Secuenciación Flashcards
1
Q
tipos de secuenciacion
A
- método de SANGER
- Maxam-Gilbert
- Secuenciación de segunda generación
2
Q
característics principales del método de SANGER
A
- se basa en la adición de ddNTPs
- 1977
3
Q
fundamento del metodo SANGER
A
- es basado en la replicacion de la molecula de ADN con ayuda de un ADN polimerasa
- terminadores
4
Q
metodología del metodo de SANGER
A
- aislar
- clonar
- desnaturalizar
- iniciador marado
- marcaje de ddNTPs
- mezcla se divide en 4 partes
- ddATPs en exceso
5
Q
cantidad de nucleotidos en los fragmentos que se pueden leer utilizando el metodo de sanger?
A
fragmentos de 50 a 300 nucleotidos
6
Q
pre-tRNA cantidad de nucleotidos
A
75-80
7
Q
pasos de la maduracion de pre-tRNA
A
- eliminacion del intron por medio de splicing
- secuencia 5’ elimina ribonucleasa P
- Resiudo UU (3’) es remplazado por ACC
- distintas bases son modificadas en el proceso de maduración
8
Q
cantidad de nucleotidos en un intron
A
14
9
Q
es requerido durante la sintesis de proreinas
A
ACC
10
Q
secuenciación automatizada
A
- PCR con fluoresencia, cadena terminadora de nnNTPs
- separación por capilaridad en un gel de electroforesis
- excitacion por laser y detección por maquinaria de secuencia
11
Q
PCR con fluoresencia
A
- amplifica y desnaturaliza la secuencia original del ADN por medio de PCR
- mezcla de dNTPs y fluoresencia ddNTPs
- da oligonucleotidos fluorescentes
12
Q
next generation sequencing
A
- permite secuenciación de múltiples sitios a escala masiva
- millones-billones de fragmentos de DNA secuenciados en una sola reacción
- cobertura y profundidad
13
Q
cobertura en el Next Generation Sequencing
A
promedio de numero de lecturas que se alinean a una secuencia de referencia
14
Q
profundidad en el Next Generation Sequencing
A
número de veces que ha sido secuenciado una base del genoma
15
Q
preparación de muestras para la secuenciación
A
- fragmentacion
- librerias
- secuenciacion
- analisis bioinformatico
