Skupiny Flashcards
Archaeplastida
- Autotrofní, primární plastidy
- společný znak: Pyrenoid - kóduje RUBISCO
- Viola/zeaxhantinový xhantofilový cyklus
- Intraplastidální škrob rostlinného typu
- nejpůvodnější typ - bičíkovec se 2 izokontními bičíky (podobné jako chlamydomonas)
Glaucophyta
- nejpůvodnější rostlinná skupina
- Cyanely - jejich plastidy - připomínají sinice - peptidoglykanová sinicová stěna - ostatní to už nemají - podklad endosymbiotické teorie
- mají jen chlorofyl a a fykobiliproteiny
Rhodophyta
- zcela chybí přídatné pigmenty (xantofyly, karotenoidy)
- viditelná přítomnost fykobiliproteinů - fykobiliny = fotosyntetické pigmenty - chlorofyl a, fykocyanin, fykoerythrin - modré, červené - zachycují modrozelené světlo - proniká mořskou hladinou celkem do hloubky
- nikdy nemají bičíky
- Cyanidophyta - drobné zelenomodré kuličky, možná příbuzné plastidům skupiny SAR, extrémofilní (příbuznost Archaebakteria?)
Eurhoduphyta - stará velká skupina, pravé ruduchy, nejsou prvoci
Proteorhodophyta - jednobuněčné, vláknité, velký plastidový genom s mnoha introny a transpozony
Rhodelphyta
- heterotrofní bičíkovci, predátoři
- po osekvenování se zjistila sesterskost k ruduchám
- extrémně redukované plastidy - už jen produkce FeS klastrů jdoucích do mtch a cytopl.
- větší genom než ruduchy
Viridiplantae
- zelené řasy, největší z Archaeplastida
- ztráta fykobiliproteinů - mají chlorofyl A a B - zelení (i do červena/oranžova - karotenoidy)
- opakování vzniku mnohobuněčnosti
- tylakoidy v plastidech tvoří grana
- BS z celulózy (vyjímečně z chytinu)
- linie - Streptophyta, Chlorophyta
- druhé zamrzání Země = snowball earth - chlorophyta pod ledem a streptophyta na souši -> rozdíly v typu osídlení, nakládání s energií a typem plastidů
- chlorophyta vytlačily streptophyta na souš (vyšší r.) nebo do rašelinišť (krásivky). ve vodě minimum
Chlorophyta a Streptophyta
Chlorophyta - osídlení moří (původně mořští)
- fykoplast - v cytokinezi se rozpadne mitotické vřeténko, vytvoří se nové mikrotubuly paralelně k původnímu vřeténku
- FTS optimalizována k uchovávání energie (glykoláty)
Streptophyta - osídlení sladkých vod (původně sladkovodní)
- fragmoplast - v cytokinezi vřeténko zachováno, BS tvořena kolmo
- FTS optimalizována na rychlý tok metabolitů - glykolát štěpen v peroxizomech
Chlorophyta
- Prasinophyceae, Chlorophyceae, Trebuxiophyceae, Ulvophyceae
- Prasinophyceae - nejpůvodnější zelené řasy, mořští, parafyletická skupina morfologicky velmi podobných org.
- mořské, variabilní počet bičíků, celulózní šupinky různých tvarů
- Chlorophyceae - sladkovodní, planktonní, modelový rostlinný bičíkovci (pediastrum)
- Pediastrum, Chlamydomonas
- Trebuxiophyceae - převážně terestričtí, půdní, aerotrifyčtí (občas i vodní)
- často symbiotické (zoochlorelly) - v lišejnících, nálevnících, nezmarovi
- morfologicky jednoduché - kulička nejméně vysychá
- chlorella
Ulvophyceae - často makroskopické, jednoduchá mnohobuněčnost či sifonální organizace
- převážně mořské ale i na stromě (trentephollia), nebo rybníce
- Ulva, trentepholia Codium
Prasinophyceae
- Chlorophyta
- nejpůvodnější zelené řasy, mořští, parafyletická skupina morfologicky velmi podobných org.
