Statistiques Flashcards

1
Q

Analyser une requête PubMed : symboles

A

[so] = source
[au] = auteur
() = priorité
[tiab] = title and abstract
AND, OR = opérateurs logiques
* = joker (écriture partielle d’un mot)

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Q

Analyser une requête PubMed : interroger une base

A

P : patient, problème, pathologie
I : intervention, exposition à un facteur
C : comparateur, comparaison
O : outcome, critère de jugement, réponse

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Q

Bases de données : fiches simples

A

Problème de duplication
Redondance
Incohérence

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4
Q

Bases de données : relation 1:N

A

Lien vers maître
Limite la redondance

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Q

Bases de données : relation N:M

A

Structure pivots à 2 liens
Limite la redondance

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6
Q

Quelles sont les variables qualitatives ?

A

Binaires
Ordinales
Nominales

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7
Q

Définir une variable binaire

A

Description : proportion
Estimation : IC
Représentation : diagramme en barres

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8
Q

Définir une variable ordinale

A

Peuvent bénéficier d’un classement ordonné
Description : effet et % OU effectif et % cumulé
Estimation : IC
Représentation : diagramme en barres

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9
Q

Définir une variable nominale

A

Ou qualitative pure
Description : table de répartition, effectif et %
Estimation : IC
Représentation : graphique en barre ou en secteur

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10
Q

Quelles sont les variables quantitatives ?

A

Sont mesurables
Discrètes
Continues

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11
Q

Définir une variable discrète

A

Nombre fini de valeurs
Description : moyenne, médiane, variance, écart type, EIQ, extrêmes
Estimation : IC
Représentation : histogramme

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12
Q

Définir une variable continue

A

Nombre infini de valeurs entre deux valeurs
Description : moyenne, médiane, variance, écart type, EIQ, extrêmes
Estimation : IC
Représentation : histogramme de fréquence

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13
Q

Définir une variable censurée

A

Délai d’observation ou non d’une variable binaire
On ne s’intéresse pas à la valeur de la variable mais plutôt à sa survenue
Description : médiane de survie
Estimation : IC
Représentation : courbe de survie de Kaplan Meier

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14
Q

Que représente une boîte à moustache ?

A

Distribution conjointe :
- Variable quantitative
- Variable qualitative

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15
Q

Que représente un nuage de points ?

A

Distribution conjointe de 2 variables quantitatives

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16
Q

Que représente un diagramme en barres avec un tableau de contingence ?

A

Distribution conjointe de 2 variables qualitatives

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17
Q

Qu’est ce que le tableau de contingence ?

A

Méthode de représentation de données issues d’un comptage permettant d’estimer la dépendance entre 2 caractères

Croise 2 caractères d’une population en dénombrant l’effectif correspondant à la conjonction “caractère 1” et “caractère 2”

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18
Q

Comment comparer 2 groupes sur une variable binaire ?

A

A une variable théorique :
- Chi 2
- Test binomial

Comparaison de 2 groupes indépendants :
- Chi 2
- Fisher si n petit

Comparaison de 2 groupes appariés : McNemar

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19
Q

Comment comparer 2 groupes sur une variable qualitative ?

A

A une variable théorique : chi 2

Comparaison de 2 groupes indépendants :
- Chi 2
- Fisher si n petit

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20
Q

Comment comparer 2 groupes sur une variable ordinale / rang / quantitative non gaussienne ?

A

A une variable théorique : Wilcoxon

Comparaison de 2 groupes indépendants :
- Chi 2 + test de tendance
- Test u de Mann Whitney

Comparaison de 2 groupes appariés : Wilcoxon apparié

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21
Q

Comment comparer 2 groupes sur une variable quantitative ?

A

A une variable théorique : t de Student pour un échantillon

Comparaison de 2 groupes indépendants : t de Student non apparié

Comparaison de 2 groupes appariés : t de Student apparié

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22
Q

Comment comparer 2 groupes sur une variable censurée ?

