte est modifiée pour favoriser les promoteurs de T4 par rapport à ceux de l’hôte.
Injection de deux protéines : Alt et Alc
À quoi sert Alt ?
(s’attache direct à la pol) qui est injectée en mm temps que ADN viral, qui modifie la subunit alpha de ARN pol par ribosylation ADP-dépendant, ce qui favorise l’activité des promoteurs T4 (réversible la ribosylation)
À quoi sert Alc ?
Oblige l’ARN pol à stopper la transcription de l’ADN contenant la cytosine hôte, tout en ignorant HMC de l’ADN viral
Dans quel sens sont synthétiés les gènes précoces ?
Anti-horaire
Qu’est-ce que la transcription intermédiaire dans T4 ?
Les gènes précoces ont été transcrit et sont donc utilisés durant cette phase. MotA et AsiA modifient le motif du sigma de l’ARN pol de l’hîte de sorte que celui-ci initie la transcrip dans les promoteurs des gènes intermédiaires uniques de T4
Pour quoi codent les gènes intermédiaires de T4?
Des nucléases qui dégradent ADN de hôte
ADN pol dépendante de l’ADN (DdDp)
Des protéines supplémentaires qui modifient l’ARN pol
Qu’est-ce qu’une DdDp?
D (à partir de ADN) 2e D (avec ADN)
Pour quoi codent les gènes de la transcription tardive chez T4? Dans quel sens sont-ils trancrits ?
Pour des protéines structurales et sont transcrits dans le sens horaire
Que nécessitent la transition entre les gènes intermédiaires et tardifs ?
Les produits des gènes 33 et 55
Quelle est la fonction du gène 55 chez t4 ?
Facteur sigma viral qui remplace celui de l’hôte et redirige ARN pol vers les séquences des promoteurs de gènes tardifs uniques à T4
Quelle est la fonction du gène 33 chez t4 ?
Modifie ARN pol aussi, de sorte quelle ne peut plus se lier à ADN hôte
Comment se passe la réplication du génome chez T4?
Le génome de T4 code pour toutes les subunits de son réplisome et toutes les enzymes nécessaires à la synthèse de l’ADN, la polymérase y compris.
La répli peut juste se réaliser si ya une accumulation suffisante de matériel (après expression des gènes tardifs)
V ou F. Le génome linéaire contient plusieurs origines de réplication
Vrai, permet d’être plus rapide. Lorsque ces origines se rencontrent, ils se déttachent et badabing
De quelle structure/forme est assemblé le génome de T4 dans la capside ?
Concatémère
Par quoi est effectué l’empaquetage de l’ADN viral ?
Le complexe protéique le packasome
Après combien de temps le T4 lyse ?
après environ 150 virions se sont accumulés dans l’hôte
Quelles sont les deux protéines impliquées dans la lyse de T4 et leur fonction ?
Holine : crée des trous dans membrane de E. coli, ce qui permet au virus de se déplacer du cytoplasme à la paroi cellulaire
Lysosyme de T4 : dégrade le peptidoglycane, entraînant la destruction de la paroi cellulaire de l’hôte
