Semaine 1 Flashcards
Par quoi est formé le nucléotide et quelles sont les liaisons impliquées?
Par condensation
Lien glycolyse entre base et ribose
Lien phosphoester entre phosphate et ribose
Quelle est le lien entre deux nucléotides?
Lien phosphodiester
Quelles sont les purines?
Adénine et Guanine
Quelles sont les pyrimidines?
Cytosine et thymine
Quelles sont les états tautomériques de A et C? préférentielle?
Amino et imino le préférentielle est AMINO
Quelles sont les états tautomériques de G et T? préférentielle?
Céto et énol le préférentielle CÉTO
Combien de liens hydrogène entre C:G et A:T?
C:G 3
A:T 2
Qu’est-ce qui créer la stabilité de la double hélice?
Entropie, l’empilement des bases et les influences hydrophiles/hydrophobes
De combien de degré chaque paire de base est décalée de la précédente?
36°
Quelle est la périodicité hélicoïdale de ADN?
10 pb/tour
Quelles sont les angles qui séparent les 2 sucres de chaque paire?
120° (petit sillon) et 240° (grand sillon)
Qu’est-ce qui A:T expose dans le grand sillon? T:A?
ADAM (MADA)
Qu’est-ce que G:C expose dans le grand sillon? C:G
AADH (HDAA)
Qu’est-ce qui A:T expose dans le petit sillon? T:A?
AHA (AHA)
Qu’est-ce que G:C expose dans le petit sillon? C:G
ADA (ADA)
ADN hélice à droite syn ou anti?
anti
ADN hélice à gauche (purine/pyrimidine)
anti pour pyrimidine
syn pour purine
De quoi dépend le Tm?
Contenu en C:G
Force ionique de la solution
Qu’est-ce que le nombre d’enlacement?
Le nombre de fois q’un brin ADNccc doit passer à travers l’autre pour que les 2 brins soient séparés (nombre entier)
nombre d’enlacement = nombre de torsion + nombre de supertours
Nombre de torsion?
nb de tours d’hélice d’un brin autour de l’autre
Nombre de supertour?
Axe longitudinal de la double hélice s’entrecroise sur lui m^me un nombre de fois (enroule sur lui même)
Que fait l’ion éthidium?
Il déroule ADN. S’intercale entre les paires de base détord ADN de 26 ° . Donc il diminue l’enroulement de ADN et relâche les ADNccc
