Statistiques Flashcards
Analyser une requête PubMed : symboles
[so] = source
[au] = auteur
() = priorité
[tiab] = title and abstract
AND, OR = opérateurs logiques
* = joker (écriture partielle d’un mot)
Analyser une requête PubMed : interroger une base
P : patient, problème, pathologie
I : intervention, exposition à un facteur
C : comparateur, comparaison
O : outcome, critère de jugement, réponse
Bases de données : fiches simples
Problème de duplication
Redondance
Incohérence
Bases de données : relation 1:N
Lien vers maître
Limite la redondance
Bases de données : relation N:M
Structure pivots à 2 liens
Limite la redondance
Quelles sont les variables qualitatives ?
Binaires
Ordinales
Nominales
Définir une variable binaire
Description : proportion
Estimation : IC
Représentation : diagramme en barres
Définir une variable ordinale
Peuvent bénéficier d’un classement ordonné
Description : effet et % OU effectif et % cumulé
Estimation : IC
Représentation : diagramme en barres
Définir une variable nominale
Ou qualitative pure
Description : table de répartition, effectif et %
Estimation : IC
Représentation : graphique en barre ou en secteur
Quelles sont les variables quantitatives ?
Sont mesurables
Discrètes
Continues
Définir une variable discrète
Nombre fini de valeurs
Description : moyenne, médiane, variance, écart type, EIQ, extrêmes
Estimation : IC
Représentation : histogramme
Définir une variable continue
Nombre infini de valeurs entre deux valeurs
Description : moyenne, médiane, variance, écart type, EIQ, extrêmes
Estimation : IC
Représentation : histogramme de fréquence
Définir une variable censurée
Délai d’observation ou non d’une variable binaire
On ne s’intéresse pas à la valeur de la variable mais plutôt à sa survenue
Description : médiane de survie
Estimation : IC
Représentation : courbe de survie de Kaplan Meier
Que représente une boîte à moustache ?
Distribution conjointe :
- Variable quantitative
- Variable qualitative
Que représente un nuage de points ?
Distribution conjointe de 2 variables quantitatives
Que représente un diagramme en barres avec un tableau de contingence ?
Distribution conjointe de 2 variables qualitatives
Qu’est ce que le tableau de contingence ?
Méthode de représentation de données issues d’un comptage permettant d’estimer la dépendance entre 2 caractères
Croise 2 caractères d’une population en dénombrant l’effectif correspondant à la conjonction “caractère 1” et “caractère 2”
Comment comparer 2 groupes sur une variable binaire ?
A une variable théorique :
- Chi 2
- Test binomial
Comparaison de 2 groupes indépendants :
- Chi 2
- Fisher si n petit
Comparaison de 2 groupes appariés : McNemar
Comment comparer 2 groupes sur une variable qualitative ?
A une variable théorique : chi 2
Comparaison de 2 groupes indépendants :
- Chi 2
- Fisher si n petit
Comment comparer 2 groupes sur une variable ordinale / rang / quantitative non gaussienne ?
A une variable théorique : Wilcoxon
Comparaison de 2 groupes indépendants :
- Chi 2 + test de tendance
- Test u de Mann Whitney
Comparaison de 2 groupes appariés : Wilcoxon apparié
Comment comparer 2 groupes sur une variable quantitative ?
A une variable théorique : t de Student pour un échantillon
Comparaison de 2 groupes indépendants : t de Student non apparié
Comparaison de 2 groupes appariés : t de Student apparié
Comment comparer 2 groupes sur une variable censurée ?
A une valeur théorique : chi 2
Comparaison de 2 groupes indépendants : test du LogRank
Comparaison de 2 groupes appariés : test de survie avec fragilité
Comment comparer k groupes sur une variable binaire ?
Groupes indépendants :
- Chi 2
- Fisher si n petits
Groupes appariés ou mesures répétées : Q de Cochran
Groupes indépendants + 3e variable qualitative :
- Mantel Haenszel
- Régression logistique
Comment comparer k groupes sur une variable qualitative ?
Groupes indépendants :
- Chi 2
- Fisher si n petits
Groupes indépendants + 3e variable qualitative :
- Mantel Haenszel
- Régression logistique polytomique
Comment comparer k groupes sur une variable ordinale / rang / quantitative non gaussienne ?
Groupes indépendants :
- Chi 2 + test de tendance
- Kruskall Wallis
Groupes appariés ou mesures répétées : test de Friedman
Groupes indépendants + 3e variable qualitative : régression logistique ordinale
Comment comparer k groupes sur une variable quantitative ?
Groupes indépendants : ANOVA à 1 facteur
Groupes appariés ou mesures répétées : ANOVA à 1 facteur pour mesures répétées
Groupes indépendants + 3e variable qualitative : ANOVA à 2 facteurs
Comment comparer k groupes sur une variable censurée ?
Groupes indépendants : test du LogRank
Groupes appariés ou mesures répétées : modèle de survie avec fragilité
Groupes indépendants + 3e variable qualitative :
- Test du LogRank stratifié
- Modèle de Cox stratifié
Quelle est l’hypothèse nulle pour un test de Chi 2 ?
Les deux variables sont indépendantes
Si Chi 2 < valeur seuil –> non rejet H0 –> variables indépendants
Interprétation au risque de 5% avec le nombre de ddl correspondant
Qu’est ce que le risque relatif RR ?
Rapport de 2 risques
(risque M+E+) / (risque M+E-)
= (M+E+ / nE+) / (M+E- / nE-)
Qu’est ce que l’odds ratio OR ?
Rapport de 2 côtes
(M+E+ x M-E-) / (M-E+ x M+E-)
Quels sont les 4 objets d’une étude ?
