Replicación, transcripcion Flashcards
Características de la replicación
-sintesis acdenas es de 5´a 3´
-semiconservadora
-bidireccional
-continua y discontinua
Que significa que sea semiconservadora la replicación?
que en cada replicación se conserva una de las cadenas originales
Que significa que sea bidireccional la replicación?
que a partir del origen de replicación se sintetizan dos cadenas en ambos sentidos
Que caracteristicas tienen los sitios de origen?
son sitios ricos en A y T
Porque los sitios donde hay mas adeninas y timinas son los que se rompen primero?
Porque los enlaces entre ellas son de 2 puentes de hidrógeno, entonces es mas fácil de romper
Cual es una característica que diferencia la replicación de los eucariontes a los procariotas?
que en los eucariotas es multifocal– significa que hay múltiples origenes de replicación
Características de la hebra discontinua
-forman fragmentos okazaki
-replicación cadena 5´a 3´
Características de la hebra continua
-replicación de 3´a 5´
-hebra líder
Función helicasa
-separa las dos hebras DNA
-rompe puentes hidrógeno
-ocasiona super enrollamientos
Función de proteínas unión a cadena sencilla (RPA o SSB)
-evitan formación de puentes de hidrógeno
-mantiene hebras separadas uniendose a la cadena
Función primasa
-sintetisa los primers
-8 a 10 nt de longitud
-proporciona un extremo 3´—en conjunto con la DNA polimerasa alfa
Función toposimoerasa
-desenrollan, cortan y luego vuelven a hacer enlaces fosfodiester
Función RNAsa H1
-retira los primers de hebra continua
Función endonucleasa FLAP 1
remueve primers de fragmentos de okazaki– después llega DNA polimerasa (discontinua)
Función de ligasa
forma enlace fosfodiester entre nucleótidos contiguos–une a todos los fragmentos de DNA
Función de telomerasa
-transcriptasa reversa que sintetiza una secuencia determinada de DNA
Función antigeno nuclear de proliferación celular (PCNA)
-junta todas las proteínas para que puedan actuar
-sirve como pinza que sostiene la DNA polimerasa sobre la cadena de DNA
Función DNA polimerasa
trata de poner la base nitrogenada contraria y después formar enlaces
En que dirección sintetiza DNA polimerasa
-sintetiza de 5´a 3´
-necesita un extremo OH libre para poder sintetizar
-la primasa se lo pone
Función DNA pol alfa
trabaja con primasa RNA primasa
Función DNA pol delta
elongación hebras rezagadas (discontinua)
Función DNA pol epsilon
elongación hebras DNA líder (continua)
Función DNa pol beta
reparación errores
Función DNA pol gamma
replicación DNA mitocondrial
Pasos para formar hebra continua
- actua DNA polimerasa alfa forma primer
- actua DNA polimerasa epsilon y empiez a pegar bases con enlaces fosfodiester
Pasos para formar hebra discontinua
- actúa DNA pol alfa primer
- actúa DNA pol delta y empieza a pegar bases con enlaces fosfodiester
En que consiste el inicio de la replicación
en reconocer el punto de origen (ORI)
Como se llama el complejo que reconoce el punto de inicio?
ORC
Que hacen las proteínas iniciadoras?
empiezan a romper puentes de h
Cuantas horquillas de replicación hay y que pasa ?
Hay 2 horquillas de replicacion y las helicasas llegan de los dos lados
Que necesita la helicasa para actuar?
se fosforila
Que hace PCNA?
mantiene pegada DNa polimerasa a la hebra de DNA
Que hace RPA?
separa las cadenas para evitar que se unan la replicacion
Cuantos primers se ponen en la hebra líder?
solo un primer
Cuantos primers se ponen en la hebra rezagada?
-varios primers
-fragmentos de okazaki
Que pasa en la terminación de la replicación?
-se unen todos los fragmentos
-se eliminan los primers
-desacoplan las proteínas
-replican los telómeros
Que son los telómeros?
secuencias de nucleótidos al final de los cromosomas que protegen el ADN de la degradación.
Que es un tandem?
pueden estar en cualquier parte del genoma y su expansión puede causar enfermedades genéticas
Cual es la secuencia de telómeros en humanos?