A

A une valeur théorique : chi 2

Comparaison de 2 groupes indépendants : test du LogRank

Comparaison de 2 groupes appariés : test de survie avec fragilité

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23
Q

Comment comparer k groupes sur une variable binaire ?

A

Groupes indépendants :
- Chi 2
- Fisher si n petits

Groupes appariés ou mesures répétées : Q de Cochran

Groupes indépendants + 3e variable qualitative :
- Mantel Haenszel
- Régression logistique

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24
Q

Comment comparer k groupes sur une variable qualitative ?

A

Groupes indépendants :
- Chi 2
- Fisher si n petits

Groupes indépendants + 3e variable qualitative :
- Mantel Haenszel
- Régression logistique polytomique

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25
Comment comparer k groupes sur une variable ordinale / rang / quantitative non gaussienne ?
Groupes indépendants : - Chi 2 + test de tendance - Kruskall Wallis Groupes appariés ou mesures répétées : test de Friedman Groupes indépendants + 3e variable qualitative : régression logistique ordinale
26
Comment comparer k groupes sur une variable quantitative ?
Groupes indépendants : ANOVA à 1 facteur Groupes appariés ou mesures répétées : ANOVA à 1 facteur pour mesures répétées Groupes indépendants + 3e variable qualitative : ANOVA à 2 facteurs
27
Comment comparer k groupes sur une variable censurée ?
Groupes indépendants : test du LogRank Groupes appariés ou mesures répétées : modèle de survie avec fragilité Groupes indépendants + 3e variable qualitative : - Test du LogRank stratifié - Modèle de Cox stratifié
28
Quelle est l'hypothèse nulle pour un test de Chi 2 ?
Les deux variables sont indépendantes Si Chi 2 < valeur seuil --> non rejet H0 --> variables indépendants Interprétation au risque de 5% avec le nombre de ddl correspondant
29
Qu'est ce que le risque relatif RR ?
Rapport de 2 risques (risque M+E+) / (risque M+E-) = (M+E+ / nE+) / (M+E- / nE-)
30
Qu'est ce que l'odds ratio OR ?
Rapport de 2 côtes (M+E+ x M-E-) / (M-E+ x M+E-)
31
Quels sont les 4 objets d'une étude ?
Etiologie Thérapeutique Pronostic Diagnostic
32
Définir l'étiologie
Identifier les facteurs de risque
33
Définir la thérapeutique
Ensemble d'interventions permettant de passer de l'état M+ à l'état mois M+ ou M-
34
Définir le pronostic
Ensemble de facteurs permettant de prédire un état de santé futur et de classer les sujets
35
Définir le diagnostic
Ensemble d'examens permettant d'établir un état de santé
36
Quels sont les 2 types d'études ?
Interventionnelle : on teste un traitement Observationnelle : on observe l'effet d'un facteur
37
Définir le plan expérimental
Conception de l'étude pour augmenter le niveau de preuve (éviter les biais et améliorer la précision)
38
Quels sont les 3 types de plans expérimentaux ?
Longitudinal : cas témoin, cohorte Transversal : photo à un instant t Essai croisé
39
Quelles sont les caractéristiques d'une étude cas témoin ?
Rétrospectif : la mesure de l'état précède celle de l'exposition Comparaison : groupes diversement malades (avec une définition précise de la maladie) Indice utilisable : OR
40
Quels sont les avantages d'une étude cas témoin ?
Facile à organiser Rapide Economique
41
Quels sont les inconvénients d'une étude cas témoin ?
Difficultés dans le choix des témoins : - Représentatifs ? - Attention à ceux qui ne sont pas des cas - Sélection indépendant de l'exposition Biais de sélection au niveau des témoins Biais de mesure : - Mémorisation - Etat connu quand on mesure le facteur
42
Quelles sont les caractéristiques d'une étude de cohorte ?
Prospectif : la mesure de l'exposition précède celle de l'état Comparaison : groupes diversement exposés Indices utilisables : RR, RT, OR
43
Quels sont les avantages d'une étude de cohorte ?
Meilleure qualité des données Donc meilleur niveau de preuves
44
Quels sont les inconvénients d'une étude de cohorte ?