- mořské, variabilní počet bičíků, celulózní šupinky různých tvarů
Trebuxiophyceae
- Chlorophyta
- převážně terestričtí, půdní, aerotrifyčtí (občas i vodní)
- často symbiotické (zoochlorelly) - v lišejnících, nálevnících, nezmarovi
- morfologicky jednoduché - kulička nejméně vysychá
- chlorella
Chlorophyceae
- Chlorophyta
- sladkovodní, planktonní, modelový rostlinný bičíkovci (pediastrum)
- Pediastrum, Chlamydomonas
Ulvophyceae
- Chlorophyta
- často makroskopické, jednoduchá mnohobuněčnost či sifonální organizace
- převážně mořské ale i na stromě (trentephollia), nebo rybníce
- Ulva, trentepholia Codium
Streptophyta
- evoluční cesta k vyšším r. , ale i pár řasových skupin
- CHLOROKYBUS - terestrická řasa, ztráta bičíkatých stádií, žije ve slizovém pouzdru
- DESMIDIALES (krásivky) - hodně diverzifikovaná, rašeliniště, ztráta bičíkatých stádií, má amébódní stádia - leze z buňky do buňky a tvoří zygospory
- unikátní pohl. r. - konjugací, anizogamie
- nepohlavně - dělení za vzniku půlbuněk
Palmophyllophyceae
- možná sesterská k Streptophyta a chlorophyta
- nedávno osekvenovaná
- mořské, mnoho kuliček ve slizu
Excavata obecně
- Metamonady, Discoba
- nejdříve definován morfologicky, poté podpořen molekulárně
- exkavátní excavata - ventrální rýha, cytoskelet podpírající stěny ventrální rýhy
- dvě bazální tělíska bičíků s mikrotubulárními kořeny (svazky mikrotubulů)
- ventrální rýhou prochází zpětný bičík (bazální tělísko je také otočeno) - má na sobě ploutvičky (2-3) - přihání potravu, kormidluje, stabilizuje
- přední bičík slouží k pohybu
- počet bičíků je variabilní
- modifikace mitochondrie:
- nejméně redukovaný genom Jakobida - nejpodobnější bakteriím
- největší genom - Kinteoplastida
- zcela bez genomu s transferovými mtch - Metamonada
- hydrogenosom - produkce H a ATP - anaerobní nálevníci, trichomonády
- mitosom -fce nejasná, v prostředí s málo O
- bez mtch - oxymonády
- obecně excaváta leží kolem LECA - Maliwomonáda patří pod Opimoda a Discoba a Metamonada do Diphoda -> LECA byl nejspíše Excavát
Excavata jako skupina
- Discoba, Metamonada
- obě skupiny začínaly jako exkavátní org. ale jejich exkavátnost často zaniká
- výskyt kosmpolitní, volně žijící, ale vzácný výskyt
- v málo úživném prostředí (málo bakterek) - exkavátnost, nahání si bakterie
- v úživných prostředí exkavátnost zaniká, fagocytace celým povrchem těla (ve střevech živ.)
- morfostáze u volně žijících - nemění se X variabilnost u těch z úživného pr.