Etiologie
Thérapeutique
Pronostic
Diagnostic
Définir l’étiologie
Identifier les facteurs de risque
Définir la thérapeutique
Ensemble d’interventions permettant de passer de l’état M+ à l’état mois M+ ou M-
Définir le pronostic
Ensemble de facteurs permettant de prédire un état de santé futur et de classer les sujets
Définir le diagnostic
Ensemble d’examens permettant d’établir un état de santé
Quels sont les 2 types d’études ?
Interventionnelle : on teste un traitement
Observationnelle : on observe l’effet d’un facteur
Définir le plan expérimental
Conception de l’étude pour augmenter le niveau de preuve (éviter les biais et améliorer la précision)
Quels sont les 3 types de plans expérimentaux ?
Longitudinal : cas témoin, cohorte
Transversal : photo à un instant t
Essai croisé
Quelles sont les caractéristiques d’une étude cas témoin ?
Rétrospectif : la mesure de l’état précède celle de l’exposition
Comparaison : groupes diversement malades (avec une définition précise de la maladie)
Indice utilisable : OR
Quels sont les avantages d’une étude cas témoin ?
Facile à organiser
Rapide
Economique
Quels sont les inconvénients d’une étude cas témoin ?
Difficultés dans le choix des témoins :
- Représentatifs ?
- Attention à ceux qui ne sont pas des cas
- Sélection indépendant de l’exposition
Biais de sélection au niveau des témoins
Biais de mesure :
- Mémorisation
- Etat connu quand on mesure le facteur
Quelles sont les caractéristiques d’une étude de cohorte ?
Prospectif : la mesure de l’exposition précède celle de l’état
Comparaison : groupes diversement exposés
Indices utilisables : RR, RT, OR
Quels sont les avantages d’une étude de cohorte ?
Meilleure qualité des données
Donc meilleur niveau de preuves
Quels sont les inconvénients d’une étude de cohorte ?
Beaucoup de participants si rare
Attente si état lointain
Coûteux
Biais d’attrition si perdus de vue différentiels
Biais de mesure si l’exposition est connue
Quelles sont les caractéristiques d’une étude transversale ?
Co existence / co variation du facteur et d’un état de santé donné chez les mêmes individus
Attention, détermination indépendante du facteur et de l’état sinon risque de biais de mesure
Avantages : facile et rapide
Inconvénients : cas prévalents (biais de mesure sélective)
Quelles sont les caractéristiques d’un essai croisé ?
Sujet pris comme son propre témoin
Permet de diminuer le biais de confusion
La comparaison est + efficace –> moins de variabilité intra et interindividuelle
Nécessite moins de sujets
Tirage au sort de l’ordre des traitements
Suppose une maladie chronique avec effet rapide et réversible
Nécessite une période de sevrage
Analyse complexe : effet du traitement, effet de la séquence, effet résiduel
Quels sont les 3 types d’étude en aveugle ?
Ouvert : pas d’insu
Simple : 1 seule partie ignore le traitement (souvent le patient)
Double : au moins 2 parties ignorent le traitement
Quels sont les avantages d’une étude double aveugle ?
Prescripteur : pas de biais de sélection / attribution
Patient : même compliance / effet psychosomatique
Médecin surveillant : suivi idem, pas d’influence sur le patient
Evaluation : mesure idem
Statisticien : pas d’arrondi ou d’estimation orientée
Comité de surveillance : même attitude pour les conclusions
Quelle est l’éthique à suivre pour un essai clinique ?
Les volontaires doivent être informés et donner leur consentement éclairé (avertis des risques éventuels)
Obtention de l’avis du comité de protection des personnes
Non rémunéré mais compensé
Impossibilité de participer à plusieurs études en même temps (registre tenu)
Quels sont les avantages et les inconvénients d’une étude monocentrique ?
Avantages :
- Plus simple à mettre en place
- Evite l’effet centre
Inconvénient : validité externe ?
Quels sont les avantages et les inconvénients d’une étude multicentrique ?
Avantages :
- Possibilité de généraliser les résultats
- Plus grand échantillon
Inconvénients :
- Surveillance complexe
- Effet centre
Qu’est-ce que la randomisation ?
Répartition aléatoire des sujets inclus entre les interventions à comparer
La comparabilité initiale supprime les biais de confusion et de sélection
Que permet la randomisation ?
Répartition équilibrée en moyenne des facteurs connus et inconnus
Indifférence des traitements et principe éthique
Développement statistique et jugement de causalité
Possibilité de liste de randomisation = séquence pseudo aléatoire pré établie par un programme
Qu’est-ce que l’intention de traiter (ITT)?
Tous les patients randomisés dans le groupe auquel ils ont été affectés, POUR TOUT TRAITEMENT ET RESPECT DU PROTOCOLE, reproduit la réalité et réduit le biais
Qu’est ce que l’ITT modifiée ?
Exige au moins une dose reçue ou autre critère, mais risque de biais
Qu’est ce que le respect du protocole ?
Tous les patients randomisés dans le groupe auquel ils ont été affectés, AVEC LE TRAITEMENT PREVU et SANS ECART MAJEUR AU PROTOCOLE
Vise l’efficacité mais risque de biais
Possibilité d’exclure des patients
Quelles études utilise-t-on dans un but thérapeutique ?
Etude prospective, interventionnelle, contrôlée, randomisée et en aveugle
Quelles études utilise-t-on dans un but diagnostic ?
Etude transversale avec échantillon de validité externe
Quelles études utilise-t-on dans un but pronostic ?
Cohorte > cas témoin
+ échantillon de validité externe
Quels sont les facteurs de confusion ?
Déterminants qui faussent une relation causale
Pour éviter le biais : étude comparative randomisée en double aveugle
Quel est le facteur individuel pouvant influencer une étude ?
Abandon
Grand échantillon pour limiter l’effet
