Structure des protéines Flashcards
Qu’est-ce qu’une protéine?
Polymère d’acides aminés à tailles variables
Vrai ou faux? Les protéines réalisent la plupart des fonctions dans l’organisme
Vrai
Qu’est-ce qu’un protéome?
Somme de toutes les protéines exprimées par la cellule
Est-ce que l’ordre de la chaine d’a.a. est importante?
OUI
Donne des exemples de protéines utiles.
Muscles
Enzymes
Récepteurs
Hormone
Hémoglobine
Qu’est-ce qu’une enzyme?
Une protéine qui agit comme catalyseur biologique
Qu’est-ce qu’un récepteur?
Protéine généralement exprimé à la membrane plasmique
Qu’est-ce que l’insuline?
Hormone et protéine qui agit via un récepteur
Vrai ou faux? L’insuline envoie un seul signal dans la cellule.
Faux
Qu’est-ce que l’hémoglobine?
Métallprotéine qui se lie au fer se trouvant dans les globules rouges
Nomme un exemple de mutation qui altère la structure d’une protéine.
Anémie falciforme
GAG = GTG
Que peuvent réaliser les protéines motrice?
Déplacer d’autres protéines
Contraction musculaire
Migration des chromosomes dans la mitose
Déplacement des organites
Déplacement des enzymes sur l’ADN
Nomme les deux façons de changer la conformation d’une protéine.
ATP/ADP
GTP/GDP
De quoi est composé un acide aminé?
Fonction carboxyle acide (C=O)
Fonction amine basique (NH2)
R attaché au C alpha
Par quoi peuvent être représenté les a.a.?
Code de 3 ou 1 lettre
Nomme les 3 types de chaines latérales.
Polaire chargé (hydrophile)
Polaire non chargé (hydrophile)
Apolaire (hydrophobe)
Quelles liaisons peuvent effectuer des chaines polaires non chargées?
Ponts H
Qu’est-ce qu’un lien peptidique?
Un lien qui relie 2 a.a. entre-eux
Est-ce que le lien peptidique comprend le C alpha?
Non
Explique ce qui se passe pendant la formation d’un lien peptidique.
Condensation de 2 a.a. (perte d’une molécule d’eau
Est-ce que la liaison peptidique permet la rotation?
NON
Est-ce que la rotation est possible au niveau du C alpha?
Oui
Qu’est-ce qu’un résidu?
Chaine latérale de l’a. a. (R)
La structure détermine…
la fonction!
Qu’est-ce qui détermine la structure?
Interaction entre groupements R
L’ordre des a.a. dans la chaine
Propriétés physicochimique des a.a.
Dans quoi sont impliquées les liaisons faibles?
Stabilisation de la structure 3D de la protéine
Nomme les 4 types de liaisons faibles.
Van der Waals
Ponts H
Liens ioniques
Interactions hydrophobes
Qu’est-ce que les forces de Van der Waals?
Quand un atome non-polaire devient polarisé à cause d’une répartition inégale des électrons
Dans quoi se produit les forces de Van der Waals?
Chaine d’a.a. apolaire
Qu’est-ce qu’un pont H?
H sur FON
Dans quoi se produit les ponts H?
Chaine d’a.a. polaires
Qu’est-ce qu’un lien ionique?
Entre + et -
Dans quoi se produit les liaisons ioniques?
Chaines d’a.a. chargés
Dans quoi se produit les interactions hydrophobes?
Chaine d’a.a. apolaire
Quel est l’équilibre dans les forces de Van der Waals?
Entre attraction et répulsion
Quel est le rôle des liaisons faibles dans le maintient de la structure des protéines?
Permettent le repliement, l’adoption et la stabilisation de la structure tridimensionnelle de la protéine.
Quel est l’impact d’une augmentation de liaisons covalente sur l’interaction entre 2 molécules?
Augmentation
Qu’est-ce qu’un pont disulfure?
Association des résidus cistéiques
Liaison covalente la plus forte
Stabilise la structure
Est-ce que les ponts disulfures sont des liaisons faibles?
Non
Nomme le 4 niveau de structure des protéines.
Primaire
Secondaire
Tertiaire
Quaternaire
Qu’est-ce que la structure primaire?
Séquence d’a.a. de la protéine
Qu’est-ce que la structure secondaire?
Premier niveau d’organisation dans l’espace des protéines
Nomme les 4 types de structures secondaires.
Hélice alpha
Feuillet béta
Coude
Boucle
Qu’est-ce que l’hélice alpha?
Mode de repliement dû à la formation de ponts H du squelette polypeptidique
Caractéristiques de l’hélice alpha?
Un pont hydrogène toutes les 4 liaisons peptidiques
Les chaînes latérales (R) dans une hélice alpha pointent à l’extérieur de la structure.
Comme les ponts hydrogènes vont dans la même direction que l’hélice, celle-ci est élastique.
Si les résidus d’une hélice alpha sont hydrophiles et hydrophobes, quelle est la nature de l’hélice?
Amphipathique
Qu’est-ce qu’un feuillet béta?
Formation de ponts hydrogène entre chaînes voisines
Deux types de chaines du feuillet béta?
Parallèles
Antiparallèles
Qu’est-ce que les boucles et les coudes et à quoi servent-ils?
Les boucles et les coudes sont des structures non régulières, non répétitives permettant des connections entre les différentes structures secondaires
Caractéristiques des coudes?
Caractérisé par un changement de direction de la chaîne polypeptidique
Permet de fléchir le polypeptide dans l’espace.
Composé de moins de 5 acides aminés (typiquement 4)
Caractéristiques des boucles?
Plus longues que les coudes (une vingtaine d’acides aminés)
Ont tendance à se localiser à l’extérieur des protéines et à engager des liaisons hydrogènes.
Qu’est-ce que la structure tertaire?
Organisation dans l’espace des structures secondaires entre elles
Est-ce que toutes les protéines ont une structure tertiaire?
Quaternaire?
Oui
Non
Qu’est-ce qu’un domaine protéique?
Un domaine protéique est une partie d’une protéine capable d’adopter une structure stable de manière autonome ou partiellement autonome
Le domaine protéique est souvent associé à quoi?
Une fonction
Est-ce que le domaine protéique peut se retrouver dans plusieurs protéines différentes?
Oui
Nomme une maladie de la structure tertiaire.
Prion
Qu’est-ce que la structure quaternaire?
Assemblage de plusieurs sous-unités protéiques (chacune avec sa structure tertiaire) entre elles
2 chaînes identiques
homodimère
2 chaines différentes
hétérodimère
3 chaînes identiques
homotrimère
3 chaines différentes
hétérotrimère
4 chaines identiques
homotétramère
4 chaines différentes
hétérotétramère
Que peut former une protéine qui n’a qu’un site de liaison?
Dimère
Des protéines identiques portant deux sites de liaison
peuvent s’assembler en un …
long filament hélicoïdale
Si les sites de liaison sont disposés de façon
adéquate, les sous-unités protéiques peuvent
former un…
cercle
Est-ce que le lien peptidique inclut le groupement R?
Non
Est-ce que le lien peptidique permet la rotation?
Non
Dans protéine en solution aqueuse, où se trouvent en général les acides
aminés hydrophobes?
Au centre
Quelle source d’énergie utilisent les protéines motrices?
ATP
De quelles façons les protéines peuvent changer d’activité?
GTP
Donne des caractéristiques du feuillet béta.
Parties de longues chaines polypeptidiques se replient
Pas élastique
Ponts H perpendiculaires
