Structure des gènes Flashcards
C’Est quoi la chromatine
forme sous laquelle le matériel génétique est organisé quand les cellules ne se divisent pas- complexe nucléoprotéique
Quelles sont les protéines les plus abondantes associées à l’ADN eucaryote
les histones
Quels sont les 5 plus grands types d’histones et quelle est leur charge
H1, H2A, H2B, H3, H4
Chargés positivement pour interagir avec l’ADN chargé négativement
Dans quel contexte la chromatine isolée ressemble à un collier de perles?
à faibles concentrations salines et en absence de cations divalents tels que Mg2+
De quoi est constitué le collier de perles sous forme étirée
ADN libre appelé ADN de liaison (ADN linker) qui relie des structures en forme de perles appelées nucléosomes
De quoi est constitué un nucléosome
d’ADN et histones, possédant un diamètre d’environ 10nm
Quels sont les principales unités structurales de la chromatine
nucléosomes
De quoi est formé un nucléosome
d’un coeur protéique avec de l’ADN enroulé à la surface comme un fil autour d’une bobine. Le coeur est un octamère en forme de disque contenant deux copies de chacune des histones H2A, H2B, H3 ET H4
Que se passe t’il quand on ajoute des histones isolées à l’ADN in vitro dans une concentration saline physiologique
les nucléosomes ne se forment pas spontanément. d’autres protéines nucléaires se fixent aux histones et les assemblent en nucléosomes
Qu’est-ce qui donne la conformation des nucléosomes empaquetés en une spirale irrégulière ou solénoide avec environ 6 nucléosomes par tour
cette conformation est possible grâce au H1 qui est liée à l’ADN à l’intérieur du solénoide, avec une molécule d’ADN associée à chaque nucléosome
Sous quelle forme existe principalement la chromatine? (sauf pour les régions chromosomiques en cours de transcription)
sous forme condensée (hétérochromatine) d’une fibre de 30nm et en structures repliées
Quelle forme adopte les régions de chromatine soumises à une transcription active (euchromatine)
forme étirée en collier de perles
Qu’est-ce qu’une queue d’histone
chacune des histones constituant le coeur du nucléosome contient une extrémité aminée flexible de 11 à 37 AA qui s’étend à partir d’une structure fixe du nucléosome
Pourquoi les queues d’histones sont nécessaires à la chromatine
pour se condenser à partir de la conformation en collier de perles en la fibre de 30nm et vice versa
Quels modifications subissent les AA des queues d’histones (particulièrement H3 et H4)? et quels sont les effets de ces modifications?
-subissent des modifs covalentes par des enzymes cellulaires (acétylase, méthylase) qui agissent sur eu pour influencer la structure de la chromatine
-ces modifs changent les interactions histone-ADN et les interactions entre les nucléosomes et participent à la régulation de la transcription
-les gènes présents dans les régions condensées et repliées dans la chromatine sont inaccessibles à l’ARN polymérase et aux autres protéines nécessaires à la transcription
Quelle est la structure générale des transposons
-une région codante incluant la transposase
-une région répétée inversée (habituellement 50 pb) à chaque extrémité
-une région répétée directe au site cible (habituellement 5-11 pb)
Quels trois fonctions remplit la transposase
-excise précisément le transposon de l’ADN donneur
-Effectue des coupures décalées dans une courte séquence de l’ADN accepteur
-Ligature des extrémités 3’ du transposon aux extrémités 5’ de l’ADN accepteur coupé
Qu’est-ce qui se passe après l’activité ligase 3’ de la transposase
une ADN polymérase de la cellule hôte remplit les brèches simples brins, produisant les courtes répétitions directes qui encadrent les éléments IS
Qu’Est-ce que l’ADN ligase fait à la fin du processus?
réunit les extrémités libres (entre les extrémités 3’ de l’ADN accepteur et 5’ du transposons)
Quels sont les rétrotransposons sans LTR
-SINE= courtes séquences dispersées (environ 300 pb humain)
-LINE= longues séquences dispersées (environ 6 kb humain)