GGGTTA
Función de la telomerasa
-reconoce la punta de los telomeros
-contiene secuencia de RNA , con la cual elonga los telóremos
-actua en la hebra rezagada
En que consiste la transcripción
síntesis de una cadena de RNA complementaria y antiparalela
Porque se dice transcripción?
es de nucleótido a nucleótido
Porque se dice traducción?
de nucleótido a proteína
Que es un gen?
secuencia de nucleótidos en la molécula de DNa, que contiene la información necesaria para síntesis de un RNA m,t y r funcional
Tipo de secuencias que puede tener un gen
Regulatorias y codificantes
Dentro de las regulatorias cuales existen?
promotores
potenciadores
silenciadores
Dentro de las codificantes cuales existen?
intrones y exones
En donde se pueden encontrar los promotores?
se pueden encontrar rio arriba y rio abajo
A que se le llama transcrito primario/RNA inmaduro?
a cuando ya se transcribe pero sin la region regulatoria aun tiene intrones y exones
Como sabemos que el RNAm ya esta completo?
cuando ya tiene puros exones, con caperuza y cola de poli a
Cuando se usa la caja tata ?
cuando es un gen que se expresa de vez en cuando o cuando se necesita — esta río arriba
La caja TATA es un promotor o regulador ?
es un promotor
Cuando se usa CAAT?
genes con alta expresión y regulación—- esta río arriba
Cuando se usa CG?
se usa para genes constitutivos, SIEMPRE ACTIVOS
ej. rna polimerasa, proteínas ribosomales y enzimas
Cuando se usa DPE?
genes sin caja TATA pero con inicio preciso
esta río abajo
se encuentra dentro del código
Que es un factor de transcripción?
son proteínas, que regulan (aumentan o disminuyen) la tasa de transcripción
Como se activan las proteínas reguladoras ?
tiene que fosforilarse
Que proteínas detectan el inicio para la transcripción?
los factores de transcripción
Cuantos tipos de RNA polimerasa existen?
RNA pol I, RNA pol II y RNA pol III
Cual es la polimerasa que se usa en los humanos ?
RNA pol II
Paso 1 de la transcripción
-TFIID se une a la caja TATA
-la parte TBP de TFIID reconoce a TATA
Paso 2 de la transcripción
Cuando se une TBP se provoca una deformación del DNA
se dobla (80°)
Paso 3 de la transcripción
TFIIB se una a la parte TBP de TFIID y pone a la RNA polimerasa la posiciona
Paso 4 de la transcripción
TFIIF agarra una RNA polimerasa y se pega al complejo porque TFIIB la atrae
Paso 5 de la transcripción
TFIIA estabiliza la unión y mantiene unida la TFIID (en su parte TBP), con el DNA
Paso 6 de la transcripción
llega TFIIH
-tiene función de helicasa para que pase RNA pol
-fosforila el carboxilo terminal de RNa pol
Que pasa cuando TFIIH fosforila el carboxilo terminal del RNA pol?
cambia de posición y la hace avanzar
Que proteína regula la fosforilación de TFIIH?
TFIIE
Que le pasa a la RNA pol cuando esta fosforilada ?
empieza a avanzar
Si hay un potenciador quien lo va a detectar?
activador
Si hay un silenciador quien lo va a detectar?
represor
Por donde se manda la señal ya sea del activador o del represor ?
por un mediador
Función del mediador
permite que las proteínas activadoras se comuniquen con la polimerasa
Función complejo de remodelación de la cromatina
-facilita el deslizamiento de nucleosomas
-promueve el desalojo de los nucleosomas
Función de la enzima modificadora de histonas
-acetilación, metilación y fosforilación
Nombra los factores que pausan a la RNA pol II
NELF, Gdown y PAFC1
Cuales son las proteínas que al llegar hacen que NELF y Gdown se salgan y que PAFC1 se convierta en activador ?
SPT4 y 5
Para que se necesitan SPT4 y 5?
para mantener unido a RNA polimerasa al DNA y que no se separe hasta que termine
Función de PTEFb
-vuelve a fosforilar la colita del RNA pol y la activa
-activa a las proteínas de la cola
Donde se encuentran las proteínas para poner caperuza y cola de poli a ?
En la cola de la RNA pol II
Nombre de las tres enzimas que ponen la caperuza
-RNA tirofosfatasa
-Guanil transferasa
-Metil transferasa
En la terminación que nos falta ponerle al RNA m?
la cola poli a
Nombra las enzimas que actuan en la terminación de la transcripción
CPSF
CstF
Poli A polimerasa
Función CPSF
-terminación AAUAAAAA
-reconoce que el RNA m esta acabando para que se de cuenta necesitamos muchas adeninas
Función CstF
-participa en la escisión
-separa todas las proteínas
Función poli A polimerasa
-añade 200nt de adenina al final de la hebra
