Structure des gènes Flashcards

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1
Q

C’Est quoi la chromatine

A

forme sous laquelle le matériel génétique est organisé quand les cellules ne se divisent pas- complexe nucléoprotéique

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Q

Quelles sont les protéines les plus abondantes associées à l’ADN eucaryote

A

les histones

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3
Q

Quels sont les 5 plus grands types d’histones et quelle est leur charge

A

H1, H2A, H2B, H3, H4
Chargés positivement pour interagir avec l’ADN chargé négativement

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4
Q

Dans quel contexte la chromatine isolée ressemble à un collier de perles?

A

à faibles concentrations salines et en absence de cations divalents tels que Mg2+

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5
Q

De quoi est constitué le collier de perles sous forme étirée

A

ADN libre appelé ADN de liaison (ADN linker) qui relie des structures en forme de perles appelées nucléosomes

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6
Q

De quoi est constitué un nucléosome

A

d’ADN et histones, possédant un diamètre d’environ 10nm

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7
Q

Quels sont les principales unités structurales de la chromatine

A

nucléosomes

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8
Q

De quoi est formé un nucléosome

A

d’un coeur protéique avec de l’ADN enroulé à la surface comme un fil autour d’une bobine. Le coeur est un octamère en forme de disque contenant deux copies de chacune des histones H2A, H2B, H3 ET H4

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9
Q

Que se passe t’il quand on ajoute des histones isolées à l’ADN in vitro dans une concentration saline physiologique

A

les nucléosomes ne se forment pas spontanément. d’autres protéines nucléaires se fixent aux histones et les assemblent en nucléosomes

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10
Q

Qu’est-ce qui donne la conformation des nucléosomes empaquetés en une spirale irrégulière ou solénoide avec environ 6 nucléosomes par tour

A

cette conformation est possible grâce au H1 qui est liée à l’ADN à l’intérieur du solénoide, avec une molécule d’ADN associée à chaque nucléosome

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11
Q

Sous quelle forme existe principalement la chromatine? (sauf pour les régions chromosomiques en cours de transcription)

A

sous forme condensée (hétérochromatine) d’une fibre de 30nm et en structures repliées

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12
Q

Quelle forme adopte les régions de chromatine soumises à une transcription active (euchromatine)

A

forme étirée en collier de perles

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13
Q

Qu’est-ce qu’une queue d’histone

A

chacune des histones constituant le coeur du nucléosome contient une extrémité aminée flexible de 11 à 37 AA qui s’étend à partir d’une structure fixe du nucléosome

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14
Q

Pourquoi les queues d’histones sont nécessaires à la chromatine

A

pour se condenser à partir de la conformation en collier de perles en la fibre de 30nm et vice versa

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15
Q

Quels modifications subissent les AA des queues d’histones (particulièrement H3 et H4)? et quels sont les effets de ces modifications?

A

-subissent des modifs covalentes par des enzymes cellulaires (acétylase, méthylase) qui agissent sur eu pour influencer la structure de la chromatine
-ces modifs changent les interactions histone-ADN et les interactions entre les nucléosomes et participent à la régulation de la transcription
-les gènes présents dans les régions condensées et repliées dans la chromatine sont inaccessibles à l’ARN polymérase et aux autres protéines nécessaires à la transcription

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16
Q

Quelle est la structure générale des transposons

A

-une région codante incluant la transposase
-une région répétée inversée (habituellement 50 pb) à chaque extrémité
-une région répétée directe au site cible (habituellement 5-11 pb)

17
Q

Quels trois fonctions remplit la transposase

A

-excise précisément le transposon de l’ADN donneur
-Effectue des coupures décalées dans une courte séquence de l’ADN accepteur
-Ligature des extrémités 3’ du transposon aux extrémités 5’ de l’ADN accepteur coupé

18
Q

Qu’est-ce qui se passe après l’activité ligase 3’ de la transposase

A

une ADN polymérase de la cellule hôte remplit les brèches simples brins, produisant les courtes répétitions directes qui encadrent les éléments IS

19
Q

Qu’Est-ce que l’ADN ligase fait à la fin du processus?

A

réunit les extrémités libres (entre les extrémités 3’ de l’ADN accepteur et 5’ du transposons)

20
Q

Quels sont les rétrotransposons sans LTR

A

-SINE= courtes séquences dispersées (environ 300 pb humain)
-LINE= longues séquences dispersées (environ 6 kb humain)