Beaucoup de participants si rare Attente si état lointain Coûteux Biais d'attrition si perdus de vue différentiels Biais de mesure si l'exposition est connue
45
Quelles sont les caractéristiques d'une étude transversale ?
Co existence / co variation du facteur et d'un état de santé donné chez les mêmes individus Attention, détermination indépendante du facteur et de l'état sinon risque de biais de mesure Avantages : facile et rapide Inconvénients : cas prévalents (biais de mesure sélective)
46
Quelles sont les caractéristiques d'un essai croisé ?
Sujet pris comme son propre témoin Permet de diminuer le biais de confusion La comparaison est + efficace --> moins de variabilité intra et interindividuelle Nécessite moins de sujets Tirage au sort de l'ordre des traitements Suppose une maladie chronique avec effet rapide et réversible Nécessite une période de sevrage Analyse complexe : effet du traitement, effet de la séquence, effet résiduel
47
Quels sont les 3 types d'étude en aveugle ?
Ouvert : pas d'insu Simple : 1 seule partie ignore le traitement (souvent le patient) Double : au moins 2 parties ignorent le traitement
48
Quels sont les avantages d'une étude double aveugle ?
Prescripteur : pas de biais de sélection / attribution Patient : même compliance / effet psychosomatique Médecin surveillant : suivi idem, pas d'influence sur le patient Evaluation : mesure idem Statisticien : pas d'arrondi ou d'estimation orientée Comité de surveillance : même attitude pour les conclusions
49
Quelle est l'éthique à suivre pour un essai clinique ?
Les volontaires doivent être informés et donner leur consentement éclairé (avertis des risques éventuels) Obtention de l'avis du comité de protection des personnes Non rémunéré mais compensé Impossibilité de participer à plusieurs études en même temps (registre tenu)
50
Quels sont les avantages et les inconvénients d'une étude monocentrique ?
Avantages : - Plus simple à mettre en place - Evite l'effet centre Inconvénient : validité externe ?
51
Quels sont les avantages et les inconvénients d'une étude multicentrique ?
Avantages : - Possibilité de généraliser les résultats - Plus grand échantillon Inconvénients : - Surveillance complexe - Effet centre
52
Qu'est-ce que la randomisation ?
Répartition aléatoire des sujets inclus entre les interventions à comparer La comparabilité initiale supprime les biais de confusion et de sélection
53
Que permet la randomisation ?
Répartition équilibrée en moyenne des facteurs connus et inconnus Indifférence des traitements et principe éthique Développement statistique et jugement de causalité Possibilité de liste de randomisation = séquence pseudo aléatoire pré établie par un programme
54
Qu'est-ce que l'intention de traiter (ITT)?
Tous les patients randomisés dans le groupe auquel ils ont été affectés, POUR TOUT TRAITEMENT ET RESPECT DU PROTOCOLE, reproduit la réalité et réduit le biais
55
Qu'est ce que l'ITT modifiée ?
Exige au moins une dose reçue ou autre critère, mais risque de biais
56
Qu'est ce que le respect du protocole ?
Tous les patients randomisés dans le groupe auquel ils ont été affectés, AVEC LE TRAITEMENT PREVU et SANS ECART MAJEUR AU PROTOCOLE Vise l'efficacité mais risque de biais Possibilité d'exclure des patients
57
Quelles études utilise-t-on dans un but thérapeutique ?
Etude prospective, interventionnelle, contrôlée, randomisée et en aveugle
58
Quelles études utilise-t-on dans un but diagnostic ?
Etude transversale avec échantillon de validité externe
59
Quelles études utilise-t-on dans un but pronostic ?
Cohorte > cas témoin + échantillon de validité externe
60
Quels sont les facteurs de confusion ?
Déterminants qui faussent une relation causale Pour éviter le biais : étude comparative randomisée en double aveugle
61
Quel est le facteur individuel pouvant influencer une étude ?
Abandon Grand échantillon pour limiter l'effet