- Discoba - Jakobida, Euglenoza, Heterolobosea, Tsukubamonas
- Metamonada - Fornicata, Parabasalia, Preaxostyla, Anaeramoeba
Discoba
- patří do Exkavat
- monofyletičtí, žádný společný znak
Jakobida
Discoba, Exkavata
- zcela exkavátní, nejancestrálnější podoba -> základ exkavátní hypotézy
- 2 bičíky, jeden s ploutvičkou, exkavátní rýha, někteří organická schránka a přisedlost
- mořští, sladkovodní, jeden druh půdní
- nejvíce aerobní s mtch s kristami ale pár anaero. s hydrogenozomem
- vzácní, nejprimitivnější genom mtch
- nejméně redukovaný, řazení genů odpovídá operonům bakterií, mnoho proteinů proteobakteriálního původu, kódují si původní eubakteriální RNA polymerázu
- gen secY pro protein který najedeme u bakterií - transport proteinu ven z buňky
Tsukubamonas
Discoba, Excavata
- volně žijící kulička s 2 bičíky
- periodicky si vytváří a ztrácí ventrální rýhu, umí ji i uzavřít
Heterolobosea
Discoba, Excavata
- původní stav - 4 bičíky
- někteří zástupci - zachovaní břišní rýha ale podložena jiným cytoskeletem
- ploutvičky také pozměněny nebo chybí
- aerobní (mtch, většina) X anaerobní (hydrogenozom)
- volně žijící ale někteří smrtící patogeny (Naegleria)
- sklony k amébovitosti - původně byli améboflageláta - střídání stádia měnavky a bičíkovce
- z měňavky na bičíkovce => měňavky nemají mikrotubuly, musí si je tvořit de novo
- morfologicky a ekologicky extrémně diverzifikovaní - halofilní, acidofilní, alkalofilní, termofilní i anaerobní
Naegleria fowleri - fakultativní parazit
- stádium bičíkovce, améby a cysty
- volně žijící, vzácně původce naeglerózy (PAME - primární amébová meningo-encefalitida)
- teplá voda -> penetrace čichovou sliznicí -> přes čichový nerv do mozku -> hnisavý zánět mozkových blan a mozku - většinou letální a rychlé
Arcasis - mnohobuněčný exkavát (jediný!), pouze měňavky, suchozemské, agregátní mnohobuněčnost
- agregace -> plodnička -> cysty
Euglenozoa
Discoba, Excavata
- druhově nejpočetnější
- znaky: mikrotubulární korzet, periflagelární kapsa, paraflagelární tyč
- původní stav: 2 bičíky (často 1) které vybíhají z periflagelární kapsy (prohlubeň NEHOMOLOGICKÁ s břišní rýhou) - bičík ztloustlý, probíhá jím mikrotubulární struktura (paraflagelární tyč
- většina aerobní, ´většinou 1 rozvětvená mtch s diskovitými kristami
- MIKROTUBULÁRNÍ KORZET - charakteristické, ctpl mem. podložená mikrotubuly -> metabolický pohyb
- Euglenoidea, Kinteoplastida, Diplonema, Symbiontida
Euglenoidea
Euglenoza, Discoba, Excavata
= krásnoočka
- jediní excaváta s plastidem - sekundární plastid - ze zel. řas - 3 membrány, chlorofyl A a B, pyrenoid, zás. látka paramylon- podobná škrobu
- sladkovodní, pár parazitických
- 2 bičíky umístěné ve vchlípené dutince (ampuli) - někdy jeden zakrní -> stigma (světločivná skrvna) blízko ampule -> fototaxe
- Distigma, Peranema - plastid nikdy neměly
- trachelomonas - schránka inkrustovaná Fe
Kinetoplastida
Euglenoza, Discoba, Excavata
- kinetoplast - mitochondriální genom, složitý, z kruhových DNA, propletené minicirkly a maxicirkly
- myslelo se, že slouží k pohybu, ale týká se dělení buň.
- s bazálním tělískem je to struktura která se dělí první -tvoří se tam signál pro dělení buňky
- jedná se o největší genom mtch vůbec - masivní editace RNA
- maxikroužky - mtDNA, minikroužky - obsah genů pro gRNA - ta umožňuje editaci RNA
- velmi sofistikované dělení minikroužků, jsou esenciální pro obě dceřinné buňky
- asi mutace kompenzující předchozí chybu, ale eventuelně je to zabije
- glykosom - modifikovaný peroxisom - glykolýza
- původně nositelé 2 bičíku, dnes diversifikace, volně žijící i parazitičtí
- BODONIA
- 2 bičíky (přední, zpětný), undulující mem, volní/paraziti, často v organicky znečištěných vodách (nozdry velryb)
TRYPANOSOMIDA
- parazité - jedno / dvouhostitelské (Leptomonas/Trypanosoma, Leishmania)
-1 bičík, složité ŽC a vývoje, - různé formy, poloha jádra,kinetoplastu a bičíku
- Trypanosoma brucei - spavá nemoc, moucha tsetse
Diplonema
Euglenoza, Discoba, Excavata
- malá skupina, sladkovodní/mořští
- znaky euglenozo: periflagelární kapsa, redukovaný korzet
Symbionta
Euglenoza, Discoba, Excavta
- hostí na svém povrchu episymbiotické bakterie podílející se na metabolické aktivitě
- planktonní ale v anaerobním prostředí - hydrogenosomy
- periflagelární kapsa, korzet